Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14311
- Subject:
- XM_011538856.2
- Aligned Length:
- 2054
- Identities:
- 2044
- Gaps:
- 7
Alignment
Query 1 ATGAACCCTCCGGCAGCCTTCCTTGCCGGGCGCCAGAACATCGGGTCAGAAGTTGAGATTTCCACTATCGAGAA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAACCCTCCGGCAGCCTTCCTTGCCGGGCGCCAGAACATCGGGTCAGAAGTTGAGATTTCCACTATCGAGAA 74
Query 75 ACAACGGAAGGAGCTGCAGTTGCTCATTGGAGAATTAAAAGATCGAGATAAAGAGCTCAATGACATGGTTGCAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ACAACGGAAGGAGCTGCAGTTGCTCATTGGAGAATTAAAAGATCGAGATAAAGAGCTCAATGACATGGTTGCAG 148
Query 149 TGCACCAGCAACAGCTTCTTTCATGGGAAGAGGATCGGCAGAAAGTGTTGACACTGGAAGAACGTTGCAGCAAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGCACCAGCAACAGCTTCTTTCATGGGAAGAGGATCGGCAGAAAGTGTTGACACTGGAAGAACGTTGCAGCAAA 222
Query 223 TTAGAAGGTGAACTACATAAAAGAACTGAAATAATCAGGTAGACT--CCAAGAAGGTAAAAGCTCTTGAATCAC 294
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| .||| |.||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 223 TTAGAAGGTGAACTACATAAAAGAACTGAAATAATCAGGT-CACTCACGAAGAAGGTAAAAGCTCTTGAATC-C 294
Query 295 AATCAAATGGAATGCCAAACAGCTCTCCAAAAGACCCAACTACAGCTTCAGGAAATGGCTCAAAAGGCAACGCA 368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 295 AATCAAATGGAATGCCAAACAGCTCTCCAAAAGACCCAACTACAGCTTCAGGAAATGGCTCAAAAGGCAACGCA 368
Query 369 TTCTTCTCTTCTCTCTGAAGACCTTGAGGCTAGAAACGAAACTCTCAGCAACACGTTAGTGGAACTTTCTGCCC 442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 369 TTCTTCTCTTCTCTCTGAAGACCTTGAGGCTAGAAACGAAACTCTCAGCAACACGTTAGTGGAACTTTCTGCCC 442
Query 443 AGGTAGGACAGCTACAAGCTCGAGAACAAGCTCTTACGACAATGATAAAGCTAAAGGACAAAGATATTATTGAG 516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 443 AGGTAGGACAGCTACAAGCTCGAGAACAAGCTCTTACGACAATGATAAAGCTAAAGGACAAAGATATTATTGAG 516
Query 517 GCAGTTAATCACATTGCAGATTGTTCGGGTAAATTTAAAATGCTAGAGCATGCCCTACGTGATGCCAAGATGGC 590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 517 GCAGTTAATCACATTGCAGATTGTTCGGGTAAATTTAAAATGCTAGAGCATGCCCTACGTGATGCCAAGATGGC 590
Query 591 GGAGACTTGTATTGTGAAAGAAAAGCAAGATTATAAGCAGAAATTGAAGGCACTTAAGATTGAAGTCAACAAAC 664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 591 GGAGACTTGTATTGTGAAAGAAAAGCAAGATTATAAGCAGAAATTGAAGGCACTTAAGATTGAAGTCAACAAAC 664
Query 665 TAAAAGAGGACCTCAATGAAAAGACGACAGAAAATAATGAGCAACGAGAAGAGATCATTCGCCTCAAGCAAGAG 738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 665 TAAAAGAGGACCTCAATGAAAAGACGACAGAAAATAATGAGCAACGAGAAGAGATCATTCGCCTCAAGCAAGAG 738
Query 739 AAAAGTTGCCTGCACGATGAATTGCTTTTTACTGTAGAGAGAGAAAAGAGGAAAGATGAATTGCTTAATATTGC 812
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 739 AAAAGTTGCCTGCACGATGAATTGCTTTTTACT---GAGAGAGAAAAGAGGAAAGATGAATTGCTTAATATTGC 809
Query 813 GAAGTCAAAGCAAGAACGCACAAATTCAGAACTGCACAATCTGAGACAGATTTATGTAAAACAACAGAGTGATC 886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 810 GAAGTCAAAGCAAGAACGCACAAATTCAGAACTGCACAATCTGAGACAGATTTATGTAAAACAACAGAGTGATC 883
Query 887 TGCAGTTTCTTAATTTCAATGTGGAAAATTCTCAGGAATTAATACAGATGTATGACTCAAAGATGGAGGAATCA 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 884 TGCAGTTTCTTAATTTCAATGTGGAAAATTCTCAGGAATTAATACAGATGTATGACTCAAAGATGGAGGAATCA 957
Query 961 AAGGCTCTGGACTCCAGCAGAGACATGTGTTTATCAGACCTTGAAAATAACCACCCAAAAGTCGATATTAAGAG 1034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 958 AAGGCTCTGGACTCCAGCAGAGACATGTGTTTATCAGACCTTGAAAATAACCACCCAAAAGTCGATATTAAGAG 1031
Query 1035 GGAAAAAAATCAGAAGTCACTGTTTAAGGACCAGAAATTTGAAGCCATGTTGGTTCAGCAAAATAGGTCAGACA 1108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032 GGAAAAAAATCAGAAGTCACTGTTTAAGGACCAGAAATTTGAAGCCATGTTGGTTCAGCAAAATAGGTCAGACA 1105
Query 1109 AGAGCTCTTGCGATGAATGCAAAGAGAAGAAACAACAGATCGATACTGTGTTTGGGGAGAAAAGTGTAATTAAG 1182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1106 AGAGCTCTTGCGATGAATGCAAAGAGAAGAAACAACAGATCGATACTGTGTTTGGGGAGAAAAGTGTAATTACG 1179
Query 1183 CTGTCATCCATATTCACCAAAGACTTAGTAGAGAAACACAACCTCCCTTGGTCTCTGGGAGGAAAAACCCAGAT 1256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1180 CTGTCATCCATATTCACCAAAGACTTAGTAGAGAAACACAACCTCCCTTGGTCTCTGGGAGGAAAAACCCAGAT 1253
Query 1257 TGAACCCGAAAACAAAATTACATTGTGCAAGATCCACACAAAATCACCAAAATGTCATGGCACTGGGGTTCAGA 1330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254 TGAACCCGAAAACAAAATTACATTGTGCAAGATCCACACAAAATCACCAAAATGTCATGGCACTGGGGTTCAGA 1327
Query 1331 ACGAAGGAAAACAACCCTCAGAAACACCCACTTTATCTGATGAGAAGCAGTGGCATGATGTCAGTGTTTACCTG 1404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1328 ACGAAGGAAAACAACCCTCAGAAACACCCACTTTATCTGATGAGAAGCAGTGGCATGATGTCAGTGTTTACCTG 1401
Query 1405 GGCCTGACCAACTGTCCAAGTTCAAAACATCCAGAAAAGCTGGATGTAGAATGTCAAGATCAGATGGAAAGGTC 1478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1402 GGCCTGACCAACTGTCCAAGTTCAAAACATCCAGAAAAGCTGGATGTAGAATGTCAAGATCAGATGGAAAGGTC 1475
Query 1479 CGAAATCTCATGCTGCCAGAAAAATGAAGCCTGTCTGGGCGAAAGTGGCATGTGTGACTCCAAGTGCTGCCACC 1552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1476 CGAAATCTCATGCTGCCAGAAAAATGAAGCCTGTCTGGGCGAAAGTGGCATGTGTGACTCCAAGTGCTGCCACC 1549
Query 1553 CGAGTAACTTCATAATTGAAGCCCCAGGCCACATGTCTGACGTGGAGTGGATGAGTATTTTCAAGCCTTCCAAA 1626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1550 CGAGTAACTTCATAATTGAAGCCCCAGGCCACATGTCTGACGTGGAGTGGATGAGTATTTTCAAGCCTTCCAAA 1623
Query 1627 ATGCAGAGAATTGTCCGCCTCAAATCTGGGTGCACCTGTTCAGAAAGCATCTGTGGCACACAACATGACTCCCC 1700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1624 ATGCAGAGAATTGTCCGCCTCAAATCTGGGTGCACCTGTTCAGAAAGCATCTGTGGCACACAACATGACTCCCC 1697
Query 1701 GGCAAGTGAGCTAATTGCCATCCAAGATTCCCACTCTTTGGGTTCTTCAAAATCTGCCTTGAGAGAAGATGAGA 1774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1698 GGCAAGTGAGCTAATTGCCATCCAAGATTCCCACTCTTTGGGTTCTTCAAAATCTGCCTTGAGAGAAGATGAGA 1771
Query 1775 CGGAGTCCTCTTCCAATAAAAAGAACTCACCTACGAGTTTGTTAATCTACAAAGATGCACCAGCATTCAATGAA 1848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1772 CGGAGTCCTCTTCCAATAAAAAGAACTCACCTACGAGTTTGTTAATCTACAAAGATGCACCAGCATTCAATGAA 1845
Query 1849 AAGGCTTCAATTGTGTTACCCTCCCAGGATGATTTCTCGCCCACGAGCAAGCTCCAGCGTTTGCTGGCGGAATC 1922
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1846 AAGGCTTCAATTGTGTTACCCTCCCAGGATGATTTCTCGCCCACGAGCAAGCTCCAGCGTTTGCTGGCGGAATC 1919
Query 1923 TCGTCAGATGGTGACGGACCTGGAGCTGAGCACACTGCTGCCCATCAGCCATGAGAATCTCACTGGCAGTGCCA 1996
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1920 TCGTCAGATGGTGACGGACCTGGAGCTGAGCACACTGCTGCCCATCAGCCATGAGAATCTCACTGGCAGTGCCA 1993
Query 1997 CAAATAAGTCAGAGGTCCCAGAAGAGTCAGCTCAAAAAAATACCTTTGTCAGTTAT 2052
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1994 CAAATAAGTCAGAGGTCCCAGAAGAGTCAGCTCAAAAAAATACCTTTGTCAGTTAT 2049