Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14276
• Subject: XM_011540181.3
• Aligned Length: 1635
• Identities: 1529
• Gaps: 105

Alignment

Query    1  ATGGCGCAGGGTTTCGCAGTGGGCTTCGACCCACTGGGCCTAGGAGACCTGAGCTCCGGCTCTCTGAGCTCCCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGCAGGGTTTCGCAGTGGGCTTCGACCCACTGGGCCTAGGAGACCTGAGCTCCGGCTCTCTGAGCTCCCT  74

Query   75  CTCCTCCCGAGGCCACCTAGGCAGCGACTCAGGCTCCACCGCAACGCGATACCTGCTAAGGAAGCAACAACGGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCCTCCCGAGGCCACCTAGGCAGCGACTCAGGCTCCACCGCAACGCGATACCTGCTAAGGAAGCAACAACGGC  148

Query  149  TGCTGAACGGGCCCCCCCGCGGAATCCGAGCCTCATCGCCCATGGGACGCGTCATCCTCATCAACTCCCCCATC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCTGAACGGGCCCCCCCGCGGAATCCGAGCCTCATCGCCCATGGGACGCGTCATCCTCATCAACTCCCCCATC  222

Query  223  GAAGCCAACAGTGATGAAAGTGACATCATCCATTCAGTCCGGGTGGAGAAGAGTCCAGCAGGGAGGCTGGGCTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAGCCAACAGTGATGAAAGTGACATCATCCATTCAGTCCGGGTGGAGAAGAGTCCAGCAGGGAGGCTGGGCTT  296

Query  297  CAGCGTGCGCGGGGGCTCAGAGCATGGCCTGGGCATCTTCGTCAGCAAAGTGGAGGAAGGCAGCAGTGCAGAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAGCGTGCGCGGGGGCTCAGAGCATGGCCTGGGCATCTTCGTCAGCAAAGTGGAGGAAGGCAGCAGTGCAGAGC  370

Query  371  GGGCTGGCCTGTGCGTGGGGGACAAGATCACGGAGGTGAATGGGCTGAGCCTGGAGAGCACCACCATGGGTAGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGCTGGCCTGTGCGTGGGGGACAAGATCACGGAGGTGAATGGGCTGAGCCTGGAGAGCACCACCATGGGTAGC  444

Query  445  GCCGTAAAGGTGCTGACCAGCAGCAGCCGCCTGCACATGATGGTTCGGCGCATGGGCCGTGTGCCGGGCATCAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCGTAAAGGTGCTGACCAGCAGCAGCCGCCTGCACATGATGGTTCGGCGCATGGGCCGTGTGCCGGGCATCAA  518

Query  519  GTTCTCCAAGGAGAAGACCACGTGGGTGGATGTGGTGAATCGGCGCCTGGTAGTGGAGAAGTGCGGTTCAACAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTTCTCCAAGGAGAAGACCACGTGGGTGGATGTGGTGAATCGGCGCCTGGTAGTGGAGAAGTGCGGTTCAACAC  592

Query  593  CCTCCGACACCAGCTCAGAAGATGGTGTCCGGCGCATCGTCCACCTATACACAACCTCCGACGACTTCTGCCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCTCCGACACCAGCTCAGAAGATGGTGTCCGGCGCATCGTCCACCTATACACAACCTCCGACGACTTCTGCCTG  666

Query  667  GGCTTCAACATCCGTGGGGGCAAGGAGTTTGGCCTGGGCATCTATGTGTCCAAAGTGGACCATGGTGGGCTGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGCTTCAACATCCGTGGGGGCAAGGAGTTTGGCCTGGGCATCTATGTGTCCAAAGTGGACCATGGTGGGCTGGC  740

Query  741  CGAGGAGAATGGCATCAAGGTGGGGGACCAGGTCCTGGCAGCCAACGGTGTCAGGTTTGACGACATCAGCCACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGAGGAGAATGGCATCAAGGTGGGGGACCAGGTCCTGGCAGCCAACGGTGTCAGGTTTGACGACATCAGCCACA  814

Query  815  GCCAGGCCGTGGAGGTGCTGAAGGGCCAAACGCACATCATGCTGACCATCAAGGAGACCGGCCGGTATCCTGCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCCAGGCCGTGGAGGTGCTGAAGGGCCAAACGCACATCATGCTGACCATCAAGGAGACCGGCCGGTATCCTGCC  888

Query  889  TACAAGGAGATGGTTTCTGAGTACTGCTGGCTGGACCGACTGAGCAACGGGGTGCTGCAGCAGCTGTCCCCGGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TACAAGGAGATGGTTTCTGAGTACTGCTGGCTGGACCGACTGAGCAACGGGGTGCTGCAGCAGCTGTCCCCGGC  962

Query  963  CTCTGAGAGCAGCTCCAGCGTCTCTTCGTGCGCCTCCAGCGCCCCCTACAGCTCGGGCTCCCTGCCGTCGGACC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTCTGAGAGCAGCTCCAGCGTCTCTTCGTGCGCCTCCAGCGCCCCCTACAGCTCGGGCTCCCTGCCGTCGGACC  1036

Query 1037  GCATGGACATCTGCCTCGGGCAGGAGGAGCCCGGCAGCCGCGGCCCAGGCTGGGGGCGGGCGGACACAGCCATG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCATGGACATCTGCCTCGGGCAGGAGGAGCCCGGCAGCCGCGGCCCAGGCTGGGGGCGGGCGGACACAGCCATG  1110

Query 1111  CAGACGGAGCCCGATGCGGGAGGCCGGGTGGAGACCTGGTGCAGCGTGCGGCCCACAGTCATCCTCAGGGACAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGACGGAGCCCGATGCGGGAGGCCGGGTGGAGACCTGGTGCAGCGTGCGGCCCACAGTCATCCTCAGGGACAC  1184

Query 1185  CGCCATCCGCTCGGACGGCCCCCATCCCGGCCGCCGCCTTGACTCTGCGCTCTCTGAGTCTCCCAAGACGGCTT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CGCCATCCGCTCGGACGGCCCCCATCCCGGCCGCCGCCTTGACTCTGCGCTCTCTGAGTCTCCCAAGACGGCTT  1258

Query 1259  TGCTGCTGGCCCTCAGCCGACCCCGGCCCCCCATCACGCGCTCCCAGAGCTATCTGACCTTGTGGGAGGAGAAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGCTGCTGGCCCTCAGCCGACCCCGGCCCCCCATCACGCGCTCCCAGAGCTATCTGACCTTGTGGGAGGAGAAG  1332

Query 1333  CAGCAGCG---GAAGGAGAAGTCGGGGTCCCCTGGGGAGAAGGGTGCCCTGCAGCGCTCCAAGACGCTGATGAA  1403
            ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAGCAGCGGAAGAAGGAGAAGTCGGGGTCCCCTGGGGAGAAGGGTGCCCTGCAGCGCTCCAAGACGCTGATGAA  1406

Query 1404  CCTCTTCTTCAAGGGAGGGCGGCAGGGGAGGCTAGCGCGGGACGGGCGCAGAGAGGCCTGGACACTGGACAGCG  1477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCTCTTCTTCAAGGGAGGGCGGCAGGGGAGGCTAGCGCGGGACGGGCGCAGAGAGGCCTGGACACTGGACAGCG  1480

Query 1478  GGAGCCTGGCCAAAACTTACCCTCGCCTGGACATAGAGAAAG-AGATGGGGGC----------AACA-------  1533
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||          .|||       
Sbjct 1481  GGAGCCTGGCCAAAACTTACCCTCGCCTGGACATAGAGAAAGCA---GGGGGCGTGGGCCCGGTACAGAAGTTT  1551

Query 1534  --------------------------------------------------------------------------  1533
                                                                                      
Sbjct 1552  GTCACCTGGAGACTGAGACGTGGTTCAGGCCTGGGAGAGCCGGCGGCCCCTCATTCAGGACCTGGCCCAGAGGC  1625

Query 1534  -------  1533
                   
Sbjct 1626  TGCTGAC  1632