Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14311
- Subject:
- XM_011538857.2
- Aligned Length:
- 2054
- Identities:
- 1897
- Gaps:
- 154
Alignment
Query 1 ATGAACCCTCCGGCAGCCTTCCTTGCCGGGCGCCAGAACATCGGGTCAGAAGTTGAGATTTCCACTATCGAGAA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAACCCTCCGGCAGCCTTCCTTGCCGGGCGCCAGAACATCGGGTCAGAAGTTGAGATTTCCACTATCGAGAA 74
Query 75 ACAACGGAAGGAGCTGCAGTTGCTCATTGGAGAATTAAAAGATCGAGATAAAGAGCTCAATGACATGGTTGCAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ACAACGGAAGGAGCTGCAGTTGCTCATTGGAGAATTAAAAGATCGAGATAAAGAGCTCAATGACATGGTTGCAG 148
Query 149 TGCACCAGCAACAGCTTCTTTCATGGGAAGAGGATCGGCAGAAAGTGTTGACACTGGAAGAACGTTGCAGCAAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGCACCAGCAACAGCTTCTTTCATGGGAAGAGGATCGGCAGAAAGTGTTGACACTGGAAGAACGTTGCAGCAAA 222
Query 223 TTAGAAGGTGAACTACATAAAAGAACTGAAATAATCAGGTAGACT--CCAAGAAGGTAAAAGCTCTTGAATCAC 294
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| .||| |.||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 223 TTAGAAGGTGAACTACATAAAAGAACTGAAATAATCAGGT-CACTCACGAAGAAGGTAAAAGCTCTTGAATC-C 294
Query 295 AATCAAATGGAATGCCAAACAGCTCTCCAAAAGACCCAACTACAGCTTCAGGAAATGGCTCAAAAGGCAACGCA 368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 295 AATCAAATGGAATGCCAAACAGCTCTCCAAAAGACCCAACTACAGCTTCAGGAAATGGCTCAAAAGGCAACGCA 368
Query 369 TTCTTCTCTTCTCTCTGAAGACCTTGAGGCTAGAAACGAAACTCTCAGCAACACGTTAGTGGAACTTTCTGCCC 442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 369 TTCTTCTCTTCTCTCTGAAGACCTTGAGGCTAGAAACGAAACTCTCAGCAACACGTTAGTGGAACTTTCTGCCC 442
Query 443 AGGTAGGACAGCTACAAGCTCGAGAACAAGCTCTTACGACAATGATAAAGCTAAAGGACAAAGATATTATTGAG 516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 443 AGGTAGGACAGCTACAAGCTCGAGAACAAGCTCTTACGACAATGATAAAGCTAAAGGACAAAGATATTATTGAG 516
Query 517 GCAGTTAATCACATTGCAGATTGTTCGGGTAAATTTAAAATGCTAGAGCATGCCCTACGTGATGCCAAGATGGC 590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 517 GCAGTTAATCACATTGCAGATTGTTCGGGTAAATTTAAAATGCTAGAGCATGCCCTACGTGATGCCAAGATGGC 590
Query 591 GGAGACTTGTATTGTGAAAGAAAAGCAAGATTATAAGCAGAAATTGAAGGCACTTAAGATTGAAGTCAACAAAC 664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 591 GGAGACTTGTATTGTGAAAGAAAAGCAAGATTATAAGCAGAAATTGAAGGCACTTAAGATTGAAGTCAACAAAC 664
Query 665 TAAAAGAGGACCTCAATGAAAAGACGACAGAAAATAATGAGCAACGAGAAGAGATCATTCGCCTCAAGCAAGAG 738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 665 TAAAAGAGGACCTCAATGAAAAGACGACAGAAAATAATGAGCAACGAGAAGAGATCATTCGCCTCAAGCAAGAG 738
Query 739 AAAAGTTGCCTGCACGATGAATTGCTTTTTACTGTAGAGAGAGAAAAGAGGAAAGATGAATTGCTTAATATTGC 812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 739 AAAAGTTGCCTGCACGATGAATTGCTTTTTACTGTAGAGAGAGAAAAGAGGAAAGATGAATTGCTTAATATTGC 812
Query 813 GAAGTCAAAGCAAGAACGCACAAATTCAGAACTGCACAATCTGAGACAGATTTATGTAAAACAACAGAGTGATC 886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 813 GAAGTCAAAGCAAGAACGCACAAATTCAGAACTGCACAATCTGAGACAGATTTATGTAAAACAACAGAGTGATC 886
Query 887 TGCAGTTTCTTAATTTCAATGTGGAAAATTCTCAGGAATTAATACAGATGTATGACTCAAAGATGGAGGAATCA 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 887 TGCAGTTTCTTAATTTCAATGTGGAAAATTCTCAGGAATTAATACAGATGTATGACTCAAAGATGGAGGAATCA 960
Query 961 AAGGCTCTGGACTCCAGCAGAGACATGTGTTTATCAGACCTTGAAAATAACCACCCAAAAGTCGATATTAAGAG 1034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 AAGGCTCTGGACTCCAGCAGAGACATGTGTTTATCAGACCTTGAAAATAACCACCCAAAAGTCGATATTAAGAG 1034
Query 1035 GGAAAAAAATCAGAAGTCACTGTTTAAGGACCAGAAATTTGAAGCCATGTTGGTTCAGCAAAATAGGTCAGACA 1108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035 GGAAAAAAATCAGAAGTCACTGTTTAAGGACCAGAAATTTGAAGCCATGTTGGTTCAGCAAAATAGGTCAGACA 1108
Query 1109 AGAGCTCTTGCGATGAATGCAAAGAGAAGAAACAACAGATCGATACTGTGTTTGGGGAGAAAAGTGTAATTAAG 1182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1109 AGAGCTCTTGCGATGAATGCAAAGAGAAGAAACAACAGATCGATACTGTGTTTGGGGAGAAAAGTGTAATTACG 1182
Query 1183 CTGTCATCCATATTCACCAAAGACTTAGTAGAGAAACACAACCTCCCTTGGTCTCTGGGAGGAAAAACCCAGAT 1256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183 CTGTCATCCATATTCACCAAAGACTTAGTAGAGAAACACAACCTCCCTTGGTCTCTGGGAGGAAAAACCCAGAT 1256
Query 1257 TGAACCCGAAAACAAAATTACATTGTGCAAGATCCACACAAAATCACCAAAATGTCATGGCACTGGGGTTCAGA 1330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257 TGAACCCGAAAACAAAATTACATTGTGCAAGATCCACACAAAATCACCAAAATGTCATGGCACTGGGGTTCAGA 1330
Query 1331 ACGAAGGAAAACAACCCTCAGAAACACCCACTTTATCTGATGAGAAGCAGTGGCATGATGTCAGTGTTTACCTG 1404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1331 ACGAAGGAAAACAACCCTCAGAAACACCCACTTTATCTGATGAGAAGCAGTGGCATGATGTCAGTGTTTACCTG 1404
Query 1405 GGCCTGACCAACTGTCCAAGTTCAAAACATCCAGAAAAGCTGGATGTAGAATGTCAAGATCAGATGGAAAGGTC 1478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1405 GGCCTGACCAACTGTCCAAGTTCAAAACATCCAGAAAAGCTGGATGTAGAATGTCAAGATCAGATGGAAAGGTC 1478
Query 1479 CGAAATCTCATGCTGCCAGAAAAATGAAGCCTGTCTGGGCGAAAGTGGCATGTGTGACTCCAAGTGCTGCCACC 1552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1479 CGAAATCTCATGCTGCCAGAAAAATGAAGCCTGTCTGGGCGAAAGTGGCATGTGTGACTCCAAGTGCTGCCACC 1552
Query 1553 CGAGTAACTTCATAATTGAAGCCCCAGGCCACATGTCTGACGTGGAGTGGATGAGTATTTTCAAGCCTTCCAAA 1626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1553 CGAGTAACTTCATAATTGAAGCCCCAGGCCACATGTCTGACGTGGAGTGGATGAGTATTTTCAAGCCTTCCAAA 1626
Query 1627 ATGCAGAGAATTGTCCGCCTCAAATCTGGGTGCACCTGTTCAGAAAGCATCTGTGGCACACAACATGACTCCCC 1700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1627 ATGCAGAGAATTGTCCGCCTCAAATCTGGGTGCACCTGTTCAGAAAGCATCTGTGGCACACAACATGACTCCCC 1700
Query 1701 GGCAAGTGAGCTAATTGCCATCCAAGATTCCCACTCTTTGGGTTCTTCAAAATCTGCCTTGAGAGAAGATGAGA 1774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1701 GGCAAGTGAGCTAATTGCCATCCAAGATTCCCACTCTTTGGGTTCTTCAAAATCTGCCTTGAGAGAAGATGAGA 1774
Query 1775 CGGAGTCCTCTTCCAATAAAAAGAACTCACCTACGAGTTTGTTAATCTACAAAGATGCACCAGCATTCAATGAA 1848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1775 CGGAGTCCTCTTCCAATAAAAAGAACTCACCTACGAGTTTGTTAATCTACAAAGATGCACCAGCATTCAATGAA 1848
Query 1849 AAGGCTTCAATTGTGTTACCCTCCCAGGATGATTTCTCGCCCACGAGCAAGCTCCAGCGTTTGCTGGCGGAATC 1922
|||
Sbjct 1849 AAG----------------------------------------------------------------------- 1851
Query 1923 TCGTCAGATGGTGACGGACCTGGAGCTGAGCACACTGCTGCCCATCAGCCATGAGAATCTCACTGGCAGTGCCA 1996
Sbjct 1852 -------------------------------------------------------------------------- 1851
Query 1997 CAAATAAGTCAGAGGTCCCAGAAGAGTCAGCTCAAAAAAATACCTTTGTCAGTTAT 2052
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1852 -----AAGTCAGAGGTCCCAGAAGAGTCAGCTCAAAAAAATACCTTTGTCAGTTAT 1902