Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14534
• Subject: NM_014203.3
• Aligned Length: 3052
• Identities: 2800
• Gaps: 226

Alignment

Query    1  ATGCCGGCCGTGTCCAAGGGCGATGGGATGCGGGGGCTCGCGGTGTTCATCTCCGACATCCGGAACTGTAAGAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCGGCCGTGTCCAAGGGCGATGGGATGCGGGGGCTCGCGGTGTTCATCTCCGACATCCGGAACTGTAAGAG  74

Query   75  CAAAGAGGCGGAAATTAAGAGAATCAACAAGGAACTGGCCAACATCCGCTCCAAGTTCAAAGGAGACAAAGCCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAAAGAGGCGGAAATTAAGAGAATCAACAAGGAACTGGCCAACATCCGCTCCAAGTTCAAAGGAGACAAAGCCT  148

Query  149  TGGATGGCTACAGTAAGAAAAAATATGTGTGTAAACTGCTTTTCATCTTCCTGCTTGGCCATGACATTGACTTT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGATGGCTACAGTAAGAAAAAATATGTGTGTAAACTGCTTTTCATCTTCCTGCTTGGCCATGACATTGACTTT  222

Query  223  GGGCACATGGAGGCTGTGAATCTGTTGAGTTCCAATAAATACACAGAGAAGCAAATAGGTTACCTGTTCATTTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGGCACATGGAGGCTGTGAATCTGTTGAGTTCCAATAAATACACAGAGAAGCAAATAGGTTACCTGTTCATTTC  296

Query  297  TGTGCTGGTGAACTCGAACTCGGAGCTGATCCGCCTCATCAACAACGCCATCAAGAATGACCTGGCCAGCCGCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGTGCTGGTGAACTCGAACTCGGAGCTGATCCGCCTCATCAACAACGCCATCAAGAATGACCTGGCCAGCCGCA  370

Query  371  ACCCCACCTTCATGTGCCTGGCCCTGCACTGCATCGCCAACGTGGGCAGCCGGGAGATGGGCGAGGCCTTTGCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACCCCACCTTCATGTGCCTGGCCCTGCACTGCATCGCCAACGTGGGCAGCCGGGAGATGGGCGAGGCCTTTGCC  444

Query  445  GCTGACATCCCCCGCATCCTGGTGGCCGGGGACAGCATGGACAGTGTCAAGCAGAGTGCGGCCCTGTGCCTCCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCTGACATCCCCCGCATCCTGGTGGCCGGGGACAGCATGGACAGTGTCAAGCAGAGTGCGGCCCTGTGCCTCCT  518

Query  519  TCGACTGTACAAGGCCTCGCCTGACCTGGTGCCCATGGGCGAGTGGACGGCGCGTGTGGTACACCTGCTCAATG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCGACTGTACAAGGCCTCGCCTGACCTGGTGCCCATGGGCGAGTGGACGGCGCGTGTGGTACACCTGCTCAATG  592

Query  593  ACCAGCACATGGGTGTGGTCACGGCCGCCGTCAGCCTCATCACCTGTCTCTGCAAGAAGAACCCAGATGACTTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACCAGCACATGGGTGTGGTCACGGCCGCCGTCAGCCTCATCACCTGTCTCTGCAAGAAGAACCCAGATGACTTC  666

Query  667  AAGACGTGCGTCTCTCTGGCTGTGTCGCGCCTGAGCCGGATCGTCTCCTCTGCCTCCACCGACCTCCAGGACTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGACGTGCGTCTCTCTGGCTGTGTCGCGCCTGAGCCGGATCGTCTCCTCTGCCTCCACCGACCTCCAGGACTA  740

Query  741  CACCTACTACTTCGTCCCAGCACCCTGGCTCTCGGTGAAGCTCCTGCGGCTGCTGCAGTGCTACCCGCTTCCAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  741  CACCTACTACTTCGTCCCAGCACCCTGGCTCTCGGTGAAGCTCCTGCGGCTGCTGCAGTGCTACCCGCCTCCAG  814

Query  815  AGGATGCGGCTGTGAAGGGGCGGCTGGTGGAATGTCTGGAGACTGTGCTCAACAAGGCCCAGGAGCCCCCCAAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGATGCGGCTGTGAAGGGGCGGCTGGTGGAATGTCTGGAGACTGTGCTCAACAAGGCCCAGGAGCCCCCCAAA  888

Query  889  TCCAAGAAGGTGCAGCATTCCAACGCCAAGAACGCCATCCTCTTCGAGACCATCAGCCTCATCATCCACTATGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCCAAGAAGGTGCAGCATTCCAACGCCAAGAACGCCATCCTCTTCGAGACCATCAGCCTCATCATCCACTATGA  962

Query  963  CAGTGAGCCCAACCTCCTGGTTCGGGCCTGCAACCAGCTGGGCCAGTTCCTGCAGCACCGGGAGACCAACCTGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAGTGAGCCCAACCTCCTGGTTCGGGCCTGCAACCAGCTGGGCCAGTTCCTGCAGCACCGGGAGACCAACCTGC  1036

Query 1037  GCTACCTGGCCCTGGAGAGCATGTGCACGCTGGCCAGCTCCGAGTTCTCCCATGAAGCCGTCAAGACGCACATT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCTACCTGGCCCTGGAGAGCATGTGCACGCTGGCCAGCTCCGAGTTCTCCCATGAAGCCGTCAAGACGCACATT  1110

Query 1111  GACACCGTCATCAATGCCCTCAAGACGGAGCGGGACGTCAGCGTGCGGCAGCGGGCGGCTGACCTCCTCTACGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GACACCGTCATCAATGCCCTCAAGACGGAGCGGGACGTCAGCGTGCGGCAGCGGGCGGCTGACCTCCTCTACGC  1184

Query 1185  CATGTGTGACCGGAGCAATGCCAAGCAGATCGTGTCGGAGATGCTGCGGTACCTGGAGACGGCAGACTACGCCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CATGTGTGACCGGAGCAATGCCAAGCAGATCGTGTCGGAGATGCTGCGGTACCTGGAGACGGCAGACTACGCCA  1258

Query 1259  TCCGCGAGGAGATCGTCCTGAAGGTGGCCATCCTGGCCGAGAAGTACGCCGTGGACTACAGCTGGTACGTGGAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCCGCGAGGAGATCGTCCTGAAGGTGGCCATCCTGGCCGAGAAGTACGCCGTGGACTACAGCTGGTACGTGGAC  1332

Query 1333  ACCATCCTCAACCTCATCCGCATTGCGGGCGACTACGTGAGTGAGGAGGTGTGGTACCGTGTGCTACAGATCGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACCATCCTCAACCTCATCCGCATTGCGGGCGACTACGTGAGTGAGGAGGTGTGGTACCGTGTGCTACAGATCGT  1406

Query 1407  CACCAACCGTGATGACGTCCAGGGCTATGCCGCCAAGACCGTCTTTGAGGCGCTCCAGGCCCCTGCCTGTCACG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CACCAACCGTGATGACGTCCAGGGCTATGCCGCCAAGACCGTCTTTGAGGCGCTCCAGGCCCCTGCCTGTCACG  1480

Query 1481  AGAACATGGTGAAGGTTGGCGGCTACATCCTTGGGGAGTTTGGGAACCTGATTGCTGGGGACCCCCGCTCCAGC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGAACATGGTGAAGGTTGGCGGCTACATCCTTGGGGAGTTTGGGAACCTGATTGCTGGGGACCCCCGCTCCAGC  1554

Query 1555  CCCCCAGTGCAGTTCTCCCTGCTCCACTCCAAGTTCCATCTGTGCAGCGTGGCCACGCGGGCGCTGCTGCTGTC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCCCCAGTGCAGTTCTCCCTGCTCCACTCCAAGTTCCATCTGTGCAGCGTGGCCACGCGGGCGCTGCTGCTGTC  1628

Query 1629  CACCTACATCAAGTTCATCAACCTCTTCCCCGAGACCAAGGCCACCATCCAGNGGNGNTCTGCGGGCCGGCTCC  1702
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||.|..|||||||||||||||
Sbjct 1629  CACCTACATCAAGTTCATCAACCTCTTCCCCGAGACCAAGGCCACCATCCAG-GGCGTCCTGCGGGCCGGCTCC  1701

Query 1703  CAGCTGCGCAATGCTGACGTGGAGCTGCAGCAGCGAGCCGTGGAGTACCTCACCCTCAGCTCAGTGGCCAGCAC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702  CAGCTGCGCAATGCTGACGTGGAGCTGCAGCAGCGAGCCGTGGAGTACCTCACCCTCAGCTCAGTGGCCAGCAC  1775

Query 1777  CGACGTCCTGGCCACGGTGCTGGAGGAGATGCCGCCCTTCCCCGAGCGCGAGTCGTCCATCCTGGCCAAGCTGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776  CGACGTCCTGGCCACGGTGCTGGAGGAGATGCCGCCCTTCCCCGAGCGCGAGTCGTCCATCCTGGCCAAGCTGA  1849

Query 1851  AACGCAAGAAGGGGCCAGGGGCCGGCAGCGCCCTGGACGATGGCCGGAGGGACCCCAGCAGCAACGACATCAAC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850  AACGCAAGAAGGGGCCAGGGGCCGGCAGCGCCCTGGACGATGGCCGGAGGGACCCCAGCAGCAACGACATCAAC  1923

Query 1925  GGGGGCATGGAGCCCACCCCCAGCACTGTGTCGACGCCCTCGCCCTCCGCCGACCTCCTGGGGCTGCGGGCAGC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1924  GGGGGCATGGAGCCCACCCCCAGCACTGTGTCGACGCCCTCGCCCTCCGCCGACCTCCTGGGGCTGCGGGCAGC  1997

Query 1999  CCCTCCCCCGGCAGCACCCCCGGCTTCTGCAGGAGCAGGGAACCTTCTGGTGGACGTCTTCGATGGCCCGGCCG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1998  CCCTCCCCCGGCAGCACCCCCGGCTTCTGCAGGAGCAGGGAACCTTCTGGTGGACGTCTTCGATGGCCCGGCCG  2071

Query 2073  CCCAGCCCAGCCTGGGGCCCACCCCCGAGGAGGCCTTCCTCAG-------------------------------  2115
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct 2072  CCCAGCCCAGCCTGGGGCCCACCCCCGAGGAGGCCTTCCTCAGCGAGCTGGAGCCGCCTGCCCCCGAGAGCCCC  2145

Query 2116  -----------------------------------CCCAGGTCCTGAGGACATCGGCCCTCCCATTCCGGAAGC  2154
                                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2146  ATGGCTTTGCTGGCTGACCCAGCTCCAGCTGCTGACCCAGGTCCTGAGGACATCGGCCCTCCCATTCCGGAAGC  2219

Query 2155  CGATGAGTTGCTGAATAAGTTTGTGTGTAAGAACAACGGGGTCCTGTTCGAGAACCAGCTGCTGCAGATCGGAG  2228
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220  CGATGAGTTGCTGAATAAGTTTGTGTGTAAGAACAACGGGGTCCTGTTCGAGAACCAGCTGCTGCAGATCGGAG  2293

Query 2229  TCAAGTCAGAGTTCCGACAGAACCTGGGCCGCATGTATCTCTTCTATGGCAACAAGACCTCGGTGCAGTTCCAG  2302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2294  TCAAGTCAGAGTTCCGACAGAACCTGGGCCGCATGTATCTCTTCTATGGCAACAAGACCTCGGTGCAGTTCCAG  2367

Query 2303  AATTTCTCACCCACTGTGGTTCACCCGGGAGACCTCCAGACTCAGCTGGCTGTGCAGACCAAGCGCGTGGCGGC  2376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2368  AATTTCTCACCCACTGTGGTTCACCCGGGAGACCTCCAGACTCAGCTGGCTGTGCAGACCAAGCGCGTGGCGGC  2441

Query 2377  GCAGGTGGACGGCGGCGCGCAGGTGCAGCAGGTGCTCAATATCGAGTGCCTGCGGGACTTCCTGACGCCCCCGC  2450
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2442  GCAGGTGGACGGCGGCGCGCAGGTGCAGCAGGTGCTCAATATCGAGTGCCTGCGGGACTTCCTGACGCCCCCGC  2515

Query 2451  TGCTGTCCGTGCGCTTCCGGTACGGTGGCGCCCCCCAGGCCCTCACCCTGAAGCTCCCAGTGACCATCAACAAG  2524
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2516  TGCTGTCCGTGCGCTTCCGGTACGGTGGCGCCCCCCAGGCCCTCACCCTGAAGCTCCCAGTGACCATCAACAAG  2589

Query 2525  TTCTTCCAGCCCACCGAGATGGCGGCCCAGGATTTCTTCCAGCGCTGGAAGCAGCTGAGCCTCCCTCAACAGGA  2598
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2590  TTCTTCCAGCCCACCGAGATGGCGGCCCAGGATTTCTTCCAGCGCTGGAAGCAGCTGAGCCTCCCTCAACAGGA  2663

Query 2599  GGCGCAGAAAATCTTCAAAGCCAACCACCCCATGGACGCAGAAGTTACTAAGGCCAAGCTTCTGGGGTTTGGCT  2672
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2664  GGCGCAGAAAATCTTCAAAGCCAACCACCCCATGGACGCAGAAGTTACTAAGGCCAAGCTTCTGGGGTTTGGCT  2737

Query 2673  CTGCTCTCCTGGACAATGTGGACCCCAACCCTGGTGACAGAGAAGACACCAGGGTT--TGGGGGATGCCTGGGA  2744
            ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||         .||  ||||||    |.||||
Sbjct 2738  CTGCTCTCCTGGACAATGTGGACCCCAACCCT-------GAGAA---------CTTCGTGGGGG----CGGGGA  2791

Query 2745  CTTTCCTCCGGCCTTTTGTATTTTTATTTTTGTTCA----TCTGC-----TGCTGTTTACATTCTGGGGGGTTA  2809
               ||.|||.|.||                     |    .||||     .|||||.|.| |||    ||.|  
Sbjct 2792  ---TCATCCAGACT---------------------AAAGCCCTGCAGGTGGGCTGTCTGC-TTC----GGCT--  2834

Query 2810  GGGGGAGTCCCCCTCCCTCCCTTTCCCCCCCAA-GCACAGAGGGGAGAGGGGCCAGGGAAGTGGATGT--CTCC  2880
               ||||                     ||||| ||.||          ||.|||        |||||  |..|
Sbjct 2835  ---GGAG---------------------CCCAATGCCCA----------GGCCCA--------GATGTACCGGC  2866

Query 2881  T--CCCCTCCCACC--CCACCCTGTTGTAGCCCCTCCTACCCCG-CCCNCATCCAGGGGCTGTGTATTATTG--  2947
            |  |||..|.||||  |.|       |.|||||.||   .|||| |.|           |||||      ||  
Sbjct 2867  TGACCCTGCGCACCAGCAA-------GGAGCCCGTC---TCCCGTCAC-----------CTGTG------TGAG  2913

Query 2948  ------------------  2947
                              
Sbjct 2914  CTGCTGGCACAGCAGTTC  2931