Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14225
• Subject: XM_011509799.2
• Aligned Length: 1398
• Identities: 982
• Gaps: 369

Alignment

Query    1  ATGGTCTTCGTGGGCTTTGGCTTCCTCA---------TGG-----------------------------TC---  33
            |||||    |.||.|...||||| ||||         |||                             ||   
Sbjct    1  ATGGT----GGGGTCAGGGGCTT-CTCAGAGGAGGCCTGGAGTGGAAGGAGGAGTGAGAGATGAAGCCCTCACC  69

Query   34  -TTCCTGCAGCGTTAC---GGCTTCA------GCAGCGTGGG-----------------------CTTCACCTT  74
             |||||.|||.|.|||   |||  ||      ||||   |||                       ||||||..|
Sbjct   70  ATTCCTTCAGAGCTACCAGGGC--CAGAGGAGGCAG---GGGAAGGACCAAGGGCCTTGACATCACTTCACAAT  138

Query   75  CC---------TCCTGGCC---GCCTTTGCCCTGCAGTGGTCCACACTGGTCC---------AGGGCT------  121
            ||         .|.|||.|   ||||.| ||.|  ||||.|..|||.||||.|         .|||||      
Sbjct  139  CCAAAAGGAAACCATGGACTAAGCCTCT-CCAT--AGTGTTTGACAGTGGTTCCTGGAGGAAGGGGCTATCTGG  209

Query  122  ---TTCTCCA----CT-CCTTCCACGGTGGCCACATCCATGTTGGCGTGGAGAGCATGATCAATGCTGACTTTT  187
               .||||||    || |||  |||.|..|||||        ||.||         |..||..|||||.| |||
Sbjct  210  TTCATCTCCAAAGCCTGCCT--CACAGGCGCCAC--------TGCCG---------TCCTCTTTGCTGTC-TTT  263

Query  188  GTGCGGGGGCCGTGCT-CATCTCCTTTGGTGCCGACCTGGGCAAGACCGGGCCTACCCAGCTGCTGCTCATGGC  260
            ||.|         ||| ||               |||   .|||.||||     ||   ||||| .||| ||||
Sbjct  264  GTCC---------GCTACA---------------ACC---ACAAAACCG-----AC---GCTGC-CCTC-TGGC  300

Query  261  -CCTGCTGGAG--------GTGGTGCTGTTTGGCATCAATGAGTTTGTGCTCCTTCATCTCCTGGGGGTGAGAG  325
             ||    ||||        ||...||.|       .||||||.|||    |.|||                   
Sbjct  301  ACC----GGAGCAACCACAGTAACGCGG-------ACAATGAATTT----TACTT-------------------  340

Query  326  TCTGGGGAGGGATGGAGTCGGGGGTGGGGGGTGGTCAAGGTCAGCCTCTGAGCCAGGAGCGTGGGGGTGGGGGC  399
                             |||                                                      
Sbjct  341  -----------------TCG------------------------------------------------------  343

Query  400  GGGGTGCTGCCTCTCACCCCACCTCCCCAGGTGAGAGATGCCGGAGGCTCCATGACTATCCACACCTTTGGTGC  473
                                  ||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  344  ----------------------CTACCCAAGTGAGAGATGCCGGAGGCTCCATGACTATCCACACCTTTGGTGC  395

Query  474  CTACTTCGGGCTCGTCCTTTCGCGGGTTCTGTACAGGCCCCAGCTGGAGAAGAGCAAGCACCGCCAGGGCTCCG  547
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  396  CTACTTCGGGCTCGTCCTTTCGCGGGTTCTGTACAGGCCCCAGCTGGAGAAGAGCAAGCACCGCCAGGGCTCCG  469

Query  548  TCTACCATTCAGACCTCTTCGCCATGATTGGGACCATCTTCCTGTGGATCTTCTGGCCTAGCTTCAATGCTGCA  621
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  470  TCTACCATTCAGACCTCTTCGCCATGATTGGGACCATCTTCCTGTGGATCTTCTGGCCTAGCTTCAATGCTGCA  543

Query  622  CTCACATCGCTGGGGGCTGGGCAGCATCGGACGGCCCTCAACACATACTACTCCCTGGCTGCCAGCACCCTTGG  695
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  544  CTCACAGCGCTGGGGGCTGGGCAGCATCGGACGGCCCTCAACACATACTACTCCCTGGCTGCCAGCACCCTTGG  617

Query  696  CACCTTTGCCTTGTCAGCCCTTGTAGGGGAAGATGGGAGGCTTGACATGGTCCACATCCAAAATGCAGCGCTGG  769
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  618  CACCTTTGCCTTGTCAGCCCTTGTAGGGGAAGATGGGAGGCTTGACATGGTCCACATCCAAAATGCAGCGCTGG  691

Query  770  CTGGAGGGGTTGTGGTGGGGACCTCAAGTGAAATGATGCTGACACCCTTTGGGGCTCTGGCAGCTGGCTTCTTG  843
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  692  CTGGAGGGGTTGTGGTGGGGACCTCAAGTGAAATGATGCTGACACCCTTTGGGGCTCTGGCAGCTGGCTTCTTG  765

Query  844  GCTAGGACTGTCTCCACGCTGGGGTACAAGTTCTTCACGCCCATCCTTGAATCAAAATTCAAAGTCCAAGACAC  917
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  766  GCTGGGACTGTCTCCACGCTGGGGTACAAGTTCTTCACGCCCATCCTTGAATCAAAATTCAAAGTCCAAGACAC  839

Query  918  ATGTGGAGTCCACAACCTCCATGGGATGCCGGGGGTCCTGGGGGCCCTCCTGGGGGTCCTTGTGGCTGGACTTG  991
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  840  ATGTGGAGTCCACAACCTCCATGGGATGCCGGGGGTCCTGGGGGCCCTCCTGGGGGTCCTTGTGGCTGGACTTG  913

Query  992  CCACCCATGAAGCTTACGGAGATGGCCTGGAGAGTGTGTTTCCACTCATAGCCGAGGGCCAGCGCAGTGCCACG  1065
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  914  CCACCCATGAAGCTTACGGAGATGGCCTGGAGAGTGTGTTTCCACTCATAGCCGAGGGCCAGCGCAGTGCCACG  987

Query 1066  TCACAGGCCATGCACCAGCTCTTCGGGCTGTTTGTCACACTGATGTTTGCCTCTGTGGGCGGGGGCCTTGGAGG  1139
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  988  TCACAGGCCATGCACCAGCTCTTCGGGCTGTTTGTCACACTGATGTTTGCCTCTGTGGGCGGGGGCCTTGGAGG  1061

Query 1140  GCTCCTGCTGAAGCTACCCTTTCTGGACTCCCCCCCCAGACTCCCAGCGCTACGAGGACCAAGTTCACTGGCAG  1213
            ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1062  GCTCCTGCTGAAGCTACCCTTTCTGGACT-CCCCCCCAGACTCCCAGCACTACGAGGACCAAGTTCACTGGCAG  1134

Query 1214  GTGCCTGGCGAGCA----------------------------------------------------  1227
            ||||||||||||||                                                    
Sbjct 1135  GTGCCTGGCGAGCATGAGGATAAAGCCCAGAGACCTCTGAGGGTGGAGGAGGCAGACACTCAGGCC  1200