Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14424
• Subject: NM_152632.4
• Aligned Length: 2931
• Identities: 2256
• Gaps: 672

Alignment

Query    1  ATGAACACCCAAAAGGGTTCCCTCACCATAAACGTCCACAGAGGTTCCCTCGCCATGAGCATCCAAAGGGGTTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAACACCCAAAAGGGTTCCCTCACCATAAACGTCCACAGAGGTTCCCTCGCCATGAGCATCCAAAGGGGTTC  74

Query   75  CCTCGTCCCCCGGGATATGGATAGCTCGGGTAGAGACATGCAGCTGCGGGTGATCCCGGCTGAGGTGAAGTTCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTCGTCCCCCGGGATATGGATAGCTCGGGTAGAGACATGCAGCTGCGGGTGATCCCGGCTGAGGTGAAGTTCC  148

Query  149  TGGACACGATGGCCGGGAGGGTGTACCGCCTCCCGATTACTGTGCATAATATTTGCCGCTGGAACCAGAAAATC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGACACGATGGCCGGGAGGGTGTACCGCCTCCCGATTACTGTGCATAATATTTGCCGCTGGAACCAGAAAATC  222

Query  223  CGATTTAAGGAGCCCGTCAAGCCACAGTTCAAACTGATGTTGACCAGTCTGGATAAAGAACTTGCTTCTGGCCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGATTTAAGGAGCCCGTCAAGCCACAGTTCAAACTGATGTTGACCAGTCTGGATAAAGAACTTGCTTCTGGCCT  296

Query  297  TCAGATGACAGCTATGGTGGAATATCATCCTGATAAAGACGAAGACACTTTTGACCGGCTACTTATTTCAATAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCAGATGACAGCTATGGTGGAATATCATCCTGATAAAGACGAAGACACTTTTGACCGGCTACTTATTTCAATAG  370

Query  371  AAAATAAAACAACAGAAATTCCTCTAATTGGGTTGATTCCATCCTGTCAATTGGAAATTGAATCAGTAGTTAAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAAATAAAACAACAGAAATTCCTCTAATTGGGTTGATTCCATCCTGTCAATTGGAAATTGAATCAGTAGTTAAT  444

Query  445  TTTGGCACACTGGTTGCCAATAGTAAAGTATATTCTAAAGAGATTACTATCACTAACCATGGCAAAGCTCCAGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTGGCACACTGGTTGCCAATAGTAAAGTATATTCTAAAGAGATTACTATCACTAACCATGGCAAAGCTCCAGG  518

Query  519  CATATTTAAGGCAGAATACCACGGCCAATTACCCATCCTCATTTTTCCAACTAGTGGTATCGTGGATGCTAAGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CATATTTAAGGCAGAATACCACGGCCAATTACCCATCCTCATTTTTCCAACTAGTGGTATCGTGGATGCTAAGT  592

Query  593  CATCAATGGTTATTAAAGTAGATTTCTGTGCAGACCAGCCAAGAATTGTAGATGAAGAGGCAATAGTGATTTTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CATCAATGGTTATTAAAGTAGATTTCTGTGCAGACCAGCCAAGAATTGTAGATGAAGAGGCAATAGTGATTTTG  666

Query  667  CAAGGTCAACCTGAGATGCTCTTGAGTATCAAAGCTCATGTGGTTGAGCAGATTATTGAATTATTAAGCATGAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAAGGTCAACCTGAGATGCTCTTGAGTATCAAAGCTCATGTGGTTGAGCAGATTATTGAATTATTAAGCATGAG  740

Query  741  TAGTGACAGAAGGCTGGAATGCATACACTTTGGTCCTGTTTTCTTCGGATCATCAAAAATTAAACATGCACGTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TAGTGACAGAAGGCTGGAATGCATACACTTTGGTCCTGTTTTCTTCGGATCATCAAAAATTAAACATGCACGTG  814

Query  815  TATACAATAATAGCCCAGAGCCCATAAATTGGGTGGCCATCATACAAGATGATGCCGTGGGAGAAGAATTGGGT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TATACAATAATAGCCCAGAGCCCATAAATTGGGTGGCCATCATACAAGATGATGCCGTGGGAGAAGAATTGGGT  888

Query  889  ACAGATATTCAACAAAGAACAGATATTGCTTTAAATAATCTCACCTACATAAGAAAAATAAAGAACATAGATAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACAGATATTCAACAAAGAACAGATATTGCTTTAAATAATCTCACCTACATAAGAAAAATAAAGAACATAGATAC  962

Query  963  TACTATCATTATCTCCTGTCTTCCTAATGAAGGGACTTTACAACCTTATCAAAAGACTGTAATTACATTTTGTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TACTATCATTATCTCCTGTCTTCCTAATGAAGGGACTTTACAACCTTATCAAAAGACTGTAATTACATTTTGTT  1036

Query 1037  TCACCCCAAAGCTAATGGCTGTTGGTAAAAAGGATATTGGACCTTCATACAGACAGGACTATGCTCTCTTTTTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCACCCCAAAGCTAATGGCTGTTGGTAAAAAGGATATTGGACCTTCATACAGACAGGACTATGCTCTCTTTTTG  1110

Query 1111  AGATTTGAGTCCGTAGGAAGTAAAGATGGATTTTTGAGAGATGATGACTATAAAACCATCAAAAGTGAACGATT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGATTTGAGTCCGTAGGAAGTAAAGATGGATTTTTGAGAGATGATGACTATAAAACCATCAAAAGTGAACGATT  1184

Query 1185  TCAGAAAGTGGAATTAGCACTGACAGGCACAGGACTTCCTGTTTTACTACAGTTTGATCCAGGACCAGTTCTTA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCAGAAAGTGGAATTAGCACTGACAGGCACAGGACTTCCTGTTTTACTACAGTTTGATCCAGGACCAGTTCTTA  1258

Query 1259  ATTTTAAACCTTGTTTCATGGGTGAACGTTCAGAAATTCAGTGCATCATAAAAAATCAATGCGAATTACTTCCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATTTTAAACCTTGTTTCATGGGTGAACGTTCAGAAATTCAGTGCATCATAAAAAATCAATGCGAATTACTTCCT  1332

Query 1333  GTGACGTACCACTTTAAAAAAACTGCAAATTTTGAAATTGATCCTGAAAAGGGCAAGATTACTGGAGGGGGTAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTGACGTACCACTTTAAAAAAACTGCAAATTTTGAAATTGATCCTGAAAAGGGCAAGATTACTGGAGGGGGTAT  1406

Query 1407  GGTGGATGTGATGTGTTCATTTGTTCCACATCAACTTGGAGTCTTCAAAGTGAAGCAGATGATAGAGATTATTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGTGGATGTGATGTGTTCATTTGTTCCACATCAACTTGGAGTCTTCAAAGTGAAGCAGATGATAGAGATTATTG  1480

Query 1481  GTTTAGTGGCAGAAGAAGATTTGCAATCTTTGTCGGTAAAATCTTTCCATCACGTATATTTAGCTTTCAACAGC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GTTTAGTGGCAGAAGAAGATTTGCAATCTTTGTCGGTAAAATCTTTCCATCACGTATATTTAGCTTTCAACAGC  1554

Query 1555  ATCTGTAAAGCTTCCACCAAGAAAGTTGTGATGAAATTTGATCCTGGTATATTGCCTTCGATCCGTAATCCCAC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATCTGTAAAGCTTCCACCAAGAAAGTTGTGATGAAATTTGATCCTGGTATATTGCCTTCGATCCGTAATCCCAC  1628

Query 1629  GGGAAAGTTTGTGGTCAAAGACTTGGCAAAACGCAAGAATTATGCACCTGTAGCAATGCTTCAATCAGCCATGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GGGAAAGTTTGTGGTCAAAGACTTGGCAAAACGCAAGAATTATGCACCTGTAGCAATGCTTCAATCAGCCATGA  1702

Query 1703  CACGCACTCACAATCATCGCTCATGTGAAGAGCCAGTGAAGGATATGCTATTAGCCTTTCCCAATGACCGAGCT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CACGCACTCACAATCATCGCTCATGTGAAGAGCCAGTGAAGGATATGCTATTAGCCTTTCCCAATGACCGAGCT  1776

Query 1777  GCAACTATCAGGTCTAAAGACCATCATAAACATTTCAGGCCAATTTTCACAAAAGTTCCAAGATTTAACTATGT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GCAACTATCAGGTCTAAAGACCATCATAAACATTTCAGGCCAATTTTCACAAAAGTTCCAAGATTTAACTATGT  1850

Query 1851  GAATCATGATTTTGCATATACTACATTTGAAAAACAGCAAAAGAAATTATATGAAAACTATTATGCAATGTATC  1924
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GAATCATGATTTTGCATATACTACATTTGAAAAACAGCAAAAGAAATTACATGAAAACTATTATGCAATGTATC  1924

Query 1925  TTAAATATTTAAGAAGTGTGCGCTTGCAGAAGAAACAAGCAGAGAGGGAGCGCATGTATTCATATGATGATACA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TTAAATATTTAAGAAGTGTGCGCTTGCAGAAGAAACAAGCAGAGAGGGAGCGCATGTATTCATATGATGATACA  1998

Query 1999  GACATAGGCTTAGAGCCGGGATCAGGTCTAAAGTCACCCTCACTCTCAGAAGCGGAAATAGAAGAGGAGCTGTC  2072
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GACATAGGCTTAGAGCCAGGATCAGGTCTAAAGTCACCCTCACTCTCAGAAGCGGAAATAGAAGAGGAGCTGTC  2072

Query 2073  TTCAGCAGCAAATTCAATTAGAGCGAATCGATTGTTAACCACCAGGGGTATAGCATCTCAGGAGGAAGAGTCTG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TTCAGCAGCAAATTCAATTAGAGCGAATCGATTGTTAACCACCAGGGGTATAGCATCTCAGGAGGAAGAGTCTG  2146

Query 2147  TGAGAAGAAAGGTTCTCAAAGGACTTAAATCAGAACCATCCACTCCACAAGAAAAACATGATTGCAGCTTAATG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TGAGAAGAAAGGTTCTCAAAGGACTTAAATCAGAACCATCCACTCCACAAGAAAAACATGATTGCAGCTTAATG  2220

Query 2221  TTGACACCAAAGCAAATTCATCAAGTAAATGTTG------------TTAGATAC--------------------  2262
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||            |||   ||                    
Sbjct 2221  TTGACACCAAAGCAAATTCATCAAGTAATTGTTGGGCCTTCTGTCCTTA---ACTTTGGTAATATTTGTGTGAA  2291

Query 2263  --------------------------------------------------------------------------  2262
                                                                                      
Sbjct 2292  CTCTCCAAATACTCATCTACTTCATGTTATTAATATGCTACCTATGCATGTTTTGCTCCAGTTAGATACTGATT  2365

Query 2263  --------------------------------------------------------------------------  2262
                                                                                      
Sbjct 2366  TAGAAGAACTTCAGAAGACCAACCAATTTTCATACGTGATTCTACCTACATCCAGTACTTATATTTCAATGGTA  2439

Query 2263  --------------------------------------------------------------------------  2262
                                                                                      
Sbjct 2440  TTTGACTCTCCCACCATTGGAAAATTTTGGAAGTCTTTCACCTTTACAGTGAACAATGTACCCAGTGGACACAT  2513

Query 2263  --------------------------------------------------------------------------  2262
                                                                                      
Sbjct 2514  CCTAGTGGTGGCAGTTGTCCAGCCAGTAACACTTGAGCTATCTTCTAATGAGCTAGTATTGAGACCACGAGGCT  2587

Query 2263  --------------------------------------------------------------------------  2262
                                                                                      
Sbjct 2588  TCTTCATGAAAACATGTTTTCGGGGGACAGTTAGATTGTATAATCGTCAGAATTGTTGTGCTCAGTTTCAATGG  2661

Query 2263  --------------------------------------------------------------------------  2262
                                                                                      
Sbjct 2662  CAACCCGTAAACACAGGAAGAGGGATAGCATTTTCTATTTGTCCAGCTAAAGGCACTGTTGAAGCATATTCCTC  2735

Query 2263  --------------------------------------------------------------------------  2262
                                                                                      
Sbjct 2736  ACTGGAATGTGAAGTAACTTGGCAGCAGGGCTTCAGTTCTCCAGAAGAAGGAGAATTTATTCTTCATGTCTTTC  2809

Query 2263  --------------------------------------------------------------------------  2262
                                                                                      
Sbjct 2810  AAGGAAACGCGTTGAAGCTAAAATGTGTTGCACATGTAATTATTTTCCTTGAACATGGTTTTTGTTTTGAGGGC  2883

Query 2263  ---------------------------------------------  2262
                                                         
Sbjct 2884  TATGAATTTGTTGGGTATACACTGGTGTATATAGTTACCTATATC  2928