Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14225
• Subject: NM_001256396.2
• Aligned Length: 1396
• Identities: 1111
• Gaps: 281

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAATTTTACTTTCGCTACCCAAAAGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAACGGCGCAATCTCGGC  74

Query    1  -------------------------------------------ATGGTCTTCGTGGGCTTTGGCTTCCTCATGG  31
                                                       |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCACTGCAACCTTCACCTCCCAGGCTTCCAGGACGTGCATGCCATGGTCTTCGTGGGCTTTGGCTTCCTCATGG  148

Query   32  TCTTCCTGCAGCGTTACGGCTTCAGCAGCGTGGGCTTCACCTTCCTCCTGGCCGCCTTTGCCCTGCAGTGGTCC  105
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCTTCCTGCAGCGTTACGGCTTCAGCAGCGTGGGCTTCACCTTCCTCCTGGCCGCCTTTGCCCTGCAGTGGTCC  222

Query  106  ACACTGGTCCAGGGCTTTCTCCACTCCTTCCACGGTGGCCACATCCATGTTGGCGTGGAGAGCATGATCAATGC  179
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACACTGGTCCAGGGCTTTCTCCACTCCTTCCACGGTGGCCACATCCATGTTGGCGTGGAGAGCATGATCAATGC  296

Query  180  TGACTTTTGTGCGGGGGCCGTGCTCATCTCCTTTGGTGCCGACCTGGGCAAGACCGGGCCTACCCAGCTGCTGC  253
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGACTTTTGTGCGGGGGCCGTGCTCATCTCCTTTGGTGCCGTCCTGGGCAAGACCGGGCCTACCCAGCTGCTGC  370

Query  254  TCATGGCCCTGCTGGAGGTGGTGCTGTTTGGCATCAATGAGTTTGTGCTCCTTCATCTCCTGGGGGTGAGAGTC  327
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
Sbjct  371  TCATGGCCCTGCTGGAGGTGGTGCTGTTTGGCATCAATGAGTTTGTGCTCCTTCATCTCCTGGG----------  434

Query  328  TGGGGAGGGATGGAGTCGGGGGTGGGGGGTGGTCAAGGTCAGCCTCTGAGCCAGGAGCGTGGGGGTGGGGGCGG  401
                                                                                      
Sbjct  435  --------------------------------------------------------------------------  434

Query  402  GGTGCTGCCTCTCACCCCACCTCCCCAGGTGAGAGATGCCGGAGGCTCCATGACTATCCACACCTTTGGTGCCT  475
                                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  435  ---------------------------GGTGAGAGATGCCGGAGGCTCCATGACTATCCACACCTTTGGTGCCT  481

Query  476  ACTTCGGGCTCGTCCTTTCGCGGGTTCTGTACAGGCCCCAGCTGGAGAAGAGCAAGCACCGCCAGGGCTCCGTC  549
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  482  ACTTCGGGCTCGTCCTTTCGCGGGTTCTGTACAGGCCCCAGCTGGAGAAGAGCAAGCACCGCCAGGGCTCCGTC  555

Query  550  TACCATTCAGACCTCTTCGCCATGATTGGGACCATCTTCCTGTGGATCTTCTGGCCTAGCTTCAATGCTGCACT  623
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  556  TACCATTCAGACCTCTTCGCCATGATTGGGACCATCTTCCTGTGGATCTTCTGGCCTAGCTTCAATGCTGCACT  629

Query  624  CACATCGCTGGGGGCTGGGCAGCATCGGACGGCCCTCAACACATACTACTCCCTGGCTGCCAGCACCCTTGGCA  697
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  630  CACAGCGCTGGGGGCTGGGCAGCATCGGACGGCCCTCAACACATACTACTCCCTGGCTGCCAGCACCCTTGGCA  703

Query  698  CCTTTGCCTTGTCAGCCCTTGTAGGGGAAGATGGGAGGCTTGACATGGTCCACATCCAAAATGCAGCGCTGGCT  771
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  704  CCTTTGCCTTGTCAGCCCTTGTAGGGGAAGATGGGAGGCTTGACATGGTCCACATCCAAAATGCAGCGCTGGCT  777

Query  772  GGAGGGGTTGTGGTGGGGACCTCAAGTGAAATGATGCTGACACCCTTTGGGGCTCTGGCAGCTGGCTTCTTGGC  845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  778  GGAGGGGTTGTGGTGGGGACCTCAAGTGAAATGATGCTGACACCCTTTGGGGCTCTGGCAGCTGGCTTCTTGGC  851

Query  846  TAGGACTGTCTCCACGCTGGGGTACAAGTTCTTCACGCCCATCCTTGAATCAAAATTCAAAGTCCAAGACACAT  919
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  852  TGGGACTGTCTCCACGCTGGGGTACAAGTTCTTCACGCCCATCCTTGAATCAAAATTCAAAGTCCAAGACACAT  925

Query  920  GTGGAGTCCACAACCTCCATGGGATGCCGGGGGTCCTGGGGGCCCTCCTGGGGGTCCTTGTGGCTGGACTTGCC  993
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  926  GTGGAGTCCACAACCTCCATGGGATGCCGGGGGTCCTGGGGGCCCTCCTGGGGGTCCTTGTGGCTGGACTTGCC  999

Query  994  ACCCATGAAGCTTACGGAGATGGCCTGGAGAGTGTGTTTCCACTCATAGCCGAGGGCCAGCGCAGTGCCACGTC  1067
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1000  ACCCATGAAGCTTACGGAGATGGCCTGGAGAGTGTGTTTCCACTCATAGCCGAGGGCCAGCGCAGTGCCACGTC  1073

Query 1068  ACAGGCCATGCACCAGCTCTTCGGGCTGTTTGTCACACTGATGTTTGCCTCTGTGGGCGGGGGCCTTGGAGGGC  1141
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1074  ACAGGCCATGCACCAGCTCTTCGGGCTGTTTGTCACACTGATGTTTGCCTCTGTGGGCGGGGGCCTTGGAGGGC  1147

Query 1142  TCCTGCTGAAGCTACCCTTTCTGGACTCCCCCCCCAGACTCCCAGCGCTACGAGGACCAAGTTCACTGGCAGGT  1215
            ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1148  TCCTGCTGAAGCTACCCTTTCTGGACT-CCCCCCCAGACTCCCAGCACTACGAGGACCAAGTTCACTGGCAGGT  1220

Query 1216  GCCTGGCGAGCA----------------------------------------------------  1227
            ||||||||||||                                                    
Sbjct 1221  GCCTGGCGAGCATGAGGATAAAGCCCAGAGACCTCTGAGGGTGGAGGAGGCAGACACTCAGGCC  1284