Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14570
• Subject: NM_001787.3
• Aligned Length: 2393
• Identities: 2335
• Gaps: 49

Alignment

Query    1  ATGGGTGATGAAAAGGACTCTTGGAAAGTGAAAACTTTAGATGAAATTCTTCAGGAAAAGAAACGAAGGAAGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGTGATGAAAAGGACTCTTGGAAAGTGAAAACTTTAGATGAAATTCTTCAGGAAAAGAAACGAAGGAAGGA  74

Query   75  ACAAGAGGAGAAAGCAGAGATAAAACGCTTAAAAAATTCTGATGACCGGGATTCCAAGCGGGATTCCCTTGAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACAAGAGGAGAAAGCAGAGATAAAACGCTTAAAAAATTCTGATGACCGGGATTCCAAGCGGGATTCCCTTGAGG  148

Query  149  AGGGGGAGCTGAGAGATCACCGCATGGAGATCACAATAAGGAACTCCCCGTATAGAAGAGAAGACTCTATGGAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGGGGAGCTGAGAGATCACCGCATGGAGATCACAATAAGGAACTCCCCGTATAGAAGAGAAGACTCTATGGAA  222

Query  223  GACAGAGGAGAAGAAGATGATTCTTTGGCCATCAAACCACCCCAGCAAATGTCTCGGAAAGAAAAAGCTCATCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACAGAGGAGAAGAAGATGATTCTTTGGCCATCAAACCACCCCAGCAAATGTCTCGGAAAGAAAAAGCTCATCA  296

Query  297  CAGAAAAGATGAAAAGAGAAAAGAGAAACGTAGGCATCGTAGCCATTCAGCAGAAGGGGGGAAGCATGCTAGAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAGAAAAGATGAAAAGAGAAAAGAGAAACGTAGGCATCGTAGCCATTCAGCAGAAGGGGGGAAGCATGCTAGAG  370

Query  371  TGAAAGAAAAAGAAAGAGAGCACGAACGTCGGAAACGGCATCGAGAAGAACAGGATAAAGCTCGCCGGGAATGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGAAAGAAAAAGAAAGAGAGCACGAACGTCGGAAACGGCATCGAGAAGAACAGGATAAAGCTCGCCGGGAATGG  444

Query  445  GAAAGACAGAAGAGAAGGGAGATGGCAAGGGAGCATTCCAGGAGAGAAAGGGACCGCTTGGAGCAGTTAGAAAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAAGACAGAAGAGAAGGGAGATGGCAAGGGAGCATTCCAGGAGAGAAAGGGACCGCTTGGAGCAGTTAGAAAG  518

Query  519  GAAGCGGGAGCGGGAGCGCAAGATGCGGGAGCAGCAGAAGGAGCAGCGGGAGCAGAAGGAGCGCGAGCGGCGGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAGCGGGAGCGGGAGCGCAAGATGCGGGAGCAGCAGAAGGAGCAGCGGGAGCAGAAGGAGCGCGAGCGGCGGG  592

Query  593  CGGAGGAGCGGCGCAAGGAGCGGGAGGCCCGCAGGGAAGTGTCTGCACATCACCGAACGATGAGAGAGGACTAC  666
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGAGGAGCGGCGCAAGGAGCGGGAGGCCCGCAGGGAAGTGTCTGCACATCACCGAACGATGAGAGAGGACTAC  666

Query  667  AGCGACAAAGTGAAAGCCAGCCACTGGAGTCGCAGCCCGCCTCGGCCGCCGCGGGAGCGGTTCGAGTTGGGAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGCGACAAAGTGAAAGCCAGCCACTGGAGTCGCAGCCCGCCTCGGCCGCCGCGGGAGCGGTTCGAGTTGGGAGA  740

Query  741  CGGCCGG--------------------------------GAAGCCAG------TAAAAG-AGAGAAAATGGAAG  775
            |||||||                                ||||||||      |||||| ||||||||||||||
Sbjct  741  CGGCCGGAAGCCAGGTGAGGCCAGGCCGGCGCCTGCGCAGAAGCCAGCACAGTTAAAAGAAGAGAAAATGGAAG  814

Query  776  AAAGGGACCTGCTGTCCGACTTACAGGACATCAGCGACAGCGAGAGGAAGACCAGCTCGGCCGAGTCCTCGTCA  849
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Sbjct  815  AAAGGGACCTGCTGTCCGACTTACAGGACATCAGCGACAGCGAGAGGAAGACCAGCTCGGCCGAGTCCTCGTCA  888

Query  850  GCAGAATCAGGCTCAGGTTCTGAGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGGGAGCACCAGTGA  923
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCGGAATCAGGCTCAGGTTCTGAGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGGGAGCACCAGTGA  962

Query  924  AGAATCAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGACCGGCAGCAACTCTGAGGAGGCATCAG  997
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGAATCAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGACCGGCAGCAACTCTGAGGAGGCATCAG  1036

Query  998  AGCAGTCTGCCGAAGAAGTAAGTGAGGAAGAAATGAGTGAAGATGAAGAACGAGAAAATGAAAACCACCTCTTG  1071
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGCAGTCTGCCGAAGAAGTAAGTGAGGAAGAAATGAGTGAAGATGAAGAACGAGAAAATGAAAACCACCTCTTG  1110

Query 1072  GTTGTTCCAGAGTCACGGTTCGACCGAGATTCCGGGGAGAGTGAAGAAGCAGAGGAAGAAGTGGGTGAGGGAAC  1145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTTGTTCCAGAGTCACGGTTCGACCGAGATTCCGGGGAGAGTGAAGAAGCAGAGGAAGAAGTGGGTGAGGGAAC  1184

Query 1146  GCCGCAGAGCAGCGCCCTGACAGAGGGCGACTATGTGCCCGACTCCCCTGCCCTGTCGCCCATCGAGCTCAAGC  1219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCCGCAGAGCAGCGCCCTGACAGAGGGCGACTATGTGCCCGACTCCCCTGCCCTGTCGCCCATCGAGCTCAAGC  1258

Query 1220  AGGAGCTGCCCAAGTACCTGCCGGCCCTGCAGGGCTGCCGGAGCGTCGAGGAGTTCCAGTGCCTGAACAGGATC  1293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGGAGCTGCCCAAGTACCTGCCGGCCCTGCAGGGCTGCCGGAGCGTCGAGGAGTTCCAGTGCCTGAACAGGATC  1332

Query 1294  GAGGAGGGCACCTATGGAGTGGTCTACAGAGCAAAAGACAAGAAAACAGATGAAATTGTGGCTCTAAAGCGGCT  1367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAGGAGGGCACCTATGGAGTGGTCTACAGAGCAAAAGACAAGAAAACAGATGAAATTGTGGCTCTAAAGCGGCT  1406

Query 1368  GAAGATGGAGAAGGAGAAGGAGGGCTTCCCGATCACGTCGCTGAGGGAGATCAACACCATCCTCAAGGCCCAGC  1441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAAGATGGAGAAGGAGAAGGAGGGCTTCCCGATCACGTCGCTGAGGGAGATCAACACCATCCTCAAGGCCCAGC  1480

Query 1442  ATCCCAACATCGTCACCGTTAGAGAGATTGTGGTGGGCAGCAACATGGACAAGATCTACATCGTGATGAACTAT  1515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATCCCAACATCGTCACCGTTAGAGAGATTGTGGTGGGCAGCAACATGGACAAGATCTACATCGTGATGAACTAT  1554

Query 1516  GTGGAGCACGACCTCAAGAGCCTGATGGAGACCAGAAAACAGCCCCTTCCTGCCAAGGGGAGGTGAAGACCCCT  1589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 1555  GTGGAGCACGACCTCAAGAGCCTGATGGAGACCATGAAACAG-CCCTTCCTGCC-AGGGGAGGTGAAGA-CCCT  1625

Query 1590  GAGAATCCAGGTTGGTGCGTGGGGGTGAAACACCTCCACGACAAACT-GATCCCTGCACCGTGACCTCAAGACG  1662
            ||..||||| |.||.||||| ||||||||||||||.|||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626  GATGATCCA-GCTGCTGCGT-GGGGTGAAACACCTGCACGAC-AACTGGAT-CCTGCACCGTGACCTCAAGACG  1695

Query 1663  TCC-ACCTGGCTGCTGAGCCACGCCGGCATCCTCAAGGTGGGTGACTTCGGGCTGGCGCGGGAGTACGGATCCC  1735
            ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1696  TCCAACCT-GCTGCTGAGCCACGCCGGCATCCTCAAGGTGGGTGACTTCGGGCTGGCGCGGGAGTACGGATCCC  1768

Query 1736  CTCTGAAGGCCTACACCCCGGTCGTGGTGACCCTGTGGTACCGCGCCCCAGAGCTGCTGCTTGGTGCCAAGGAA  1809
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1769  CTCTGAAGGCCTACACCCCGGTCGTGGTGACCCTGTGGTACCGCGCCCCAGAGCTGCTGCTTGGTGCCAAGGAA  1842

Query 1810  TACTCCACGGCCGTGGACATGTGGTCAGTGGGTTGCATCTTCGGGGAGCTGCTGACTCAGAAGCCTCTGTTCCC  1883
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Sbjct 1843  TACTCCACGGCCGTGGACATGTGGTCAGTGGGTTGCATCTTCGGGGAGCTGCTGACTCAGAAGCCTCTGTTCCC  1916

Query 1884  CGGGAAGTCAGAAATCGATCAGATCAACAAGGTGTTCAAGGATCTGGGGACCCCTAGTGAGAAAATCTGGCCCG  1957
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Sbjct 1917  CGGGAAGTCAGAAATCGATCAGATCAACAAGGTGTTCAAGGATCTGGGGACCCCTAGTGAGAAAATCTGGCCCG  1990

Query 1958  GCTACAGCGAGCTCCCAGCAGTCAAGAAGATGACCTTCAGCGAGCACCCCTACAACAACCTCCGCAAGCGCTTC  2031
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Sbjct 1991  GCTACAGCGAGCTCCCAGCAGTCAAGAAGATGACCTTCAGCGAGCACCCCTACAACAACCTCCGCAAGCGCTTC  2064

Query 2032  GGGGCTCTGCTCTCAGACCAGGGCTTCGACCTCATGAACAAGTTCCTGACCTACTTCCCCGGGAGGAGGATCAG  2105
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2065  GGGGCTCTGCTCTCAGACCAGGGCTTCGACCTCATGAACAAGTTCCTGACCTACTTCCCCGGGAGGAGGATCAG  2138

Query 2106  CGCTGAGGACGGCCTCAAGCATGAGTATTTCCGCGAGACCCCCCTCCCCATCGACCCCTCCATGTTCCCCACGT  2179
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2139  CGCTGAGGACGGCCTCAAGCATGAGTATTTCCGCGAGACCCCCCTCCCCATCGACCCCTCCATGTTCCCCACGT  2212

Query 2180  GGCCCGCCAAGAGCGAGCAGCAGCGTGTGAAGCGGGGCACCAGCCCGAGGCCCCCTGAGGGAGGCCTGGGCTAC  2253
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Sbjct 2213  GGCCCGCCAAGAGCGAGCAGCAGCGTGTGAAGCGGGGCACCAGCCCGAGGCCCCCTGAGGGAGGCCTGGGCTAC  2286

Query 2254  AGCCAGCTGGGTGACGACGACCTGAAGGAGACGGGCTTCCACCTTACCACCACGAACCAGGGGGCCTCTGCCGC  2327
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Sbjct 2287  AGCCAGCTGGGTGACGACGACCTGAAGGAGACGGGCTTCCACCTTACCACCACGAACCAGGGGGCCTCTGCCGC  2360

Query 2328  GGGCCCCGGCTTCAGCCTCAAGTTC  2352
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2361  GGGCCCCGGCTTCAGCCTCAAGTTC  2385