Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14570
• Subject: NM_033486.3
• Aligned Length: 2355
• Identities: 2334
• Gaps: 12

Alignment

Query    1  ATGGGTGATGAAAAGGACTCTTGGAAAGTGAAAACTTTAGATGAAATTCTTCAGGAAAAGAAACGAAGGAAGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGTGATGAAAAGGACTCTTGGAAAGTGAAAACTTTAGATGAAATTCTTCAGGAAAAGAAACGAAGGAAGGA  74

Query   75  ACAAGAGGAGAAAGCAGAGATAAAACGCTTAAAAAATTCTGATGACCGGGATTCCAAGCGGGATTCCCTTGAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACAAGAGGAGAAAGCAGAGATAAAACGCTTAAAAAATTCTGATGACCGGGATTCCAAGCGGGATTCCCTTGAGG  148

Query  149  AGGGGGAGCTGAGAGATCACCGCATGGAGATCACAATAAGGAACTCCCCGTATAGAAGAGAAGACTCTATGGAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGGGGAGCTGAGAGATCACCGCATGGAGATCACAATAAGGAACTCCCCGTATAGAAGAGAAGACTCTATGGAA  222

Query  223  GACAGAGGAGAAGAAGATGATTCTTTGGCCATCAAACCACCCCAGCAAATGTCTCGGAAAGAAAAAGCTCATCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACAGAGGAGAAGAAGATGATTCTTTGGCCATCAAACCACCCCAGCAAATGTCTCGGAAAGAAAAAGCTCATCA  296

Query  297  CAGAAAAGATGAAAAGAGAAAAGAGAAACGTAGGCATCGTAGCCATTCAGCAGAAGGGGGGAAGCATGCTAGAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAGAAAAGATGAAAAGAGAAAAGAGAAACGTAGGCATCGTAGCCATTCAGCAGAAGGGGGGAAGCATGCTAGAG  370

Query  371  TGAAAGAAAAAGAAAGAGAGCACGAACGTCGGAAACGGCATCGAGAAGAACAGGATAAAGCTCGCCGGGAATGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGAAAGAAAAAGAAAGAGAGCACGAACGTCGGAAACGGCATCGAGAAGAACAGGATAAAGCTCGCCGGGAATGG  444

Query  445  GAAAGACAGAAGAGAAGGGAGATGGCAAGGGAGCATTCCAGGAGAGAAAGGGACCGCTTGGAGCAGTTAGAAAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAAGACAGAAGAGAAGGGAGATGGCAAGGGAGCATTCCAGGAGAGAAAGGGACCGCTTGGAGCAGTTAGAAAG  518

Query  519  GAAGCGGGAGCGGGAGCGCAAGATGCGGGAGCAGCAGAAGGAGCAGCGGGAGCAGAAGGAGCGCGAGCGGCGGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAGCGGGAGCGGGAGCGCAAGATGCGGGAGCAGCAGAAGGAGCAGCGGGAGCAGAAGGAGCGCGAGCGGCGGG  592

Query  593  CGGAGGAGCGGCGCAAGGAGCGGGAGGCCCGCAGGGAAGTGTCTGCACATCACCGAACGATGAGAGAGGACTAC  666
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGAGGAGCGGCGCAAGGAGCGGGAGGCCCGCAGGGAAGTGTCTGCACATCACCGAACGATGAGAGAGGACTAC  666

Query  667  AGCGACAAAGTGAAAGCCAGCCACTGGAGTCGCAGCCCGCCTCGGCCGCCGCGGGAGCGGTTCGAGTTGGGAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGCGACAAAGTGAAAGCCAGCCACTGGAGTCGCAGCCCGCCTCGGCCGCCGCGGGAGCGGTTCGAGTTGGGAGA  740

Query  741  CGGCCGGGAAGCCAGTAAAAG-AGAGAAAATGGAAGAAAGGGACCTGCTGTCCGACTTACAGGACATCAGCGAC  813
            ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGGCC-GGAAGCCAGTAAAAGAAGAGAAAATGGAAGAAAGGGACCTGCTGTCCGACTTACAGGACATCAGCGAC  813

Query  814  AGCGAGAGGAAGACCAGCTCGGCCGAGTCCTCGTCAGCAGAATCAGGCTCAGGTTCTGAGGAAGAAGAGGAGGA  887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  AGCGAGAGGAAGACCAGCTCGGCCGAGTCCTCGTCAGCGGAATCAGGCTCAGGTTCTGAGGAAGAAGAGGAGGA  887

Query  888  GGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGGGAGCACCAGTGAAGAATCAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGG  961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  GGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGGGAGCACCAGTGAAGAATCAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGG  961

Query  962  AGGAGGAGACCGGCAGCAACTCTGAGGAGGCATCAGAGCAGTCTGCCGAAGAAGTAAGTGAGGAAGAAATGAGT  1035
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  AGGAGGAGACCGGCAGCAACTCTGAGGAGGCATCAGAGCAGTCTGCCGAAGAAGTAAGTGAGGAAGAAATGAGT  1035

Query 1036  GAAGATGAAGAACGAGAAAATGAAAACCACCTCTTGGTTGTTCCAGAGTCACGGTTCGACCGAGATTCCGGGGA  1109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  GAAGATGAAGAACGAGAAAATGAAAACCACCTCTTGGTTGTTCCAGAGTCACGGTTCGACCGAGATTCCGGGGA  1109

Query 1110  GAGTGAAGAAGCAGAGGAAGAAGTGGGTGAGGGAACGCCGCAGAGCAGCGCCCTGACAGAGGGCGACTATGTGC  1183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  GAGTGAAGAAGCAGAGGAAGAAGTGGGTGAGGGAACGCCGCAGAGCAGCGCCCTGACAGAGGGCGACTATGTGC  1183

Query 1184  CCGACTCCCCTGCCCTGTCGCCCATCGAGCTCAAGCAGGAGCTGCCCAAGTACCTGCCGGCCCTGCAGGGCTGC  1257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  CCGACTCCCCTGCCCTGTCGCCCATCGAGCTCAAGCAGGAGCTGCCCAAGTACCTGCCGGCCCTGCAGGGCTGC  1257

Query 1258  CGGAGCGTCGAGGAGTTCCAGTGCCTGAACAGGATCGAGGAGGGCACCTATGGAGTGGTCTACAGAGCAAAAGA  1331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258  CGGAGCGTCGAGGAGTTCCAGTGCCTGAACAGGATCGAGGAGGGCACCTATGGAGTGGTCTACAGAGCAAAAGA  1331

Query 1332  CAAGAAAACAGATGAAATTGTGGCTCTAAAGCGGCTGAAGATGGAGAAGGAGAAGGAGGGCTTCCCGATCACGT  1405
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332  CAAGAAAACAGATGAAATTGTGGCTCTAAAGCGGCTGAAGATGGAGAAGGAGAAGGAGGGCTTCCCGATCACGT  1405

Query 1406  CGCTGAGGGAGATCAACACCATCCTCAAGGCCCAGCATCCCAACATCGTCACCGTTAGAGAGATTGTGGTGGGC  1479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406  CGCTGAGGGAGATCAACACCATCCTCAAGGCCCAGCATCCCAACATCGTCACCGTTAGAGAGATTGTGGTGGGC  1479

Query 1480  AGCAACATGGACAAGATCTACATCGTGATGAACTATGTGGAGCACGACCTCAAGAGCCTGATGGAGACCAGAAA  1553
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||
Sbjct 1480  AGCAACATGGACAAGATCTACATCGTGATGAACTATGTGGAGCACGACCTCAAGAGCCTGATGGAGACCATGAA  1553

Query 1554  ACAGCCCCTTCCTGCCAAGGGGAGGTGAAGACCCCTGAGAATCCAGGTTGGTGCGTGGGGGTGAAACACCTCCA  1627
            |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||..||||| |.||.||||| ||||||||||||||.||
Sbjct 1554  ACAG-CCCTTCCTGCC-AGGGGAGGTGAAGA-CCCTGATGATCCA-GCTGCTGCGT-GGGGTGAAACACCTGCA  1622

Query 1628  CGACAAACT-GATCCCTGCACCGTGACCTCAAGACGTCC-ACCTGGCTGCTGAGCCACGCCGGCATCCTCAAGG  1699
            |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1623  CGAC-AACTGGAT-CCTGCACCGTGACCTCAAGACGTCCAACCT-GCTGCTGAGCCACGCCGGCATCCTCAAGG  1693

Query 1700  TGGGTGACTTCGGGCTGGCGCGGGAGTACGGATCCCCTCTGAAGGCCTACACCCCGGTCGTGGTGACCCTGTGG  1773
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1694  TGGGTGACTTCGGGCTGGCGCGGGAGTACGGATCCCCTCTGAAGGCCTACACCCCGGTCGTGGTGACCCTGTGG  1767

Query 1774  TACCGCGCCCCAGAGCTGCTGCTTGGTGCCAAGGAATACTCCACGGCCGTGGACATGTGGTCAGTGGGTTGCAT  1847
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1768  TACCGCGCCCCAGAGCTGCTGCTTGGTGCCAAGGAATACTCCACGGCCGTGGACATGTGGTCAGTGGGTTGCAT  1841

Query 1848  CTTCGGGGAGCTGCTGACTCAGAAGCCTCTGTTCCCCGGGAAGTCAGAAATCGATCAGATCAACAAGGTGTTCA  1921
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1842  CTTCGGGGAGCTGCTGACTCAGAAGCCTCTGTTCCCCGGGAAGTCAGAAATCGATCAGATCAACAAGGTGTTCA  1915

Query 1922  AGGATCTGGGGACCCCTAGTGAGAAAATCTGGCCCGGCTACAGCGAGCTCCCAGCAGTCAAGAAGATGACCTTC  1995
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1916  AGGATCTGGGGACCCCTAGTGAGAAAATCTGGCCCGGCTACAGCGAGCTCCCAGCAGTCAAGAAGATGACCTTC  1989

Query 1996  AGCGAGCACCCCTACAACAACCTCCGCAAGCGCTTCGGGGCTCTGCTCTCAGACCAGGGCTTCGACCTCATGAA  2069
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1990  AGCGAGCACCCCTACAACAACCTCCGCAAGCGCTTCGGGGCTCTGCTCTCAGACCAGGGCTTCGACCTCATGAA  2063

Query 2070  CAAGTTCCTGACCTACTTCCCCGGGAGGAGGATCAGCGCTGAGGACGGCCTCAAGCATGAGTATTTCCGCGAGA  2143
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2064  CAAGTTCCTGACCTACTTCCCCGGGAGGAGGATCAGCGCTGAGGACGGCCTCAAGCATGAGTATTTCCGCGAGA  2137

Query 2144  CCCCCCTCCCCATCGACCCCTCCATGTTCCCCACGTGGCCCGCCAAGAGCGAGCAGCAGCGTGTGAAGCGGGGC  2217
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2138  CCCCCCTCCCCATCGACCCCTCCATGTTCCCCACGTGGCCCGCCAAGAGCGAGCAGCAGCGTGTGAAGCGGGGC  2211

Query 2218  ACCAGCCCGAGGCCCCCTGAGGGAGGCCTGGGCTACAGCCAGCTGGGTGACGACGACCTGAAGGAGACGGGCTT  2291
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2212  ACCAGCCCGAGGCCCCCTGAGGGAGGCCTGGGCTACAGCCAGCTGGGTGACGACGACCTGAAGGAGACGGGCTT  2285

Query 2292  CCACCTTACCACCACGAACCAGGGGGCCTCTGCCGCGGGCCCCGGCTTCAGCCTCAAGTTC  2352
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2286  CCACCTTACCACCACGAACCAGGGGGCCTCTGCCGCGGGCCCCGGCTTCAGCCTCAAGTTC  2346