Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14455
• Subject: NM_174937.4
• Aligned Length: 1758
• Identities: 1631
• Gaps: 123

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCAGGCGGGCGCCAGGTTCCAGCGGCGGCGGCGGCAGCTGCAGCAGCAGCAGCCCCGGCGGCGGCAGCCTCT  74

Query    1  -------------------------------------------------ATGGTGCCGGGCTCGGCCGGGCTGC  25
                                                             |||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTCTGGCCGATGGACGCAGAGCCGCCGCCGCCGCCGCCCTGGGTCTGGATGGTGCCGGGCTCGGCCGGGCTGC  148

Query   26  TCCGGCTCAGCGCGGGGGTCGTGGTTCCCCCGGTGCTGCTCGCCTCGGCCCCGCCGCCCGCGGCCCCGCTGCTC  99
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCCGGCTCAGCGCGGGGGTCGTGGTTCCCCCGGTGCTGCTCGCCTCGGCCCCGCCGCCCGCGGCCCCGCTGCTC  222

Query  100  CCCGGTCTCCCCGGCTGGCCGGCCCCGAGCGAGCCGGTGCTCCCGCTGCTGCCGCTGCCCTCTGCGCCAGACTC  173
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCCGGTCTCCCCGGCTGGCCGGCCCCGAGCGAGCCGGTGCTCCCGCTGCTGCCGCTGCCCTCTGCGCCAGACTC  296

Query  174  CGCCGCCGCCGCCGCCGCGCACCCCTTCCCCGCGCTCCACGGGCAGTGGCTGTTTGGTGGCCATTCTCCGTCCC  247
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGCCGCCGCCGCCGCCGCGCACCCCTTCCCCGCGCTCCACGGGCAGTGGCTGTTTGGTGGCCATTCTCCGTCCC  370

Query  248  TAGGACTGCCCCCCTCTTCCACAGTGGAGCTGGTGCCCGTCTTCCCACATCTCTGCCCTTCTGCTCTTGCAACC  321
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TAGGACTGCCCCCCTCTTCCACAGTGGAGCTGGTGCCCGTCTTCCCACATCTCTGCCCTTCTGCTCTTGCAACC  444

Query  322  CCTATTGGGAAAAGTTGGATAGACAAAAGGATTCCTAACTGTAAGATCTTTTTTAATAATTCCTTTGCTCTGGA  395
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCTATTGGGAAAAGTTGGATAGACAAAAGGATTCCTAACTGTAAGATCTTTTTTAATAATTCCTTTGCTCTGGA  518

Query  396  CTCAACGTGGATACATCCTGAGGAGTCAAGGTTTTTCCATGGGCATGAAAAGCCTCGTTTGCTGGCAAATCAAG  469
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTCAACGTGGATACATCCTGAGGAGTCAAGGTTTTTCCATGGGCATGAAAAGCCTCGTTTGCTGGCAAATCAAG  592

Query  470  TAGCTGTGTCTCTGTCCAGGCCGGCTCCTGCCTCCAGGCCGCTCCCCACGGTGGTGTTAGCACCTCAGCCCATC  543
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TAGCTGTGTCTCTGTCCAGGCCGGCTCCTGCCTCCAGGCCGCTCCCCACGGTGGTGTTAGCACCTCAGCCCATC  666

Query  544  CCAGGTGGCTGCCATAACAGCCTTAAGGTGACCAGCAGCCCCGCCATTGCCATCGCCACCGCCGCCGCCGCTGC  617
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCAGGTGGCTGCCATAACAGCCTTAAGGTGACCAGCAGCCCCGCCATTGCCATCGCCACCGCCGCCGCCGCTGC  740

Query  618  CATGGTCTCCGTGGACCCTGAGAACCTCCGGGGCCCGTCCCCCTCCAGCGTGCAGCCGCGCCACTTCCTGACCT  691
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CATGGTCTCCGTGGACCCTGAGAACCTCCGGGGCCCGTCCCCCTCCAGCGTGCAGCCGCGCCACTTCCTGACCT  814

Query  692  TGGCACCCATCAAAATACCCCTCCGGACGTCCCCCGTCTCAGATACAAGGACAGAGCGGGGCCGAGTGGCCCGC  765
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGCACCCATCAAAATACCCCTCCGGACGTCCCCCGTCTCAGATACAAGGACAGAGCGGGGCCGAGTGGCCCGC  888

Query  766  CCTCCTGCCCTGATGCTGCGGGCCCAGAAGAGCCGGGATGGAGACAAAGAAGACAAGGAGCCTCCACCGATGCT  839
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCTCCTGCCCTGATGCTGCGGGCCCAGAAGAGCCGGGATGGAGACAAAGAAGACAAGGAGCCTCCACCGATGCT  962

Query  840  GGGGGGAGGAGAGGACAGCACAGCCAGAGGCAACAGGCCAGTGGCCTCCACCCAGGTGCCCGGATCCCCCTGGT  913
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGGGGGAGGAGAGGACAGCACAGCCAGAGGCAACAGGCCAGTGGCCTCCACCCCGGTGCCCGGATCCCCCTGGT  1036

Query  914  GTGTGGTCTGGACGGGCNATGACCGAGTTTTCTTCTTCAACCCAACGATGCACCTGTCTGTCTGGGAGAAGCCC  987
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTGTGGTCTGGACGGGCGATGACCGAGTTTTCTTCTTCAACCCAACGATGCACCTGTCTGTCTGGGAGAAGCCC  1110

Query  988  ATGGACCTGAAGGACCGCGGAGACCTCAACAGGATCATTGAGGACCCGCCCCACAAACGCAAGCTGGAGGCACC  1061
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATGGACCTGAAGGACCGCGGAGACCTCAACAGGATCATTGAGGACCCGCCCCACAAACGCAAGCTGGAGGCACC  1184

Query 1062  AGCAACTGACAACAGCGATGGGTCCAGTTCTGAAGACAACAGGGAAGACCAAGATGTGAAAACCAAGAGGAACC  1135
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGCAACTGACAACAGCGATGGGTCCAGTTCTGAAGACAACAGGGAAGACCAAGATGTGAAAACCAAGAGGAACC  1258

Query 1136  GGACCGAAGGCTGCGGGAGTCCCAAGCCAGAGGAGGCAAAGAGAGAGGACAAAGGCACAAGGACGCCGCCCCCG  1209
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGACCGAAGGCTGCGGGAGTCCCAAGCCAGAGGAGGCAAAGAGAGAGGACAAAGGCACAAGGACGCCGCCCCCG  1332

Query 1210  CAGATCCTCCTGCCTCTGGAGGAGCGTGTGACCCACTTCCGAGACATGCTGCTGGAGAGAGGGGTATCAGCATT  1283
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAGATCCTCCTGCCTCTGGAGGAGCGTGTGACCCACTTCCGAGACATGCTGCTGGAGAGAGGGGTATCAGCATT  1406

Query 1284  TTCTACCTGGGAGAAAGAATTACACAAAATCGTGTTTGACCCACGCTATCTCCTGCTCAACTCTGAGGAACGAA  1357
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TTCTACCTGGGAGAAAGAATTACACAAAATCGTGTTTGACCCACGCTATCTCCTGCTCAACTCTGAGGAACGAA  1480

Query 1358  AGCAGATATTTGAACAGTTTGTCAAGACAAGAATAAAAGAAGAATACAAGGAAAAGAAAAGTAAATTGCTGCTA  1431
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGCAGATATTTGAACAGTTTGTCAAGACAAGAATAAAAGAAGAATACAAGGAAAAGAAAAGTAAATTGCTGCTA  1554

Query 1432  GCCAAAGAAGAATTCAAGAAACTTCTAGAGAAATCTAAAGTGTCTCCCAGGACCACGTTTAAGGAGTTTGCAGA  1505
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GCCAAAGAAGAATTCAAGAAACTTCTAGAGGAATCTAAAGTGTCTCCCAGGACCACGTTTAAGGAGTTTGCAGA  1628

Query 1506  GAAATACGGCCGGGATCAGAGGTTCCGACTTGTTCAAAAAAGAAAGGACCAGGAGCATTTTTTCAACAAATTCA  1579
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1629  GAAATACGGCCGGGATCAGAGGTTCCGACTTGTTCAAAAAAGAAAGGACCAGGAGCATTTTTTCAACCAATTCA  1702

Query 1580  TACTTATTCTTAAGAAACGGGACAAGGAAAACAGACTAAGGCTGCGGAAAATGAGA  1635
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TACTTATTCTTAAGAAACGGGACAAGGAAAACAGACTAAGGCTGCGGAAAATGAGA  1758