Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14562
- Subject:
- XM_017317805.2
- Aligned Length:
- 1435
- Identities:
- 1333
- Gaps:
- 1
Alignment
Query 1 ATGGCCACCATCACCTGCACCCGCTTCACGGAAGAGTACCAGCTCTTCGAGGAATTGGGCAAGGGAGCCTTCTC 74
|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||.||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTACCATCACCTGCACCCGATTCACAGAAGAGTACCAGCTCTTTGAGGAACTGGGAAAGGGAGCCTTCTC 74
Query 75 GGTGGTGCGAAGGTGTGTGAAGGTGCTGGCTGGCCAGGAGTATGCTGCCAAGATCATCAACACAAAGAAGCTGT 148
.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 75 TGTGGTGCGCAGGTGTGTGAAGGTGCTGGCTGGTCAGGAGTATGCTGCCAAGATTATCAACACCAAGAAGCTTT 148
Query 149 CAGCCAGAGACCATCAGAAGCTGGAGCGTGAAGCCCGCATCTGCCGCCTGCTGAAGCACCCCAACATCGTCCGA 222
||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.||.|||||||||||||.|||||||||
Sbjct 149 CAGCCAGAGATCACCAGAAGCTGGAGCGTGAGGCCCGCATCTGCCGCTTGTTGAAGCACCCCAATATCGTCCGA 222
Query 223 CTACATGACAGCATCTCAGAGGAGGGACACCACTACCTGATCTTCGACCTGGTCACTGGTGGGGAACTGTTTGA 296
||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTCCATGACAGCATCTCCGAGGAGGGGCACCACTACCTTATCTTCGATCTGGTTACTGGTGGGGAACTGTTTGA 296
Query 297 AGATATCGTGGCCCGGGAGTATTACAGTGAGGCGGATGCCAGTCACTGTATCCAGCAGATCCTGGAGGCTGTGC 370
|||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 297 AGACATTGTGGCCCGGGAGTATTACAGTGAAGCTGATGCCAGCCACTGTATCCAGCAGATCTTGGAGGCTGTGC 370
Query 371 TGCACTGCCACCAGATGGGGGTGGTGCACCGGGACCTGAAGCCTGAGAATCTGTTGCTGGCCTCCAAGCTCAAG 444
|.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 371 TACACTGTCACCAGATGGGGGTGGTGCATCGTGACCTGAAGCCTGAGAATCTGTTGCTGGCCTCGAAGCTCAAG 444
Query 445 GGTGCCGCAGTGAAGCTGGCAGACTTTGGCCTGGCCATAGAGGTGGAGGGGGAGCAGCAGGCATGGTTTGGGTT 518
||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGCGCTGCTGTGAAGCTGGCAGACTTTGGCCTGGCCATAGAGGTGGAGGGGGAGCAGCAGGCATGGTTTGGGTT 518
Query 519 TGCAGGGACTCCTGGATATCTCTCCCCAGAAGTGCTGCGGAAGGACCCGTACGGGAAGCCTGTGGACCTGTGGG 592
.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 519 CGCAGGGACACCTGGATACCTCTCCCCAGAAGTGCTGAGGAAGGACCCGTACGGGAAGCCCGTGGACCTGTGGG 592
Query 593 CTTGTGGGGTCATCCTGTACATCCTGCTGGTTGGGTACCCCCCGTTCTGGGATGAGGACCAGCACCGCCTGTAC 666
|.|||||.|||||||||||.|||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 593 CCTGTGGCGTCATCCTGTATATCTTGCTGGTTGGGTATCCCCCGTTCTGGGATGAAGACCAGCATCGCCTGTAC 666
Query 667 CAGCAGATCAAAGCCGGCGCCTTATGATTTCCCATCGCCGGAATGGGACACTGTCACCCCGGAAGCCAAGGATC 740
||||||||||||||.||.||| ||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 667 CAGCAGATCAAAGCTGGTGCC-TATGATTTCCCATCACCAGAATGGGACACCGTCACCCCAGAAGCCAAGGATC 739
Query 741 TGATCAATAAGATGCTGACCATTAACCCATCCAAACGCATCACAGCTGCCGAAGCCATTAAGCACCCCTGGATC 814
||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.||..|.||||||||.||||||
Sbjct 740 TGATCAATAAGATGCTGACCATCAACCCGTCCAAACGCATCACGGCCGCTGAGGCTCTCAAGCACCCATGGATC 813
Query 815 TCGCACCGCTCCACCGTGGCATCGTGCATGCACAGACAGGAGACCGTGGACTGCCTGAAGAAGTTCAATGCCAG 888
||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 TCGCACCGCTCCACCGTGGCCTCCTGCATGCACAGACAGGAGACCGTGGACTGCCTGAAGAAGTTCAATGCCAG 887
Query 889 GAGGAAACTGAAGGGAGCCATTCTCACCACGATGCTGGCCACCAGGAACTTCTCCGGAGGGAAGAGTGGGGGAA 962
|||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 888 GAGGAAACTGAAGGGAGCCATCCTCACCACTATGCTGGCCACCAGGAACTTCTCCGGAGGGAAGAGCGGAGGAA 961
Query 963 ACAAGAAGAGCGATGGTGTGAAGGAATCCTCAGAGAGCACCAACACCACCATCGAGGATGAAGACACCAAAGTG 1036
|||||||||.||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 962 ACAAGAAGAACGATGGTGTGAAGGAATCTTCTGAGAGCACCAACACCACCATTGAGGACGAAGACACCAAAGTG 1035
Query 1037 CGGAAACAGGAAATTATAAAAGTGACAGAGCAGCTGATTGAAGCCATAAGCAATGGAGATTTTGAGTCCTACAC 1110
||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1036 CGCAAACAGGAAATTATCAAAGTGACAGAGCAGCTGATCGAAGCCATAAGCAATGGAGACTTTGAGTCCTACAC 1109
Query 1111 GAAGATGTGCGACCCTGGCATGACAGCCTTCGAACCTGAGGCCCTGGGGAACCTGGTTGAGGGCCTGGACTTCC 1184
||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1110 GAAGATGTGCGACCCTGGAATGACAGCCTTTGAACCAGAGGCCCTGGGGAACCTGGTGGAGGGCCTGGACTTTC 1183
Query 1185 ATCGATTCTATTTTGAAAACCTGTGGTCCCGGAACAGCAAGCCCGTGCACACCACCATCCTGAATCCCCACATC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1184 ATCGATTCTATTTTGAAAACCTGTGGTCCCGGAACAGCAAGCCCGTGCACACCACCATCCTGAACCCTCACATC 1257
Query 1259 CACCTGATGGGCGACGAGTCAGCCTGCATCGCCTACATCCGCATCACGCAGTACCTGGACGCTGGCGGCATCCC 1332
|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 1258 CACCTGATGGGTGACGAGTCAGCCTGCATCGCCTATATCCGCATCACTCAGTACCTGGATGCAGGCGGCATACC 1331
Query 1333 ACGCACCGCCCAGTCGGAGGAGACCCGTGTCTGGCACCGCCGGGACGGCAAATGGCAGATCGTCCACTTCCACA 1406
.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332 CCGCACGGCCCAGTCAGAGGAGACCCGCGTCTGGCACCGCAGGGACGGCAAATGGCAGATCGTCCACTTCCACA 1405
Query 1407 GATCTGGGGCGCCCTCCGTCCTGCCCCAC 1435
|||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1406 GATCTGGGGCGCCCTCCGTCCTGCCGCAG 1434