Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14546
- Subject:
- NM_001699.6
- Aligned Length:
- 2682
- Identities:
- 2655
- Gaps:
- 27
Alignment
Query 1 ATGGCGTGGCGGTGCCCCAGGATGGGCAGGGTCCCGCTGGCCTGGTGCTTGGCGCTGTGCGGCTGGGCGTGCAT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGTGGCGGTGCCCCAGGATGGGCAGGGTCCCGCTGGCCTGGTGCTTGGCGCTGTGCGGCTGGGCGTGCAT 74
Query 75 GGCCCCCAGGGGCACGCAGGCTGAAGAAAGTCCCTTCGTGGGCAACCCAGGGAATATCACAGGTGCCCGGGGAC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGCCCCCAGGGGCACGCAGGCTGAAGAAAGTCCCTTCGTGGGCAACCCAGGGAATATCACAGGTGCCCGGGGAC 148
Query 149 TCACGGGCACCCTTCGGTGTCAGCTCCAGGTTCAGGGAGAGCCCCCCGAGGTACATTGGCTTCGGGATGGACAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCACGGGCACCCTTCGGTGTCAGCTCCAGGTTCAGGGAGAGCCCCCCGAGGTACATTGGCTTCGGGATGGACAG 222
Query 223 ATCCTGGAGCTCGCGGACAGCACCCAGACCCAGGTGCCCCTGGGTGAGGATGAACAGGATGACTGGATAGTGGT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATCCTGGAGCTCGCGGACAGCACCCAGACCCAGGTGCCCCTGGGTGAGGATGAACAGGATGACTGGATAGTGGT 296
Query 297 CAGCCAGCTCAGAATCACCTCCCTGCAGCTTTCCGACACGGGACAGTACCAGTGTTTGGTGTTTCTGGGACATC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAGCCAGCTCAGAATCACCTCCCTGCAGCTTTCCGACACGGGACAGTACCAGTGTTTGGTGTTTCTGGGACATC 370
Query 371 AGACCTTCGTGTCCCAGCCTGGCTATGTTGGGCTGGAGGGCTTGCCTTACTTCCTGGAGGAGCCCGAAGACAGG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGACCTTCGTGTCCCAGCCTGGCTATGTTGGGCTGGAGGGCTTGCCTTACTTCCTGGAGGAGCCCGAAGACAGG 444
Query 445 ACTGTGGCCGCCAACACCCCCTTCAACCTGAGCTGCCAAGCTCAGGGACCCCCAGAGCCCGTGGACCTACTCTG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACTGTGGCCGCCAACACCCCCTTCAACCTGAGCTGCCAAGCTCAGGGACCCCCAGAGCCCGTGGACCTACTCTG 518
Query 519 GCTCCAGGATGCTGTCCCCCTGGCCACGGCTCCAGGTCACGGCCCCCAGCGCAGCCTGCATGTTCCAGGGCTGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCTCCAGGATGCTGTCCCCCTGGCCACGGCTCCAGGTCACGGCCCCCAGCGCAGCCTGCATGTTCCAGGGCTGA 592
Query 593 ACAAGACATCCTCTTTCTCCTGCGAAGCCCATAACGCCAAGGGGGTCACCACATCCCGCACAGCCACCATCACA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACAAGACATCCTCTTTCTCCTGCGAAGCCCATAACGCCAAGGGGGTCACCACATCCCGCACAGCCACCATCACA 666
Query 667 GTGCTCCCCCAGCAGCCCCGTAACCTCCACCTGGTCTCCCGCCAACCCACGGAGCTGGAGGTGGCTTGGACTCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GTGCTCCCCCAGCAGCCCCGTAACCTCCACCTGGTCTCCCGCCAACCCACGGAGCTGGAGGTGGCTTGGACTCC 740
Query 741 AGGCCTGAGCGGCATCTACCCCCTGACCCACTGCACCCTGCAGGCTGTGCTGTCAGACGATGGGATGGGCATCC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGGCCTGAGCGGCATCTACCCCCTGACCCACTGCACCCTGCAGGCTGTGCTGTCAGACGATGGGATGGGCATCC 814
Query 815 AGGCGGGAGAACCAGACCCCCCAGAGGAGCCCCTCACCTCGCAAGCATCCGTGCCCCCCCATCAGCTTCGGCTA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGGCGGGAGAACCAGACCCCCCAGAGGAGCCCCTCACCTCGCAAGCATCCGTGCCCCCCCATCAGCTTCGGCTA 888
Query 889 GGCAGCCTCCATCCTCACACCCCTTATCACATCCGCGTGGCATGCACCAGCAGCCAGGGCCCCTCATCCTGGAC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGCAGCCTCCATCCTCACACCCCTTATCACATCCGCGTGGCATGCACCAGCAGCCAGGGCCCCTCATCCTGGAC 962
Query 963 CCACTGGCTTCCTGTGGAGACGCCGGAGGGAGTGCCCCTGGGCCCCCCTGAGAACATTAGTGCTACGCGGAATG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCACTGGCTTCCTGTGGAGACGCCGGAGGGAGTGCCCCTGGGCCCCCCTGAGAACATTAGTGCTACGCGGAATG 1036
Query 1037 GGAGCCAGGCCTTCGTGCATTGGCAAGAGCCCCGGGCGCCCCTGCAGGGTACCCTGTTAGGGTACCGGCTGGCG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GGAGCCAGGCCTTCGTGCATTGGCAAGAGCCCCGGGCGCCCCTGCAGGGTACCCTGTTAGGGTACCGGCTGGCG 1110
Query 1111 TATCAAGGCCAGGACACCCCAGAGGTGCTAATGGACATAGGGCTAAGGCAAGAGGTGACCCTGGAGCTGCAGGG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TATCAAGGCCAGGACACCCCAGAGGTGCTAATGGACATAGGGCTAAGGCAAGAGGTGACCCTGGAGCTGCAGGG 1184
Query 1185 GGACGGGTCTGTGTCCAATCTGACAGTGTGTGTGGCAGCCTACACTGCTGCTGGGGATGGACCCTGGAGCCTCC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGACGGGTCTGTGTCCAATCTGACAGTGTGTGTGGCAGCCTACACTGCTGCTGGGGATGGACCCTGGAGCCTCC 1258
Query 1259 CAGTACCCCTGGAGGCCTGGCGCCCAGGGCAAGCACAGCCAGTCCACCAGCTGGTGAAGGAACCTTCAACTCCT 1332
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CAGTACCCCTGGAGGCCTGGCGCCCA---------------------------GTGAAGGAACCTTCAACTCCT 1305
Query 1333 GCCTTCTCGTGGCCCTGGTGGTATGTACTGCTAGGAGCAGTCGTGGCCGCTGCCTGTGTCCTCATCTTGGCTCT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1306 GCCTTCTCGTGGCCCTGGTGGTATGTACTGCTAGGAGCAGTCGTGGCCGCTGCCTGTGTCCTCATCTTGGCTCT 1379
Query 1407 CTTCCTTGTCCACCGGCGAAAGAAGGAGACCCGTTATGGAGAAGTGTTTGAACCAACAGTGGAAAGAGGTGAAC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 CTTCCTTGTCCACCGGCGAAAGAAGGAGACCCGTTATGGAGAAGTGTTTGAACCAACAGTGGAAAGAGGTGAAC 1453
Query 1481 TGGTAGTCAGGTACCGCGTGCGCAAGTCCTACAGTCGTCGGACCACTGAAGCTACCTTGAACAGCCTGGGCATC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1454 TGGTAGTCAGGTACCGCGTGCGCAAGTCCTACAGTCGTCGGACCACTGAAGCTACCTTGAACAGCCTGGGCATC 1527
Query 1555 AGTGAAGAGCTGAAGGAGAAGCTGCGGGATGTGATGGTGGACCGGCACAAGGTGGCCCTGGGGAAGACTCTGGG 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1528 AGTGAAGAGCTGAAGGAGAAGCTGCGGGATGTGATGGTGGACCGGCACAAGGTGGCCCTGGGGAAGACTCTGGG 1601
Query 1629 AGAGGGAGAGTTTGGAGCTGTGATGGAAGGCCAGCTCAACCAGGACGACTCCATCCTCAAGGTGGCTGTGAAGA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1602 AGAGGGAGAGTTTGGAGCTGTGATGGAAGGCCAGCTCAACCAGGACGACTCCATCCTCAAGGTGGCTGTGAAGA 1675
Query 1703 CGATGAAGATTGCCATCTGCACGAGGTCAGAGCTGGAGGATTTCCTGAGTGAAGCGGTCTGCATGAAGGAATTT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1676 CGATGAAGATTGCCATCTGCACGAGGTCAGAGCTGGAGGATTTCCTGAGTGAAGCGGTCTGCATGAAGGAATTT 1749
Query 1777 GACCATCCCAACGTCATGAGGCTCATCGGTGTCTGTTTCCAGGGTTCTGAACGAGAGAGCTTCCCAGCACCTGT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1750 GACCATCCCAACGTCATGAGGCTCATCGGTGTCTGTTTCCAGGGTTCTGAACGAGAGAGCTTCCCAGCACCTGT 1823
Query 1851 GGTCATCTTACCTTTCATGAAACATGGAGACCTACACAGCTTCCTCCTCTATTCCCGGCTCGGGGACCAGCCAG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1824 GGTCATCTTACCTTTCATGAAACATGGAGACCTACACAGCTTCCTCCTCTATTCCCGGCTCGGGGACCAGCCAG 1897
Query 1925 TGTACCTGCCCACTCAGATGCTAGTGAAGTTCATGGCAGACATCGCCAGTGGCATGGAGTATCTGAGTACCAAG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1898 TGTACCTGCCCACTCAGATGCTAGTGAAGTTCATGGCAGACATCGCCAGTGGCATGGAGTATCTGAGTACCAAG 1971
Query 1999 AGATTCATACACCGGGACCTGGCGGCCAGGAACTGCATGCTGAATGAGAACATGTCCGTGTGTGTGGCGGACTT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1972 AGATTCATACACCGGGACCTGGCGGCCAGGAACTGCATGCTGAATGAGAACATGTCCGTGTGTGTGGCGGACTT 2045
Query 2073 CGGGCTCTCCAAGAAGATCTACAATGGGGACTACTACCGCCAGGGACGTATCGCCAAGATGCCAGTCAAGTGGA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2046 CGGGCTCTCCAAGAAGATCTACAATGGGGACTACTACCGCCAGGGACGTATCGCCAAGATGCCAGTCAAGTGGA 2119
Query 2147 TTGCCATTGAGAGTCTAGCTGACCGTGTCTACACCAGCAAGAGCGATGTGTGGTCCTTCGGGGTGACAATGTGG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2120 TTGCCATTGAGAGTCTAGCTGACCGTGTCTACACCAGCAAGAGCGATGTGTGGTCCTTCGGGGTGACAATGTGG 2193
Query 2221 GAGATTGCCACAAGAGGCCAAACCCCATATCCGGGCGTGGAGAACAGCGAGATTTATGACTATCTGCGCCAGGG 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2194 GAGATTGCCACAAGAGGCCAAACCCCATATCCGGGCGTGGAGAACAGCGAGATTTATGACTATCTGCGCCAGGG 2267
Query 2295 AAATCGCCTGAAGCAGCCTGCGGACTGTCTGGATGGACTGTATGCCTTGATGTCGCGGTGCTGGGAGCTAAATC 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2268 AAATCGCCTGAAGCAGCCTGCGGACTGTCTGGATGGACTGTATGCCTTGATGTCGCGGTGCTGGGAGCTAAATC 2341
Query 2369 CCCAGGACCGGCCAAGTTTTACAGAGCTGCGGGAAGATTTGGAGAACACACTGAAGGCCTTGCCTCCTGCCCAG 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2342 CCCAGGACCGGCCAAGTTTTACAGAGCTGCGGGAAGATTTGGAGAACACACTGAAGGCCTTGCCTCCTGCCCAG 2415
Query 2443 GAGCCTGACGAAATCCTCTATGTCAACATGGATGAGGGTGGAGGTTATCCTGAACCCCCTGGAGCTGCAGGAGG 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2416 GAGCCTGACGAAATCCTCTATGTCAACATGGATGAGGGTGGAGGTTATCCTGAACCCCCTGGAGCTGCAGGAGG 2489
Query 2517 AGCTGACCCCCCAACCCAGCCAGACCCTAAGGATTCCTGTAGCTGCCTCACTGCGGCTGAGGTCCATCCTGCTG 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2490 AGCTGACCCCCCAACCCAGCCAGACCCTAAGGATTCCTGTAGCTGCCTCACTGCGGCTGAGGTCCATCCTGCTG 2563
Query 2591 GACGCTATGTCCTCTGCCCTTCCACAACCCCTAGCCCCGCTCAGCCTGCTGATAGGGGCTCCCCAGCAGCCCCA 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2564 GACGCTATGTCCTCTGCCCTTCCACAACCCCTAGCCCCGCTCAGCCTGCTGATAGGGGCTCCCCAGCAGCCCCA 2637
Query 2665 GGGCAGGAGGATGGTGCC 2682
||||||||||||||||||
Sbjct 2638 GGGCAGGAGGATGGTGCC 2655