Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14534
- Subject:
- XM_011526557.3
- Aligned Length:
- 3042
- Identities:
- 2776
- Gaps:
- 221
Alignment
Query 1 --------------------------------------ATGC----CGGCCGTGTCCAAGGGCG-ATGGGATGC 31
.||| |.|.|.||..|.||.|.| |||||||..
Sbjct 1 ATGGAAACACGAGGGAGGCAAGAAGGCTGGAGGGGAGGCTGCTTCACTGACCTGAGCGAGCGAGCATGGGATCT 74
Query 32 GG-------GGGC----TCGCGGTGTTCATCTCCGACA--TCCGGAACTGTAAGAGCAAAGAGGCGGAAATTAA 92
|| ||.| |.|.||||.||| .|||| |.|.||| .|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGATGAAGTGGTCATCGTGGAGGTGCTCA----AGACATGTTCTGAA-GGTAAGAGCAAAGAGGCGGAAATTAA 143
Query 93 GAGAATCAACAAGGAACTGGCCAACATCCGCTCCAAGTTCAAAGGAGACAAAGCCTTGGATGGCTACAGTAAGA 166
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 144 GAGAATCAACAAGGAACTGGCCAACATCCGCTCCAAGTTCAAAGGAGACAAAGCCTTGGATGGCTACAGTAAGA 217
Query 167 AAAAATATGTGTGTAAACTGCTTTTCATCTTCCTGCTTGGCCATGACATTGACTTTGGGCACATGGAGGCTGTG 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 218 AAAAATATGTGTGTAAACTGCTTTTCATCTTCCTGCTTGGCCATGACATTGACTTTGGGCACATGGAGGCTGTG 291
Query 241 AATCTGTTGAGTTCCAATAAATACACAGAGAAGCAAATAGGTTACCTGTTCATTTCTGTGCTGGTGAACTCGAA 314
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 292 AATCTGTTGAGTTCCAATAAATACACAGAGAAGCAAATAGGTTACCTGTTCATTTCTGTGCTGGTGAACTCGAA 365
Query 315 CTCGGAGCTGATCCGCCTCATCAACAACGCCATCAAGAATGACCTGGCCAGCCGCAACCCCACCTTCATGTGCC 388
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 366 CTCGGAGCTGATCCGCCTCATCAACAACGCCATCAAGAATGACCTGGCCAGCCGCAACCCCACCTTCATGTGCC 439
Query 389 TGGCCCTGCACTGCATCGCCAACGTGGGCAGCCGGGAGATGGGCGAGGCCTTTGCCGCTGACATCCCCCGCATC 462
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 440 TGGCCCTGCACTGCATCGCCAACGTGGGCAGCCGGGAGATGGGCGAGGCCTTTGCCGCTGACATCCCCCGCATC 513
Query 463 CTGGTGGCCGGGGACAGCATGGACAGTGTCAAGCAGAGTGCGGCCCTGTGCCTCCTTCGACTGTACAAGGCCTC 536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 514 CTGGTGGCCGGGGACAGCATGGACAGTGTCAAGCAGAGTGCGGCCCTGTGCCTCCTTCGACTGTACAAGGCCTC 587
Query 537 GCCTGACCTGGTGCCCATGGGCGAGTGGACGGCGCGTGTGGTACACCTGCTCAATGACCAGCACATGGGTGTGG 610
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 588 GCCTGACCTGGTGCCCATGGGCGAGTGGACGGCGCGTGTGGTACACCTGCTCAATGACCAGCACATGGGTGTGG 661
Query 611 TCACGGCCGCCGTCAGCCTCATCACCTGTCTCTGCAAGAAGAACCCAGATGACTTCAAGACGTGCGTCTCTCTG 684
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 662 TCACGGCCGCCGTCAGCCTCATCACCTGTCTCTGCAAGAAGAACCCAGATGACTTCAAGACGTGCGTCTCTCTG 735
Query 685 GCTGTGTCGCGCCTGAGCCGGATCGTCTCCTCTGCCTCCACCGACCTCCAGGACTACACCTACTACTTCGTCCC 758
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 736 GCTGTGTCGCGCCTGAGCCGGATCGTCTCCTCTGCCTCCACCGACCTCCAGGACTACACCTACTACTTCGTCCC 809
Query 759 AGCACCCTGGCTCTCGGTGAAGCTCCTGCGGCTGCTGCAGTGCTACCCGCTTCCAGAGGATGCGGCTGTGAAGG 832
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 810 AGCACCCTGGCTCTCGGTGAAGCTCCTGCGGCTGCTGCAGTGCTACCCGCCTCCAGAGGATGCGGCTGTGAAGG 883
Query 833 GGCGGCTGGTGGAATGTCTGGAGACTGTGCTCAACAAGGCCCAGGAGCCCCCCAAATCCAAGAAGGTGCAGCAT 906
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 884 GGCGGCTGGTGGAATGTCTGGAGACTGTGCTCAACAAGGCCCAGGAGCCCCCCAAATCCAAGAAGGTGCAGCAT 957
Query 907 TCCAACGCCAAGAACGCCATCCTCTTCGAGACCATCAGCCTCATCATCCACTATGACAGTGAGCCCAACCTCCT 980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 958 TCCAACGCCAAGAACGCCATCCTCTTCGAGACCATCAGCCTCATCATCCACTATGACAGTGAGCCCAACCTCCT 1031
Query 981 GGTTCGGGCCTGCAACCAGCTGGGCCAGTTCCTGCAGCACCGGGAGACCAACCTGCGCTACCTGGCCCTGGAGA 1054
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032 GGTTCGGGCCTGCAACCAGCTGGGCCAGTTCCTGCAGCACCGGGAGACCAACCTGCGCTACCTGGCCCTGGAGA 1105
Query 1055 GCATGTGCACGCTGGCCAGCTCCGAGTTCTCCCATGAAGCCGTCAAGACGCACATTGACACCGTCATCAATGCC 1128
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1106 GCATGTGCACGCTGGCCAGCTCCGAGTTCTCCCATGAAGCCGTCAAGACGCACATTGACACCGTCATCAATGCC 1179
Query 1129 CTCAAGACGGAGCGGGACGTCAGCGTGCGGCAGCGGGCGGCTGACCTCCTCTACGCCATGTGTGACCGGAGCAA 1202
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1180 CTCAAGACGGAGCGGGACGTCAGCGTGCGGCAGCGGGCGGCTGACCTCCTCTACGCCATGTGTGACCGGAGCAA 1253
Query 1203 TGCCAAGCAGATCGTGTCGGAGATGCTGCGGTACCTGGAGACGGCAGACTACGCCATCCGCGAGGAGATCGTCC 1276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254 TGCCAAGCAGATCGTGTCGGAGATGCTGCGGTACCTGGAGACGGCAGACTACGCCATCCGCGAGGAGATCGTCC 1327
Query 1277 TGAAGGTGGCCATCCTGGCCGAGAAGTACGCCGTGGACTACAGCTGGTACGTGGACACCATCCTCAACCTCATC 1350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1328 TGAAGGTGGCCATCCTGGCCGAGAAGTACGCCGTGGACTACAGCTGGTACGTGGACACCATCCTCAACCTCATC 1401
Query 1351 CGCATTGCGGGCGACTACGTGAGTGAGGAGGTGTGGTACCGTGTGCTACAGATCGTCACCAACCGTGATGACGT 1424
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1402 CGCATTGCGGGCGACTACGTGAGTGAGGAGGTGTGGTACCGTGTGCTACAGATCGTCACCAACCGTGATGACGT 1475
Query 1425 CCAGGGCTATGCCGCCAAGACCGTCTTTGAGGCGCTCCAGGCCCCTGCCTGTCACGAGAACATGGTGAAGGTTG 1498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1476 CCAGGGCTATGCCGCCAAGACCGTCTTTGAGGCGCTCCAGGCCCCTGCCTGTCACGAGAACATGGTGAAGGTTG 1549
Query 1499 GCGGCTACATCCTTGGGGAGTTTGGGAACCTGATTGCTGGGGACCCCCGCTCCAGCCCCCCAGTGCAGTTCTCC 1572
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1550 GCGGCTACATCCTTGGGGAGTTTGGGAACCTGATTGCTGGGGACCCCCGCTCCAGCCCCCCAGTGCAGTTCTCC 1623
Query 1573 CTGCTCCACTCCAAGTTCCATCTGTGCAGCGTGGCCACGCGGGCGCTGCTGCTGTCCACCTACATCAAGTTCAT 1646
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1624 CTGCTCCACTCCAAGTTCCATCTGTGCAGCGTGGCCACGCGGGCGCTGCTGCTGTCCACCTACATCAAGTTCAT 1697
Query 1647 CAACCTCTTCCCCGAGACCAAGGCCACCATCCAGNGGNGNTCTGCGGGCCGGCTCCCAGCTGCGCAATGCTGAC 1720
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||.|..|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1698 CAACCTCTTCCCCGAGACCAAGGCCACCATCCAG-GGCGTCCTGCGGGCCGGCTCCCAGCTGCGCAATGCTGAC 1770
Query 1721 GTGGAGCTGCAGCAGCGAGCCGTGGAGTACCTCACCCTCAGCTCAGTGGCCAGCACCGACGTCCTGGCCACGGT 1794
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1771 GTGGAGCTGCAGCAGCGAGCCGTGGAGTACCTCACCCTCAGCTCAGTGGCCAGCACCGACGTCCTGGCCACGGT 1844
Query 1795 GCTGGAGGAGATGCCGCCCTTCCCCGAGCGCGAGTCGTCCATCCTGGCCAAGCTGAAACGCAAGAAGGGGCCAG 1868
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1845 GCTGGAGGAGATGCCGCCCTTCCCCGAGCGCGAGTCGTCCATCCTGGCCAAGCTGAAACGCAAGAAGGGGCCAG 1918
Query 1869 GGGCCGGCAGCGCCCTGGACGATGGCCGGAGGGACCCCAGCAGCAACGACATCAACGGGGGCATGGAGCCCACC 1942
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1919 GGGCCGGCAGCGCCCTGGACGATGGCCGGAGGGACCCCAGCAGCAACGACATCAACGGGGGCATGGAGCCCACC 1992
Query 1943 CCCAGCACTGTGTCGACGCCCTCGCCCTCCGCCGACCTCCTGGGGCTGCGGGCAGCCCCTCCCCCGGCAGCACC 2016
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1993 CCCAGCACTGTGTCGACGCCCTCGCCCTCCGCCGACCTCCTGGGGCTGCGGGCAGCCCCTCCCCCGGCAGCACC 2066
Query 2017 CCCGGCTTCTGCAGGAGCAGGGAACCTTCTGGTGGACGTCTTCGATGGCCCGGCCGCCCAGCCCAGCCTGGGGC 2090
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2067 CCCGGCTTCTGCAGGAGCAGGGAACCTTCTGGTGGACGTCTTCGATGGCCCGGCCGCCCAGCCCAGCCTGGGGC 2140
Query 2091 CCACCCCCGAGGAGGCCTTCCTCAGCCCAGGTCCTGAGGACATCGGCCCTCCCATTCCGGAAGCCGATGAGTTG 2164
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2141 CCACCCCCGAGGAGGCCTTCCTCAGCCCAGGTCCTGAGGACATCGGCCCTCCCATTCCGGAAGCCGATGAGTTG 2214
Query 2165 CTGAATAAGTTTGTGTGTAAGAACAACGGGGTCCTGTTCGAGAACCAGCTGCTGCAGATCGGAGTCAAGTCAGA 2238
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2215 CTGAATAAGTTTGTGTGTAAGAACAACGGGGTCCTGTTCGAGAACCAGCTGCTGCAGATCGGAGTCAAGTCAGA 2288
Query 2239 GTTCCGACAGAACCTGGGCCGCATGTATCTCTTCTATGGCAACAAGACCTCGGTGCAGTTCCAGAATTTCTCAC 2312
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2289 GTTCCGACAGAACCTGGGCCGCATGTATCTCTTCTATGGCAACAAGACCTCGGTGCAGTTCCAGAATTTCTCAC 2362
Query 2313 CCACTGTGGTTCACCCGGGAGACCTCCAGACTCAGCTGGCTGTGCAGACCAAGCGCGTGGCGGCGCAGGTGGAC 2386
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2363 CCACTGTGGTTCACCCGGGAGACCTCCAGACTCAGCTGGCTGTGCAGACCAAGCGCGTGGCGGCGCAGGTGGAC 2436
Query 2387 GGCGGCGCGCAGGTGCAGCAGGTGCTCAATATCGAGTGCCTGCGGGACTTCCTGACGCCCCCGCTGCTGTCCGT 2460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2437 GGCGGCGCGCAGGTGCAGCAGGTGCTCAATATCGAGTGCCTGCGGGACTTCCTGACGCCCCCGCTGCTGTCCGT 2510
Query 2461 GCGCTTCCGGTACGGTGGCGCCCCCCAGGCCCTCACCCTGAAGCTCCCAGTGACCATCAACAAGTTCTTCCAGC 2534
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2511 GCGCTTCCGGTACGGTGGCGCCCCCCAGGCCCTCACCCTGAAGCTCCCAGTGACCATCAACAAGTTCTTCCAGC 2584
Query 2535 CCACCGAGATGGCGGCCCAGGATTTCTTCCAGCGCTGGAAGCAGCTGAGCCTCCCTCAACAGGAGGCGCAGAAA 2608
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2585 CCACCGAGATGGCGGCCCAGGATTTCTTCCAGCGCTGGAAGCAGCTGAGCCTCCCTCAACAGGAGGCGCAGAAA 2658
Query 2609 ATCTTCAAAGCCAACCACCCCATGGACGCAGAAGTTACTAAGGCCAAGCTTCTGGGGTTTGGCTCTGCTCTCCT 2682
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2659 ATCTTCAAAGCCAACCACCCCATGGACGCAGAAGTTACTAAGGCCAAGCTTCTGGGGTTTGGCTCTGCTCTCCT 2732
Query 2683 GGACAATGTGGACCCCAACCCTGGTGACAGAGAAGACACCAGGGTT--TGGGGGATGCCTGGGACTTTCCTCCG 2754
|||||||||||||||||||||| ||||| .|| |||||| |.|||| ||.|||.
Sbjct 2733 GGACAATGTGGACCCCAACCCT-------GAGAA---------CTTCGTGGGGG----CGGGGA---TCATCCA 2783
Query 2755 GCCTTTTGTATTTTTATTTTTGTTCA----TCTGC-----TGCTGTTTACATTCTGGGGGGTTAGGGGGAGTCC 2819
|.|| | .|||| .|||||.|.| ||| ||.| ||||
Sbjct 2784 GACT---------------------AAAGCCCTGCAGGTGGGCTGTCTGC-TTC----GGCT-----GGAG--- 2823
Query 2820 CCCTCCCTCCCTTTCCCCCCCAA-GCACAGAGGGGAGAGGGGCCAGGGAAGTGGATGT--CTCCT--CCCCTCC 2888
||||| ||.|| ||.||| ||||| |..|| |||..|.
Sbjct 2824 ------------------CCCAATGCCCA----------GGCCCA--------GATGTACCGGCTGACCCTGCG 2861
Query 2889 CACC--CCACCCTGTTGTAGCCCCTCCTACCCCG-CCCNCATCCAGGGGCTGTGTATTATTG------------ 2947
|||| |.| |.|||||.|| .|||| |.| ||||| ||
Sbjct 2862 CACCAGCAA-------GGAGCCCGTC---TCCCGTCAC-----------CTGTG------TGAGCTGCTGGCAC 2908
Query 2948 -------- 2947
Sbjct 2909 AGCAGTTC 2916