Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14200
- Subject:
- NM_001004176.2
- Aligned Length:
- 1149
- Identities:
- 935
- Gaps:
- 84
Alignment
Query 1 MGDFAAPAAAANGSSICINSSLNSSLGGAGIGVNNTPNSTPAAPSSNHPAAGGCGGSGGPGGGSAAVPKHSTVV 74
||||||||||||||||||||||.|||||||||| |||||||.|||.||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1 MGDFAAPAAAANGSSICINSSLSSSLGGAGIGV-NTPNSTPVAPSGNHPAAGGCGGSGGPGGSSAAVPKHSTVV 73
Query 75 ERLRQRIEGCRRHHVNCENRYQQAQVEQLELERRDTVSLYQRTLEQRAKKSGAGTGKQQHPSKPQQDAEAASAE 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 74 ERLRQRIEGCRRHHVNCENRYQQAQVEQLELERRDTVSLYQRTLEQRAKKSGAGSGKQQHPSKTQQDAEAASAE 147
Query 149 QRNHTLIMLQETVKRKLEGARSPLNGDQQNGACDGNFSPTSKRIRKDISAGMEAINNLPSNMPLPSASPLHQLD 222
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||...|.|||||||.||||.|||||||||
Sbjct 148 QRNHTLIMLQETVKRKLEGARSPLNGDQQNGACDGSFSPTSKRIRKDLGTGLEAINNLPNNMPLTSASPLHQLD 221
Query 223 LKPSLPLQNSGTHTPGLLEDLSKNGRLPEIKLPVNGCSDLEDSFTILQSKDLKQEPLDDPTCIDTSETSLSNQN 296
||||||||||..|||||||||||||| ||||||.||||||.|||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 222 LKPSLPLQNSAAHTPGLLEDLSKNGR-----LPVNGCGDLEDSFAILQNKDLKQEPLDDPACIDTSETSLSNQN 290
Query 297 KLFSDINLNDQEWQELIDELANTVPEDDIQDLFNEDFEEKKEPEFSQPATETPLSQESASVKSDPSHSPFAHVS 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||...||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 291 KLFSDINLNDQEWQELIDELANTVPEDDIQDLFNEDFEEKKEQEFSQTTMETPLSQESVSVKSDASHSPFAHVS 364
Query 371 MGSPQARPSSSGPPFSTVSTATSLPSVASTPAAPNPASSPANCAVQSPQTPNQAHTPGQAPPRPGNGYLLNPAA 444
.|||||||||||||||||||.|.|||||.||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||..
Sbjct 365 LGSPQARPSSSGPPFSTVSTGTNLPSVANTPGAQNPASSPANCAVQSPQTPTQAHTPGQAPPRPGNGYLLNPVS 438
Query 445 VTVAGSASGPVAVPSSDMSPAEQLKQMAAQQQQRAKLMQQKQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQHSNQTSNWSPLG 518
|.|.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 439 VAVSGSGSGSVAGPSSDMSPAEQLKQMAAQQQQRAKLMQQK--QQQQQQQQQQQQQQQQQQQHSNQTSSWSPLG 510
Query 519 PPSSPYGAAFTAEKPNSPMMYPQAFNNQNPIVPPMANNLQKTTMNNYLPQNHMNMINQQPNNLGTNSLNKQHNI 592
|||||||.||..|||||||||||||||||.|||.|||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 511 PPSSPYGTAFASEKPNSPMMYPQAFNNQNTIVPAMANSLQKTTMNNYLPSNHMNMISQQPNNLGTNSLNKQHNI 584
Query 593 LTYGNTKPLTHFNADLSQRMTPPVANPNKNPLMPYIQQQQQQQQQQQQQQQQQQPPPPQLQAPRAHLSEDQKRL 666
|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.||.|.|..|||.|||||||||||||||||||.
Sbjct 585 LTYGNTKPLTHFNADLSPRMTPPMANPNKTPLMPYIQQPQQSQQPQPQPPQQQPPPPPQLQAPRAHLSEDQKRM 658
Query 667 LLMKQKGVMNQPMAYAALPSHGQEQHPVGLPRTTGPMQSSVPPGSGGMVSGASPAGPGFLGSQPQAAIMKQMLI 740
||.|||||||.||||||||.||||||.||.||||||||.|||.|||.|||||||.|.||||||||||||||||.
Sbjct 659 LLIKQKGVMNPPMAYAALPAHGQEQHAVGIPRTTGPMQNSVPSGSGSMVSGASPGGLGFLGSQPQAAIMKQMLM 732
Query 741 DQRAQLIEQQKQQFLREQR----------QQQQQQQQILAEQQLQQSHLPRQHLQPQRNPYPVQQVNQFQGSPQ 804
||||||.|.|||||||||| |||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 733 DQRAQLMEHQKQQFLREQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQILAEQQLQQPHLPRQHLQQQRNPYPVQQVNQFQGSPQ 806
Query 805 DIAAVRSQAALQSMRTSRLMAQNAGMMGIGPSQNPGTMATAAAQSEMGLAPYSTTPTSQPGMYNMSTGMTQMLQ 878
||||||.|.||||||.|||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.||..||||||||||.||||||||
Sbjct 807 DIAAVRNQVALQSMRASRLIAQNAGMMGMGPSQNPGTMATAAAQSEIGLASYSAPPTSQPGMYNMNTGMTQMLQ 880
Query 879 HPNQSGMSITHNQAQGPRQPASGQGVGMVSGFGQSMLVNSAITQQHPQMKGPVGQALPRPQAPPRLQSLMGTVQ 952
|.|||||.|.|||.||||.|||.||||||||||||||||||..|||.|.||.|||||||||.||||||.|||||
Sbjct 881 HSNQSGMGIPHNQSQGPRPPASSQGVGMVSGFGQSMLVNSALSQQHQQLKGSVGQALPRPQGPPRLQSVMGTVQ 954
Query 953 QGAQSWQQRSLQGMPGRTSGELGPFNNGASYPLQAGQPRLTKQHFPQGLSQSVVDANTGTVRTLNPAAMGRQMM 1026
||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||
Sbjct 955 QGAQNWQQRSLQGVPGRTSGELGPFNNGASYPLQAGQPRLTKQHFPQGLSQPVMDANTGAVRTLNPAAMGRQMM 1028
Query 1027 PSLPGQQGTSQ-------AMANGHVWPEPGSPRHASVQP-------APSTAADTQWQLCSKQPEPSL------- 1079
|.|.|||..|| ....| .||.| |..|| ....||..|.|.....|....
Sbjct 1029 PTLAGQQSASQVRPLVMPGLSQG----VPGMP--AFSQPPAQQQIAGGNFAASNQGQAYERTPAQDMSYSYSGE 1096
Query 1080 --------------------------------------- 1079
Sbjct 1097 GVGAAFPGLPDSTDLVDSIIKSGPGDEWMQELDELFGNP 1135