Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14383
• Subject: XM_024446659.1
• Aligned Length: 2527
• Identities: 2375
• Gaps: 142

Alignment

Query    1  ATGGCGACCTCCGAGAGGGGCTCTCCTGAGGACCAGAGCTGCCTCTCTCCTGAGAGGCTTGGGCAGATCCCGAA  74
            |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGACCTCCGAGA-GGGCTCTCCTGAGGACCAGAGCTGCCTCTCTCCTGAGAGGCTTGGGCAGATCCCGAA  73

Query   75  CTGGAGCCCGATCGTTACAGTTTCGCGCAGAAAAAGAGCGTCAGCCTTGCTGGTCTTTTCCCATGGGGCAGAAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   74  CTGGAGCCCGATCGTTACAGTTTCGCGCAGAAAAAGAGCGTCAGCCTTGCTGGTCTTTTCCCATGGGGCAGAAG  147

Query  149  ACGAAAGGCAGCTCTAACATAGCCTCCTCCTACCTGCTCCAGCAGCTCATGCACCGCTATCAGGAGCTGGACTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  148  ACGAAAGGCAGCTCTAACATAGCCTCCTCCTACCTGCTCCAGCAGCTCATGCACCGCTATCAGGAGCTGGACTC  221

Query  223  GGACGGAGATGAGGACCAGGGCGAGGGCGAGGCGGGATCCGAGGAGTCCTCAGAGTCCGAAATGCTGAATTTGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  GGACGGAGATGAGGACCAGGGCGAGGGCGAGGCGGGATCCGAGGAGTCCTCAGAGTCCGAAATGCTGAATTTGG  295

Query  297  AGGAGGAATTTGATGGGGTCCTGAGAGAGGAGGCTGTGGCCAAAGCACTCCATCACTTGGGGCGCTCAGGCTCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  296  AGGAGGAATTTGATGGGGTCCTGAGAGAGGAGGCTGTGGCCAAAGCACTCCATCACTTGGGGCGCTCAGGCTCT  369

Query  371  GGGACTGAGCAAGTCTACCTCAATCTAACTTTATCAGGTTGTAATTTAATTGATGTTAGCATTCTCTGTGGATA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  370  GGGACTGAGCAAGTCTACCTCAATCTAACTTTATCAGGTTGTAATTTAATTGATGTTAGCATTCTCTGTGGATA  443

Query  445  TGTTCATCTACAGAAGTTGGATCTTTCAGCGAATAAAATTGAAGATTTATCTTGTGTGAGTTGTATGCCTTATC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  TGTTCATCTACAGAAGTTGGATCTTTCAGCGAATAAAATTGAAGATTTATCTTGTGTGAGTTGTATGCCTTATC  517

Query  519  TCCTAGAACTTAATGCTTCTCAAAATAATTTGACTACGTTCTTCAATTTCAAGCCACCCAAAAACCTCAAGAAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  TCCTAGAACTTAATGCTTCTCAAAATAATTTGACTACGTTCTTCAATTTCAAGCCACCCAAAAACCTCAAGAAG  591

Query  593  GCGGATTTTTCCCACAACCAAATTTCTGAAATTTGTGATTTGTCAGCGTATCATGCTCTCACTAAACTAATTTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  GCGGATTTTTCCCACAACCAAATTTCTGAAATTTGTGATTTGTCAGCGTATCATGCTCTCACTAAACTAATTTT  665

Query  667  GGATGGCAATGAGATAGAAGAAATCAGTGGACTAGAGATGTGCAACAACCTAATTCACCTTAGTTTGGCCAACA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  GGATGGCAATGAGATAGAAGAAATCAGTGGACTAGAGATGTGCAACAACCTAATTCACCTTAGTTTGGCCAACA  739

Query  741  ATAAGATCACGACAATTAATGGCTTAAACAAGTTACCAATCAAAATACTTTGTCTGAGCAATAACCAGATTGAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  ATAAGATCACGACAATTAATGGCTTAAACAAGTTACCAATCAAAATACTTTGTCTGAGCAATAACCAGATTGAG  813

Query  815  ATGATCACAGGTTTGGAGGATCTGAAAGCCCTGCAGAACCTGGATCTGTCCCACAATCAGATAAGCAGCCTCCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  ATGATCACAGGTTTGGAGGATCTGAAAGCCCTGCAGAACCTGGATCTGTCCCACAATCAGATAAGCAGCCTCCA  887

Query  889  AGGCTTAGAGAATCATGACCTCCTGGAAGTGATCAACCTGGAGGATAATAAGATTGCTGAGCTGAGAGAAATAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  AGGCTTAGAGAATCATGACCTCCTGGAAGTGATCAACCTGGAGGATAATAAGATTGCTGAGCTGAGAGAAATAG  961

Query  963  AATACATTAAAAATTTACCCATCCTTCGAGTTCTCAATCTTCTAGAAAATCCAATTCAGGAAAAGTCTGAATAT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  AATACATTAAAAATTTACCCATCCTTCGAGTTCTCAATCTTCTAGAAAATCCAATTCAGGAAAAGTCTGAATAT  1035

Query 1037  TGGTTCTTCGTAATTTTTATGCTTCTGCGATTAACAGAATTAGATCAGAAGAAGATTAAAGTGGAAGAAAAGGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  TGGTTCTTCGTAATTTTTATGCTTCTGCGATTAACAGAATTAGATCAGAAGAAGATTAAAGTGGAAGAAAAGGT  1109

Query 1111  TTCAGCAGTGAATAAATATGATCCTCCCCCTGAAGTGGTTGCAGCTCAAGACCACCTGACCCATGTTGTCAACA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  TTCAGCAGTGAATAAATATGATCCTCCCCCTGAAGTGGTTGCAGCTCAAGACCACCTGACCCATGTTGTCAACA  1183

Query 1185  GCGTGATGCAGCCGCAGAGGATCTTTGACAGCACTCTTCCCAGCCTGGATGCTCCTTATCCCATGCTGATACTA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  GCGTGATGCAGCCGCAGAGGATCTTTGACAGCACTCTTCCCAGCCTGGATGCCCCTTATCCCATGCTGATACTA  1257

Query 1259  GCTGGTCCTGAAGCTTGTGGGAAACGAGAGCTTGCCCATCGCCTCTGCAGACAGTTTAGCACTTACTTCAGATA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258  GCTGGTCCTGAAGCTTGTGGGAAACGAGAGCTTGCCCATCGCCTCTGCAGACAGTTTAGCACTTACTTCAGATA  1331

Query 1333  TGGGGCCTGTCATACCACAAGACCACCTTACTTTGGAGAAGGGGATCGAGTTGATTATCATTTTATCTCTCAAG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332  TGGGGCCTGTCATACCACAAGACCACCTTACTTTGGAGAAGGGGATCGAGTTGATTATCATTTTATCTCTCAAG  1405

Query 1407  ACGTTTTTGATGAAATGGTGAACATGGGGAAATTCATTCTAACATTTAGTTATGGTAATCACAAGTATGGATTA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406  ACGTTTTTGATGAAATGGTGAACATGGGGAAATTCATTCTAACATTTAGTTATGGTAATCACAAGTATGGATTA  1479

Query 1481  AATAGGGACACCGTAGAAGGTATCGCAAGAGATGGTTTGGCAAGCTGTATTCATATGGAAATAGAAGGTGTAAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480  AATAGGGACACCGTAGAAGGTATCGCAAGAGATGGTTTGGCAAGCTGTATTCATATGGAAATAGAAGGTGTAAG  1553

Query 1555  AAGTTTGAAATATTCCTATTTTGAGCCTCGTTATATCCTGGTGGTGCCCATGAACAAGGAAAAATATGAGGGAT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554  AAGTTTGAAATATTCCTATTTTGAGCCTCGTTATATCCTGGTGGTGCCCATGAACAAGGAAAAATATGAGGGAT  1627

Query 1629  ATTTGCGGAGAAAAGGATTATTCAGTCGTGCAGAAATTGAATTTGCTGTCTCCAGAGTGGACCTTTATATTAAA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628  ATTTGCGGAGAAAAGGATTATTCAGTCGTGCAGAAATTGAATTTGCTGTCTCCAGAGTGGACCTTTATATTAAA  1701

Query 1703  ATTAATCAGAATTTTCCGGGATATTTTGATGAGGTAATCAATGCAGATGATCTGGATGTTGCCTACCAAAAACT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702  ATTAATCAGAATTTTCCGGGATATTTTGATGAGGTAATCAATGCAGATGATCTGGATGTTGCCTACCAAAAACT  1775

Query 1777  GAGTCAGCTCATTAGAGAATACCTTGGATTGACTGAGGAACTTGCCAAGAGTTTGGCTACAACTGCAGATGTTA  1850
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776  GAGTCAGCTCATTAGAGAATACCTTGGATTGACTGAGGAACCTGCCAAGAGTTTGGCTACAACTGCAGATGTTA  1849

Query 1851  AGACATCCCACCTGAAACCTGAAGCGCATCCTACAAAGTATATTTCTTCGAATATGGGTGATTTCCTGCATTCT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850  AGACATCCCACCTGAAACCTGAAGCGCATCCTACAAAGTATATTTCTTCGAATATGGGTGATTTCCTGCATTCT  1923

Query 1925  ACAGACAGAAACTACCTCATTAAATTTTGGGCCAAACTTTCAGCCAAAAAAACACCAGCGGAAAGAGATTCTAT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1924  ACAGACAGAAACTACCTCATTAAATTTTGGGCCAAACTTTCAGCCAAAAAAACACCAGCGGAAAGAGATTCTAT  1997

Query 1999  ACACAGACAGCACGAGGCAGCCCGGCAAGCTCTAATGGGAAGGATACGCCCTGATCACACACTCCTATTTCAAA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1998  ACACAGACAGCACGAGGCAGCCCGGCAAGCTCTAATGGGAAGGATACGCCCTGATCACACACTCCTATTTCAAA  2071

Query 2073  GGGGTCCAGTACCAGCACCTCTCACCAGTGGTCTACACTATTATACAACTTTAGAAGAACTCTGGAAAAGTTTT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2072  GGGGTCCAGTACCAGCACCTCTCACCAGTGGTCTACACTATTATACAACTTTAGAAGAACTCTGGAAAAGTTTT  2145

Query 2147  GATCTTTGTGAAGACTATTTTAAACCTCCATTTGGACCATATCCTGAAAAGAGTGGGAAGGATTCCTTGGTTTC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2146  GATCTTTGTGAAGACTATTTTAAACCTCCATTTGGACCATATCCTGAAAAGAGTGGGAAGGATTCCTTGGTTTC  2219

Query 2221  CATGAAATGTTCATTGTTTCGGTTCTGTCCGTGGTCAAAAGAATTGCCTTTCCAGCCTCCGGAGGGGAGCATTT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220  CATGAAATGTTCATTGTTTCGGTTCTGTCCGTGGTCAAAAGAATTGCCTTTCCAGCCTCCGGAGGGGAGCATTT  2293

Query 2295  CTTCACACCTAGGATCAGGAGCCAGTGACAGTGAGACCGAAGAGACCCGGAAAGC-------------------  2349
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
Sbjct 2294  CTTCACACCTAGGATCAGGAGCCAGTGACAGTGAGACCGAAGAGACCCGGAAAGCCAGAAGAGAAAGTGAGGGG  2367

Query 2350  ---------------ACTACCTATACAATCATTTTCACATGAAAAAGAGTCT-----------------CACCA  2391
                           |.||  ||||||.|.||          |.||||||||                 ||.||
Sbjct 2368  AAGGGAGCATTTTGGAATA--TATACAGTAAT----------AGAAGAGTCTGCTTGATTTCTGTATTCCAGCA  2429

Query 2392  ACACAGACAACACTCGGTCCCAGTCATCAGTCGCCCAGGTTCCAACGTCAAACCCACCCTCCCTCCAATCCCTC  2465
            ..|.|||                                                                   
Sbjct 2430  GGAGAGA-------------------------------------------------------------------  2436

Query 2466  AGGGCCGCAGG  2476
                       
Sbjct 2437  -----------  2436