Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14485
• Subject: NM_198567.5
• Aligned Length: 1371
• Identities: 982
• Gaps: 372

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAGGATTTCATCGTGATCTCGGACGACAGCGGCTCTGAGAGCTCCGGGGGCGCCCGCCCGGGCCGGTCGCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GAGGCCGCGCCGGGCCCTGTCGCGAACCTCCGGCGCGCTGCCCCGCCGGACCGTGAACAAGGGTCAAAAATTAG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  AACCCATCCCTCATCGAAGACTAAGAATGGTAACAAATACCATTGAAGAGAATTTTCCTCTGGGGACTGTGCAG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  TTTTTGATGGACTTTGTGTCACCCCAGCATTACCCACCAAGAGAAATCGTGGCTCACATCATCCAGAAAATCTT  296

Query    1  -----------------------------------ATGCCTAGATCC-----------ATTGAACAAGTA-AT-  26
                                               |.|||||.||.|           |||.||||..|| || 
Sbjct  297  GCTCAGTGGCTCTGAGACTGTGGATGTCCTAAAGGAGGCCTACATGCTTCTCATGAAAATTCAACAGCTACATC  370

Query   27  -----AATACTTAAAAAATGGTTT----CTGAAACCT-------TAT------------AAGGGACAAACTCTG  72
                 |||.|..|.|.|.|||..|    |||.||.||       |||            .||||||||||||||
Sbjct  371  CAGCCAATGCCAAGACAGTGGAGTGGGACTGGAAACTGCTCACCTATGTCATGGAGGAAGAGGGACAAACTCTG  444

Query   73  CCTGGGCGAGTCCTTTTCCTGCGTTATGTCGTTCAGACCCTAGAAGATGACTTTCAGCAGACCCTGAGGAGGCA  146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCTGGGCGAGTCCTTTTCCTGCGTTATGTCGTTCAGACCCTAGAAGATGACTTTCAGCAGACCCTGAGGAGGCA  518

Query  147  ACGGCAGCACCTGCAGCAATCCATTGCAAACATGGTGCTTTCCTGTGACAAGCAGCCCCACAATGTCAGGGATG  220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACGGCAGCACCTGCAGCAATCCATTGCAAACATGGTGCTTTCCTGTGACAAGCAGCCCCACAATGTCAGGGATG  592

Query  221  TTATCAAGTGGCTGGTCAAAGCAGTAACTGAAGATGGATTGACTCAGCCCCCAAATGGAAATCAAACGTCTTCA  294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTATCAAGTGGCTGGTCAAAGCAGTAACTGAAGATGGATTGACTCAGCCCCCAAATGGAAATCAAACGTCTTCA  666

Query  295  GGAACAGGAATCTTGAAAGCCAGCAGTAGCCACCCTTCTTCCCAGCCCAACCTGACAAAGAACACCAATCAGCT  368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGAACAGGAATCTTGAAAGCCAGCAGTAGCCACCCTTCTTCCCAGCCCAACCTGACAAAGAACACCAATCAGCT  740

Query  369  GATTGTGTGCCAGCTTCAGAGGATGCTCTCCATAGCCGTAGAGGTGGACAGGACCCCCACCTGCAGCTCCAATA  442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GATTGTGTGCCAGCTTCAGAGGATGCTCTCCATAGCCGTAGAGGTGGACAGGACCCCCACCTGCAGCTCCAATA  814

Query  443  AAATTGCCGAGATGATGTTTGGGTTTGTGCTGGACATTCCTGAGAGGAGCCAGAGAGAAATGTTCTTTACTACC  516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAATTGCCGAGATGATGTTTGGGTTTGTGCTGGACATTCCTGAGAGGAGCCAGAGAGAAATGTTCTTTACTACC  888

Query  517  ATGGAAAGCCACCTTCTGCGCTGCAAAGTGTTAGAAATCATATTCCTCCACAGCTGTGAGACACCCACCCGCCT  590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATGGAAAGCCACCTTCTGCGCTGCAAAGTGTTAGAAATCATATTCCTCCACAGCTGTGAGACACCCACCCGCCT  962

Query  591  GCCTCTGTCTCTGGCCCAGGCCCTCTACTTTCTGAATAATTCTACGTCACTGCTCAAGTGTCAGTCAGATAAAA  664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCCTCTGTCTCTGGCCCAGGCCCTCTACTTTCTGAATAATTCTACGTCACTGCTCAAGTGTCAGTCAGATAAAA  1036

Query  665  GCCAGTGGCAGACTTGGGACGAATTGGTTGAGCATCTGCAGTTTCTGCTGTCCAGTTATCAACATGTTTTAAGA  738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCCAGTGGCAGACTTGGGACGAATTGGTTGAGCATCTGCAGTTTCTGCTGTCCAGTTATCAACATGTTTTAAGA  1110

Query  739  GAACACTTAAGGAGTTCCGTGATCGACCGAAAGGACTTAATAATCAAAAGGATTAAGCCCAAACCCCAGCAAGG  812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAACACTTAAGGAGTTCCGTGATCGACCGAAAGGACTTAATAATCAAAAGGATTAAGCCCAAACCCCAGCAAGG  1184

Query  813  AGATGACATCACAGTGGTAGACGTAGAGAAGCAGATTGAGGCCTTCCGCAGCCGCCTGATCCAGATGCTGGGGG  886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGATGACATCACAGTGGTAGACGTAGAGAAGCAGATTGAGGCCTTCCGCAGCCGCCTGATCCAGATGCTGGGGG  1258

Query  887  AGCCTCTTGTCCCCCAACTCCAAGACAAAGTGCACTTGTTGAAGCTCCTGCTCTTCTATGCTGCGGACTTGAAC  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGCCTCTTGTCCCCCAACTCCAAGACAAAGTGCACTTGTTGAAGCTCCTGCTCTTCTATGCTGCGGACTTGAAC  1332

Query  961  CCTGATGCAGAGCCCTTTCAAAAGGGCTGGAGCGGCTCC  999
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCTGATGCAGAGCCCTTTCAAAAGGGCTGGAGCGGCTCC  1371