Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14531
• Subject: NM_001277259.1
• Aligned Length: 1512
• Identities: 1286
• Gaps: 9

Alignment

Query    1  ATGACCTTGGGCTCCCCCAGGAAAGGCCTTCTGATGCTGCTGATGGCCTTGG---TGACCCAGGGAGACCCTGT  71
            |||||||||||...|..|||.|..||||||.||||||||..|.|||||||.|   |.|||..|||||||...|.
Sbjct    1  ATGACCTTGGGGAGCTTCAGAAGGGGCCTTTTGATGCTGTCGGTGGCCTTTGGCCTAACCAGGGGAGACTTGGC  74

Query   72  GAAGCCGTCTCGGGGCCCGCTGGTGACCTGCACGTGTGAGAGCCCACATTGCAAGGGGCCTACCTGCCGGGGGG  145
            ||||||.||      |..||||||||.||||||.||||||||||||||.||||||.|.||...|||||.||||.
Sbjct   75  GAAGCCTTC------CAAGCTGGTGAACTGCACTTGTGAGAGCCCACACTGCAAGAGACCATTCTGCCAGGGGT  142

Query  146  CCTGGTGCACAGTAGTGCTGGTGCGGGAGGAGGGGAGGCACCCCCAGGAACATCGGGGCTGCGGGAACTTGCAC  219
            |.|||||||||||.||||||||.||||||.||||.|||||||||||||...|||||||||||||||.|.||.||
Sbjct  143  CATGGTGCACAGTGGTGCTGGTTCGGGAGCAGGGCAGGCACCCCCAGGTCTATCGGGGCTGCGGGAGCCTGAAC  216

Query  220  AGGGAGCTCTGCAGGGGGCGCCCCACCGAGTTCGTCAACCACTACTGCTGCGACAGCCACCTCTGCAACCACAA  293
            ..||||||||||..|||.||.|||||.|||||..|.|||||..||||||||.|.||...|.|||||||||||||
Sbjct  217  CAGGAGCTCTGCTTGGGACGTCCCACAGAGTTTCTGAACCATCACTGCTGCTATAGATCCTTCTGCAACCACAA  290

Query  294  CGTGTCCCTGGTGCTGGAGGCCACCCAACCTCCTTCGGAGCAGCCGGGAACAGATGGCCAGCTGGCCCTGATCC  367
            ||||||.|||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||.|.|...||||.|||.|||.|.|||||||
Sbjct  291  CGTGTCTCTGATGCTGGAGGCCACCCAAACTCCTTCGGAGGAGCCAGAAGTTGATGCCCATCTGCCTCTGATCC  364

Query  368  TGGGCCCCGTGCTGGCCTTGCTGGCCCTGGTGGCCCTGGGTGTCCTGGGCCTGTGGCATGTCCGACGGAGGCAG  441
            ||||.||.|||||||||||||.||.|||||||||||||||||..||.|||.||||||.||||||.|||||||||
Sbjct  365  TGGGTCCTGTGCTGGCCTTGCCGGTCCTGGTGGCCCTGGGTGCTCTAGGCTTGTGGCGTGTCCGGCGGAGGCAG  438

Query  442  GAGAAGCAGCGTGGCCTGCACAGCGAGCTGGGAGAGTCCAGTCTCATCCTGAAAGCATCTGAGCAGGGCGACAG  515
            |||||||||||.|...|||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||..|||||
Sbjct  439  GAGAAGCAGCGGGATTTGCACAGTGACCTGGGCGAGTCCAGTCTCATCCTGAAGGCATCTGAACAGGCAGACAG  512

Query  516  CATGTTGGGGGACCTCCTGGACAGTGACTGCACCACAGGGAGTGGCTCAGGGCTCCCCTTCCTGGTGCAGAGGA  589
            |||||||||||||.||||||||||.|||||.||.||.||.||.|||||.||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  513  CATGTTGGGGGACTTCCTGGACAGCGACTGTACTACGGGCAGCGGCTCGGGGCTCCCCTTCTTGGTGCAGAGGA  586

Query  590  CAGTGGCACGGCAGGTTGCCTTGGTGGAGTGTGTGGGAAAAGGCCGCTATGGCGAAGTGTGGCGGGGCTTGTGG  663
            |.||.||.|||||||||||..||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.|.||||
Sbjct  587  CGGTAGCTCGGCAGGTTGCGCTGGTAGAGTGTGTGGGAAAGGGCCGATATGGTGAGGTGTGGCGCGGTTCGTGG  660

Query  664  CACGGTGAGAGTGTGGCCGTCAAGATCTTCTCCTCGAGGGATGAACAGTCCTGGTTCCGGGAGACTGAGATCTA  737
            ||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||..|.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  661  CATGGCGAGAGTGTGGCGGTCAAGATTTTCTCCTCACGAGATGAGCAGTCCTGGTTCCGGGAGACGGAGATCTA  734

Query  738  TAACACAGTGTTGCTCAGACACGACAACATCCTAGGCTTCATCGCCTCAGACATGACCTCCCGCAACTCGAGCA  811
            .||||||||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct  735  CAACACAGTTCTGCTTAGACACGACAACATCCTAGGCTTCATCGCCTCCGACATGACTTCGCGGAACTCGAGCA  808

Query  812  CGCAGCTGTGGCTCATCACGCACTACCACGAGCACGGCTCCCTCTACGACTTTCTGCAGAGACAGACGCTGGAG  885
            |||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  809  CGCAGCTGTGGCTCATCACCCACTACCATGAACACGGCTCCCTCTATGACTTTCTGCAGAGGCAGACGCTGGAG  882

Query  886  CCCCATCTGGCTCTGAGGCTAGCTGTGTCCGCGGCATGCGGCCTGGCGCACCTGCACGTGGAGATCTTCGGTAC  959
            |||||..||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct  883  CCCCAGTTGGCCCTGAGGCTAGCTGTGTCCGCGGCCTGCGGCCTGGCGCACCTACATGTGGAGATCTTTGGCAC  956

Query  960  ACAGGGCAAACCAGCCATTGCCCACCGCGACTTCAAGAGCCGCAATGTGCTGGTCAAGAGCAACCTGCAGTGTT  1033
            .||.||||||||||||||||||||.||.|||.|||||||.||||||||||||||||||||.|||.|||||||||
Sbjct  957  TCAAGGCAAACCAGCCATTGCCCATCGTGACCTCAAGAGTCGCAATGTGCTGGTCAAGAGTAACTTGCAGTGTT  1030

Query 1034  GCATCGCCGACCTGGGCCTGGCTGTGATGCACTCACAGGGCAGCGATTACCTGGACATCGGCAACAACCCGAGA  1107
            ||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..||||||||||||||||.||||||||||||||..||
Sbjct 1031  GCATTGCAGACCTGGGACTGGCTGTGATGCACTCACAAAGCAGCGATTACCTGGATATCGGCAACAACCCCCGA  1104

Query 1108  GTGGGCACCAAGCGGTACATGGCACCCGAGGTGCTGGACGAGCAGATCCGCACGGACTGCTTTGAGTCCTACAA  1181
            |||||.|||||..|.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1105  GTGGGTACCAAAAGATACATGGCACCCGAGGTGCTGGATGAGCACATCCGCACAGACTGCTTTGAGTCGTACAA  1178

Query 1182  GTGGACTGACATCTGGGCCTTTGGCCTGGTGCTGTGGGAGATTGCCCGCCGGACCATCGTGAATGGCATCGTGG  1255
            ||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||.|.||||||||.||||
Sbjct 1179  GTGGACAGACATCTGGGCCTTTGGCCTAGTGCTATGGGAGATCGCCCGGCGGACCATCATCAATGGCATTGTGG  1252

Query 1256  AGGACTATAGACCACCCTTCTATGATGTGGTGCCCAATGACCCCAGCTTTGAGGACATGAAGAAGGTGGTGTGT  1329
            ||||.||.||.|||||.||||||||..||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1253  AGGATTACAGGCCACCTTTCTATGACATGGTACCCAATGACCCCAGTTTTGAGGACATGAAAAAGGTGGTGTGC  1326

Query 1330  GTGGATCAGCAGACCCCCACCATCCCTAACCGGCTGGCTGCAGACCCGGTCCTCTCAGGCCTAGCTCAGATGAT  1403
            ||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 1327  GTTGACCAGCAGACACCCACCATCCCTAACCGGCTGGCTGCAGATCCGGTCCTCTCCGGGCTGGCCCAGATGAT  1400

Query 1404  GCGGGAGTGCTGGTACCCAAACCCCTCTGCCCGACTCACCGCGCTGCGGATCAAGAAGACACTACAAAAAATTA  1477
            |.|.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||||||.|.||.||..|.|
Sbjct 1401  GAGAGAGTGCTGGTACCCCAACCCCTCTGCTCGCCTCACCGCACTGCGCATAAAGAAGACATTGCAGAAGCTCA  1474

Query 1478  GCAACAGTCCAGAGAAGCCTAAAGTGATTCAA  1509
            |..|||.||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1475  GTCACAATCCAGAGAAGCCCAAAGTGATTCAC  1506