Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14546
• Subject: XM_006539989.3
• Aligned Length: 2692
• Identities: 2288
• Gaps: 38

Alignment

Query    1  ATGGCGTGGCGGTGCCCCAGGATGGGCAGGGTCCCGCTGGCCTGGTGCTTGGCGCTGTGCGGCTGGGCGTGCAT  74
                                 ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||.|||  |
Sbjct    1  ---------------------ATGGGCAGGGTCCCGCTGGCCTGGTGGTTGGCGCTGTGCTGCTGGGGGTG--T  51

Query   75  G--GCCCCCAGGGGCACGCAGGCTGA---AGAAAGTCCCTTCGTGGGCAACCCAGGGAATATCACAGGTGCCCG  143
            |  ||||..|.||.|||.|||.|.||   .|..||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   52  GCAGCCCATAAGGACACACAGACCGAGGCTGGCAGCCCGTTTGTGGGGAACCCAGGGAATATCACAGGTGCCAG  125

Query  144  GGGACTCACGGGCACCCTTCGGTGTCAGCTCCAGGTTCAGGGAGAGCCCCCCGAGGTACATTGGCTTCGGGATG  217
            .|||||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||||.||.|||||.|||||....||||||||.||||
Sbjct  126  AGGACTCACGGGGACACTTCGGTGTGAGCTCCAGGTTCAGGGGGAACCCCCTGAGGTGGTGTGGCTTCGAGATG  199

Query  218  GACAGATCCTGGAGCTCGCGGACAGCACCCAGACCCAGGTGCCCCTGGGTGAGGA-TGAACAGGATGACTGGAT  290
            ||||||||||.||.||.||.||.|.||||||||||||||||||.|||||.||.|| || .||.|||||.||||.
Sbjct  200  GACAGATCCTAGAACTGGCTGATAACACCCAGACCCAGGTGCCTCTGGGCGAAGACTG-GCAAGATGAATGGAA  272

Query  291  AGTGGTCAGCCAGCTCAGAATCACCTCCCTGCAGCTTTCCGA--CACGGGACAGTACCAGTGTTTGGTGTTTCT  362
            |||.|||||.||||||||||||.|..|||||||.|||||.||  ||.|||  |||||||||||.|||||..|||
Sbjct  273  AGTTGTCAGTCAGCTCAGAATCTCAGCCCTGCAACTTTCAGATGCAGGGG--AGTACCAGTGTATGGTGCATCT  344

Query  363  GGGACATCAGACCTTCGTGTCCCAGCCTGGCTATGTTGGGCTGGAGGGCTTGCCTTACTTCCTGGAGGAGCCCG  436
            .|.|...|.||||||.|||||.|||||.||||.|||.||||||||.||..|.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  345  AGAAGGACGGACCTTTGTGTCTCAGCCGGGCTTTGTAGGGCTGGAAGGTCTCCCGTACTTCCTGGAGGAGCCTG  418

Query  437  AAGACAGGACTGTGGCCGCCAACACCCCCTTCAACCTGAGCTGCCAAGCTCAGGGACCCCCAGAGCCCGTGGAC  510
            |.||||...|||||.|.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||..|
Sbjct  419  AGGACAAAGCTGTGCCTGCCAACACCCCTTTCAACCTAAGCTGCCAGGCCCAGGGACCCCCGGAACCCGTGACC  492

Query  511  CTACTCTGGCTCCAGGATGCTGTCCCCCTGGCCACGGCTC-CAGGTCACGGCCCCCAGCGCAGCCTGCATGTTC  583
            |||||||||||.||.||||||||||||||||||.|.| || ||||.|||.||.||||||.|||.|||||...||
Sbjct  493  CTACTCTGGCTTCAAGATGCTGTCCCCCTGGCCCCAG-TCACAGGACACAGCTCCCAGCACAGTCTGCAAACTC  565

Query  584  CAGGGCTGAACAAGACATCCTCTTTCTCCTGCGAAGCCCATAACGCCAAGGGGGTCACCACATCCCGCACAGCC  657
            ||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  566  CAGGCCTGAACAAGACATCTTCTTTCTCATGTGAAGCCCACAATGCCAAGGGAGTCACCACCTCCCGCACAGCC  639

Query  658  ACCATCACAGTGCTCCCCCAGCAGCCCCGTAACCTCCACCTGGTCTCCCGCCAACCCACGGAGCTGGAGGTGGC  731
            |||||||||||||||||||||..|||.|...|.||||||.||||.|||.|.|||||.||||||||.|||||.||
Sbjct  640  ACCATCACAGTGCTCCCCCAGAGGCCTCACCATCTCCACGTGGTTTCCAGACAACCTACGGAGCTAGAGGTAGC  713

Query  732  TTGGACTCCAGGCCTGAGCGGCATCTACCCCCTGACCCACTGCACCCTGCAGGCTGTGCTGTCAGACGATGGGA  805
            ||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||.
Sbjct  714  TTGGACCCCTGGCCTGAGTGGCATCTACCCGCTCACCCACTGCAACCTGCAGGCCGTGCTGTCAGACGATGGGG  787

Query  806  TGGGCATCCAGGC-GGGAGAACCAGACCCCCCAGAGGAGCCCCTCACCTCGCAAGCATCCGTGCCCCCCCATCA  878
            ||||.|| |.||| ||||.|..||||.||.||.||.||.||||||||||.|||||.|||.|||||||||||.||
Sbjct  788  TGGGTAT-CTGGCTGGGAAAGTCAGATCCTCCTGAAGACCCCCTCACCTTGCAAGTATCAGTGCCCCCCCACCA  860

Query  879  GCTTCGGCTAGGCAGCCTCCATCCTCACACCCCTTATCACATCCGCGTGGCATGCACCAGCAGCCAGGGCCCCT  952
            |||||||||.|..|..||||.||||||||||||.|||||||||||..|..|.||||.|||||||||||||||||
Sbjct  861  GCTTCGGCTGGAAAAGCTCCTTCCTCACACCCCGTATCACATCCGGATATCCTGCAGCAGCAGCCAGGGCCCCT  934

Query  953  CATCCTGGACCCACTGGCTTCCTGTGGAGACGCCGGAGGGAGTGCCCCTGGGCCCCCCTGAGAACATTAGTGCT  1026
            ||.|.||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||.||||.||||||||||||.||||.||.
Sbjct  935  CACCTTGGACCCACTGGCTTCCTGTGGAGACCACAGAGGGAGTGCCCTTGGGTCCCCCTGAGAACGTTAGCGCC  1008

Query 1027  ACGCGGAATGGGAGCCAGGCCTTCGTGCATTGGCAAGAGCCCCGGGCGCCCCTGCAGGGTACCCTGTTAGGGTA  1100
            |.|||||||||||||||||.|.||||||.||||||.|||||..|||.|||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1009  ATGCGGAATGGGAGCCAGGTCCTCGTGCGTTGGCAGGAGCCAAGGGTGCCCCTGCAAGGCACCCTGTTAGGGTA  1082

Query 1101  CCGGCTGGCGTATCAAGGCCAGGACACCCCAGAGGTGCTAATGGACATAGGGCTAAGGCAAGAGGTGACCCTGG  1174
            |||||||||.||||.|||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||..|.||||||||||.|||
Sbjct 1083  CCGGCTGGCATATCGAGGCCAGGACACCCCCGAGGTACTTATGGATATAGGGCTAACTCGAGAGGTGACCTTGG  1156

Query 1175  AGCTGCAGGGGGACGGGTCTGTGTCCAATCTGACAGTGTGTGTGGCAGCCTACACTGCTGCTGGGGATGGACCC  1248
            |.||||.|||||||.||.|||||.|.||.|||||.||||.||||.|||||||.||..|.|||||||||||.|||
Sbjct 1157  AACTGCGGGGGGACAGGCCTGTGGCTAACCTGACTGTGTCTGTGACAGCCTATACCTCGGCTGGGGATGGGCCC  1230

Query 1249  TGGAGCCTCCCAGTACCCCTGGAGGCCTGGCGCCCAGGGCAAGCACAGCCAGTCCACCAGCTGGTGAAGGAACC  1322
            ||||||||.||.||.|||||.|||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||||.|||||||..|||||
Sbjct 1231  TGGAGCCTTCCTGTGCCCCTAGAGCCCTGGCGCCCAGGGCAAGGACAGCCACTCCACCATCTGGTGAGTGAACC  1304

Query 1323  TTCAACTCCTGCCTTCTCGTGGCCCTGGTGGTATGTACTGCTAGGAGCAGTCGTGGCCGCTGCCTGTGTCCTCA  1396
            ..||.|||..||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|.|||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 1305  CCCACCTCGCGCCTTCTCGTGGCCTTGGTGGTATGTACTGCTGGGAGCACTTGTGGCTGCCGCCTGCGTCCTCA  1378

Query 1397  TCTTGGCTCTCTTCCTTGTCCACCGGCGAAAGAAGGAGACCCGTTATGGAGAAGTGTTTGAACCAACAGTGGAA  1470
            |||||||.||.|||||||||||.|||.|.|||||||||||.||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1379  TCTTGGCCCTGTTCCTTGTCCATCGGAGGAAGAAGGAGACTCGATATGGGGAGGTGTTTGAGCCAACCGTGGAA  1452

Query 1471  AGAGGTGAACTGGTAGTCAGGTACCGCGTGCGCAAGTCCTACAGTCGTCGGACCACTGAAGCTACCTTGAACAG  1544
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1453  AGAGGTGAACTGGTAGTCAGGTACCGTGTCCGAAAGTCCTACAGCCGGCGGACCACTGAAGCCACCTTGAACAG  1526

Query 1545  CCTGGGCATCAGTGAAGAGCTGAAGGAGAAGCTGCGGGATGTGATGGTGGACCGGCACAAGGTGGCCCTGGGGA  1618
            .|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.||.|||||.|||||||||.||||||
Sbjct 1527  TCTGGGCATCAGTGAAGAGCTGAAGGAGAAACTACGAGACGTCATGGTAGATCGGCATAAGGTGGCCTTGGGGA  1600

Query 1619  AGACTCTGGGAGAGGGAGAGTTTGGAGCTGTGATGGAAGGCCAGCTCAACCAGGACGACTCCATCCTCAAGGTG  1692
            ||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1601  AGACCCTGGGAGAAGGAGAATTTGGCGCTGTGATGGAAGGTCAGCTCAATCAGGATGACTCCATCCTCAAGGTC  1674

Query 1693  GCTGTGAAGACGATGAAGATTGCCATCTGCACGAGGTCAGAGCTGGAGGATTTCCTGAGTGAAGCGGTCTGCAT  1766
            |||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1675  GCTGTGAAGACCATGAAAATTGCCATCTGCACAAGATCAGAGCTGGAGGATTTCCTGAGTGAAGCTGTCTGCAT  1748

Query 1767  GAAGGAATTTGACCATCCCAACGTCATGAGGCTCATCGGTGTCTGTTTCCAGGGTTCTGAACGAGAGAGCTTCC  1840
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||..|||||.|.||||
Sbjct 1749  GAAGGAATTTGACCACCCCAACGTCATGAGGCTCATTGGCGTCTGTTTTCAGGGCTCTGACAGAGAGGGTTTCC  1822

Query 1841  CAGCACCTGTGGTCATCTTACCTTTCATGAAACATGGAGACCTACACAGCTTCCTCCTCTATTCCCGGCTCGGG  1914
            |||.|||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1823  CAGAACCTGTGGTCATCTTGCCTTTCATGAAACACGGAGACCTACACAGTTTCCTCCTGTACTCCCGGCTCGGG  1896

Query 1915  GACCAGCCAGTGTACCTGCCCACTCAGATGCTAGTGAAGTTCATGGCAGACATCGCCAGTGGCATGGAGTATCT  1988
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 1897  GACCAGCCAGTGTTCCTGCCCACTCAGATGCTAGTGAAGTTCATGGCCGACATTGCCAGTGGTATGGAGTACCT  1970

Query 1989  GAGTACCAAGAGATTCATACACCGGGACCTGGCGGCCAGGAACTGCATGCTGAATGAGAACATGTCCGTGTGTG  2062
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1971  GAGTACCAAGAGATTCATACATCGGGACCTGGCTGCCAGGAACTGCATGCTGAATGAGAACATGTCCGTGTGTG  2044

Query 2063  TGGCGGACTTCGGGCTCTCCAAGAAGATCTACAATGGGGACTACTACCGCCAGGGACGTATCGCCAAGATGCCA  2136
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||
Sbjct 2045  TGGCAGACTTCGGGCTCTCCAAGAAGATCTACAACGGGGATTACTACCGCCAAGGGCGCATTGCCAAGATGCCA  2118

Query 2137  GTCAAGTGGATTGCCATTGAGAGTCTAGCTGACCGTGTCTACACCAGCAAGAGCGATGTGTGGTCCTTCGGGGT  2210
            ||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2119  GTCAAGTGGATTGCTATTGAGAGTCTGGCAGATCGGGTCTACACCAGCAAGAGCGATGTGTGGTCCTTCGGTGT  2192

Query 2211  GACAATGTGGGAGATTGCCACAAGAGGCCAAACCCCATATCCGGGCGTGGAGAACAGCGAGATTTATGACTATC  2284
            |||||||||||||||.|||||..||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct 2193  GACAATGTGGGAGATCGCCACCCGAGGCCAAACTCCCTATCCAGGGGTGGAGAACAGTGAGATTTACGACTACC  2266

Query 2285  TGCGCCAGGGAAATCGCCTGAAGCAGCCTGCGGACTGTCTGGATGGACTGTATGCCTTGATGTCGCGGTGCTGG  2358
            ||||.||.||||||||.|||||.|||||||.||||||||||||.||.|||||||||.|||||||.|||||||||
Sbjct 2267  TGCGTCAAGGAAATCGGCTGAAACAGCCTGTGGACTGTCTGGACGGCCTGTATGCCCTGATGTCTCGGTGCTGG  2340

Query 2359  GAGCTAAATCCCCAGGACCGGCCAAGTTTTACAGAGCTGCGGGAAGATTTGGAGAACACACTGAAGGCCTTGCC  2432
            ||.||.||.||.|..|||||||||||||||.|.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||..||||
Sbjct 2341  GAACTGAACCCTCGAGACCGGCCAAGTTTTGCGGAGCTCCGGGAAGACTTGGAGAACACACTGAAGGCTCTGCC  2414

Query 2433  TCCTGCCCAGGAGCCTGACGAAATCCTCTATGTCAACATGGATGAGGGTGGAGGTTATCCTGAACCCCCTGGAG  2506
            .|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||.|..|.|.||||||||.|||.|
Sbjct 2415  CCCTGCTCAGGAGCCAGATGAAATCCTCTATGTCAACATGGATGAGGGCGGAAGCCACCTTGAACCCCGTGGGG  2488

Query 2507  CTGCAGGAGGAGCTGACCCCCCAACCCAGCCAGACCCTAAGGATTCCTGTAGCTGCCTCACTGCGGCTGAGGTC  2580
            ||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 2489  CTGCTGGAGGAGCTGACCCCCCAACCCAACCTGATCCTAAGGATTCCTGTAGCTGTCTCACTGCAGCTGACGTC  2562

Query 2581  CATCCTGCTGGACGCTATGTCCTCTGCCCTTCCACAACCCCTAGCCCCGCTCAGCCTGCTGATAGGGGCTCCCC  2654
            ||..|.|||||||||||||||||.||.|||||.|||.||||..|.|||.|||.|.|||||||.||.||||.|||
Sbjct 2563  CACTCAGCTGGACGCTATGTCCTTTGTCCTTCTACAGCCCCAGGACCCACTCTGTCTGCTGACAGAGGCTGCCC  2636

Query 2655  AGCAGCCCCAGGGCAGGAGGATGGTGCC  2682
            ||||.|.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 2637  AGCACCTCCAGGGCAGGAGGACGGAGCC  2664