Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14209
- Subject:
- XM_024452996.1
- Aligned Length:
- 3969
- Identities:
- 2719
- Gaps:
- 1248
Alignment
Query 1 ATGGTGCTCACGCTCGGAGAAAGTTGGCCGGTATTGGTGGGGAGGAGGTTTCTCAGTCTGTCCGCAGCCGACGG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CAGCGATGGCAGCCACGACAGCTGGGACGTGGAGCGCGTCGCCGAGTGGCCCTGGCTCTCCGGGACCATTCGAG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CTGTTTCCCACACCGACGTTACCAAGAAGGATCTGAAGGTGTGTGTGGAATTTGATGGGGAATCTTGGAGGAAA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 AGAAGATGGATAGAAGTCTACAGCCTTCTAAGGAGAGCATTTTTAGTAGAACATAATTTGGTTTTAGCTGAACG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 AAAGTCACCTGAAATTTCTGAACGAATTGTACAGTGGCCTGCAATAACGTACAAACCTCTGTTGGACAAAGCTG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 GTTTGGGATCCATAACTTCTGTTCGCTTTCTGGGAGATCAACAAAGAGTATTTCTTTCTAAAGACCTTTTGAAG 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 CCTATACAGGATGTAAACAGTCTTCGACTTTCTCTTACGGATAATCAGATTGTCAGTAAAGAATTTCAAGCTTT 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 GATTGTGAAGCATTTAGATGAAAGCCATCTTTTAAAAGGTGACAAAAACTTAGTTGGTTCAGAAGTAAAAATTT 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 ATAGCTTGGACCCATCTACTCAGTGGTTTTCAGCAACCGTTGTAAATGGAAACCCAGCATCAAAAACTCTTCAA 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 GTCAACTGTGAGGAGATTCCAGCACTGAAAATTGTTGATCCGTCACTGATTCATGTTGAAGTTGTACACGATAA 740
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 741 CCTTGTGACATGTGGTAATTCTGCAAGAATTGGAGCTGTAAAACGCAAGTCTTCTGAGAATAATGGAACCCTGG 814
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 815 TTTCCAAACAAGCAAAATCTTGCTCTGAGGCCTCTCCCAGTATGTGTCCTGTGCAGTCTGTACCTACAACAGTT 888
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -----------------------------------------ATGTGTCCTGTGCAGTCTGTACCTACAACAGTT 33
Query 889 TTTAAGGAGATACTGCTTGGCTGTACTGCAGCAACTCCACCTAGTAAGGACCCAAGACAGCAAAGTACTCCCCA 962
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 34 TTTAAGGAGATACTGCTTGGCTGTACTGCGGCAACTCCACCTAGTAAGGACCCAAGACAGCAAAGTACTCCCCA 107
Query 963 GGCTGCCAACTCTCCACCTAACCTTGGAGCAAAAATTCCTCAAGGATGTCATAAACAAAGTTTACCAGAGGAAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 108 GGCTGCCAACTCTCCACCTAACCTTGGAGCAAAAATTCCTCAAGGATGTCATAAACAAAGTTTACCAGAGGAAA 181
Query 1037 TTTCTTCCTGTCTAAATACAAAGTCTGAAGCTCTGAGAACAAAACCAGATGTCTGCAAAGCAGGGTTGCTCTCA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 182 TTTCTTCCTGTCTAAATACAAAGTCTGAAGCTCTGAGAACAAAACCAGATGTCTGCAAAGCAGGGTTGCTCTCA 255
Query 1111 AAGTCCTCTCAGATTGGAACTGGAGACTTGAAAATTCTGACTGAGCCAAAAGGCAGCTGTACTCAGCCTAAGAC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 256 AAGTCCTCTCAGATTGGAACTGGAGACTTGAAAATTCTGACTGAGCCAAAAGGCAGCTGTACTCAGCCTAAGAC 329
Query 1185 AAACACTGATCAGGAAAACAGATTGGAGTCTGTTCCACAAGCATTGACTGGCCTTCCTAAGGAGTGCTTACCTA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 330 AAACACTGATCAGGAAAACAGATTGGAGTCTGTTCCACAAGCATTGACTGGCCTTCCTAAGGAGTGCTTACCTA 403
Query 1259 CAAAGGCTTCTTCTAAGGCAGAATTGGAAATTGCCAATCCTCCTGAACTGCAGAAGCACCTAGAACATGCACCT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 404 CAAAGGCTTCTTCTAAGGCAGAATTGGAAATTGCCAATCCTCCTGAACTGCAGAAGCACCTAGAACATGCACCT 477
Query 1333 TCCCCATCGGATGTTTCAAATGCACCAGAAGTGAAAGCAGGTGTCAATAGTGATAGCCCTAATAACTGTTCAGG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 478 TCCCCATCGGATGTTTCAAATGCACCAGAAGTGAAAGCAGGTGTCAATAGTGATAGCCCTAATAACTGTTCAGG 551
Query 1407 AAAAAAGGTAGAACCTTCAGCTTTAGCTTGCCGATCACAGAATTTAAAGGAATCTTCAGTAAAAGTAGATAATG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 552 AAAAAAGGTAGAACCTTCAGCTTTAGCTTGCCGATCACAGAATTTAAAGGAATCTTCAGTAAAAGTAGATAATG 625
Query 1481 AAAGCTGTTGTTCAAGAAGCAACAATAAAATCCAGAATGCCCCATCCAGGAAGTCGGTTTTGACAGACCCAGCT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 626 AAAGCTGTTGTTCAAGAAGCAACAATAAAATCCAGAATGCCCCATCCAGGAAGTCGGTTTTGACAGACCCAGCT 699
Query 1555 AAACTCAAAAAGCTGCAACAGAGTGGCGAGGCCTTCGTACAGGATGATTCTTGTGTGAACATCGTGGCACAGTT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 700 AAACTCAAAAAGCTGCAACAGAGTGGCGAGGCCTTCGTACAGGATGATTCTTGTGTGAACATCGTGGCACAGTT 773
Query 1629 GCCTAAATGCCGAGAGTGTCGCTTGGACAGTCTCCGCAAGGATAAGGAGCAACAGAAGGACTCACCTGTGTTTT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 774 GCCTAAATGCCGAGAGTGTCGCTTGGACAGTCTCCGCAAGGATAAGGAGCAACAGAAGGACTCACCTGTGTTTT 847
Query 1703 GCCGCTTCTTTCACTTCAGGAGGTTACAATTCAACAAACATGGTGTGTTGCGGGTAGAAGGCTTCTTAACACCA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 848 GCCGCTTCTTTCACTTCAGGAGGTTACAATTCAACAAACATGGTGTGTTGCGGGTAGAAGGCTTCTTAACACCA 921
Query 1777 AACAAGTATGACAATGAAGCAATTGGCTTGTGGTTACCTTTAACCAAAAACGTTGTGGGGATTGATTTGGACAC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 922 AACAAGTATGACAATGAAGCAATTGGCTTGTGGTTACCTTTAACCAAAAACGTTGTGGGGATTGATTTGGACAC 995
Query 1851 AGCAAAGTACATCTTGGCCAACATTGGAGACCACTTCTGTCAAATGGTGATTTCTGAAAAGGAAGCTATGTCAA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 996 AGCAAAGTACATCTTGGCCAACATTGGAGACCACTTCTGTCAAATGGTGATTTCTGAAAAGGAAGCTATGTCAA 1069
Query 1925 CTATTGAGCCACACAGACAGGTTGCTTGGAAGCGAGCTGTCAAAGGTGTTCGAGAAATGTGTGATGTGTGCGAC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1070 CTATTGAGCCACACAGACAGGTTGCTTGGAAGCGAGCTGTCAAAGGTGTTCGAGAAATGTGTGATGTGTGCGAC 1143
Query 1999 ACCACCATCTTCAACCTGCACTGGGTGTGTCCTCGGTGTGGGTTTGGAGTATGTGTGGACTGCTACCGGATGAA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1144 ACCACCATCTTCAACCTGCACTGGGTGTGTCCTCGGTGTGGGTTTGGAGTATGTGTGGACTGCTACCGGATGAA 1217
Query 2073 GAGAAAGAATTGCCAACAGGGTGCTGCTTACAAGACTTTCTCTTGGCTAAAATGTGTGAAGAGTCAGATACATG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1218 GAGAAAGAATTGCCAACAGGGTGCTGCTTACAAGACTTTCTCTTGGCTAAAATGTGTGAAGAGTCAGATACATG 1291
Query 2147 AACCAGAGAACTTAATGCCCACACAGATCATTCCTGGAAAAGCACTCTATGATGTTGGAGACATTGTTCATTCT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1292 AACCAGAGAACTTAATGCCCACACAGATCATTCCTGGAAAAGCACTCTATGATGTTGGAGACATTGTTCATTCT 1365
Query 2221 GTAAGAGCGAAATGGGGAATAAAGGCAAACTGCCCTTGTTCAAACAGGCAATTCAAACTCTTTTCAAAGCCAGC 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1366 GTAAGAGCGAAATGGGGAATAAAGGCAAACTGCCCTTGTTCAAACAGGCAATTCAAACTCTTTTCAAAGCCAGC 1439
Query 2295 CTCAAAGGAAGACCTAAAACAGACTTCTTTAGCTGGAGAAAAACCGACTCTTGGTGCAGTGCTCCAGCAGAATC 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440 CTCAAAGGAAGACCTAAAACAGACTTCTTTAGCTGGAGAAAAACCGACTCTTGGTGCAGTGCTCCAGCAGAATC 1513
Query 2369 CCTCAGTGTTGGAGCCAGCAGCTGTGGGTGGGGAAGCAGCCTCCAAGCCAGCCGGCAGCATGAAGCCTGCCTGT 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1514 CCTCAGTGTTGGAGCCAGCAGCTGTGGGTGGGGAAGCAGCCTCCAAGCCAGCCGGCAGCATGAAGCCTGCCTGT 1587
Query 2443 CCAGCCAGCACATCTCCTCTAAACTGGCTGGCCGACCTAACCAGCGGGAATGTCAACAAGGAAAACAAGGAAAA 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1588 CCAGCCAGCACATCTCCTCTAAACTGGCTGGCCGACCTAACCAGCGGGAATGTCAACAAGGAAAACAAGGAAAA 1661
Query 2517 ACAACCAACAATGCCAATTTTAAAGAATGAAATCAAATGCCTTCCACCCCTCCCACCTTTAAGCAAATCCAGCA 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1662 ACAACCAACAATGCCAATTTTAAAGAATGAAATCAAATGCCTTCCACCCCTCCCACCTTTAAGCAAATCCAGCA 1735
Query 2591 CAGTCCTCCATACGTTTAACAGCACAATTTTGACACCCGTAAGCAACAACAATTCTGGTTTCCTCCGGAATCTC 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1736 CAGTCCTCCATACGTTTAACAGCACAATTTTGACACCCGTAAGCAACAACAATTCTGGTTTCCTCCGGAATCTC 1809
Query 2665 TTGAATTCTTCTACAGGAAAGACAGAAAATGGACTCAAGAATACACCAAAAATCCTTGATGACATCTTTGCCTC 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1810 TTGAATTCTTCTACAGGAAAGACAGAAAATGGACTCAAGAATACACCAAAAATCCTTGATGACATCTTTGCCTC 1883
Query 2739 TTTGGTGCAAAATAAGACGACTTCTGATTTATCTAAGAGGCCTCAAGGACTAACCATCAAGCCCAGCATTCTGG 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1884 TTTGGTGCAAAATAAGACGACTTCTGATTTATCTAAGAGGCCTCAAGGACTAACCATCAAGCCCAGCATTCTGG 1957
Query 2813 GCTTTGACACTCCTCACTATTGGCTTTGTGATAATCGCTTGCTGTGCTTGCAAGACCCCAACAATAAGAGCAAC 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1958 GCTTTGACACTCCTCACTATTGGCTTTGTGATAATCGCTTGCTGTGCTTGCAAGACCCCAACAATAAGAGCAAC 2031
Query 2887 TGGAATGTGTTTAGGGAGTGCTGGAAACAAGGGCAGCCAGTGATGGTGTCTGGAGTGCATCATAAATTGAACTC 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2032 TGGAATGTGTTTAGGGAGTGCTGGAAACAAGGGCAGCCAGTGATGGTGTCTGGAGTGCATCATAAATTGAACTC 2105
Query 2961 TGAACTTTGGAAACCTGAATCCTTCAGGAAAGAGTTTGGTGAGCAGGAAGTAGACCTAGTTAATTGTAGGACCA 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2106 TGAACTTTGGAAACCTGAATCCTTCAGGAAAGAGTTTGGTGAGCAGGAAGTAGACCTAGTTAATTGTAGGACCA 2179
Query 3035 ATGAAATCATCACAGGAGCCACAGTAGGAGACTTCTGGGATGGATTTGAAGATGTTCCAAATCGTTTGAAAAAT 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2180 ATGAAATCATCACAGGAGCCACAGTAGGAGACTTCTGGGATGGATTTGAAGATGTTCCAAATCGTTTGAAAAAT 2253
Query 3109 GAAAAAGAACCAATGGTGTTGAAACTTAAGGACTGGCCACCAGGAGAAGATTTTAGAGATATGATGCCTTCCAG 3182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2254 GAAAAAGAACCAATGGTGTTGAAACTTAAGGACTGGCCACCAGGAGAAGATTTTAGAGATATGATGCCTTCCAG 2327
Query 3183 GTTTGATGATCTGATGGCCAACATTCCACTGCCCGAGTACACAAGGCGAGATGGCAAACTGAATTTGGCCTCTA 3256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2328 GTTTGATGATCTGATGGCCAACATTCCACTGCCCGAGTACACAAGGCGAGATGGCAAACTGAATTTGGCCTCTA 2401
Query 3257 GGCTGCCAAACTACTTTGTTCGGCCAGATCTGGGCCCCAAGATGTATAATGCTTATGGATTAATCACTCCTGAA 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2402 GGCTGCCAAACTACTTTGTTCGGCCAGATCTGGGCCCCAAGATGTATAATGCTTATGGATTAATCACTCCTGAA 2475
Query 3331 GATCGGAAATATGGAACAACAAATCTTCACTTAGATGTATCTGATGCAGCTAATGTCATGGTCTATGTGGGAAT 3404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2476 GATCGGAAATATGGAACAACAAATCTTCACTTAGATGTATCTGATGCAGCTAATGTCATGGTCTATGTGGGAAT 2549
Query 3405 TCCCAAAGGACAGTGTGAGCAAGAAGAAGAAGTCCTTAAGACCATCCAAGATGGAGATTCTGACGAACTCACAA 3478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2550 TCCCAAAGGACAGTGTGAGCAAGAAGAAGAAGTCCTTAAGACCATCCAAGATGGAGATTCTGACGAACTCACAA 2623
Query 3479 TAAAGCGATTTATTGAAGGAAAAGAGAAGCCAGGAGCACTGTGGCACATATATGCTGCAAAGGACACGGAGAAG 3552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2624 TAAAGCGATTTATTGAAGGAAAAGAGAAGCCAGGAGCACTGTGGCACATATATGCTGCAAAGGACACGGAGAAG 2697
Query 3553 ATAAGGGAATTTCTTAAAAAGATA-------------------------------------------------- 3576
|||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2698 ATAAGGGAATTTCTTAAAAAGGTATCAGAAGAGCAAGGTCAAGAAAACCCAGCAGACCACGATCCTATTCATGA 2771
Query 3577 -------------------------------------------------------------------------- 3576
Sbjct 2772 TCAAAGCTGGTATTTAGACCGATCATTAAGAAAACGTCTTCATCAAGAGTATGGAGTTCAAGGCTGGGCTATTG 2845
Query 3577 -------------------------------------------------------------------------- 3576
Sbjct 2846 TACAGTTTCTTGGGGATGTGGTGTTTATCCCGGCAGGAGCTCCACATCAGGCAAGAATCATTACTTTTTCTTTA 2919
Query 3577 -------------------------------------------------------------------------- 3576
Sbjct 2920 ATCTCTTTATGTCATGAACTTTTGGGTTTGTTACTGATATATTACTTGGTGTTTTTCAGGTTCATAACTTATAT 2993
Query 3577 -------------------------------------------------------------------------- 3576
Sbjct 2994 AGCTGCATCAAAGTGGCTGAAGATTTTGTTTCTCCAGAGCATGTTAAACACTGCTTCTGGCTTACTCAGGAATT 3067
Query 3577 ----------------------------------------------- 3576
Sbjct 3068 CCGATATCTGTCACAGACTCATACCAATCACGAAGATAAATTACAGG 3114
