Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14534
• Subject: XM_011526556.2
• Aligned Length: 3108
• Identities: 2776
• Gaps: 287

Alignment

Query    1  --------------------------------------ATGC----CGGCCGTGTCCAAGGGCG-ATGGGATGC  31
                                                  .|||    |.|.|.||..|.||.|.| |||||||..
Sbjct    1  ATGGAAACACGAGGGAGGCAAGAAGGCTGGAGGGGAGGCTGCTTCACTGACCTGAGCGAGCGAGCATGGGATCT  74

Query   32  GG-------GGGC----TCGCGGTGTTCATCTCCGACA--TCCGGAACTGTAAGAGCAAAGAGGCGGAAATTAA  92
            ||       ||.|    |.|.||||.|||    .||||  |.|.||| .|||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGATGAAGTGGTCATCGTGGAGGTGCTCA----AGACATGTTCTGAA-GGTAAGAGCAAAGAGGCGGAAATTAA  143

Query   93  GAGAATCAACAAGGAACTGGCCAACATCCGCTCCAAGTTCAAAGGAGACAAAGCCTTGGATGGCTACAGTAAGA  166
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  144  GAGAATCAACAAGGAACTGGCCAACATCCGCTCCAAGTTCAAAGGAGACAAAGCCTTGGATGGCTACAGTAAGA  217

Query  167  AAAAATATGTGTGTAAACTGCTTTTCATCTTCCTGCTTGGCCATGACATTGACTTTGGGCACATGGAGGCTGTG  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  218  AAAAATATGTGTGTAAACTGCTTTTCATCTTCCTGCTTGGCCATGACATTGACTTTGGGCACATGGAGGCTGTG  291

Query  241  AATCTGTTGAGTTCCAATAAATACACAGAGAAGCAAATAGGTTACCTGTTCATTTCTGTGCTGGTGAACTCGAA  314
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  292  AATCTGTTGAGTTCCAATAAATACACAGAGAAGCAAATAGGTTACCTGTTCATTTCTGTGCTGGTGAACTCGAA  365

Query  315  CTCGGAGCTGATCCGCCTCATCAACAACGCCATCAAGAATGACCTGGCCAGCCGCAACCCCACCTTCATGTGCC  388
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  366  CTCGGAGCTGATCCGCCTCATCAACAACGCCATCAAGAATGACCTGGCCAGCCGCAACCCCACCTTCATGTGCC  439

Query  389  TGGCCCTGCACTGCATCGCCAACGTGGGCAGCCGGGAGATGGGCGAGGCCTTTGCCGCTGACATCCCCCGCATC  462
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  440  TGGCCCTGCACTGCATCGCCAACGTGGGCAGCCGGGAGATGGGCGAGGCCTTTGCCGCTGACATCCCCCGCATC  513

Query  463  CTGGTGGCCGGGGACAGCATGGACAGTGTCAAGCAGAGTGCGGCCCTGTGCCTCCTTCGACTGTACAAGGCCTC  536
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  514  CTGGTGGCCGGGGACAGCATGGACAGTGTCAAGCAGAGTGCGGCCCTGTGCCTCCTTCGACTGTACAAGGCCTC  587

Query  537  GCCTGACCTGGTGCCCATGGGCGAGTGGACGGCGCGTGTGGTACACCTGCTCAATGACCAGCACATGGGTGTGG  610
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  588  GCCTGACCTGGTGCCCATGGGCGAGTGGACGGCGCGTGTGGTACACCTGCTCAATGACCAGCACATGGGTGTGG  661

Query  611  TCACGGCCGCCGTCAGCCTCATCACCTGTCTCTGCAAGAAGAACCCAGATGACTTCAAGACGTGCGTCTCTCTG  684
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  662  TCACGGCCGCCGTCAGCCTCATCACCTGTCTCTGCAAGAAGAACCCAGATGACTTCAAGACGTGCGTCTCTCTG  735

Query  685  GCTGTGTCGCGCCTGAGCCGGATCGTCTCCTCTGCCTCCACCGACCTCCAGGACTACACCTACTACTTCGTCCC  758
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  736  GCTGTGTCGCGCCTGAGCCGGATCGTCTCCTCTGCCTCCACCGACCTCCAGGACTACACCTACTACTTCGTCCC  809

Query  759  AGCACCCTGGCTCTCGGTGAAGCTCCTGCGGCTGCTGCAGTGCTACCCGCTTCCAGAGGATGCGGCTGTGAAGG  832
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  810  AGCACCCTGGCTCTCGGTGAAGCTCCTGCGGCTGCTGCAGTGCTACCCGCCTCCAGAGGATGCGGCTGTGAAGG  883

Query  833  GGCGGCTGGTGGAATGTCTGGAGACTGTGCTCAACAAGGCCCAGGAGCCCCCCAAATCCAAGAAGGTGCAGCAT  906
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  884  GGCGGCTGGTGGAATGTCTGGAGACTGTGCTCAACAAGGCCCAGGAGCCCCCCAAATCCAAGAAGGTGCAGCAT  957

Query  907  TCCAACGCCAAGAACGCCATCCTCTTCGAGACCATCAGCCTCATCATCCACTATGACAGTGAGCCCAACCTCCT  980
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  958  TCCAACGCCAAGAACGCCATCCTCTTCGAGACCATCAGCCTCATCATCCACTATGACAGTGAGCCCAACCTCCT  1031

Query  981  GGTTCGGGCCTGCAACCAGCTGGGCCAGTTCCTGCAGCACCGGGAGACCAACCTGCGCTACCTGGCCCTGGAGA  1054
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032  GGTTCGGGCCTGCAACCAGCTGGGCCAGTTCCTGCAGCACCGGGAGACCAACCTGCGCTACCTGGCCCTGGAGA  1105

Query 1055  GCATGTGCACGCTGGCCAGCTCCGAGTTCTCCCATGAAGCCGTCAAGACGCACATTGACACCGTCATCAATGCC  1128
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1106  GCATGTGCACGCTGGCCAGCTCCGAGTTCTCCCATGAAGCCGTCAAGACGCACATTGACACCGTCATCAATGCC  1179

Query 1129  CTCAAGACGGAGCGGGACGTCAGCGTGCGGCAGCGGGCGGCTGACCTCCTCTACGCCATGTGTGACCGGAGCAA  1202
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1180  CTCAAGACGGAGCGGGACGTCAGCGTGCGGCAGCGGGCGGCTGACCTCCTCTACGCCATGTGTGACCGGAGCAA  1253

Query 1203  TGCCAAGCAGATCGTGTCGGAGATGCTGCGGTACCTGGAGACGGCAGACTACGCCATCCGCGAGGAGATCGTCC  1276
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254  TGCCAAGCAGATCGTGTCGGAGATGCTGCGGTACCTGGAGACGGCAGACTACGCCATCCGCGAGGAGATCGTCC  1327

Query 1277  TGAAGGTGGCCATCCTGGCCGAGAAGTACGCCGTGGACTACAGCTGGTACGTGGACACCATCCTCAACCTCATC  1350
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1328  TGAAGGTGGCCATCCTGGCCGAGAAGTACGCCGTGGACTACAGCTGGTACGTGGACACCATCCTCAACCTCATC  1401

Query 1351  CGCATTGCGGGCGACTACGTGAGTGAGGAGGTGTGGTACCGTGTGCTACAGATCGTCACCAACCGTGATGACGT  1424
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1402  CGCATTGCGGGCGACTACGTGAGTGAGGAGGTGTGGTACCGTGTGCTACAGATCGTCACCAACCGTGATGACGT  1475

Query 1425  CCAGGGCTATGCCGCCAAGACCGTCTTTGAGGCGCTCCAGGCCCCTGCCTGTCACGAGAACATGGTGAAGGTTG  1498
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1476  CCAGGGCTATGCCGCCAAGACCGTCTTTGAGGCGCTCCAGGCCCCTGCCTGTCACGAGAACATGGTGAAGGTTG  1549

Query 1499  GCGGCTACATCCTTGGGGAGTTTGGGAACCTGATTGCTGGGGACCCCCGCTCCAGCCCCCCAGTGCAGTTCTCC  1572
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1550  GCGGCTACATCCTTGGGGAGTTTGGGAACCTGATTGCTGGGGACCCCCGCTCCAGCCCCCCAGTGCAGTTCTCC  1623

Query 1573  CTGCTCCACTCCAAGTTCCATCTGTGCAGCGTGGCCACGCGGGCGCTGCTGCTGTCCACCTACATCAAGTTCAT  1646
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1624  CTGCTCCACTCCAAGTTCCATCTGTGCAGCGTGGCCACGCGGGCGCTGCTGCTGTCCACCTACATCAAGTTCAT  1697

Query 1647  CAACCTCTTCCCCGAGACCAAGGCCACCATCCAGNGGNGNTCTGCGGGCCGGCTCCCAGCTGCGCAATGCTGAC  1720
            |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||.|..|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1698  CAACCTCTTCCCCGAGACCAAGGCCACCATCCAG-GGCGTCCTGCGGGCCGGCTCCCAGCTGCGCAATGCTGAC  1770

Query 1721  GTGGAGCTGCAGCAGCGAGCCGTGGAGTACCTCACCCTCAGCTCAGTGGCCAGCACCGACGTCCTGGCCACGGT  1794
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1771  GTGGAGCTGCAGCAGCGAGCCGTGGAGTACCTCACCCTCAGCTCAGTGGCCAGCACCGACGTCCTGGCCACGGT  1844

Query 1795  GCTGGAGGAGATGCCGCCCTTCCCCGAGCGCGAGTCGTCCATCCTGGCCAAGCTGAAACGCAAGAAGGGGCCAG  1868
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1845  GCTGGAGGAGATGCCGCCCTTCCCCGAGCGCGAGTCGTCCATCCTGGCCAAGCTGAAACGCAAGAAGGGGCCAG  1918

Query 1869  GGGCCGGCAGCGCCCTGGACGATGGCCGGAGGGACCCCAGCAGCAACGACATCAACGGGGGCATGGAGCCCACC  1942
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1919  GGGCCGGCAGCGCCCTGGACGATGGCCGGAGGGACCCCAGCAGCAACGACATCAACGGGGGCATGGAGCCCACC  1992

Query 1943  CCCAGCACTGTGTCGACGCCCTCGCCCTCCGCCGACCTCCTGGGGCTGCGGGCAGCCCCTCCCCCGGCAGCACC  2016
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1993  CCCAGCACTGTGTCGACGCCCTCGCCCTCCGCCGACCTCCTGGGGCTGCGGGCAGCCCCTCCCCCGGCAGCACC  2066

Query 2017  CCCGGCTTCTGCAGGAGCAGGGAACCTTCTGGTGGACGTCTTCGATGGCCCGGCCGCCCAGCCCAGCCTGGGGC  2090
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2067  CCCGGCTTCTGCAGGAGCAGGGAACCTTCTGGTGGACGTCTTCGATGGCCCGGCCGCCCAGCCCAGCCTGGGGC  2140

Query 2091  CCACCCCCGAGGAGGCCTTCCTCAG-------------------------------------------------  2115
            |||||||||||||||||||||||||                                                 
Sbjct 2141  CCACCCCCGAGGAGGCCTTCCTCAGCGAGCTGGAGCCGCCTGCCCCCGAGAGCCCCATGGCTTTGCTGGCTGAC  2214

Query 2116  -----------------CCCAGGTCCTGAGGACATCGGCCCTCCCATTCCGGAAGCCGATGAGTTGCTGAATAA  2172
                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2215  CCAGCTCCAGCTGCTGACCCAGGTCCTGAGGACATCGGCCCTCCCATTCCGGAAGCCGATGAGTTGCTGAATAA  2288

Query 2173  GTTTGTGTGTAAGAACAACGGGGTCCTGTTCGAGAACCAGCTGCTGCAGATCGGAGTCAAGTCAGAGTTCCGAC  2246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2289  GTTTGTGTGTAAGAACAACGGGGTCCTGTTCGAGAACCAGCTGCTGCAGATCGGAGTCAAGTCAGAGTTCCGAC  2362

Query 2247  AGAACCTGGGCCGCATGTATCTCTTCTATGGCAACAAGACCTCGGTGCAGTTCCAGAATTTCTCACCCACTGTG  2320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2363  AGAACCTGGGCCGCATGTATCTCTTCTATGGCAACAAGACCTCGGTGCAGTTCCAGAATTTCTCACCCACTGTG  2436

Query 2321  GTTCACCCGGGAGACCTCCAGACTCAGCTGGCTGTGCAGACCAAGCGCGTGGCGGCGCAGGTGGACGGCGGCGC  2394
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2437  GTTCACCCGGGAGACCTCCAGACTCAGCTGGCTGTGCAGACCAAGCGCGTGGCGGCGCAGGTGGACGGCGGCGC  2510

Query 2395  GCAGGTGCAGCAGGTGCTCAATATCGAGTGCCTGCGGGACTTCCTGACGCCCCCGCTGCTGTCCGTGCGCTTCC  2468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2511  GCAGGTGCAGCAGGTGCTCAATATCGAGTGCCTGCGGGACTTCCTGACGCCCCCGCTGCTGTCCGTGCGCTTCC  2584

Query 2469  GGTACGGTGGCGCCCCCCAGGCCCTCACCCTGAAGCTCCCAGTGACCATCAACAAGTTCTTCCAGCCCACCGAG  2542
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2585  GGTACGGTGGCGCCCCCCAGGCCCTCACCCTGAAGCTCCCAGTGACCATCAACAAGTTCTTCCAGCCCACCGAG  2658

Query 2543  ATGGCGGCCCAGGATTTCTTCCAGCGCTGGAAGCAGCTGAGCCTCCCTCAACAGGAGGCGCAGAAAATCTTCAA  2616
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2659  ATGGCGGCCCAGGATTTCTTCCAGCGCTGGAAGCAGCTGAGCCTCCCTCAACAGGAGGCGCAGAAAATCTTCAA  2732

Query 2617  AGCCAACCACCCCATGGACGCAGAAGTTACTAAGGCCAAGCTTCTGGGGTTTGGCTCTGCTCTCCTGGACAATG  2690
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2733  AGCCAACCACCCCATGGACGCAGAAGTTACTAAGGCCAAGCTTCTGGGGTTTGGCTCTGCTCTCCTGGACAATG  2806

Query 2691  TGGACCCCAACCCTGGTGACAGAGAAGACACCAGGGTT--TGGGGGATGCCTGGGACTTTCCTCCGGCCTTTTG  2762
            ||||||||||||||       |||||         .||  ||||||    |.||||   ||.|||.|.||    
Sbjct 2807  TGGACCCCAACCCT-------GAGAA---------CTTCGTGGGGG----CGGGGA---TCATCCAGACT----  2853

Query 2763  TATTTTTATTTTTGTTCA----TCTGC-----TGCTGTTTACATTCTGGGGGGTTAGGGGGAGTCCCCCTCCCT  2827
                             |    .||||     .|||||.|.| |||    ||.|     ||||           
Sbjct 2854  -----------------AAAGCCCTGCAGGTGGGCTGTCTGC-TTC----GGCT-----GGAG-----------  2889

Query 2828  CCCTTTCCCCCCCAA-GCACAGAGGGGAGAGGGGCCAGGGAAGTGGATGT--CTCCT--CCCCTCCCACC--CC  2894
                      ||||| ||.||          ||.|||        |||||  |..||  |||..|.||||  |.
Sbjct 2890  ----------CCCAATGCCCA----------GGCCCA--------GATGTACCGGCTGACCCTGCGCACCAGCA  2935

Query 2895  ACCCTGTTGTAGCCCCTCCTACCCCG-CCCNCATCCAGGGGCTGTGTATTATTG--------------------  2947
            |       |.|||||.||   .|||| |.|           |||||      ||                    
Sbjct 2936  A-------GGAGCCCGTC---TCCCGTCAC-----------CTGTG------TGAGCTGCTGGCACAGCAGTTC  2982