Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14570
• Subject: XM_017002927.2
• Aligned Length: 2423
• Identities: 2229
• Gaps: 184

Alignment

Query    1  ATGGGTGATGAAAAGGACTCTTGGAAAGTGAAAACTTTAGATGAAATTCTTCAGGAAAAGAAACGAAGGAAGGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACAAGAGGAGAAAGCAGAGATAAAA---CGCTTAAAAAATTCTGATGACCGGGATTCCAAGCGGGATTCCCTTG  145
                                    |   |||       |.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------ATGTCGC-------AGTCTGATGACCGGGATTCCAAGCGGGATTCCCTTG  43

Query  146  AGGAGGGGGAGCTGAGAGATCACCGCATGGAGATCACAATAAGGAACTCCCCGTATAGAAGAGAAGACTCTATG  219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   44  AGGAGGGGGAGCTGAGAGATCACCGCATGGAGATCACAATAAGGAACTCCCCGTATAGAAGAGAAGACTCTATG  117

Query  220  GAAGACAGAGGAGAAGAAGATGATTCTTTGGCCATCAAACCACCCCAGCAAATGTCTCGGAAAGAAAAAGCTCA  293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  118  GAAGACAGAGGAGAAGAAGATGATTCTTTGGCCATCAAACCACCCCAGCAAATGTCTCGGAAAGAAAAAGCTCA  191

Query  294  TCACAGAAAAGATGAAAAGAGAAAAGAGAAACGTAGGCATCGTAGCCATTCAGCAGAAGGGGGGAAGCATGCTA  367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  192  TCACAGAAAAGATGAAAAGAGAAAAGAGAAACGTAGGCATCGTAGCCATTCAGCAGAAGGGGGGAAGCATGCTA  265

Query  368  GAGTGAAAGAAAAAGAAAGAGAGCACGAACGTCGGAAACGGCATCGAGAAGAACAGGATAAAGCTCGCCGGGAA  441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  266  GAGTGAAAGAAAAAGAAAGAGAGCACGAACGTCGGAAACGGCATCGAGAAGAACAGGATAAAGCTCGCCGGGAA  339

Query  442  TGGGAAAGACAGAAGAGAAGGGAGATGGCAAGGGAGCATTCCAGGAGAGAA-----------------------  492
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
Sbjct  340  TGGGAAAGACAGAAGAGAAGGGAGATGGCAAGGGAGCATTCCAGGAGAGAAAGGGGGAATGATGGCGTGTGCCT  413

Query  493  ----AGGGACCGCTTGGAGCAGTTAGAAAGGAAGCGGGAGCGGGAGCGCAAGATGCGGGAGCAGCAGAAGGAGC  562
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  414  CTTCAGGGACCGCTTGGAGCAGTTAGAAAGGAAGCGGGAGCGGGAGCGCAAGATGCGGGAGCAGCAGAAGGAGC  487

Query  563  AGCGGGAGCAGAAGGAGCGCGAGCGGCGGGCGGAGGAGCGGCGCAAGGAGCGGGAGGCCCGCAGGGAAGTGTCT  636
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  488  AGCGGGAGCAGAAGGAGCGCGAGCGGCGGGCAGAGGAGCGGCGCAAGGAGCGGGAGGCCCGCAGGGAAGTGTCT  561

Query  637  GCACATCACCGAACGATGAGAGAGGACTACAGCGACAAAGTGAAAGCCAGCCACTGGAGTCGCAGCCCGCCTCG  710
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  562  GCACATCACCGAACGATGAGAGAGGACTACAGCGACAAAGTGAAAGCCAGCCACTGGAGTCGCAGCCCGCCTCG  635

Query  711  GCCGCCGCGGGAGCGGTTCGAGTTGGGAGACGGCCGG--------------------------------GAAGC  752
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                |||||
Sbjct  636  GCCGCCGCGGGAGCGGTTCGAGTTGGGAGACGGCCGGAAGCCAGGTGAGGCCAGGCCGGCGCCTGCGCAGAAGC  709

Query  753  CAG------TAAAAG-AGAGAAAATGGAAGAAAGGGACCTGCTGTCCGACTTACAGGACATCAGCGACAGCGAG  819
            |||      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  710  CAGCACAGTTAAAAGAAGAGAAAATGGAAGAAAGGGACCTGCTGTCCGACTTACAGGACATCAGCGACAGCGAG  783

Query  820  AGGAAGACCAGCTCGGCCGAGTCCTCGTCAGCAGAATCAGGCTCAGGTTCTGAGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGA  893
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  784  AGGAAGACCAGCTCGGCCGAGTCCTCGTCAGCGGAATCAGGCTCAGGTTCTGAGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGA  857

Query  894  AGAGGAGGAGGAGGAAGGGAGCACCAGTGAAGAATCAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGGAGGAGG  967
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  858  AGAGGAGGAGGAGGAAGGGAGCACCAGTGAAGAATCAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGGAGGAGG  931

Query  968  AGACCGGCAGCAACTCTGAGGAGGCATCAGAGCAGTCTGCCGAAGAAGTAAGTGAGGAAGAAATGAGTGAAGAT  1041
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  932  AGACCGGCAGCAACTCTGAGGAGGCATCAGAGCAGTCTGCCGAAGAAGTAAGTGAGGAAGAAATGAGTGAAGAT  1005

Query 1042  GAAGAACGAGAAAATGAAAACCACCTCTTGGTTGTTCCAGAGTCACGGTTCGACCGAGATTCCGGGGAGAGTGA  1115
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1006  GAAGAACGAGAAAATGAAAACCACCTCTTGGTTGTTCCAGAGTCACGGTTCGACCGAGATTCCGGGGAGAGTGA  1079

Query 1116  AGAAGCAGAGGAAGAAGTGGGTGAGGGAACGCCGCAGAGCAGCGCCCTGACAGAGGGCGACTATGTGCCCGACT  1189
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080  AGAAGCAGAGGAAGAAGTGGGTGAGGGAACGCCGCAGAGCAGCGCCCTGACAGAGGGCGACTATGTGCCCGACT  1153

Query 1190  CCCCTGCCCTGTCGCCCATCGAGCTCAAGCAGGAGCTGCCCAAGTACCTGCCGGCCCTGCAGGGCTGCCGGAGC  1263
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1154  CCCCTGCCCTGTCGCCCATCGAGCTCAAGCAGGAGCTGCCCAAGTACCTGCCGGCCCTGCAGGGCTGCCGGAGC  1227

Query 1264  GTCGAGGAGTTCCAGTGCCTGAACAGGATCGAGGAGGGCACCTATGGAGTGGTCTACAGAGCAAAAGACAAGAA  1337
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1228  GTCGAGGAGTTCCAGTGCCTGAACAGGATCGAGGAGGGCACCTATGGAGTGGTCTACAGAGCAAAAGACAAGAA  1301

Query 1338  AACAGATGAAATTGTGGCTCTAAAGCGGCTGAAGATGGAGAAGGAGAAGGAGGGCTTCCCGATCACGTCGCTGA  1411
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1302  AACAGATGAAATTGTGGCTCTAAAGCGGCTGAAGATGGAGAAGGAGAAGGAGGGCTTCCCGATCACGTCGCTGA  1375

Query 1412  GGGAGATCAACACCATCCTCAAGGCCCAGCATCCCAACATCGTCACCGTTAGAGAGATTGTGGTGGGCAGCAAC  1485
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1376  GGGAGATCAACACCATCCTCAAGGCCCAGCATCCCAACATCGTCACCGTTAGAGAGATTGTGGTGGGCAGCAAC  1449

Query 1486  ATGGACAAGATCTACATCGTGATGAACTATGTGGAGCACGACCTCAAGAGCCTGATGGAGACCAGAAAACAGCC  1559
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||| |
Sbjct 1450  ATGGACAAGATCTACATCGTGATGAACTATGTGGAGCACGACCTCAAGAGCCTGATGGAGACCATGAAACAG-C  1522

Query 1560  CCTTCCTGCCAAGGGGAGGTGAAGACCCCTGAGAATCCAGGTTGGTGCGTGGGGGTGAAACACCTCCACGACAA  1633
            |||||||||| |||||||||||||| ||||||..||||| |.||.||||| ||||||||||||||.|||||| |
Sbjct 1523  CCTTCCTGCC-AGGGGAGGTGAAGA-CCCTGATGATCCA-GCTGCTGCGT-GGGGTGAAACACCTGCACGAC-A  1591

Query 1634  ACT-GATCCCTGCACCGTGACCTCAAGACGTCC-ACCTGGCTGCTGAGCCACGCCGGCATCCTCAAGGTGGGTG  1705
            ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1592  ACTGGAT-CCTGCACCGTGACCTCAAGACGTCCAACCT-GCTGCTGAGCCACGCCGGCATCCTCAAGGTGGGTG  1663

Query 1706  ACTTCGGGCTGGCGCGGGAGTACGGATCCCCTCTGAAGGCCTACACCCCGGTCGTGGTGACCCTGTGGTACCGC  1779
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1664  ACTTCGGGCTGGCGCGGGAGTACGGATCCCCTCTGAAGGCCTACACCCCGGTCGTGGTGACCCTGTGGTACCGC  1737

Query 1780  GCCCCAGAGCTGCTGCTTGGTGCCAAGGAATACTCCACGGCCGTGGACATGTGGTCAGTGGGTTGCATCTTCGG  1853
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1738  GCCCCAGAGCTGCTGCTTGGTGCCAAGGAATACTCCACGGCCGTGGACATGTGGTCAGTGGGTTGCATCTTCGG  1811

Query 1854  GGAGCTGCTGACTCAGAAGCCTCTGTTCCCCGGGAAGTCAGAAATCGATCAGATCAACAAGGTGTTCAAGGATC  1927
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1812  GGAGCTGCTGACTCAGAAGCCTCTGTTCCCCGGGAAGTCAGAAATCGATCAGATCAACAAGGTGTTCAAGGATC  1885

Query 1928  TGGGGACCCCTAGTGAGAAAATCTGGCCCGGCTACAGCGAGCTCCCAGCAGTCAAGAAGATGACCTTCAGCGAG  2001
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1886  TGGGGACCCCTAGTGAGAAAATCTGGCCCGGCTACAGCGAGCTCCCAGCAGTCAAGAAGATGACCTTCAGCGAG  1959

Query 2002  CACCCCTACAACAACCTCCGCAAGCGCTTCGGGGCTCTGCTCTCAGACCAGGGCTTCGACCTCATGAACAAGTT  2075
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1960  CACCCCTACAACAACCTCCGCAAGCGCTTCGGGGCTCTGCTCTCAGACCAGGGCTTCGACCTCATGAACAAGTT  2033

Query 2076  CCTGACCTACTTCCCCGGGAGGAGGATCAGCGCTGAGGACGGCCTCAAGCATGAGTATTTCCGCGAGACCCCCC  2149
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2034  CCTGACCTACTTCCCCGGGAGGAGGATCAGCGCTGAGGACGGCCTCAAGCATGAGTATTTCCGCGAGACCCCCC  2107

Query 2150  TCCCCATCGACCCCTCCATGTTCCCCACGTGGCCCGCCAAGAGCGAGCAGCAGCGTGTGAAGCGGGGCACCAGC  2223
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2108  TCCCCATCGACCCCTCCATGTTCCCCACGTGGCCCGCCAAGAGCGAGCAGCAGCGTGTGAAGCGGGGCACCAGC  2181

Query 2224  CCGAGGCCCCCTGAGGGAGGCCTGGGCTACAGCCAGCTGGGTGACGACGACCTGAAGGAGACGGGCTTCCACCT  2297
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2182  CCGAGGCCCCCTGAGGGAGGCCTGGGCTACAGCCAGCTGGGTGACGACGACCTGAAGGAGACGGGCTTCCACCT  2255

Query 2298  TACCACCACGAACCAGGGGGCCTCTGCCGCGGGCCCCGGCTTCAGCCTCAAGTTC  2352
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2256  TACCACCACGAACCAGGGGGCCTCTGCCGCGGGCCCCGGCTTCAGCCTCAAGTTC  2310