Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14570
- Subject:
- XM_006711065.4
- Aligned Length:
- 2393
- Identities:
- 2305
- Gaps:
- 79
Alignment
Query 1 ATGGGTGATGAAAAGGACTCTTGGAAAGTGAAAACTTTAGATGAAATTCTTCAGGAAAAGAAACGAAGGAAGGA 74
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Sbjct 1 ATGGGTGATGAAAAGGACTCTTGGAAAGTGAAAACTTTAGATGAAATTCTTCAGGAAAAGAAACGAAGGAAGGA 74
Query 75 ACAAGAGGAGAAAGCAGAGATAAAACGCTTAAAAAATTCTGATGACCGGGATTCCAAGCGGGATTCCCTTGAGG 148
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Sbjct 75 ACAAGAGGAGAAAGCAGAGATAAAACGCTTAAAAAATTCTGATGACCGGGATTCCAAGCGGGATTCCCTTGAGG 148
Query 149 AGGGGGAGCTGAGAGATCACCGCATGGAGATCACAATAAGGAACTCCCCGTATAGAAGAGAAGACTCTATGGAA 222
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Sbjct 149 AGGGGGAGCTGAGAGATCACCGCATGGAGATCACAATAAGGAACTCCCCGTATAGAAGAGAAGACTCTATGGAA 222
Query 223 GACAGAGGAGAAGAAGATGATTCTTTGGCCATCAAACCACCCCAGCAAATGTCTCGGAAAGAAAAAGCTCATCA 296
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Sbjct 223 GACAGAGGAGAAGAAGATGATTCTTTGGCCATCAAACCACCCCAGCAAATGTCTCGGAAAGAAAAAGCTCATCA 296
Query 297 CAGAAAAGATGAAAAGAGAAAAGAGAAACGTAGGCATCGTAGCCATTCAGCAGAAGGGGGGAAGCATGCTAGAG 370
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Sbjct 297 CAGAAAAGATGAAAAGAGAAAAGAGAAAC------------------------------GGAAGCATGCTAGAG 340
Query 371 TGAAAGAAAAAGAAAGAGAGCACGAACGTCGGAAACGGCATCGAGAAGAACAGGATAAAGCTCGCCGGGAATGG 444
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Sbjct 341 TGAAAGAAAAAGAAAGAGAGCACGAACGTCGGAAACGGCATCGAGAAGAACAGGATAAAGCTCGCCGGGAATGG 414
Query 445 GAAAGACAGAAGAGAAGGGAGATGGCAAGGGAGCATTCCAGGAGAGAAAGGGACCGCTTGGAGCAGTTAGAAAG 518
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Sbjct 415 GAAAGACAGAAGAGAAGGGAGATGGCAAGGGAGCATTCCAGGAGAGAAAGGGACCGCTTGGAGCAGTTAGAAAG 488
Query 519 GAAGCGGGAGCGGGAGCGCAAGATGCGGGAGCAGCAGAAGGAGCAGCGGGAGCAGAAGGAGCGCGAGCGGCGGG 592
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Sbjct 489 GAAGCGGGAGCGGGAGCGCAAGATGCGGGAGCAGCAGAAGGAGCAGCGGGAGCAGAAGGAGCGCGAGCGGCGGG 562
Query 593 CGGAGGAGCGGCGCAAGGAGCGGGAGGCCCGCAGGGAAGTGTCTGCACATCACCGAACGATGAGAGAGGACTAC 666
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Sbjct 563 CAGAGGAGCGGCGCAAGGAGCGGGAGGCCCGCAGGGAAGTGTCTGCACATCACCGAACGATGAGAGAGGACTAC 636
Query 667 AGCGACAAAGTGAAAGCCAGCCACTGGAGTCGCAGCCCGCCTCGGCCGCCGCGGGAGCGGTTCGAGTTGGGAGA 740
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Sbjct 637 AGCGACAAAGTGAAAGCCAGCCACTGGAGTCGCAGCCCGCCTCGGCCGCCGCGGGAGCGGTTCGAGTTGGGAGA 710
Query 741 CGGCCGG--------------------------------GAAGCCAG------TAAAAG-AGAGAAAATGGAAG 775
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Sbjct 711 CGGCCGGAAGCCAGGTGAGGCCAGGCCGGCGCCTGCGCAGAAGCCAGCACAGTTAAAAGAAGAGAAAATGGAAG 784
Query 776 AAAGGGACCTGCTGTCCGACTTACAGGACATCAGCGACAGCGAGAGGAAGACCAGCTCGGCCGAGTCCTCGTCA 849
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Sbjct 785 AAAGGGACCTGCTGTCCGACTTACAGGACATCAGCGACAGCGAGAGGAAGACCAGCTCGGCCGAGTCCTCGTCA 858
Query 850 GCAGAATCAGGCTCAGGTTCTGAGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGGGAGCACCAGTGA 923
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Sbjct 859 GCGGAATCAGGCTCAGGTTCTGAGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGGGAGCACCAGTGA 932
Query 924 AGAATCAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGACCGGCAGCAACTCTGAGGAGGCATCAG 997
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Sbjct 933 AGAATCAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGACCGGCAGCAACTCTGAGGAGGCATCAG 1006
Query 998 AGCAGTCTGCCGAAGAAGTAAGTGAGGAAGAAATGAGTGAAGATGAAGAACGAGAAAATGAAAACCACCTCTTG 1071
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Sbjct 1007 AGCAGTCTGCCGAAGAAGTAAGTGAGGAAGAAATGAGTGAAGATGAAGAACGAGAAAATGAAAACCACCTCTTG 1080
Query 1072 GTTGTTCCAGAGTCACGGTTCGACCGAGATTCCGGGGAGAGTGAAGAAGCAGAGGAAGAAGTGGGTGAGGGAAC 1145
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Sbjct 1081 GTTGTTCCAGAGTCACGGTTCGACCGAGATTCCGGGGAGAGTGAAGAAGCAGAGGAAGAAGTGGGTGAGGGAAC 1154
Query 1146 GCCGCAGAGCAGCGCCCTGACAGAGGGCGACTATGTGCCCGACTCCCCTGCCCTGTCGCCCATCGAGCTCAAGC 1219
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Sbjct 1155 GCCGCAGAGCAGCGCCCTGACAGAGGGCGACTATGTGCCCGACTCCCCTGCCCTGTCGCCCATCGAGCTCAAGC 1228
Query 1220 AGGAGCTGCCCAAGTACCTGCCGGCCCTGCAGGGCTGCCGGAGCGTCGAGGAGTTCCAGTGCCTGAACAGGATC 1293
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Sbjct 1229 AGGAGCTGCCCAAGTACCTGCCGGCCCTGCAGGGCTGCCGGAGCGTCGAGGAGTTCCAGTGCCTGAACAGGATC 1302
Query 1294 GAGGAGGGCACCTATGGAGTGGTCTACAGAGCAAAAGACAAGAAAACAGATGAAATTGTGGCTCTAAAGCGGCT 1367
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Sbjct 1303 GAGGAGGGCACCTATGGAGTGGTCTACAGAGCAAAAGACAAGAAAACAGATGAAATTGTGGCTCTAAAGCGGCT 1376
Query 1368 GAAGATGGAGAAGGAGAAGGAGGGCTTCCCGATCACGTCGCTGAGGGAGATCAACACCATCCTCAAGGCCCAGC 1441
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Sbjct 1377 GAAGATGGAGAAGGAGAAGGAGGGCTTCCCGATCACGTCGCTGAGGGAGATCAACACCATCCTCAAGGCCCAGC 1450
Query 1442 ATCCCAACATCGTCACCGTTAGAGAGATTGTGGTGGGCAGCAACATGGACAAGATCTACATCGTGATGAACTAT 1515
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Sbjct 1451 ATCCCAACATCGTCACCGTTAGAGAGATTGTGGTGGGCAGCAACATGGACAAGATCTACATCGTGATGAACTAT 1524
Query 1516 GTGGAGCACGACCTCAAGAGCCTGATGGAGACCAGAAAACAGCCCCTTCCTGCCAAGGGGAGGTGAAGACCCCT 1589
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Sbjct 1525 GTGGAGCACGACCTCAAGAGCCTGATGGAGACCATGAAACAG-CCCTTCCTGCC-AGGGGAGGTGAAGA-CCCT 1595
Query 1590 GAGAATCCAGGTTGGTGCGTGGGGGTGAAACACCTCCACGACAAACT-GATCCCTGCACCGTGACCTCAAGACG 1662
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Sbjct 1596 GATGATCCA-GCTGCTGCGT-GGGGTGAAACACCTGCACGAC-AACTGGAT-CCTGCACCGTGACCTCAAGACG 1665
Query 1663 TCC-ACCTGGCTGCTGAGCCACGCCGGCATCCTCAAGGTGGGTGACTTCGGGCTGGCGCGGGAGTACGGATCCC 1735
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Sbjct 1666 TCCAACCT-GCTGCTGAGCCACGCCGGCATCCTCAAGGTGGGTGACTTCGGGCTGGCGCGGGAGTACGGATCCC 1738
Query 1736 CTCTGAAGGCCTACACCCCGGTCGTGGTGACCCTGTGGTACCGCGCCCCAGAGCTGCTGCTTGGTGCCAAGGAA 1809
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Sbjct 1739 CTCTGAAGGCCTACACCCCGGTCGTGGTGACCCTGTGGTACCGCGCCCCAGAGCTGCTGCTTGGTGCCAAGGAA 1812
Query 1810 TACTCCACGGCCGTGGACATGTGGTCAGTGGGTTGCATCTTCGGGGAGCTGCTGACTCAGAAGCCTCTGTTCCC 1883
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Sbjct 1813 TACTCCACGGCCGTGGACATGTGGTCAGTGGGTTGCATCTTCGGGGAGCTGCTGACTCAGAAGCCTCTGTTCCC 1886
Query 1884 CGGGAAGTCAGAAATCGATCAGATCAACAAGGTGTTCAAGGATCTGGGGACCCCTAGTGAGAAAATCTGGCCCG 1957
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Sbjct 1887 CGGGAAGTCAGAAATCGATCAGATCAACAAGGTGTTCAAGGATCTGGGGACCCCTAGTGAGAAAATCTGGCCCG 1960
Query 1958 GCTACAGCGAGCTCCCAGCAGTCAAGAAGATGACCTTCAGCGAGCACCCCTACAACAACCTCCGCAAGCGCTTC 2031
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Sbjct 1961 GCTACAGCGAGCTCCCAGCAGTCAAGAAGATGACCTTCAGCGAGCACCCCTACAACAACCTCCGCAAGCGCTTC 2034
Query 2032 GGGGCTCTGCTCTCAGACCAGGGCTTCGACCTCATGAACAAGTTCCTGACCTACTTCCCCGGGAGGAGGATCAG 2105
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Sbjct 2035 GGGGCTCTGCTCTCAGACCAGGGCTTCGACCTCATGAACAAGTTCCTGACCTACTTCCCCGGGAGGAGGATCAG 2108
Query 2106 CGCTGAGGACGGCCTCAAGCATGAGTATTTCCGCGAGACCCCCCTCCCCATCGACCCCTCCATGTTCCCCACGT 2179
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Sbjct 2109 CGCTGAGGACGGCCTCAAGCATGAGTATTTCCGCGAGACCCCCCTCCCCATCGACCCCTCCATGTTCCCCACGT 2182
Query 2180 GGCCCGCCAAGAGCGAGCAGCAGCGTGTGAAGCGGGGCACCAGCCCGAGGCCCCCTGAGGGAGGCCTGGGCTAC 2253
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Sbjct 2183 GGCCCGCCAAGAGCGAGCAGCAGCGTGTGAAGCGGGGCACCAGCCCGAGGCCCCCTGAGGGAGGCCTGGGCTAC 2256
Query 2254 AGCCAGCTGGGTGACGACGACCTGAAGGAGACGGGCTTCCACCTTACCACCACGAACCAGGGGGCCTCTGCCGC 2327
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Sbjct 2257 AGCCAGCTGGGTGACGACGACCTGAAGGAGACGGGCTTCCACCTTACCACCACGAACCAGGGGGCCTCTGCCGC 2330
Query 2328 GGGCCCCGGCTTCAGCCTCAAGTTC 2352
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Sbjct 2331 GGGCCCCGGCTTCAGCCTCAAGTTC 2355