Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14392
• Subject: NM_001178003.2
• Aligned Length: 1161
• Identities: 923
• Gaps: 227

Alignment

Query    1  MSDAAEAPREATGENGETEMKEEEEPNPNYKEVEDPQQESKDDTIAWRESQEEERKTGEEEGEEEEKEEEGKED  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||
Sbjct    1  MSDAAEAPREATGENGETEMKEEEEPNPNYKEVEDPQQESKDDTIAWRESQEEERKTGEEEG-----EEEGKED  69

Query   75  KKIVMEETEEKAGEVQEKEASGIQEETTVEPQEVTASMIRLETQITDSQSITSGIFPKTQRGSKSKLSLQLEDA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   70  KKIVMEETEEKAGEVQEKEASGIQEETTVEPQEVTASMIRLETQITDSQSITSGIFPKTQRGSKSKLSLQLEDA  143

Query  149  ETDELLRDLSTQIEFLDLDQISPEEQQISSPERQPSGELEEKTDRMPQDELGQERRDLEPENREEGQERRVSDI  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  144  ETDELLRDLSTQIEFLDLDQISPEEQQISSPERQPSGELEEKTDRMPQDELGQERRDLEPENREEGQERRVSDI  217

Query  223  QSKAGISRESLVSSTTEDILFQKDKSTPVYPLTMTWSFGWNSSLPVYYIREERQRVLLYVCAHTAIIYNVFRNN  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  218  QSKAGISRESLVSSTTEDILFQKDKSTPVYPLTMTWSFGWNSSLPVYYIREERQRVLLYVCAHTAIIYNVFRNN  291

Query  297  QYHLQGHANIISCLCVSEDRRWIATADKGPDCLVIIWDSFTGIPVHTIFDSCPEGNGIMAMAMTHDAKYLATIS  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  292  QYHLQGHANIISCLCVSEDRRWIATADKGPDCLVIIWDSFTGIPVHTIFDSCPEGNGIMAMAMTHDAKYLATIS  365

Query  371  DAEVQKVCIWKWTLAVETPACTLELPTEYGVQNYVTFNPTNNKELVSNSKTRAIYYAWYEERDTLAHSAPLLTE  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  366  DAEVQKVCIWKWTLAVETPACTLELPTEYGVQNYVTFNPTNNKELVSNSKTRAIYYAWYEERDTLAHSAPLLTE  439

Query  445  KTFNKLVGKFSQSIFHLNLTQILSATMEGKLVVWDIHRPPSSASTFLGFPYIKPCKLVHLQKEGITVLTTIDSY  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  440  KTFNKLVGKFSQSIFHLNLTQILSATMEGKLVVWDIHRPPSSASTFLGFPYIKPCKLVHLQKEGITVLTTIDSY  513

Query  519  IVTGDIKGNIKFYDHTLSIVNWYSHLKLGAIRTLSFSKTPATPPTEKSNYPPDCTLKGDLFVLRNFIIGTSDAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  514  IVTGDIKGNIKFYDHTLSIVNWYSHLKLGAIRTLSFSKTPATPPTEKSNYPPDCTLKGDLFVLRNFIIGTSDAA  587

Query  593  VYHLTTDGTKLEKLFVEPKDAICAISCHPYQPLIAIGSICGMIKVWNYENKQYLFSRVFEKGFGVQSLTYNPEG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  588  VYHLTTDGTKLEKLFVEPKDAICAISCHPYQPLIAIGSICGMIKVWNYENKQYLFSRVFEKGLGVQSLTYNPEG  661

Query  667  ALLGAGFTEGTVYILDAMSLENESPEPFKYSRTSVTHISFSHDSQYMATADRSFTVAVYMLVVRNGQRVWEYLA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  662  ALLGAGFTEGTVYILDAMSLENESPEPFKYSRTSVTHISFSHDSQYMATADRSFTVAVYMLVVRNGQRVWEYLA  735

Query  741  RLRSHRKSIRSLLFGVYLDSNEPRLLSLGTDRLLIEYDLLRSYKDHLEVLDIHHTDQGCYPTCMVWYPPLTREL  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  736  RLRSHRKSIRSLLFGVYLDSNEPRLLSLGTDRLLIEYDLLRSYKDHLEVLDIHHTDQGCYPTCMVWYPPLTREL  809

Query  815  FLLICNSGYKVKLFNATTKMCRKTLLGPAYGSPIEQTQVLPVRSMAELQKRYLVFINRDKLGLQILPVDGNPHK  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  810  FLLICNSGYKVKLFNATTKMCRKTLLGPAYGSPIEQTQVLPVRSMAELQKRYLVFINRDKVGLQILPVDGNPHK  883

Query  889  TSAIVCHPNGVAGMAVSYDGCYAFTAGGHDRSVVQWKITLS-------VLEAAVSLGGEDLTPFYGLLSGGREG  955
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       .|........                
Sbjct  884  TSAIVCHPNGVAGMAVSYDGCYAFTAGGHDRSVVQWKITLSHPGSQAPILSPSDTSRS----------------  941

Query  956  KFYRELEDYFYYSQLRSQGIDTMETRKVSEHICLSELPFVMRAIGFYPSEEKIDDIFNEIKFGEYVDTGKLIDK  1029
                                                                                      
Sbjct  942  --------------------------------------------------------------------------  941

Query 1030  INLPDFLKVYLNHKPPFGNTMSGIHKSFEVLGYTNSKGKKAIRREDFLRLLVTKGEHMTEEEMLDCFASLFGLN  1103
                                                                                      
Sbjct  942  --------------------------------------------------------------------------  941

Query 1104  PEGWKSEPATCSVKGSEICLEEELPDEITAEIFATEILGLTISEDSAQDCQ  1154
                                                               
Sbjct  942  ---------------------------------------------------  941