Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14534
- Subject:
- NM_130787.3
- Aligned Length:
- 2986
- Identities:
- 2800
- Gaps:
- 160
Alignment
Query 1 ATGCCGGCCGTGTCCAAGGGCGATGGGATGCGGGGGCTCGCGGTGTTCATCTCCGACATCCGGAACTGTAAGAG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCGGCCGTGTCCAAGGGCGATGGGATGCGGGGGCTCGCGGTGTTCATCTCCGACATCCGGAACTGTAAGAG 74
Query 75 CAAAGAGGCGGAAATTAAGAGAATCAACAAGGAACTGGCCAACATCCGCTCCAAGTTCAAAGGAGACAAAGCCT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAAAGAGGCGGAAATTAAGAGAATCAACAAGGAACTGGCCAACATCCGCTCCAAGTTCAAAGGAGACAAAGCCT 148
Query 149 TGGATGGCTACAGTAAGAAAAAATATGTGTGTAAACTGCTTTTCATCTTCCTGCTTGGCCATGACATTGACTTT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGGATGGCTACAGTAAGAAAAAATATGTGTGTAAACTGCTTTTCATCTTCCTGCTTGGCCATGACATTGACTTT 222
Query 223 GGGCACATGGAGGCTGTGAATCTGTTGAGTTCCAATAAATACACAGAGAAGCAAATAGGTTACCTGTTCATTTC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGGCACATGGAGGCTGTGAATCTGTTGAGTTCCAATAAATACACAGAGAAGCAAATAGGTTACCTGTTCATTTC 296
Query 297 TGTGCTGGTGAACTCGAACTCGGAGCTGATCCGCCTCATCAACAACGCCATCAAGAATGACCTGGCCAGCCGCA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGTGCTGGTGAACTCGAACTCGGAGCTGATCCGCCTCATCAACAACGCCATCAAGAATGACCTGGCCAGCCGCA 370
Query 371 ACCCCACCTTCATGTGCCTGGCCCTGCACTGCATCGCCAACGTGGGCAGCCGGGAGATGGGCGAGGCCTTTGCC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACCCCACCTTCATGTGCCTGGCCCTGCACTGCATCGCCAACGTGGGCAGCCGGGAGATGGGCGAGGCCTTTGCC 444
Query 445 GCTGACATCCCCCGCATCCTGGTGGCCGGGGACAGCATGGACAGTGTCAAGCAGAGTGCGGCCCTGTGCCTCCT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCTGACATCCCCCGCATCCTGGTGGCCGGGGACAGCATGGACAGTGTCAAGCAGAGTGCGGCCCTGTGCCTCCT 518
Query 519 TCGACTGTACAAGGCCTCGCCTGACCTGGTGCCCATGGGCGAGTGGACGGCGCGTGTGGTACACCTGCTCAATG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCGACTGTACAAGGCCTCGCCTGACCTGGTGCCCATGGGCGAGTGGACGGCGCGTGTGGTACACCTGCTCAATG 592
Query 593 ACCAGCACATGGGTGTGGTCACGGCCGCCGTCAGCCTCATCACCTGTCTCTGCAAGAAGAACCCAGATGACTTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACCAGCACATGGGTGTGGTCACGGCCGCCGTCAGCCTCATCACCTGTCTCTGCAAGAAGAACCCAGATGACTTC 666
Query 667 AAGACGTGCGTCTCTCTGGCTGTGTCGCGCCTGAGCCGGATCGTCTCCTCTGCCTCCACCGACCTCCAGGACTA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAGACGTGCGTCTCTCTGGCTGTGTCGCGCCTGAGCCGGATCGTCTCCTCTGCCTCCACCGACCTCCAGGACTA 740
Query 741 CACCTACTACTTCGTCCCAGCACCCTGGCTCTCGGTGAAGCTCCTGCGGCTGCTGCAGTGCTACCCGCTTCCAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 741 CACCTACTACTTCGTCCCAGCACCCTGGCTCTCGGTGAAGCTCCTGCGGCTGCTGCAGTGCTACCCGCCTCCAG 814
Query 815 AGGATGCGGCTGTGAAGGGGCGGCTGGTGGAATGTCTGGAGACTGTGCTCAACAAGGCCCAGGAGCCCCCCAAA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGGATGCGGCTGTGAAGGGGCGGCTGGTGGAATGTCTGGAGACTGTGCTCAACAAGGCCCAGGAGCCCCCCAAA 888
Query 889 TCCAAGAAGGTGCAGCATTCCAACGCCAAGAACGCCATCCTCTTCGAGACCATCAGCCTCATCATCCACTATGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TCCAAGAAGGTGCAGCATTCCAACGCCAAGAACGCCATCCTCTTCGAGACCATCAGCCTCATCATCCACTATGA 962
Query 963 CAGTGAGCCCAACCTCCTGGTTCGGGCCTGCAACCAGCTGGGCCAGTTCCTGCAGCACCGGGAGACCAACCTGC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAGTGAGCCCAACCTCCTGGTTCGGGCCTGCAACCAGCTGGGCCAGTTCCTGCAGCACCGGGAGACCAACCTGC 1036
Query 1037 GCTACCTGGCCCTGGAGAGCATGTGCACGCTGGCCAGCTCCGAGTTCTCCCATGAAGCCGTCAAGACGCACATT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCTACCTGGCCCTGGAGAGCATGTGCACGCTGGCCAGCTCCGAGTTCTCCCATGAAGCCGTCAAGACGCACATT 1110
Query 1111 GACACCGTCATCAATGCCCTCAAGACGGAGCGGGACGTCAGCGTGCGGCAGCGGGCGGCTGACCTCCTCTACGC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GACACCGTCATCAATGCCCTCAAGACGGAGCGGGACGTCAGCGTGCGGCAGCGGGCGGCTGACCTCCTCTACGC 1184
Query 1185 CATGTGTGACCGGAGCAATGCCAAGCAGATCGTGTCGGAGATGCTGCGGTACCTGGAGACGGCAGACTACGCCA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CATGTGTGACCGGAGCAATGCCAAGCAGATCGTGTCGGAGATGCTGCGGTACCTGGAGACGGCAGACTACGCCA 1258
Query 1259 TCCGCGAGGAGATCGTCCTGAAGGTGGCCATCCTGGCCGAGAAGTACGCCGTGGACTACAGCTGGTACGTGGAC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCCGCGAGGAGATCGTCCTGAAGGTGGCCATCCTGGCCGAGAAGTACGCCGTGGACTACAGCTGGTACGTGGAC 1332
Query 1333 ACCATCCTCAACCTCATCCGCATTGCGGGCGACTACGTGAGTGAGGAGGTGTGGTACCGTGTGCTACAGATCGT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ACCATCCTCAACCTCATCCGCATTGCGGGCGACTACGTGAGTGAGGAGGTGTGGTACCGTGTGCTACAGATCGT 1406
Query 1407 CACCAACCGTGATGACGTCCAGGGCTATGCCGCCAAGACCGTCTTTGAGGCGCTCCAGGCCCCTGCCTGTCACG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CACCAACCGTGATGACGTCCAGGGCTATGCCGCCAAGACCGTCTTTGAGGCGCTCCAGGCCCCTGCCTGTCACG 1480
Query 1481 AGAACATGGTGAAGGTTGGCGGCTACATCCTTGGGGAGTTTGGGAACCTGATTGCTGGGGACCCCCGCTCCAGC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGAACATGGTGAAGGTTGGCGGCTACATCCTTGGGGAGTTTGGGAACCTGATTGCTGGGGACCCCCGCTCCAGC 1554
Query 1555 CCCCCAGTGCAGTTCTCCCTGCTCCACTCCAAGTTCCATCTGTGCAGCGTGGCCACGCGGGCGCTGCTGCTGTC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CCCCCAGTGCAGTTCTCCCTGCTCCACTCCAAGTTCCATCTGTGCAGCGTGGCCACGCGGGCGCTGCTGCTGTC 1628
Query 1629 CACCTACATCAAGTTCATCAACCTCTTCCCCGAGACCAAGGCCACCATCCAGNGGNGNTCTGCGGGCCGGCTCC 1702
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||.|..|||||||||||||||
Sbjct 1629 CACCTACATCAAGTTCATCAACCTCTTCCCCGAGACCAAGGCCACCATCCAG-GGCGTCCTGCGGGCCGGCTCC 1701
Query 1703 CAGCTGCGCAATGCTGACGTGGAGCTGCAGCAGCGAGCCGTGGAGTACCTCACCCTCAGCTCAGTGGCCAGCAC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702 CAGCTGCGCAATGCTGACGTGGAGCTGCAGCAGCGAGCCGTGGAGTACCTCACCCTCAGCTCAGTGGCCAGCAC 1775
Query 1777 CGACGTCCTGGCCACGGTGCTGGAGGAGATGCCGCCCTTCCCCGAGCGCGAGTCGTCCATCCTGGCCAAGCTGA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776 CGACGTCCTGGCCACGGTGCTGGAGGAGATGCCGCCCTTCCCCGAGCGCGAGTCGTCCATCCTGGCCAAGCTGA 1849
Query 1851 AACGCAAGAAGGGGCCAGGGGCCGGCAGCGCCCTGGACGATGGCCGGAGGGACCCCAGCAGCAACGACATCAAC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850 AACGCAAGAAGGGGCCAGGGGCCGGCAGCGCCCTGGACGATGGCCGGAGGGACCCCAGCAGCAACGACATCAAC 1923
Query 1925 GGGGGCATGGAGCCCACCCCCAGCACTGTGTCGACGCCCTCGCCCTCCGCCGACCTCCTGGGGCTGCGGGCAGC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1924 GGGGGCATGGAGCCCACCCCCAGCACTGTGTCGACGCCCTCGCCCTCCGCCGACCTCCTGGGGCTGCGGGCAGC 1997
Query 1999 CCCTCCCCCGGCAGCACCCCCGGCTTCTGCAGGAGCAGGGAACCTTCTGGTGGACGTCTTCGATGGCCCGGCCG 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1998 CCCTCCCCCGGCAGCACCCCCGGCTTCTGCAGGAGCAGGGAACCTTCTGGTGGACGTCTTCGATGGCCCGGCCG 2071
Query 2073 CCCAGCCCAGCCTGGGGCCCACCCCCGAGGAGGCCTTCCTCAGCCCAGGTCCTGAGGACATCGGCCCTCCCATT 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2072 CCCAGCCCAGCCTGGGGCCCACCCCCGAGGAGGCCTTCCTCAGCCCAGGTCCTGAGGACATCGGCCCTCCCATT 2145
Query 2147 CCGGAAGCCGATGAGTTGCTGAATAAGTTTGTGTGTAAGAACAACGGGGTCCTGTTCGAGAACCAGCTGCTGCA 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2146 CCGGAAGCCGATGAGTTGCTGAATAAGTTTGTGTGTAAGAACAACGGGGTCCTGTTCGAGAACCAGCTGCTGCA 2219
Query 2221 GATCGGAGTCAAGTCAGAGTTCCGACAGAACCTGGGCCGCATGTATCTCTTCTATGGCAACAAGACCTCGGTGC 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 GATCGGAGTCAAGTCAGAGTTCCGACAGAACCTGGGCCGCATGTATCTCTTCTATGGCAACAAGACCTCGGTGC 2293
Query 2295 AGTTCCAGAATTTCTCACCCACTGTGGTTCACCCGGGAGACCTCCAGACTCAGCTGGCTGTGCAGACCAAGCGC 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2294 AGTTCCAGAATTTCTCACCCACTGTGGTTCACCCGGGAGACCTCCAGACTCAGCTGGCTGTGCAGACCAAGCGC 2367
Query 2369 GTGGCGGCGCAGGTGGACGGCGGCGCGCAGGTGCAGCAGGTGCTCAATATCGAGTGCCTGCGGGACTTCCTGAC 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2368 GTGGCGGCGCAGGTGGACGGCGGCGCGCAGGTGCAGCAGGTGCTCAATATCGAGTGCCTGCGGGACTTCCTGAC 2441
Query 2443 GCCCCCGCTGCTGTCCGTGCGCTTCCGGTACGGTGGCGCCCCCCAGGCCCTCACCCTGAAGCTCCCAGTGACCA 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2442 GCCCCCGCTGCTGTCCGTGCGCTTCCGGTACGGTGGCGCCCCCCAGGCCCTCACCCTGAAGCTCCCAGTGACCA 2515
Query 2517 TCAACAAGTTCTTCCAGCCCACCGAGATGGCGGCCCAGGATTTCTTCCAGCGCTGGAAGCAGCTGAGCCTCCCT 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2516 TCAACAAGTTCTTCCAGCCCACCGAGATGGCGGCCCAGGATTTCTTCCAGCGCTGGAAGCAGCTGAGCCTCCCT 2589
Query 2591 CAACAGGAGGCGCAGAAAATCTTCAAAGCCAACCACCCCATGGACGCAGAAGTTACTAAGGCCAAGCTTCTGGG 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2590 CAACAGGAGGCGCAGAAAATCTTCAAAGCCAACCACCCCATGGACGCAGAAGTTACTAAGGCCAAGCTTCTGGG 2663
Query 2665 GTTTGGCTCTGCTCTCCTGGACAATGTGGACCCCAACCCTGGTGACAGAGAAGACACCAGGGTT--TGGGGGAT 2736
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| .|| ||||||
Sbjct 2664 GTTTGGCTCTGCTCTCCTGGACAATGTGGACCCCAACCCT-------GAGAA---------CTTCGTGGGGG-- 2719
Query 2737 GCCTGGGACTTTCCTCCGGCCTTTTGTATTTTTATTTTTGTTCA----TCTGC-----TGCTGTTTACATTCTG 2801
|.|||| ||.|||.|.|| | .|||| .|||||.|.| |||
Sbjct 2720 --CGGGGA---TCATCCAGACT---------------------AAAGCCCTGCAGGTGGGCTGTCTGC-TTC-- 2764
Query 2802 GGGGGTTAGGGGGAGTCCCCCTCCCTCCCTTTCCCCCCCAA-GCACAGAGGGGAGAGGGGCCAGGGAAGTGGAT 2874
||.| |||| ||||| ||.|| ||.||| |||
Sbjct 2765 --GGCT-----GGAG---------------------CCCAATGCCCA----------GGCCCA--------GAT 2792
Query 2875 GT--CTCCT--CCCCTCCCACC--CCACCCTGTTGTAGCCCCTCCTACCCCG-CCCNCATCCAGGGGCTGTGTA 2941
|| |..|| |||..|.|||| |.| |.|||||.|| .|||| |.| |||||
Sbjct 2793 GTACCGGCTGACCCTGCGCACCAGCAA-------GGAGCCCGTC---TCCCGTCAC-----------CTGTG-- 2843
Query 2942 TTATTG-------------------- 2947
||
Sbjct 2844 ----TGAGCTGCTGGCACAGCAGTTC 2865