Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14607
- Subject:
- NM_001350705.1
- Aligned Length:
- 2415
- Identities:
- 2368
- Gaps:
- 36
Alignment
Query 1 ATGACAAACCAGGAAAAATGGGCCCACCTCAGCCCTTCGGAATTTTCCCAACTTCAGAAATATGCTGAGTATTC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGACAAACCAGGAAAAATGGGCCCACCTCAGCCCTTCGGAATTTTCCCAACTTCAGAAATATGCTGAGTATTC 74
Query 75 TACAAAGAAATTAAAGGATGTTCTTGAAGAATTCCATGGTAATGGTGTGCTTGCAAAGTATAATCCTGAAGGG- 147
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TACAAAGAAATTAAAGGATGTTCTTGAAGAATTCCATGGTAATGGTGTGCTTGCAAAGTATAATCCTGAAGGGA 148
Query 148 --------------------ACAATAGATTTTGAAGGTTTCAAACTATTCATGAAGACATTCCTGGAAGCCGAG 201
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AACAAGACATTCTTAACCAAACAATAGATTTTGAAGGTTTCAAACTATTCATGAAGACATTCCTGGAAGCCGAG 222
Query 202 CTTCCTGATGATTTCACTGCACACCTTTTCATGTCATTTAGCAACAAGTTTCCTCATTCTAGTCCAATGGTAAA 275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTTCCTGATGATTTCACTGCACACCTTTTCATGTCATTTAGCAACAAGTTTCCTCATTCTAGTCCAATGGTAAA 296
Query 276 AAGTAAGCCTGCTCTCCTATCAGGCGGTCTGAGAATGAATAAAGGTGCCATCACCCCTCCCCGAACTACTTCTC 349
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 297 AAGTAAGCCTGCTCTCCTATCAGGCGGTCTGAGAATGAATAAAGGTGCCATCACCCCTCCCCGGACTACTTCTC 370
Query 350 CTGCAAATACGTGTTCCCCAGAAGTAATCCATCTGAAGGACATTGTCTGTTACCTGTCTCTGCTTGAAAGAGGA 423
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTGCAAATACGTGTTCCCCAGAAGTAATCCATCTGAAGGACATTGTCTGTTACCTGTCTCTGCTTGAAAGAGGA 444
Query 424 AGACCTGAGGATAAGCTTGAGTTTATGTTTCGCCTTTATGACACGGATGGGAATGGCTTCCTGGACAGCTCGGA 497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGACCTGAGGATAAGCTTGAGTTTATGTTTCGCCTTTATGACACGGATGGGAATGGCTTCCTGGACAGCTCGGA 518
Query 498 GCTAGAAAATATCATCAGTCAGATGATGCATGTTGCAGAATACCTTGAGTGGGATGTCACTGAACTTAATCCAA 571
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCTAGAAAATATCATCAGTCAGATGATGCATGTTGCAGAATACCTTGAGTGGGATGTCACTGAACTTAATCCAA 592
Query 572 TCCTCCATGAAATGATGGAAGAAATTGACTATGATCATGATGGAACCGTGTCTCTGGAGGAATGGATTCAAGGA 645
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCCTCCATGAAATGATGGAAGAAATTGACTATGATCATGATGGAACCGTGTCTCTGGAGGAATGGATTCAAGGA 666
Query 646 GGAATGACAACGATTCCACTTCTTGTGCTCCTGGGCTTAGAAAATAACGTGAAAGGATGATGGACAGCACGTGT 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGAATGACAACGATTCCACTTCTTGTGCTCCTGGGCTTAGAAAATAACGTG-AAGGATGATGGACAGCACGTGT 739
Query 720 GGCGACTG-AGCACTTTAACAAACCTG-CTA-TGCA--CTTTG-CTG-ACATGCTGATT-GCGTGGGGAAGCAG 785
|||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 740 GGCGACTGAAGCACTTTAACAAACCTGCCTATTGCAACCTTTGCCTGAACATGCTGATTGGCGTGGGGAAGCAG 813
Query 786 G--CTCTGCTGTTCCTTCTGC-AGTACACAGTCCATGAGCGCTGTGTGGCTCGAGCACCTCCCTCTTGCATCAA 856
| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 GGCCTCTGCTGTTCCTTCTGCAAGTACACAGTCCATGAGCGCTGTGTGGCTCGAGCACCTCCCTCTTGCATCAA 887
Query 857 GACCTATGTGAAGTCCAAAAGGAACACTGATGTCATGCACCATTACTGGGTTGAAGGTAACTGCCCAACCAAGT 930
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 GACCTATGTGAAGTCCAAAAGGAACACTGATGTCATGCACCATTACTGGGTTGAAGGTAACTGCCCAACCAAGT 961
Query 931 GTGATAAGTGCCACAAAACTGTTAAATGTTACCAGGGCCTGACAGGACTGCATTGTGTTTGGTGTCAGATCACA 1004
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 GTGATAAGTGCCACAAAACTGTTAAATGTTACCAGGGCCTGACAGGACTGCATTGTGTTTGGTGTCAGATCACA 1035
Query 1005 CTGCATAATAAATGTGCTTCTCATCTAAAACCTGAATGTGACTGTGGACCTTTGAAGGACCATATTTTACCACC 1078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 CTGCATAATAAATGTGCTTCTCATCTAAAACCTGAATGTGACTGTGGACCTTTGAAGGACCATATTTTACCACC 1109
Query 1079 CACAACAATCTGTCCAGTGGTACTGCAGACTCTGCCCACTTCAGGAGTTTCAGTTCCTGAGGAAAGACAATCAA 1152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 CACAACAATCTGTCCAGTGGTACTGCAGACTCTGCCCACTTCAGGAGTTTCAGTTCCTGAGGAAAGACAATCAA 1183
Query 1153 CAGTGAAAAAGGAAAAGAGTGGTTCCCAGCAGCCAAACAAAGTGATTGACAAGAATAAAATGCAAAGAGCCAAC 1226
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 CAGTGAAAAAGGAAAAGAGTGGTTCCCAGCAGCCAAACAAAGTGATTGACAAGAATAAAATGCAAAGAGCCAAC 1257
Query 1227 TCTGTTACTGTAGATGGACAAGGCCTGCAGGTCACTCCTGTGCCTGGTACTCACCCACTTTTAGTTTTTGTGAA 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 TCTGTTACTGTAGATGGACAAGGCCTGCAGGTCACTCCTGTGCCTGGTACTCACCCACTTTTAGTTTTTGTGAA 1331
Query 1301 CCCCAAAAGTGGTGGAAAACAAGGAGAACGAATTTACAGAAAATTCCAGTATCTATTAAATCCTCGTCAGGTTT 1374
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332 CCCCAAAAGTGGTGGAAAACAAGGAGAACGAATTTACAGAAAATTCCAGTATCTATTAAATCCTCGTCAGGTTT 1405
Query 1375 ACAGTCTTTCTGGAAATGGACCAATGCCAGGGTTAAACTTTTTCCGTGATGTTCCTGACTTCAGAGTGTTAGCC 1448
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 ACAGTCTTTCTGGAAATGGACCAATGCCAGGGTTAAACTTTTTCCGTGATGTTCCTGACTTCAGAGTGTTAGCC 1479
Query 1449 TGTGGTGGAGATGGAACCGTGGGCTGGGTTTTGGATTGCATAGAAAAGGCCAATGTAGGCAAGCATCCTCCAGT 1522
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480 TGTGGTGGAGATGGAACCGTGGGCTGGGTTTTGGATTGCATAGAAAAGGCCAATGTAGGCAAGCATCCTCCAGT 1553
Query 1523 TGCGATTCTGCCTCTTGGGACTGGCAATGATCTAGCAAGATGCCTGCGATGGGGAGGAGGTTACGAAGGTGAGG 1596
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1554 TGCGATTCTGCCTCTTGGGACTGGCAATGATCTAGCAAGATGCCTGCGATGGGGAGGAGGTTACGAAGGTGAGA 1627
Query 1597 ATCTGATGAAAATTTTAAAAGACATTGNAAACAGCACAGAAATCATG-TGGACAGGTGGAAGTTTGAAAGTCAT 1669
||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1628 ATCTGATGAAAATTCTAAAAGACATTGAAAACAGCACAGAAATCATGTTGGACAGGTGGAAGTTTG-AAGTCAT 1700
Query 1670 ACNTAATGACAAGNATGAGAAAGGAGACCCAGTGCCTANCAGTATCATCAATAATTACTTTTCCATTGGCGTGG 1743
||.|||||||||..|||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1701 ACCTAATGACAAAGATGAGAAAGGAGACCCAGTGCCTTACAGTATCATCAATAATTACTTTTCCATTGGCGTGG 1774
Query 1744 ATGCCTCCATGNCACACAGATTCCACATCATGAGAGAAAAACACCCNAGAGAAATTCAACAGTAGAATGAAGAA 1817
||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1775 ATGCCTCCATTGCACACAGATTCCACATCATGAGAGAAAAACACCC-AGAGAAATTCAACAGTAGAATGAAGAA 1847
Query 1818 CAAATTTTGGTATTTTGAGTTTGGCACATCTGAAACTTTCTCAGCCACCTGCAAGAAGCTACATGAATCTGTAG 1891
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848 CAAATTTTGGTATTTTGAGTTTGGCACATCTGAAACTTTCTCAGCCACCTGCAAGAAGCTACATGAATCTGTAG 1921
Query 1892 AAATAGAATGTGATGGAGTACAGATAGATTTAATAAACATCTCTCTGGAAGGAATTGCTATTTTGAATATACCA 1965
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922 AAATAGAATGTGATGGAGTACAGATAGATTTAATAAACATCTCTCTGGAAGGAATTGCTATTTTGAATATACCA 1995
Query 1966 AGCATGCATGGAGGATCCAATCTTTGGGGAGAGTCTAAGAAAAGACGAAGCCATCGACGAATAGAGAAAAAAGG 2039
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996 AGCATGCATGGAGGATCCAATCTTTGGGGAGAGTCTAAGAAAAGACGAAGCCATCGACGAATAGAGAAAAAAGG 2069
Query 2040 GTCTGACAAAAGGACCACCGTCACAGATGCCAAAGAGTTGAAGTTTGCAAGTCAAGATCTCAGTGACCAGCTGC 2113
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070 GTCTGACAAAAGGACCACCGTCACAGATGCCAAAGAGTTGAAGTTTGCAAGTCAAGATCTCAGTGACCAGCTGC 2143
Query 2114 TGGAGGTGGTCGGCTTGGAAGGAGCCATGGAGATGGGGCAAATATACACAGGCCTGAAAAGTGCTGGCCGGCGG 2187
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2144 TGGAGGTGGTCGGCTTGGAAGGAGCCATGGAGATGGGGCAAATATACACAGGCCTGAAAAGTGCTGGCCGGCGG 2217
Query 2188 CTGGCTCAGTGCTCCTGCGTGGTCATCAGGACGAGCAAGTCTCTGCCAATGCAAATTGATGGGGAGCCATGGAT 2261
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2218 CTGGCTCAGTGCTCCTGCGTGGTCATCAGGACGAGCAAGTCTCTGCCAATGCAAATTGATGGGGAGCCATGGAT 2291
Query 2262 GCAGACCCCATGCACAATAAAAATTACACACAAGAACCAAGCCCCAATGCTGATGGGCCCGCCTCCAAAAACCG 2335
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2292 GCAGACCCCATGCACAATAAAAATTACACACAAGAACCAAGCCCCAATGCTGATGGGCCCGCCTCCAAAAACCG 2365
Query 2336 GTTTATTCTGCTCCCTCGTCAAAAGGACAAGAAACCGAAGCAAGGAA 2382
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2366 GTTTATTCTGCTCCCTCGTCAAAAGGACAAGAAACCGAAGCAAGGAA 2412