Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14225
• Subject: XM_017001857.1
• Aligned Length: 1448
• Identities: 1050
• Gaps: 385

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCCGGGTCTCCTAGCCGCGCCGCGGGCCGGCGACTGCAGCTTCCCCTGCTGTGCCTCTTCCTCCAGGGCGC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CACTGCCGTCCTCTTTGCTGTCTTTGTCCGCTACAACCACAAAACCGACGCTGCCCTCTGGCACCGGAGCAACC  148

Query    1  -----------------------------------------------------------ATGGTCTTCGTGGGC  15
                                                                       |||||||||||||||
Sbjct  149  ACAGTAACGCGGACAATGAATTTTACTTTCGCTACCCAAGCTTCCAGGACGTGCATGCCATGGTCTTCGTGGGC  222

Query   16  TTTGGCTTCCTCATGGTCTTCCTGCAGCGTTACGGCTTCAGCAGCGTGGGCTTCACCTTCCTCCTGGCCGCCTT  89
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTTGGCTTCCTCATGGTCTTCCTGCAGCGTTACGGCTTCAGCAGCGTGGGCTTCACCTTCCTCCTGGCCGCCTT  296

Query   90  TGCCCTGCAGTGGTCCACACTGGTCCAGGGCTTTCTCCACTCCTTCCACGGTGGCCACATCCATGTTGGCGTGG  163
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCCCTGCAGTGGTCCACACTGGTCCAGGGCTTTCTCCACTCCTTCCACGGTGGCCACATCCATGTTGGCGTGG  370

Query  164  AGAGCATGATCAATGCTGACTTTTGTGCGGGGGCCGTGCTCATCTCCTTTGGTGCCGACCTGGGCAAGACCGGG  237
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  371  AGAGCATGATCAATGCTGACTTTTGTGCGGGGGCCGTGCTCATCTCCTTTGGTGCCGTCCTGGGCAAGACCGGG  444

Query  238  CCTACCCAGCTGCTGCTCATGGCCCTGCTGGAGGTGGTGCTGTTTGGCATCAATGAGTTTGTGCTCCTTCATCT  311
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCTACCCAGCTGCTGCTCATGGCCCTGCTGGAGGTGGTGCTGTTTGGCATCAATGAGTTTGTGCTCCTTCATCT  518

Query  312  CCTGGGGGTGAGAGTCTGGGGAGGGATGGAGTCGGGGGTGGGGGGTGGTCAAGGTCAGCCTCTGAGCCAGGAGC  385
            ||||||                                                                    
Sbjct  519  CCTGGG--------------------------------------------------------------------  524

Query  386  GTGGGGGTGGGGGCGGGGTGCTGCCTCTCACCCCACCTCCCCAGGTGAGAGATGCCGGAGGCTCCATGACTATC  459
                                                       |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  525  -------------------------------------------GGTGAGAGATGCCGGAGGCTCCATGACTATC  555

Query  460  CACACCTTTGGTGCCTACTTCGGGCTCGTCCTTTCGCGGGTTCTGTACAGGCCCCAGCTGGAGAAGAGCAAGCA  533
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  556  CACACCTTTGGTGCCTACTTCGGGCTCGTCCTTTCGCGGGTTCTGTACAGGCCCCAGCTGGAGAAGAGCAAGCA  629

Query  534  CCGCCAGGGCTCCGTCTACCATTCAGACCTCTTCGCCATGATTGGGACCATCTTCCTGTGGATCTTCTGGCCTA  607
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  630  CCGCCAGGGCTCCGTCTACCATTCAGACCTCTTCGCCATGATTGGGACCATCTTCCTGTGGATCTTCTGGCCTA  703

Query  608  GCTTCAATGCTGCACTCACATCGCTGGGGGCTGGGCAGCATCGGACGGCCCTCAACACATACTACTCCCTGGCT  681
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  704  GCTTCAATGCTGCACTCACAGCGCTGGGGGCTGGGCAGCATCGGACGGCCCTCAACACATACTACTCCCTGGCT  777

Query  682  GCCAGCACCCTTGGCACCTTTGCCTTGTCAGCCCTTGTAGGGGAAGATGGGAGGCTTGACATGGTCCACATCCA  755
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  778  GCCAGCACCCTTGGCACCTTTGCCTTGTCAGCCCTTGTAGGGGAAGATGGGAGGCTTGACATGGTCCACATCCA  851

Query  756  AAATGCAGCGCTGGCTGGAGGGGTTGTGGTGGGGACCTCAAGTGAAATGATGCTGACACCCTTTGGGGCTCTGG  829
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  852  AAATGCAGCGCTGGCTGGAGGGGTTGTGGTGGGGACCTCAAGTGAAATGATGCTGACACCCTTTGGGGCTCTGG  925

Query  830  CAGCTGGCTTCTTGGCTAGGACTGTCTCCACGCTGGGGTACAAGTTCTTCACGCCCATCCTTGAATCAAAATTC  903
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  926  CAGCTGGCTTCTTGGCTGGGACTGTCTCCACGCTGGGGTACAAGTTCTTCACGCCCATCCTTGAATCAAAATTC  999

Query  904  AAAGTCCAAGACACATGTGGAGTCCACAACCTCCATGGGATGCCGGGGGTCCTGGGGGCCCTCCTGGGGGTCCT  977
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1000  AAAGTCCAAGACACATGTGGAGTCCACAACCTCCATGGGATGCCGGGGGTCCTGGGGGCCCTCCTGGGGGTCCT  1073

Query  978  TGTGGCTGGACTTGCCACCCATGAAGCTTACGGAGATGGCCTGGAGAGTGTGTTTCCACTCATAGCCGAGGGCC  1051
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1074  TGTGGCTGGACTTGCCACCCATGAAGCTTACGGAGATGGCCTGGAGAGTGTGTTTCCACTCATAGCCGAGGGCC  1147

Query 1052  AGCGCAGTGCCACGTCACAGGCCATGCACCAGCTCTTCGGGCTGTTTGTCACACTGATGTTTGCCTCTGTGGGC  1125
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1148  AGCGCAGTGCCACGTCACAGGCCATGCACCAGCTCTTCGGGCTGTTTGTCACACTGATGTTTGCCTCTGTGGGC  1221

Query 1126  GGGGGCCTTGGAGGGCTCCTGCTGAAGCTACCCTTTCTGG------------ACTCCCCCCCCAGACTCCCAGC  1187
            ||||||||||||||..|..|..||      .||||.|.||            ||||                  
Sbjct 1222  GGGGGCCTTGGAGGAATAATATTG------GCCTTGCAGGGTTGTTGTGATTACTC------------------  1271

Query 1188  GCTACGAGG--ACCAAGTTCACTGGCAGGTGCCTGGCGAGCA  1227
                  |||  |.||||   ||                    
Sbjct 1272  ------AGGAAAGCAAG---AC--------------------  1284