Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_14345
Subject:
XM_024447333.1
Aligned Length:
1167
Identities:
846
Gaps:
318

Alignment

Query    1  ATGTTGGCGCCACCAGCTGGTGAGGGCCCTGGGGTGGACCTGGCGGCCAAAGCCCAGGTGTGGCTGGAGCAGGT  74
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTGGCGCCAGCAGCTGGTGAGGGCCCTGGGGTGGACCTGGCGGCCAAAGCCCAGGTGTGGCTGGAGCAGGT  74

Query   75  GTGTGCCCACCTGGGGCTGGGGGTGCAGGAGCCACATCCAGGCGAGCGGGCAGCCTTTGTGGCCTATGCCTTGG  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTGTGCCCACCTGGGGCTGGGGGTGCAGGAGCCGCATCCAGGCGAGCGGGCAGCCTTTGTGGCCTATGCCTTGG  148

Query  149  CTTTTCCCCGGGCCTTCCAGGGCCTCCTGGACACCTACAGCGTGTGGAGGAGTGGTCTCCCCAACTTCCTAGCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTTTTCCCCGGGCCTTCCAGGGCCTCCTGGACACCTACAGCGTGTGGAGGAGTGGTCTCCCCAACTTCCTAGCA  222

Query  223  GTCGCCTTGGCCCTGGGAGAGCTGGGCTACCGGGCAGTGGGCGTGAGGCTGGACAGTGGTGACCTGCTACAGCA  296
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCGCCCTGGCCCTGGGAGAGCTGGGCTACCGGGCAGTGGGCGTGAGGCTGGACAGTGGTGACCTGCTACAGCA  296

Query  297  GGCTCAGGAGATCCGCAAGGTCTTCCGAGCTGCTGCAGCCCAGTTCCAGGTGCCCTGGCTGGAGTCAGTCCTCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCTCAGGAGATCCGCAAGGTCTTCCGAGCTGCTGCAGCCCAGTTCCAGGTGCCCTGGCTGGAGTCAGTCCTCA  370

Query  371  TCGTAGTCAGCAACAACATTGACGAGGAGGCGCTGGCCCGACTGGCCCAGGAGGGCAGTGAGGTGAATGTCATT  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
Sbjct  371  TCGTAGTCAGCAACAACATTGACGAGGAGGCGCTGGCCCGACTGGCCCAGG-----------------------  421

Query  445  GGCATTGGCACCAGTGTGGTCACCTGCCCCCAACAGCCTTCCCTGGGTGGCGTCTATAAGCTGGTGGCCGTGGG  518
                                                                      ||||||||||||||||
Sbjct  422  ----------------------------------------------------------AGCTGGTGGCCGTGGG  437

Query  519  GGGCCAGCCACGAATGAAGCTGACCGAGGACCCCGAGAAGCAGACGTTGCCTGGGAGCAAGGCTGCTTTCCGGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  438  GGGCCAGCCACGAATGAAGCTGACCGAGGACCCCGAGAAGCAGACGTTGCCTGGGAGCAAGGCTGCTTTCCGGC  511

Query  593  TCCTGGGCTCTGACGGGTCTCCACTCATGGACATGCTGCAGTTAGCAGAAGAGCCAGTGCCACAGGCTGGGCAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  512  TCCTGGGCTCTGACGGGTCTCCACTCATGGACATGCTGCAGTTAGCAGAAGAGCCAGTGCCACAGGCTGGGCAG  585

Query  667  GAGCTGAGGGTGTGGCCTCCAGGGGCCCAGGAGCCCTGCACCGTGAGGCCAGCCCAGGTGGAGCCACTACTGCG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  586  GAGCTGAGGGTGTGGCCTCCAGGGGCCCAGGAGCCCTGCACCGTGAGGCCAGCCCAGGTGGAGCCACTACTGCG  659

Query  741  GCTCTGCCTCCAGCAGGGACAGCTGTGTGAGCCGCTCCCATCCCTGGCAGAGTCTAGAGCCTTGGCCCAGCTGT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  660  GCTCTGCCTCCAGCAGGGACAGCTGTGTGAGCCGCTCCCATCCCTGGCAGAGTCTAGAGCCTTGGCCCAGCTGT  733

Query  815  CCCTGAGCCGACTCAGCCCTGAGCACAGGCGGCTGCGGAGCCCTGCACAGTAC---------------------  867
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     
Sbjct  734  CCCTGAGCCGACTCAGCCCTGAGCACAGGCGGCTGCGGAGCCCTGCACAGTACCAGGTTGGGGGGAGGCCCACC  807

Query  868  ----------------------------------------------------------------CAGGTGGTGC  877
                                                                            ||||||||||
Sbjct  808  CTGTCATTCTGCCCTGTGCGCCCCCGCCCTCACCCTGCCCACCGCTCCTGTCCTCTGCTCCCTGCAGGTGGTGC  881

Query  878  TGTCCGAGAGGCTGCAGGCCCTGGTGAACAGTCTGTGTGCGGGGCAGTCCCCC---------------------  930
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     
Sbjct  882  TGTCCGAGAGGCTGCAGGCCCTGGTGAACAGTCTGTGTGCGGGGCAGTCCCCCTGAGACTCGGAGCGGGGCTGA  955

Query  931  --------------------------------------------------------------------------  930
                                                                                      
Sbjct  956  CTGGAAACAACACGAATCACTCACTTTTCCCCACAGCTTGTCCTGTGTTGTTTGTGTCGTTTGTTCACCCAGCC  1029

Query  931  ---------------------------------------------------------  930
                                                                     
Sbjct 1030  CACGGGCTGCGCCTCCCGGGCTGCGGCTGGGCTGGAGTCGGGAATCTGAGCTCGAGG  1086