Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14553
- Subject:
- NM_139294.5
- Aligned Length:
- 2523
- Identities:
- 1903
- Gaps:
- 465
Alignment
Query 1 ATGGCGGCGCTGA------------------------------------------------GCGGTGGCGGT-- 24
||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGCGCTGAGTGGCGGCGGTGGCAGCAGCAGCGGTGGCGGCGGCGGCGGTGGCGGCGGCGGTGGCGGTGG 74
Query 25 -------GGTGGCGGCGCGGAGCCGGGCCAGGCTCTGTTCAACGGGGACATGGAGCCCGAGGCCGGCGCCGGCG 91
||.||||||||.||||.||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||| |||||||
Sbjct 75 CGACGGCGGCGGCGGCGCCGAGCAGGGCCAGGCTCTGTTCAATGGCGACATGGAGCCGGAG------GCCGGCG 142
Query 92 CCGGCGCCGCGGCCTCTTCGGCTGCGGACCCTGCCATTCCGGAGGAGGTGTGGAATATCAAACAAATGATTAAG 165
|.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 143 CTGGCGCCGCGGCCTCTTCGGCTGCGGACCCGGCCATTCCTGAAGAGGTATGGAATATCAAGCAAATGATTAAG 216
Query 166 TTGACACAGGAACATATAGAGGCCCTATTGGACAAATTTGGTGGGGAGCATAATCCACCATCAATATATCTGGA 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 217 TTGACACAGGAACATATAGAGGCCCTATTGGACAAATTTGGTGGAGAGCATAACCCACCATCAATATACCTGGA 290
Query 240 GGCCTATGAAGAATACACCAGCAAGCTAGATGCACTCCAACAAAGAGAACAACAGTTATTGGAATCTCTGGGGA 313
||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||.|.||||||||.|||
Sbjct 291 GGCCTATGAAGAGTACACCAGCAAGCTAGATGCCCTTCAGCAAAGAGAACAGCAGCTTTTGGAATCCCTG---- 360
Query 314 ACGGAACTGATTTTTCTGTTTCTAGCTCTGCATCAATGGATACCGTTACATCTTCTTCCTCTTCTAGCCTTTCA 387
Sbjct 361 -------------------------------------------------------------------------- 360
Query 388 GTGCTACCTTCATCTCTTTCAGTTTTTCAAAATCCCACAGATGTGGCACGGAGCAACCCCAAGTCACCACAAAA 461
||||||||||.|||||||||||...||||||.||||||||||||||||||.||
Sbjct 361 ---------------------GTTTTTCAAACTCCCACAGATGCATCACGGAACAACCCCAAGTCACCACAGAA 413
Query 462 ACCTATCGTTAGAGTCTTCCTGCCCAACAAACAGAGGACAGTGGTACCTGCAAGGTGTGGAGTTACAGTCCGAG 535
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 414 ACCTATCGTTAGAGTCTTCCTGCCCAACAAACAGAGGACAGTGGTACCCGCAAGATGTGGTGTTACAGTTCGAG 487
Query 536 ACAGTCTAAAGAAAGCACTGATGATGAGAGGTCTAATCCCAGAGTGCTGTGCTGTTTACAGAATTCATGATGG- 608
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 488 ACAGTCTAAAGAAAGCACTGATGATGAGAGGTCTCATCCCAGAATGCTGTGCTGTTTACAGAATTCAGGATGGA 561
Query 609 ---------------GTCT---------------------TTTCTGGAGCTGA-------CTTGAAGAA---AA 636
|.|| ||.||||||..|| .||||||.| .|
Sbjct 562 GAGAAGAAACCAATTGGCTGGGACACGGACATTTCCTGGCTTACTGGAGAGGAGTTACATGTTGAAGTACTGGA 635
Query 637 GAGT----------------ACATCT------------CTTT----ACC------------------------- 653
||.| |||.|| |||| |||
Sbjct 636 GAATGTCCCACTTACAACACACAACTTTGTACGGAAAACTTTTTTCACCTTAGCATTTTGTGACTTTTGCCGAA 709
Query 654 --CTGCTGT-------------TTGTCCAAGA----GTGATACATTT--------ATTTGGGAGAGAAGTTCCA 700
|||||.| |||||.||.| ||.|||.|||| .|.|.|.|.|||.||||||
Sbjct 710 AGCTGCTTTTCCAGGGTTTCCGTTGTCAAACATGTGGTTATAAATTTCACCAGCGTTGTAGTACAGAGGTTCCA 783
Query 701 CTGATGTGTGTTAATTATGACCAACTTGATTTGCTGTTTGTCTCCAAGTTCTTTGAACACCACCCAATACCACA 774
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.|||||||
Sbjct 784 CTGATGTGTGTAAATTATGACCAACTTGATTTGCTGTTTGTCTCCAAGTTCTTTGAGCATCACCCAGTACCACA 857
Query 775 GGAAGAGGCGTCCTTAGCAGAGACTGCCCTAACATCTGGATCATCCCCTTCCGCACCCGCCTCGGACTCTATTG 848
|||.|||||.|||||..|||||||||||||..||||||| ||||.|||||||||||.||||.|||||||.||
Sbjct 858 GGAGGAGGCCTCCTTCCCAGAGACTGCCCTTCCATCTGG---ATCCTCTTCCGCACCCCCCTCAGACTCTACTG 928
Query 849 GGCCCCAAATTCTCACCAGTCCGTCTCCTTCAAAATCCATTCCAATTCCACAGCCCTTCCGACCAGCAGATGAA 922
||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 929 GGCCCCAAATCCTCACCAGTCCATCTCCTTCAAAATCCATTCCAATTCCACAGCCCTTCCGACCAGCAGATGAA 1002
Query 923 GATCATCGAAATCAATTTGGGCAACGAGACCGATCCTCATCAGCTCCCAATGTGCATATAAACACAATAGAACC 996
||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 1003 GATCATCGCAATCAGTTTGGGCAACGAGACCGGTCCTCCTCAGCTCCCAATGTTCATATAAACACAATTGAGCC 1076
Query 997 TGTCAATATTGAT------------------------------------GACTTGATTAGAGACCAAGGATTTC 1034
|||.|||||.||| ||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1077 TGTGAATATCGATGAAAAATTCCCAGAAGTGGAATTACAGGATCAAAGGGATTTGATTAGAGACCAGGGGTTTC 1150
Query 1035 GTGGTGATG----------------------------------------------------------------- 1043
|||||||||
Sbjct 1151 GTGGTGATGGAGCCCCCTTGAACCAACTGATGCGCTGTCTTCGGAAATACCAATCCCGGACTCCCAGCCCCCTC 1224
Query 1044 -------------------------------------------------------GAGGATCAACCACAGGTTT 1062
||||.|||||||||||.||
Sbjct 1225 CTCCATTCTGTCCCCAGTGAAATAGTGTTTGATTTTGAGCCTGGCCCAGTGTTCAGAGGGTCAACCACAGGCTT 1298
Query 1063 GTCTGCTACCCCCCCTGCCTCATTACCTGGCTCACTAACTAACGTGAAAGCCTTACAGAAATCTCCAGGACCTC 1136
|||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1299 GTCCGCCACCCCGCCTGCCTCATTACCTGGCTCACTCACTAACGTGAAAGCCTTACAGAAATCTCCAGGTCCTC 1372
Query 1137 AGCGAGAAAGGAAGTCATCT------TCATCCTCAGAAGACAGGAATCGAATGAAAACACTTGGTAGACGGGAC 1204
||||.||||||||||||||| ||||||||.||.|||||.|.|||.||||||||||||||||||.|.||.
Sbjct 1373 AGCGGGAAAGGAAGTCATCTTCTTCCTCATCCTCGGAGGACAGAAGTCGGATGAAAACACTTGGTAGAAGAGAT 1446
Query 1205 TCGAGTGATGATTGGGAGATTCCTGATGGGCAGATTACAGTGGGACAAAGAATTGGATCTGGATCATTTGGAAC 1278
||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1447 TCAAGTGATGACTGGGAGATTCCTGATGGACAGATTACAGTGGGACAGAGAATTGGATCTGGGTCATTTGGAAC 1520
Query 1279 AGTCTACAAGGGAAAGTGGCATGGTGATGTGGCAGTGAAAATGTTGAATGTGACAGCACCTACACCTCAGCAGT 1352
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||.
Sbjct 1521 TGTCTACAAGGGAAAGTGGCATGGTGATGTGGCAGTGAAAATGTTGAATGTGACAGCACCCACACCTCAACAGC 1594
Query 1353 TACAAGCCTTCAAAAATGAAGTAGGAGTACTCAGGAAAACACGACATGTGAATATCCTACTCTTCATGGGCTAT 1426
||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1595 TACAGGCCTTCAAAAATGAAGTAGGAGTGCTCAGGAAAACTCGACATGTGAATATCCTCCTTTTCATGGGCTAT 1668
Query 1427 TCCACAAAGCCACAACTGGCTATTGTTACCCAGTCGTGTGAAGGACTCCCAGCTTGTATCACCATCTCCATATC 1500
||.|||||||||||||||||.||||||||.||||.||||| |||.|| |||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1669 TCTACAAAGCCACAACTGGCAATTGTTACACAGTGGTGTG-AGGGCT-CCAGCTTATATCACCATCTCCACATC 1740
Query 1501 ATTGAGACCAAATTTGAGATGATCAAACTTATAGATATTGCACGACAGACTGCACAGGGCATGGATTACTTACA 1574
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 ATTGAGACCAAATTTGAGATGATCAAACTTATAGATATTGCTCGGCAGACTGCACAGGGCATGGATTACTTACA 1814
Query 1575 CGCCAAGTCAATCATCCACAGAGACCTCAAGAGTAATAATATATTTCTTCATGAAGACCTCACAGTAAAAATAG 1648
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1815 CGCCAAGTCAATCATCCACAGAGACCTCAAGAGTAATAATATATTTCTTCATGAAGACCTCACGGTAAAAATAG 1888
Query 1649 GTGATTTTGGTCTAGCTACAGTGAAATCTCGATGGAGTGGGTCCCATCAGTTTGAACAGTTGTCTGGATCCATT 1722
||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1889 GTGACTTTGGTCTAGCCACAGTGAAATCTCGGTGGAGTGGGTCCCATCAGTTTGAACAGTTGTCTGGATCTATT 1962
Query 1723 TTGTGGATGGCACCAGAAGTCATCAGAATGCAAGATAAAAATCCATACAGCTTTCAGTCAGATGTATATGCATT 1796
||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 1963 TTGTGGATGGCACCAGAAGTAATCAGAATGCAAGATAAAAACCCGTATAGCTTTCAGTCAGACGTGTATGCGTT 2036
Query 1797 TGGAATTGTTCTGTATGAATTGATGACTGGACAGTTACCTTATTCAAACATCAACAACAGGGACCAGATAATTT 1870
|||.|||||||||||.|||.|||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2037 TGGGATTGTTCTGTACGAACTGATGACCGGCCAGCTACCTTATTCAAACATCAACAACAGGGATCAGATAATTT 2110
Query 1871 TTATGGTGGGACGAGGATACCTGTCTCCAGATCTCAGTAAGGTACGGAGTAACTGTCCAAAAGCCATGAAGAGA 1944
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2111 TTATGGTGGGACGAGGATACCTATCTCCAGATCTCAGTAAGGTACGGAGTAACTGTCCAAAAGCCATGAAGAGA 2184
Query 1945 TTAATGGCAGAGTGCCTCAAAAAGAAAAGAGATGAGAGACCACTCTTTCCCCAAATTCTCGCCTCTATTGAGCT 2018
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2185 TTAATGGCAGAGTGCCTCAAAAAGAAAAGAGACGAGAGACCACTCTTTCCCCAAATTCTCGCCTCCATTGAGCT 2258
Query 2019 GCTGGCCCGCTCATTGCCAAAAATTCACCGCAGTGCATCAGAACCCTCCTTGAATCGGGCTGGTTTCCAAACAG 2092
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2259 GCTGGCCCGCTCATTGCCAAAAATTCACCGCAGTGCATCAGAACCTTCCTTGAATCGGGCTGGTTTCCAAACAG 2332
Query 2093 AGGATTTTAGTCTATATGCTTGTGCTTCTCCAAAAACACCCATCCAGGCAGGGGGATATGGTGCGTTT----CC 2162
|.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|..||| ||
Sbjct 2333 AAGATTTTAGTCTGTATGCTTGTGCTTCTCCGAAAACACCCATCCAAGCAGGGGGATATGGAGAATTTGCAGCC 2406
Query 2163 TGTCCAC 2169
| ||.|.
Sbjct 2407 T-TCAAG 2412