Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14531
• Subject: NM_001277255.1
• Aligned Length: 1557
• Identities: 1286
• Gaps: 54

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------ATGACCTTGGGCTCCCCCAGGAAAGGCCT  29
                                                         |||||||||||...|..|||.|..|||||
Sbjct    1  ATGGCAGGAAATCTCACCACATCTCTTCTCCTATCTCCAAGGACCATGACCTTGGGGAGCTTCAGAAGGGGCCT  74

Query   30  TCTGATGCTGCTGATGGCCTTGG---TGACCCAGGGAGACCCTGTGAAGCCGTCTCGGGGCCCGCTGGTGACCT  100
            |.||||||||..|.|||||||.|   |.|||..|||||||...|.||||||.||      |..||||||||.||
Sbjct   75  TTTGATGCTGTCGGTGGCCTTTGGCCTAACCAGGGGAGACTTGGCGAAGCCTTC------CAAGCTGGTGAACT  142

Query  101  GCACGTGTGAGAGCCCACATTGCAAGGGGCCTACCTGCCGGGGGGCCTGGTGCACAGTAGTGCTGGTGCGGGAG  174
            ||||.||||||||||||||.||||||.|.||...|||||.||||.|.|||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  143  GCACTTGTGAGAGCCCACACTGCAAGAGACCATTCTGCCAGGGGTCATGGTGCACAGTGGTGCTGGTTCGGGAG  216

Query  175  GAGGGGAGGCACCCCCAGGAACATCGGGGCTGCGGGAACTTGCACAGGGAGCTCTGCAGGGGGCGCCCCACCGA  248
            .||||.|||||||||||||...|||||||||||||||.|.||.||..||||||||||..|||.||.|||||.||
Sbjct  217  CAGGGCAGGCACCCCCAGGTCTATCGGGGCTGCGGGAGCCTGAACCAGGAGCTCTGCTTGGGACGTCCCACAGA  290

Query  249  GTTCGTCAACCACTACTGCTGCGACAGCCACCTCTGCAACCACAACGTGTCCCTGGTGCTGGAGGCCACCCAAC  322
            |||..|.|||||..||||||||.|.||...|.|||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||.
Sbjct  291  GTTTCTGAACCATCACTGCTGCTATAGATCCTTCTGCAACCACAACGTGTCTCTGATGCTGGAGGCCACCCAAA  364

Query  323  CTCCTTCGGAGCAGCCGGGAACAGATGGCCAGCTGGCCCTGATCCTGGGCCCCGTGCTGGCCTTGCTGGCCCTG  396
            |||||||||||.||||.|.|...||||.|||.|||.|.|||||||||||.||.|||||||||||||.||.||||
Sbjct  365  CTCCTTCGGAGGAGCCAGAAGTTGATGCCCATCTGCCTCTGATCCTGGGTCCTGTGCTGGCCTTGCCGGTCCTG  438

Query  397  GTGGCCCTGGGTGTCCTGGGCCTGTGGCATGTCCGACGGAGGCAGGAGAAGCAGCGTGGCCTGCACAGCGAGCT  470
            |||||||||||||..||.|||.||||||.||||||.||||||||||||||||||||.|...|||||||.||.||
Sbjct  439  GTGGCCCTGGGTGCTCTAGGCTTGTGGCGTGTCCGGCGGAGGCAGGAGAAGCAGCGGGATTTGCACAGTGACCT  512

Query  471  GGGAGAGTCCAGTCTCATCCTGAAAGCATCTGAGCAGGGCGACAGCATGTTGGGGGACCTCCTGGACAGTGACT  544
            |||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||..||||||||||||||||||.||||||||||.||||
Sbjct  513  GGGCGAGTCCAGTCTCATCCTGAAGGCATCTGAACAGGCAGACAGCATGTTGGGGGACTTCCTGGACAGCGACT  586

Query  545  GCACCACAGGGAGTGGCTCAGGGCTCCCCTTCCTGGTGCAGAGGACAGTGGCACGGCAGGTTGCCTTGGTGGAG  618
            |.||.||.||.||.|||||.||||||||||||.|||||||||||||.||.||.|||||||||||..||||.|||
Sbjct  587  GTACTACGGGCAGCGGCTCGGGGCTCCCCTTCTTGGTGCAGAGGACGGTAGCTCGGCAGGTTGCGCTGGTAGAG  660

Query  619  TGTGTGGGAAAAGGCCGCTATGGCGAAGTGTGGCGGGGCTTGTGGCACGGTGAGAGTGTGGCCGTCAAGATCTT  692
            |||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.|.||||||.||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct  661  TGTGTGGGAAAGGGCCGATATGGTGAGGTGTGGCGCGGTTCGTGGCATGGCGAGAGTGTGGCGGTCAAGATTTT  734

Query  693  CTCCTCGAGGGATGAACAGTCCTGGTTCCGGGAGACTGAGATCTATAACACAGTGTTGCTCAGACACGACAACA  766
            ||||||..|.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||..||||.|||||||||||||
Sbjct  735  CTCCTCACGAGATGAGCAGTCCTGGTTCCGGGAGACGGAGATCTACAACACAGTTCTGCTTAGACACGACAACA  808

Query  767  TCCTAGGCTTCATCGCCTCAGACATGACCTCCCGCAACTCGAGCACGCAGCTGTGGCTCATCACGCACTACCAC  840
            |||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  809  TCCTAGGCTTCATCGCCTCCGACATGACTTCGCGGAACTCGAGCACGCAGCTGTGGCTCATCACCCACTACCAT  882

Query  841  GAGCACGGCTCCCTCTACGACTTTCTGCAGAGACAGACGCTGGAGCCCCATCTGGCTCTGAGGCTAGCTGTGTC  914
            ||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||
Sbjct  883  GAACACGGCTCCCTCTATGACTTTCTGCAGAGGCAGACGCTGGAGCCCCAGTTGGCCCTGAGGCTAGCTGTGTC  956

Query  915  CGCGGCATGCGGCCTGGCGCACCTGCACGTGGAGATCTTCGGTACACAGGGCAAACCAGCCATTGCCCACCGCG  988
            ||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  957  CGCGGCCTGCGGCCTGGCGCACCTACATGTGGAGATCTTTGGCACTCAAGGCAAACCAGCCATTGCCCATCGTG  1030

Query  989  ACTTCAAGAGCCGCAATGTGCTGGTCAAGAGCAACCTGCAGTGTTGCATCGCCGACCTGGGCCTGGCTGTGATG  1062
            ||.|||||||.||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1031  ACCTCAAGAGTCGCAATGTGCTGGTCAAGAGTAACTTGCAGTGTTGCATTGCAGACCTGGGACTGGCTGTGATG  1104

Query 1063  CACTCACAGGGCAGCGATTACCTGGACATCGGCAACAACCCGAGAGTGGGCACCAAGCGGTACATGGCACCCGA  1136
            ||||||||..||||||||||||||||.||||||||||||||..|||||||.|||||..|.||||||||||||||
Sbjct 1105  CACTCACAAAGCAGCGATTACCTGGATATCGGCAACAACCCCCGAGTGGGTACCAAAAGATACATGGCACCCGA  1178

Query 1137  GGTGCTGGACGAGCAGATCCGCACGGACTGCTTTGAGTCCTACAAGTGGACTGACATCTGGGCCTTTGGCCTGG  1210
            |||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1179  GGTGCTGGATGAGCACATCCGCACAGACTGCTTTGAGTCGTACAAGTGGACAGACATCTGGGCCTTTGGCCTAG  1252

Query 1211  TGCTGTGGGAGATTGCCCGCCGGACCATCGTGAATGGCATCGTGGAGGACTATAGACCACCCTTCTATGATGTG  1284
            ||||.||||||||.|||||.|||||||||.|.||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||..||
Sbjct 1253  TGCTATGGGAGATCGCCCGGCGGACCATCATCAATGGCATTGTGGAGGATTACAGGCCACCTTTCTATGACATG  1326

Query 1285  GTGCCCAATGACCCCAGCTTTGAGGACATGAAGAAGGTGGTGTGTGTGGATCAGCAGACCCCCACCATCCCTAA  1358
            ||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1327  GTACCCAATGACCCCAGTTTTGAGGACATGAAAAAGGTGGTGTGCGTTGACCAGCAGACACCCACCATCCCTAA  1400

Query 1359  CCGGCTGGCTGCAGACCCGGTCCTCTCAGGCCTAGCTCAGATGATGCGGGAGTGCTGGTACCCAAACCCCTCTG  1432
            |||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||.|.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1401  CCGGCTGGCTGCAGATCCGGTCCTCTCCGGGCTGGCCCAGATGATGAGAGAGTGCTGGTACCCCAACCCCTCTG  1474

Query 1433  CCCGACTCACCGCGCTGCGGATCAAGAAGACACTACAAAAAATTAGCAACAGTCCAGAGAAGCCTAAAGTGATT  1506
            |.||.||||||||.|||||.||.|||||||||.|.||.||..|.||..|||.||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1475  CTCGCCTCACCGCACTGCGCATAAAGAAGACATTGCAGAAGCTCAGTCACAATCCAGAGAAGCCCAAAGTGATT  1548

Query 1507  CAA  1509
            ||.
Sbjct 1549  CAC  1551