Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14570
• Subject: XM_017002925.2
• Aligned Length: 2382
• Identities: 2334
• Gaps: 39

Alignment

Query    1  ATGGGTGATGAAAAGGACTCTTGGAAAGTGAAAACTTTAGATGAAATTCTTCAGGAAAAGAAACGAAGGAAGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGTGATGAAAAGGACTCTTGGAAAGTGAAAACTTTAGATGAAATTCTTCAGGAAAAGAAACGAAGGAAGGA  74

Query   75  ACAAGAGGAGAAAGCAGAGATAAAACGCTTAAAAAATTCTGATGACCGGGATTCCAAGCGGGATTCCCTTGAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACAAGAGGAGAAAGCAGAGATAAAACGCTTAAAAAATTCTGATGACCGGGATTCCAAGCGGGATTCCCTTGAGG  148

Query  149  AGGGGGAGCTGAGAGATCACCGCATGGAGATCACAATAAGGAACTCCCCGTATAGAAGAGAAGACTCTATGGAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGGGGAGCTGAGAGATCACCGCATGGAGATCACAATAAGGAACTCCCCGTATAGAAGAGAAGACTCTATGGAA  222

Query  223  GACAGAGGAGAAGAAGATGATTCTTTGGCCATCAAACCACCCCAGCAAATGTCTCGGAAAGAAAAAGCTCATCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACAGAGGAGAAGAAGATGATTCTTTGGCCATCAAACCACCCCAGCAAATGTCTCGGAAAGAAAAAGCTCATCA  296

Query  297  CAGAAAAGATGAAAAGAGAAAAGAGAAACGTAGGCATCGTAGCCATTCAGCAGAAGGGGGGAAGCATGCTAGAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAGAAAAGATGAAAAGAGAAAAGAGAAACGTAGGCATCGTAGCCATTCAGCAGAAGGGGGGAAGCATGCTAGAG  370

Query  371  TGAAAGAAAAAGAAAGAGAGCACGAACGTCGGAAACGGCATCGAGAAGAACAGGATAAAGCTCGCCGGGAATGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGAAAGAAAAAGAAAGAGAGCACGAACGTCGGAAACGGCATCGAGAAGAACAGGATAAAGCTCGCCGGGAATGG  444

Query  445  GAAAGACAGAAGAGAAGGGAGATGGCAAGGGAGCATTCCAGGAGAGAA--------------------------  492
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                          
Sbjct  445  GAAAGACAGAAGAGAAGGGAGATGGCAAGGGAGCATTCCAGGAGAGAAAGGGGGAATGATGGCGTGTGCCTCTT  518

Query  493  -AGGGACCGCTTGGAGCAGTTAGAAAGGAAGCGGGAGCGGGAGCGCAAGATGCGGGAGCAGCAGAAGGAGCAGC  565
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAGGGACCGCTTGGAGCAGTTAGAAAGGAAGCGGGAGCGGGAGCGCAAGATGCGGGAGCAGCAGAAGGAGCAGC  592

Query  566  GGGAGCAGAAGGAGCGCGAGCGGCGGGCGGAGGAGCGGCGCAAGGAGCGGGAGGCCCGCAGGGAAGTGTCTGCA  639
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGGAGCAGAAGGAGCGCGAGCGGCGGGCAGAGGAGCGGCGCAAGGAGCGGGAGGCCCGCAGGGAAGTGTCTGCA  666

Query  640  CATCACCGAACGATGAGAGAGGACTACAGCGACAAAGTGAAAGCCAGCCACTGGAGTCGCAGCCCGCCTCGGCC  713
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CATCACCGAACGATGAGAGAGGACTACAGCGACAAAGTGAAAGCCAGCCACTGGAGTCGCAGCCCGCCTCGGCC  740

Query  714  GCCGCGGGAGCGGTTCGAGTTGGGAGACGGCCGGGAAGCCAGTAAAAG-AGAGAAAATGGAAGAAAGGGACCTG  786
            |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCCGCGGGAGCGGTTCGAGTTGGGAGACGGCC-GGAAGCCAGTAAAAGAAGAGAAAATGGAAGAAAGGGACCTG  813

Query  787  CTGTCCGACTTACAGGACATCAGCGACAGCGAGAGGAAGACCAGCTCGGCCGAGTCCTCGTCAGCAGAATCAGG  860
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  814  CTGTCCGACTTACAGGACATCAGCGACAGCGAGAGGAAGACCAGCTCGGCCGAGTCCTCGTCAGCGGAATCAGG  887

Query  861  CTCAGGTTCTGAGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGGGAGCACCAGTGAAGAATCAGAGG  934
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  CTCAGGTTCTGAGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGGGAGCACCAGTGAAGAATCAGAGG  961

Query  935  AGGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGACCGGCAGCAACTCTGAGGAGGCATCAGAGCAGTCTGCC  1008
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  AGGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGACCGGCAGCAACTCTGAGGAGGCATCAGAGCAGTCTGCC  1035

Query 1009  GAAGAAGTAAGTGAGGAAGAAATGAGTGAAGATGAAGAACGAGAAAATGAAAACCACCTCTTGGTTGTTCCAGA  1082
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  GAAGAAGTAAGTGAGGAAGAAATGAGTGAAGATGAAGAACGAGAAAATGAAAACCACCTCTTGGTTGTTCCAGA  1109

Query 1083  GTCACGGTTCGACCGAGATTCCGGGGAGAGTGAAGAAGCAGAGGAAGAAGTGGGTGAGGGAACGCCGCAGAGCA  1156
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  GTCACGGTTCGACCGAGATTCCGGGGAGAGTGAAGAAGCAGAGGAAGAAGTGGGTGAGGGAACGCCGCAGAGCA  1183

Query 1157  GCGCCCTGACAGAGGGCGACTATGTGCCCGACTCCCCTGCCCTGTCGCCCATCGAGCTCAAGCAGGAGCTGCCC  1230
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  GCGCCCTGACAGAGGGCGACTATGTGCCCGACTCCCCTGCCCTGTCGCCCATCGAGCTCAAGCAGGAGCTGCCC  1257

Query 1231  AAGTACCTGCCGGCCCTGCAGGGCTGCCGGAGCGTCGAGGAGTTCCAGTGCCTGAACAGGATCGAGGAGGGCAC  1304
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258  AAGTACCTGCCGGCCCTGCAGGGCTGCCGGAGCGTCGAGGAGTTCCAGTGCCTGAACAGGATCGAGGAGGGCAC  1331

Query 1305  CTATGGAGTGGTCTACAGAGCAAAAGACAAGAAAACAGATGAAATTGTGGCTCTAAAGCGGCTGAAGATGGAGA  1378
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332  CTATGGAGTGGTCTACAGAGCAAAAGACAAGAAAACAGATGAAATTGTGGCTCTAAAGCGGCTGAAGATGGAGA  1405

Query 1379  AGGAGAAGGAGGGCTTCCCGATCACGTCGCTGAGGGAGATCAACACCATCCTCAAGGCCCAGCATCCCAACATC  1452
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406  AGGAGAAGGAGGGCTTCCCGATCACGTCGCTGAGGGAGATCAACACCATCCTCAAGGCCCAGCATCCCAACATC  1479

Query 1453  GTCACCGTTAGAGAGATTGTGGTGGGCAGCAACATGGACAAGATCTACATCGTGATGAACTATGTGGAGCACGA  1526
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480  GTCACCGTTAGAGAGATTGTGGTGGGCAGCAACATGGACAAGATCTACATCGTGATGAACTATGTGGAGCACGA  1553

Query 1527  CCTCAAGAGCCTGATGGAGACCAGAAAACAGCCCCTTCCTGCCAAGGGGAGGTGAAGACCCCTGAGAATCCAGG  1600
            |||||||||||||||||||||||..|||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||..||||| |
Sbjct 1554  CCTCAAGAGCCTGATGGAGACCATGAAACAG-CCCTTCCTGCC-AGGGGAGGTGAAGA-CCCTGATGATCCA-G  1623

Query 1601  TTGGTGCGTGGGGGTGAAACACCTCCACGACAAACT-GATCCCTGCACCGTGACCTCAAGACGTCC-ACCTGGC  1672
            .||.||||| ||||||||||||||.|||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||
Sbjct 1624  CTGCTGCGT-GGGGTGAAACACCTGCACGAC-AACTGGAT-CCTGCACCGTGACCTCAAGACGTCCAACCT-GC  1693

Query 1673  TGCTGAGCCACGCCGGCATCCTCAAGGTGGGTGACTTCGGGCTGGCGCGGGAGTACGGATCCCCTCTGAAGGCC  1746
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1694  TGCTGAGCCACGCCGGCATCCTCAAGGTGGGTGACTTCGGGCTGGCGCGGGAGTACGGATCCCCTCTGAAGGCC  1767

Query 1747  TACACCCCGGTCGTGGTGACCCTGTGGTACCGCGCCCCAGAGCTGCTGCTTGGTGCCAAGGAATACTCCACGGC  1820
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1768  TACACCCCGGTCGTGGTGACCCTGTGGTACCGCGCCCCAGAGCTGCTGCTTGGTGCCAAGGAATACTCCACGGC  1841

Query 1821  CGTGGACATGTGGTCAGTGGGTTGCATCTTCGGGGAGCTGCTGACTCAGAAGCCTCTGTTCCCCGGGAAGTCAG  1894
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1842  CGTGGACATGTGGTCAGTGGGTTGCATCTTCGGGGAGCTGCTGACTCAGAAGCCTCTGTTCCCCGGGAAGTCAG  1915

Query 1895  AAATCGATCAGATCAACAAGGTGTTCAAGGATCTGGGGACCCCTAGTGAGAAAATCTGGCCCGGCTACAGCGAG  1968
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1916  AAATCGATCAGATCAACAAGGTGTTCAAGGATCTGGGGACCCCTAGTGAGAAAATCTGGCCCGGCTACAGCGAG  1989

Query 1969  CTCCCAGCAGTCAAGAAGATGACCTTCAGCGAGCACCCCTACAACAACCTCCGCAAGCGCTTCGGGGCTCTGCT  2042
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1990  CTCCCAGCAGTCAAGAAGATGACCTTCAGCGAGCACCCCTACAACAACCTCCGCAAGCGCTTCGGGGCTCTGCT  2063

Query 2043  CTCAGACCAGGGCTTCGACCTCATGAACAAGTTCCTGACCTACTTCCCCGGGAGGAGGATCAGCGCTGAGGACG  2116
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2064  CTCAGACCAGGGCTTCGACCTCATGAACAAGTTCCTGACCTACTTCCCCGGGAGGAGGATCAGCGCTGAGGACG  2137

Query 2117  GCCTCAAGCATGAGTATTTCCGCGAGACCCCCCTCCCCATCGACCCCTCCATGTTCCCCACGTGGCCCGCCAAG  2190
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2138  GCCTCAAGCATGAGTATTTCCGCGAGACCCCCCTCCCCATCGACCCCTCCATGTTCCCCACGTGGCCCGCCAAG  2211

Query 2191  AGCGAGCAGCAGCGTGTGAAGCGGGGCACCAGCCCGAGGCCCCCTGAGGGAGGCCTGGGCTACAGCCAGCTGGG  2264
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2212  AGCGAGCAGCAGCGTGTGAAGCGGGGCACCAGCCCGAGGCCCCCTGAGGGAGGCCTGGGCTACAGCCAGCTGGG  2285

Query 2265  TGACGACGACCTGAAGGAGACGGGCTTCCACCTTACCACCACGAACCAGGGGGCCTCTGCCGCGGGCCCCGGCT  2338
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2286  TGACGACGACCTGAAGGAGACGGGCTTCCACCTTACCACCACGAACCAGGGGGCCTCTGCCGCGGGCCCCGGCT  2359

Query 2339  TCAGCCTCAAGTTC  2352
            ||||||||||||||
Sbjct 2360  TCAGCCTCAAGTTC  2373