Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14225
• Subject: XM_017001859.1
• Aligned Length: 1279
• Identities: 806
• Gaps: 458

Alignment

Query    1  ATGGTCTTCGTGGGCTTTGGCTTCCTCATGGTCTTCCTGCAGCGTTACGGCTTCAGCAGCGTGGGCTTCACCTT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCTCCTGGCCGCCTTTGCCCTGCAGTGGTCCACACTGGTCCAGGGCTTTCTCCACTCCTTCCACGGTGGCCACA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TCCATGTTGGCGTGGAGAGCATGATCAATGCTGACTTTTGTGCGGGGGCCGTGCTCATCTCCTTTGGTGCCGAC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CTGGGCAAGACCGGGCCTACCCAGCTGCTGCTCATGGCCCTGCTGGAGGTGGTGCTGTTTGGCATCAATGAGTT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TGTGCTCCTTCATCTCCTGGGGGTGAGAGTCTGGGGAGGGATGGAGTCGGGGGTGGGGGGTGGTCAAGGTCAGC  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CTCTGAGCCAGGAGCGTGGGGGTGGGGGCGGGGTGCTGCCTCTCACCCCACCTCCCCAGGTGAGAGATGCCGGA  444
                                               .||..|.|.||.....||.||||.|||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------------------ATGAATTTTACTTTCGCTACCCAAGTGAGAGATGCCGGA  39

Query  445  GGCTCCATGACTATCCACACCTTTGGTGCCTACTTCGGGCTCGTCCTTTCGCGGGTTCTGTACAGGCCCCAGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   40  GGCTCCATGACTATCCACACCTTTGGTGCCTACTTCGGGCTCGTCCTTTCGCGGGTTCTGTACAGGCCCCAGCT  113

Query  519  GGAGAAGAGCAAGCACCGCCAGGGCTCCGTCTACCATTCAGACCTCTTCGCCATGATTGGGACCATCTTCCTGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  114  GGAGAAGAGCAAGCACCGCCAGGGCTCCGTCTACCATTCAGACCTCTTCGCCATGATTGGGACCATCTTCCTGT  187

Query  593  GGATCTTCTGGCCTAGCTTCAATGCTGCACTCACATCGCTGGGGGCTGGGCAGCATCGGACGGCCCTCAACACA  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  188  GGATCTTCTGGCCTAGCTTCAATGCTGCACTCACAGCGCTGGGGGCTGGGCAGCATCGGACGGCCCTCAACACA  261

Query  667  TACTACTCCCTGGCTGCCAGCACCCTTGGCACCTTTGCCTTGTCAGCCCTTGTAGGGGAAGATGGGAGGCTTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  262  TACTACTCCCTGGCTGCCAGCACCCTTGGCACCTTTGCCTTGTCAGCCCTTGTAGGGGAAGATGGGAGGCTTGA  335

Query  741  CATGGTCCACATCCAAAATGCAGCGCTGGCTGGAGGGGTTGTGGTGGGGACCTCAAGTGAAATGATGCTGACAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  336  CATGGTCCACATCCAAAATGCAGCGCTGGCTGGAGGGGTTGTGGTGGGGACCTCAAGTGAAATGATGCTGACAC  409

Query  815  CCTTTGGGGCTCTGGCAGCTGGCTTCTTGGCTAGGACTGTCTCCACGCTGGGGTACAAGTTCTTCACGCCCATC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  410  CCTTTGGGGCTCTGGCAGCTGGCTTCTTGGCTGGGACTGTCTCCACGCTGGGGTACAAGTTCTTCACGCCCATC  483

Query  889  CTTGAATCAAAATTCAAAGTCCAAGACACATGTGGAGTCCACAACCTCCATGGGATGCCGGGGGTCCTGGGGGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  484  CTTGAATCAAAATTCAAAGTCCAAGACACATGTGGAGTCCACAACCTCCATGGGATGCCGGGGGTCCTGGGGGC  557

Query  963  CCTCCTGGGGGTCCTTGTGGCTGGACTTGCCACCCATGAAGCTTACGGAGATGGCCTGGAGAGTGTGTTTCCAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  558  CCTCCTGGGGGTCCTTGTGGCTGGACTTGCCACCCATGAAGCTTACGGAGATGGCCTGGAGAGTGTGTTTCCAC  631

Query 1037  TCATAGCCGAGGGCCAGCGCAGTGCCACGTCACAGGCCATGCACCAGCTCTTCGGGCTGTTTGTCACACTGATG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  632  TCATAGCCGAGGGCCAGCGCAGTGCCACGTCACAGGCCATGCACCAGCTCTTCGGGCTGTTTGTCACACTGATG  705

Query 1111  TTTGCCTCTGTGGGCGGGGGCCTTGGAGGGCTCCTGCTGAAGCTACCCTTTCTGGACTCCCCCCCCAGACTCCC  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  706  TTTGCCTCTGTGGGCGGGGGCCTTGGAGGGCTCCTGCTGAAGCTACCCTTTCTGGACT-CCCCCCCAGACTCCC  778

Query 1185  AGCGCTACGAGGACCAAGTTCACTGGCAGGTGCCTGGCGAGCA-------------------------------  1227
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct  779  AGCACTACGAGGACCAAGTTCACTGGCAGGTGCCTGGCGAGCATGAGGATAAAGCCCAGAGACCTCTGAGGGTG  852

Query 1228  ---------------------  1227
                                 
Sbjct  853  GAGGAGGCAGACACTCAGGCC  873