Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14225
• Subject: NM_021375.3
• Aligned Length: 1480
• Identities: 961
• Gaps: 368

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCCCGCGTTCCCCGCCACCGGCGCCTGGTCCTGCCGCTGCTGTGCCTGCTCTTCCAAGGCGCCACTGCCCT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCTCTTTGCTATCTTTGTCCGGTACAACCACGAAACCGACGCTGCCCTGTGGCACTGGGGCAACCACAGTAACG  148

Query    1  --------------------------------------------------ATGGTCTTCGTGGGCTTTGGCTTC  24
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGACAACGAGTTTTACTTTCGCTACCCAAGCTTCCAGGATGTGCACGTCATGGTCTTCGTGGGCTTTGGCTTC  222

Query   25  CTCATGGTCTTCCTGCAGCGTTACGGCTTCAGCAGCGTGGGCTTCACCTTCCTCCTGGCC-GCCTTTGCCCTGC  97
            |||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||.||||| ||| |..||||||
Sbjct  223  CTCATGGTCTTTCTACAGCGGTACGGCTTCAGCAGTGTGGGCTTTACCTTCCTCGTGGCCAGCC-TCACCCTGC  295

Query   98  AGTGGTCCACACTGGTCCAGGGCTTTCTCCACTCCTTCCACGGTGGCCACATCCATGTTGGCGTGGAGAGCATG  171
            |||||.||||||||.||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..||
Sbjct  296  AGTGGGCCACACTGCTCCAAGGCTTCCTCCACTCTTTCCACGGTGGCCACATCCATGTTGGCGTGGAGAGTTTG  369

Query  172  ATCAATGCTGACTTTTGTGCGGGGGCCGTGCTCATCTCCTTTGGTGCCGACCTGGGCAAGACCGGGCCTACCCA  245
            |||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.|..|||||||||||.|||||..||||
Sbjct  370  ATCAACGCTGACTTCTGCGCGGGAGCTGTGCTCATCTCTTTCGGGGCTGTTCTGGGCAAGACTGGGCCAGCCCA  443

Query  246  GCTGCTGCTCATGGCCCTGCTGGAGGTGGTGCTGTTTGGCATCAATGAGTTTGTGCTCCTTCA-TCTCCTGGGG  318
            |||||||||.|||||.||.|||||||..|||||||||.||.||||.||||||.|.||.| ||| ||||||||| 
Sbjct  444  GCTGCTGCTAATGGCTCTACTGGAGGCAGTGCTGTTTAGCGTCAACGAGTTTATACTAC-TCAGTCTCCTGGG-  515

Query  319  GTGAGAGTCTGGGGAGGGATGGAGTCGGGGGTGGGGGGTGGTCAAGGTCAGCCTCTGAGCCAGGAGCGTGGGGG  392
                                                                                      
Sbjct  516  --------------------------------------------------------------------------  515

Query  393  TGGGGGCGGGGTGCTGCCTCTCACCCCACCTCCCCAGGTGAGAGATGCCGGAGGCTCCATGACTATCCACACCT  466
                                                ||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|
Sbjct  516  ------------------------------------GGTGAGAGATGCTGGAGGGTCCATGACAATTCACACAT  553

Query  467  TTGGTGCCTACTTCGGGCTCGTCCTTTCGCGGGTTCTGTACAGGCCCCAGCTGGAGAAGAGCAAGCACCGCCAG  540
            ||||.||||||||||||||..||||.||..||||.||.|||||..||||||||||||||||||.|||.||||||
Sbjct  554  TTGGGGCCTACTTCGGGCTGTTCCTCTCATGGGTCCTCTACAGATCCCAGCTGGAGAAGAGCAGGCATCGCCAG  627

Query  541  GGCTCCGTCTACCATTCAGACCTCTTCGCCATGATTGGGACCATCTTCCTGTGGATCTTCTGGCCTAGCTTCAA  614
            .||||.||||||.|.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||.|.||||||||.||||||||
Sbjct  628  AGCTCTGTCTACAACTCTGACCTCTTTGCCATGATCGGGACCATCTTCCTGTGGGTTTTCTGGCCCAGCTTCAA  701

Query  615  TGCTGCACTCACATCGCTGGGGGCTGGGCAGCATCGGACGGCCCTCAACACATACTACTCCCTGGCTGCCAGCA  688
            ..|.||.|..|||.|||||||||.|||||||||||||||.|...|||||||||||||.||.||..|.||.||||
Sbjct  702  CTCCGCGCCGACAGCGCTGGGGGATGGGCAGCATCGGACCGTGGTCAACACATACTATTCACTCACCGCAAGCA  775

Query  689  CCCTTGGCACCTTTGCCTTGTCAGCCCTTGT-AGGGGAAGATGGGAGGCTTGACATGGTCCACATCCAAAATGC  761
            ||||..|.||.||.||||||||||||||||| ||.|| ||||||..|.||.||||||||||||.||||.||.||
Sbjct  776  CCCTCAGTACTTTCGCCTTGTCAGCCCTTGTCAGTGG-AGATGGACGACTGGACATGGTCCACGTCCAGAACGC  848

Query  762  AGCGCTGGCTGGAGGGGTTGTGGTGGGGACCTCAAGTGAAATGATGCTGACACCCTTTGGGGCTCTGGCAGCTG  835
            |||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  849  AGCACTGGCTGGAGGTGTTGTGGTGGGGACATCAAGTGAGATGATGCTGACACCCTTTGGGGCGCTGGCAGCTG  922

Query  836  GCTTCTTGGCTAGGACTGTCTCCACGCTGGGGTACAAGTTCTTCACGCCCATCCTTGAATCAAAATTCAAAGTC  909
            |||||.|||||.|||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|.|||.|||.|.
Sbjct  923  GCTTCCTGGCTGGGACTGTCTCCACACTGGGGTATAAGTTCTTTACGCCTATCCTTGAATCCAGATTTAAACTG  996

Query  910  CAAGACACATGTGGAGTCCACAACCTCCATGGGATGCCGGGGGTCCTGGGGGCCCTCCTGGGGGTCCTTGTGGC  983
            ||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.|||.|.|||||
Sbjct  997  CAAGACACATGTGGTGTTCACAACCTCCATGGGATGCCAGGGGTCCTGGGGGCCATCCTGGGAGTCGTAGTGGC  1070

Query  984  TGGACTTGCCACCCATGAAGCTTACGGAGATGGCCTGGAGAGTGTGTTTCCACTCATAGCCGAGGGCCAGCGCA  1057
            ||.|||.||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||.|||||.|
Sbjct 1071  TGCACTGGCCACCCACGAAGCTTATGGAGATGGCCTGCAGAGTGTGTTTCCACTCATAGCCAAGGGTCAGCGGA  1144

Query 1058  GTGCCACGTCACAGGCCATGCACCAGCTCTTCGGGCTGTTTGTCACACTGATGTTTGCCTCTGTGGGCGGGGGC  1131
            ||||||||||.||||||.||.|.|||||||||||..||||||||||||||.||||||||||||||||.||..||
Sbjct 1145  GTGCCACGTCTCAGGCCGTGTATCAGCTCTTCGGAATGTTTGTCACACTGGTGTTTGCCTCTGTGGGTGGCAGC  1218

Query 1132  CTTGGAGGGCTCCTGCTGAAGCTACCCTTTCTGGACTCCCCCCCCAGACTCCCAGCGCTACGAGGACCAAGTTC  1205
            ||||||||||||||||||..|||.||||||||||||| ||||.|||||||||||..|||.|||||||||.|||.
Sbjct 1219  CTTGGAGGGCTCCTGCTGCGGCTCCCCTTTCTGGACT-CCCCTCCAGACTCCCAATGCTTCGAGGACCAGGTTT  1291

Query 1206  ACTGGCAGGTGCCTGGCGAGCA----------------------------------------------------  1227
            |||||.||||.|||||.|||||                                                    
Sbjct 1292  ACTGGGAGGTACCTGGAGAGCAGGAGACTGAGACCCAGAGGCCTCTGAGGGGTGGGGAGTCAGACACCCGGGCC  1365