Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14570
- Subject:
- XM_011542490.3
- Aligned Length:
- 2420
- Identities:
- 2335
- Gaps:
- 76
Alignment
Query 1 ATGGGTGATGAAAAGGACTCTTGGAAAGTGAAAACTTTAGATGAAATTCTTCAGGAAAAGAAACGAAGGAAGGA 74
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Sbjct 1 ATGGGTGATGAAAAGGACTCTTGGAAAGTGAAAACTTTAGATGAAATTCTTCAGGAAAAGAAACGAAGGAAGGA 74
Query 75 ACAAGAGGAGAAAGCAGAGATAAAACGCTTAAAAAATTCTGATGACCGGGATTCCAAGCGGGATTCCCTTGAGG 148
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Sbjct 75 ACAAGAGGAGAAAGCAGAGATAAAACGCTTAAAAAATTCTGATGACCGGGATTCCAAGCGGGATTCCCTTGAGG 148
Query 149 AGGGGGAGCTGAGAGATCACCGCATGGAGATCACAATAAGGAACTCCCCGTATAGAAGAGAAGACTCTATGGAA 222
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Sbjct 149 AGGGGGAGCTGAGAGATCACCGCATGGAGATCACAATAAGGAACTCCCCGTATAGAAGAGAAGACTCTATGGAA 222
Query 223 GACAGAGGAGAAGAAGATGATTCTTTGGCCATCAAACCACCCCAGCAAATGTCTCGGAAAGAAAAAGCTCATCA 296
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Sbjct 223 GACAGAGGAGAAGAAGATGATTCTTTGGCCATCAAACCACCCCAGCAAATGTCTCGGAAAGAAAAAGCTCATCA 296
Query 297 CAGAAAAGATGAAAAGAGAAAAGAGAAACGTAGGCATCGTAGCCATTCAGCAGAAGGGGGGAAGCATGCTAGAG 370
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Sbjct 297 CAGAAAAGATGAAAAGAGAAAAGAGAAACGTAGGCATCGTAGCCATTCAGCAGAAGGGGGGAAGCATGCTAGAG 370
Query 371 TGAAAGAAAAAGAAAGAGAGCACGAACGTCGGAAACGGCATCGAGAAGAACAGGATAAAGCTCGCCGGGAATGG 444
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Sbjct 371 TGAAAGAAAAAGAAAGAGAGCACGAACGTCGGAAACGGCATCGAGAAGAACAGGATAAAGCTCGCCGGGAATGG 444
Query 445 GAAAGACAGAAGAGAAGGGAGATGGCAAGGGAGCATTCCAGGAGAGAA-------------------------- 492
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Sbjct 445 GAAAGACAGAAGAGAAGGGAGATGGCAAGGGAGCATTCCAGGAGAGAAAGGGGGAATGATGGCGTGTGCCTCTT 518
Query 493 -AGGGACCGCTTGGAGCAGTTAGAAAGGAAGCGGGAGCGGGAGCGCAAGATGCGGGAGCAGCAGAAGGAGCAGC 565
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Sbjct 519 CAGGGACCGCTTGGAGCAGTTAGAAAGGAAGCGGGAGCGGGAGCGCAAGATGCGGGAGCAGCAGAAGGAGCAGC 592
Query 566 GGGAGCAGAAGGAGCGCGAGCGGCGGGCGGAGGAGCGGCGCAAGGAGCGGGAGGCCCGCAGGGAAGTGTCTGCA 639
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Sbjct 593 GGGAGCAGAAGGAGCGCGAGCGGCGGGCAGAGGAGCGGCGCAAGGAGCGGGAGGCCCGCAGGGAAGTGTCTGCA 666
Query 640 CATCACCGAACGATGAGAGAGGACTACAGCGACAAAGTGAAAGCCAGCCACTGGAGTCGCAGCCCGCCTCGGCC 713
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Sbjct 667 CATCACCGAACGATGAGAGAGGACTACAGCGACAAAGTGAAAGCCAGCCACTGGAGTCGCAGCCCGCCTCGGCC 740
Query 714 GCCGCGGGAGCGGTTCGAGTTGGGAGACGGCCGG--------------------------------GAAGCCAG 755
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Sbjct 741 GCCGCGGGAGCGGTTCGAGTTGGGAGACGGCCGGAAGCCAGGTGAGGCCAGGCCGGCGCCTGCGCAGAAGCCAG 814
Query 756 ------TAAAAG-AGAGAAAATGGAAGAAAGGGACCTGCTGTCCGACTTACAGGACATCAGCGACAGCGAGAGG 822
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Sbjct 815 CACAGTTAAAAGAAGAGAAAATGGAAGAAAGGGACCTGCTGTCCGACTTACAGGACATCAGCGACAGCGAGAGG 888
Query 823 AAGACCAGCTCGGCCGAGTCCTCGTCAGCAGAATCAGGCTCAGGTTCTGAGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGA 896
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Sbjct 889 AAGACCAGCTCGGCCGAGTCCTCGTCAGCGGAATCAGGCTCAGGTTCTGAGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGA 962
Query 897 GGAGGAGGAGGAAGGGAGCACCAGTGAAGAATCAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGA 970
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Sbjct 963 GGAGGAGGAGGAAGGGAGCACCAGTGAAGAATCAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGA 1036
Query 971 CCGGCAGCAACTCTGAGGAGGCATCAGAGCAGTCTGCCGAAGAAGTAAGTGAGGAAGAAATGAGTGAAGATGAA 1044
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Sbjct 1037 CCGGCAGCAACTCTGAGGAGGCATCAGAGCAGTCTGCCGAAGAAGTAAGTGAGGAAGAAATGAGTGAAGATGAA 1110
Query 1045 GAACGAGAAAATGAAAACCACCTCTTGGTTGTTCCAGAGTCACGGTTCGACCGAGATTCCGGGGAGAGTGAAGA 1118
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Sbjct 1111 GAACGAGAAAATGAAAACCACCTCTTGGTTGTTCCAGAGTCACGGTTCGACCGAGATTCCGGGGAGAGTGAAGA 1184
Query 1119 AGCAGAGGAAGAAGTGGGTGAGGGAACGCCGCAGAGCAGCGCCCTGACAGAGGGCGACTATGTGCCCGACTCCC 1192
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Sbjct 1185 AGCAGAGGAAGAAGTGGGTGAGGGAACGCCGCAGAGCAGCGCCCTGACAGAGGGCGACTATGTGCCCGACTCCC 1258
Query 1193 CTGCCCTGTCGCCCATCGAGCTCAAGCAGGAGCTGCCCAAGTACCTGCCGGCCCTGCAGGGCTGCCGGAGCGTC 1266
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Sbjct 1259 CTGCCCTGTCGCCCATCGAGCTCAAGCAGGAGCTGCCCAAGTACCTGCCGGCCCTGCAGGGCTGCCGGAGCGTC 1332
Query 1267 GAGGAGTTCCAGTGCCTGAACAGGATCGAGGAGGGCACCTATGGAGTGGTCTACAGAGCAAAAGACAAGAAAAC 1340
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Sbjct 1333 GAGGAGTTCCAGTGCCTGAACAGGATCGAGGAGGGCACCTATGGAGTGGTCTACAGAGCAAAAGACAAGAAAAC 1406
Query 1341 AGATGAAATTGTGGCTCTAAAGCGGCTGAAGATGGAGAAGGAGAAGGAGGGCTTCCCGATCACGTCGCTGAGGG 1414
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Sbjct 1407 AGATGAAATTGTGGCTCTAAAGCGGCTGAAGATGGAGAAGGAGAAGGAGGGCTTCCCGATCACGTCGCTGAGGG 1480
Query 1415 AGATCAACACCATCCTCAAGGCCCAGCATCCCAACATCGTCACCGTTAGAGAGATTGTGGTGGGCAGCAACATG 1488
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Sbjct 1481 AGATCAACACCATCCTCAAGGCCCAGCATCCCAACATCGTCACCGTTAGAGAGATTGTGGTGGGCAGCAACATG 1554
Query 1489 GACAAGATCTACATCGTGATGAACTATGTGGAGCACGACCTCAAGAGCCTGATGGAGACCAGAAAACAGCCCCT 1562
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Sbjct 1555 GACAAGATCTACATCGTGATGAACTATGTGGAGCACGACCTCAAGAGCCTGATGGAGACCATGAAACAG-CCCT 1627
Query 1563 TCCTGCCAAGGGGAGGTGAAGACCCCTGAGAATCCAGGTTGGTGCGTGGGGGTGAAACACCTCCACGACAAACT 1636
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Sbjct 1628 TCCTGCC-AGGGGAGGTGAAGA-CCCTGATGATCCA-GCTGCTGCGT-GGGGTGAAACACCTGCACGAC-AACT 1696
Query 1637 -GATCCCTGCACCGTGACCTCAAGACGTCC-ACCTGGCTGCTGAGCCACGCCGGCATCCTCAAGGTGGGTGACT 1708
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Sbjct 1697 GGAT-CCTGCACCGTGACCTCAAGACGTCCAACCT-GCTGCTGAGCCACGCCGGCATCCTCAAGGTGGGTGACT 1768
Query 1709 TCGGGCTGGCGCGGGAGTACGGATCCCCTCTGAAGGCCTACACCCCGGTCGTGGTGACCCTGTGGTACCGCGCC 1782
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Sbjct 1769 TCGGGCTGGCGCGGGAGTACGGATCCCCTCTGAAGGCCTACACCCCGGTCGTGGTGACCCTGTGGTACCGCGCC 1842
Query 1783 CCAGAGCTGCTGCTTGGTGCCAAGGAATACTCCACGGCCGTGGACATGTGGTCAGTGGGTTGCATCTTCGGGGA 1856
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Sbjct 1843 CCAGAGCTGCTGCTTGGTGCCAAGGAATACTCCACGGCCGTGGACATGTGGTCAGTGGGTTGCATCTTCGGGGA 1916
Query 1857 GCTGCTGACTCAGAAGCCTCTGTTCCCCGGGAAGTCAGAAATCGATCAGATCAACAAGGTGTTCAAGGATCTGG 1930
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Sbjct 1917 GCTGCTGACTCAGAAGCCTCTGTTCCCCGGGAAGTCAGAAATCGATCAGATCAACAAGGTGTTCAAGGATCTGG 1990
Query 1931 GGACCCCTAGTGAGAAAATCTGGCCCGGCTACAGCGAGCTCCCAGCAGTCAAGAAGATGACCTTCAGCGAGCAC 2004
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Sbjct 1991 GGACCCCTAGTGAGAAAATCTGGCCCGGCTACAGCGAGCTCCCAGCAGTCAAGAAGATGACCTTCAGCGAGCAC 2064
Query 2005 CCCTACAACAACCTCCGCAAGCGCTTCGGGGCTCTGCTCTCAGACCAGGGCTTCGACCTCATGAACAAGTTCCT 2078
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Sbjct 2065 CCCTACAACAACCTCCGCAAGCGCTTCGGGGCTCTGCTCTCAGACCAGGGCTTCGACCTCATGAACAAGTTCCT 2138
Query 2079 GACCTACTTCCCCGGGAGGAGGATCAGCGCTGAGGACGGCCTCAAGCATGAGTATTTCCGCGAGACCCCCCTCC 2152
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Sbjct 2139 GACCTACTTCCCCGGGAGGAGGATCAGCGCTGAGGACGGCCTCAAGCATGAGTATTTCCGCGAGACCCCCCTCC 2212
Query 2153 CCATCGACCCCTCCATGTTCCCCACGTGGCCCGCCAAGAGCGAGCAGCAGCGTGTGAAGCGGGGCACCAGCCCG 2226
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Sbjct 2213 CCATCGACCCCTCCATGTTCCCCACGTGGCCCGCCAAGAGCGAGCAGCAGCGTGTGAAGCGGGGCACCAGCCCG 2286
Query 2227 AGGCCCCCTGAGGGAGGCCTGGGCTACAGCCAGCTGGGTGACGACGACCTGAAGGAGACGGGCTTCCACCTTAC 2300
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Sbjct 2287 AGGCCCCCTGAGGGAGGCCTGGGCTACAGCCAGCTGGGTGACGACGACCTGAAGGAGACGGGCTTCCACCTTAC 2360
Query 2301 CACCACGAACCAGGGGGCCTCTGCCGCGGGCCCCGGCTTCAGCCTCAAGTTC 2352
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Sbjct 2361 CACCACGAACCAGGGGGCCTCTGCCGCGGGCCCCGGCTTCAGCCTCAAGTTC 2412
