Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14562
• Subject: NM_177407.4
• Aligned Length: 1435
• Identities: 1333
• Gaps: 1

Alignment

Query    1  ATGGCCACCATCACCTGCACCCGCTTCACGGAAGAGTACCAGCTCTTCGAGGAATTGGGCAAGGGAGCCTTCTC  74
            |||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||.||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTACCATCACCTGCACCCGATTCACAGAAGAGTACCAGCTCTTTGAGGAACTGGGAAAGGGAGCCTTCTC  74

Query   75  GGTGGTGCGAAGGTGTGTGAAGGTGCTGGCTGGCCAGGAGTATGCTGCCAAGATCATCAACACAAAGAAGCTGT  148
            .||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct   75  TGTGGTGCGCAGGTGTGTGAAGGTGCTGGCTGGTCAGGAGTATGCTGCCAAGATTATCAACACCAAGAAGCTTT  148

Query  149  CAGCCAGAGACCATCAGAAGCTGGAGCGTGAAGCCCGCATCTGCCGCCTGCTGAAGCACCCCAACATCGTCCGA  222
            ||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.||.|||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  CAGCCAGAGATCACCAGAAGCTGGAGCGTGAGGCCCGCATCTGCCGCTTGTTGAAGCACCCCAATATCGTCCGA  222

Query  223  CTACATGACAGCATCTCAGAGGAGGGACACCACTACCTGATCTTCGACCTGGTCACTGGTGGGGAACTGTTTGA  296
            ||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTCCATGACAGCATCTCCGAGGAGGGGCACCACTACCTTATCTTCGATCTGGTTACTGGTGGGGAACTGTTTGA  296

Query  297  AGATATCGTGGCCCGGGAGTATTACAGTGAGGCGGATGCCAGTCACTGTATCCAGCAGATCCTGGAGGCTGTGC  370
            |||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  297  AGACATTGTGGCCCGGGAGTATTACAGTGAAGCTGATGCCAGCCACTGTATCCAGCAGATCTTGGAGGCTGTGC  370

Query  371  TGCACTGCCACCAGATGGGGGTGGTGCACCGGGACCTGAAGCCTGAGAATCTGTTGCTGGCCTCCAAGCTCAAG  444
            |.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  371  TACACTGTCACCAGATGGGGGTGGTGCATCGTGACCTGAAGCCTGAGAATCTGTTGCTGGCCTCGAAGCTCAAG  444

Query  445  GGTGCCGCAGTGAAGCTGGCAGACTTTGGCCTGGCCATAGAGGTGGAGGGGGAGCAGCAGGCATGGTTTGGGTT  518
            ||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCGCTGCTGTGAAGCTGGCAGACTTTGGCCTGGCCATAGAGGTGGAGGGGGAGCAGCAGGCATGGTTTGGGTT  518

Query  519  TGCAGGGACTCCTGGATATCTCTCCCCAGAAGTGCTGCGGAAGGACCCGTACGGGAAGCCTGTGGACCTGTGGG  592
            .||||||||.||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  519  CGCAGGGACACCTGGATACCTCTCCCCAGAAGTGCTGAGGAAGGACCCGTACGGGAAGCCCGTGGACCTGTGGG  592

Query  593  CTTGTGGGGTCATCCTGTACATCCTGCTGGTTGGGTACCCCCCGTTCTGGGATGAGGACCAGCACCGCCTGTAC  666
            |.|||||.|||||||||||.|||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  593  CCTGTGGCGTCATCCTGTATATCTTGCTGGTTGGGTATCCCCCGTTCTGGGATGAAGACCAGCATCGCCTGTAC  666

Query  667  CAGCAGATCAAAGCCGGCGCCTTATGATTTCCCATCGCCGGAATGGGACACTGTCACCCCGGAAGCCAAGGATC  740
            ||||||||||||||.||.||| ||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  667  CAGCAGATCAAAGCTGGTGCC-TATGATTTCCCATCACCAGAATGGGACACCGTCACCCCAGAAGCCAAGGATC  739

Query  741  TGATCAATAAGATGCTGACCATTAACCCATCCAAACGCATCACAGCTGCCGAAGCCATTAAGCACCCCTGGATC  814
            ||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.||..|.||||||||.||||||
Sbjct  740  TGATCAATAAGATGCTGACCATCAACCCGTCCAAACGCATCACGGCCGCTGAGGCTCTCAAGCACCCATGGATC  813

Query  815  TCGCACCGCTCCACCGTGGCATCGTGCATGCACAGACAGGAGACCGTGGACTGCCTGAAGAAGTTCAATGCCAG  888
            ||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  TCGCACCGCTCCACCGTGGCCTCCTGCATGCACAGACAGGAGACCGTGGACTGCCTGAAGAAGTTCAATGCCAG  887

Query  889  GAGGAAACTGAAGGGAGCCATTCTCACCACGATGCTGGCCACCAGGAACTTCTCCGGAGGGAAGAGTGGGGGAA  962
            |||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  888  GAGGAAACTGAAGGGAGCCATCCTCACCACTATGCTGGCCACCAGGAACTTCTCCGGAGGGAAGAGCGGAGGAA  961

Query  963  ACAAGAAGAGCGATGGTGTGAAGGAATCCTCAGAGAGCACCAACACCACCATCGAGGATGAAGACACCAAAGTG  1036
            |||||||||.||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  962  ACAAGAAGAACGATGGTGTGAAGGAATCTTCTGAGAGCACCAACACCACCATTGAGGACGAAGACACCAAAGTG  1035

Query 1037  CGGAAACAGGAAATTATAAAAGTGACAGAGCAGCTGATTGAAGCCATAAGCAATGGAGATTTTGAGTCCTACAC  1110
            ||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1036  CGCAAACAGGAAATTATCAAAGTGACAGAGCAGCTGATCGAAGCCATAAGCAATGGAGACTTTGAGTCCTACAC  1109

Query 1111  GAAGATGTGCGACCCTGGCATGACAGCCTTCGAACCTGAGGCCCTGGGGAACCTGGTTGAGGGCCTGGACTTCC  1184
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1110  GAAGATGTGCGACCCTGGAATGACAGCCTTTGAACCAGAGGCCCTGGGGAACCTGGTGGAGGGCCTGGACTTTC  1183

Query 1185  ATCGATTCTATTTTGAAAACCTGTGGTCCCGGAACAGCAAGCCCGTGCACACCACCATCCTGAATCCCCACATC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1184  ATCGATTCTATTTTGAAAACCTGTGGTCCCGGAACAGCAAGCCCGTGCACACCACCATCCTGAACCCTCACATC  1257

Query 1259  CACCTGATGGGCGACGAGTCAGCCTGCATCGCCTACATCCGCATCACGCAGTACCTGGACGCTGGCGGCATCCC  1332
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 1258  CACCTGATGGGTGACGAGTCAGCCTGCATCGCCTATATCCGCATCACTCAGTACCTGGATGCAGGCGGCATACC  1331

Query 1333  ACGCACCGCCCAGTCGGAGGAGACCCGTGTCTGGCACCGCCGGGACGGCAAATGGCAGATCGTCCACTTCCACA  1406
            .|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332  CCGCACGGCCCAGTCAGAGGAGACCCGCGTCTGGCACCGCAGGGACGGCAAATGGCAGATCGTCCACTTCCACA  1405

Query 1407  GATCTGGGGCGCCCTCCGTCCTGCCCCAC  1435
            |||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1406  GATCTGGGGCGCCCTCCGTCCTGCCGCAT  1434