Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14607
- Subject:
- NM_001350711.2
- Aligned Length:
- 2394
- Identities:
- 2365
- Gaps:
- 18
Alignment
Query 1 ATGACAAACCAGGAAAAATGGGCCCACCTCAGCCCTTCGGAATTTTCCCAACTTCAGAAATATGCTGAGTATTC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGACAAACCAGGAAAAATGGGCCCACCTCAGCCCTTCGGAATTTTCCCAACTTCAGAAATATGCTGAGTATTC 74
Query 75 TACAAAGAAATTAAAGGATGTTCTTGAAGAATTCCATGGTAATGGTGTGCTTGCAAAGTATAATCCTGAAGGGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TACAAAGAAATTAAAGGATGTTCTTGAAGAATTCCATGGTAATGGTGTGCTTGCAAAGTATAATCCTGAAGGGA 148
Query 149 CAATAGATTTTGAAGGTTTCAAACTATTCATGAAGACATTCCTGGAAGCCGAGCTTCCTGATGATTTCACTGCA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CAATAGATTTTGAAGGTTTCAAACTATTCATGAAGACATTCCTGGAAGCCGAGCTTCCTGATGATTTCACTGCA 222
Query 223 CACCTTTTCATGTCATTTAGCAACAAGTTTCCTCATTCTAGTCCAATGGTAAAAAGTAAGCCTGCTCTCCTATC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CACCTTTTCATGTCATTTAGCAACAAGTTTCCTCATTCTAGTCCAATGGTAAAAAGTAAGCCTGCTCTCCTATC 296
Query 297 AGGCGGTCTGAGAATGAATAAAGGTGCCATCACCCCTCCCCGAACTACTTCTCCTGCAAATACGTGTTCCCCAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGGCGGTCTGAGAATGAATAAAGGTGCCATCACCCCTCCCCGGACTACTTCTCCTGCAAATACGTGTTCCCCAG 370
Query 371 AAGTAATCCATCTGAAGGACATTGTCTGTTACCTGTCTCTGCTTGAAAGAGGAAGACCTGAGGATAAGCTTGAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAGTAATCCATCTGAAGGACATTGTCTGTTACCTGTCTCTGCTTGAAAGAGGAAGACCTGAGGATAAGCTTGAG 444
Query 445 TTTATGTTTCGCCTTTATGACACGGATGGGAATGGCTTCCTGGACAGCTCGGAGCTAGAAAATATCATCAGTCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTTATGTTTCGCCTTTATGACACGGATGGGAATGGCTTCCTGGACAGCTCGGAGCTAGAAAATATCATCAGTCA 518
Query 519 GATGATGCATGTTGCAGAATACCTTGAGTGGGATGTCACTGAACTTAATCCAATCCTCCATGAAATGATGGAAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GATGATGCATGTTGCAGAATACCTTGAGTGGGATGTCACTGAACTTAATCCAATCCTCCATGAAATGATGGAAG 592
Query 593 AAATTGACTATGATCATGATGGAACCGTGTCTCTGGAGGAATGGATTCAAGGAGGAATGACAACGATTCCACTT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAATTGACTATGATCATGATGGAACCGTGTCTCTGGAGGAATGGATTCAAGGAGGAATGACAACGATTCCACTT 666
Query 667 CTTGTGCTCCTGGGCTTAGAAAATAACGTGAAAGGATGATGGACAGCACGTGTGGCGACTG-AGCACTTTAACA 739
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 667 CTTGTGCTCCTGGGCTTAGAAAATAACGTG-AAGGATGATGGACAGCACGTGTGGCGACTGAAGCACTTTAACA 739
Query 740 AACCTG-CTA-TGCA--CTTTG-CTG-ACATGCTGATT-GCGTGGGGAAGCAGG--CTCTGCTGTTCCTTCTGC 804
|||||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 740 AACCTGCCTATTGCAACCTTTGCCTGAACATGCTGATTGGCGTGGGGAAGCAGGGCCTCTGCTGTTCCTTCTGC 813
Query 805 -AGTACACAGTCCATGAGCGCTGTGTGGCTCGAGCACCTCCCTCTTGCATCAAGACCTATGTGAAGTCCAAAAG 877
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 AAGTACACAGTCCATGAGCGCTGTGTGGCTCGAGCACCTCCCTCTTGCATCAAGACCTATGTGAAGTCCAAAAG 887
Query 878 GAACACTGATGTCATGCACCATTACTGGGTTGAAGGTAACTGCCCAACCAAGTGTGATAAGTGCCACAAAACTG 951
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 GAACACTGATGTCATGCACCATTACTGGGTTGAAGGTAACTGCCCAACCAAGTGTGATAAGTGCCACAAAACTG 961
Query 952 TTAAATGTTACCAGGGCCTGACAGGACTGCATTGTGTTTGGTGTCAGATCACACTGCATAATAAATGTGCTTCT 1025
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 TTAAATGTTACCAGGGCCTGACAGGACTGCATTGTGTTTGGTGTCAGATCACACTGCATAATAAATGTGCTTCT 1035
Query 1026 CATCTAAAACCTGAATGTGACTGTGGACCTTTGAAGGACCATATTTTACCACCCACAACAATCTGTCCAGTGGT 1099
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 CATCTAAAACCTGAATGTGACTGTGGACCTTTGAAGGACCATATTTTACCACCCACAACAATCTGTCCAGTGGT 1109
Query 1100 ACTGCAGACTCTGCCCACTTCAGGAGTTTCAGTTCCTGAGGAAAGACAATCAACAGTGAAAAAGGAAAAGAGTG 1173
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 ACT---GACTCTGCCCACTTCAGGAGTTTCAGTTCCTGAGGAAAGACAATCAACAGTGAAAAAGGAAAAGAGTG 1180
Query 1174 GTTCCCAGCAGCCAAACAAAGTGATTGACAAGAATAAAATGCAAAGAGCCAACTCTGTTACTGTAGATGGACAA 1247
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181 GTTCCCAGCAGCCAAACAAAGTGATTGACAAGAATAAAATGCAAAGAGCCAACTCTGTTACTGTAGATGGACAA 1254
Query 1248 GGCCTGCAGGTCACTCCTGTGCCTGGTACTCACCCACTTTTAGTTTTTGTGAACCCCAAAAGTGGTGGAAAACA 1321
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255 GGCCTGCAGGTCACTCCTGTGCCTGGTACTCACCCACTTTTAGTTTTTGTGAACCCCAAAAGTGGTGGAAAACA 1328
Query 1322 AGGAGAACGAATTTACAGAAAATTCCAGTATCTATTAAATCCTCGTCAGGTTTACAGTCTTTCTGGAAATGGAC 1395
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329 AGGAGAACGAATTTACAGAAAATTCCAGTATCTATTAAATCCTCGTCAGGTTTACAGTCTTTCTGGAAATGGAC 1402
Query 1396 CAATGCCAGGGTTAAACTTTTTCCGTGATGTTCCTGACTTCAGAGTGTTAGCCTGTGGTGGAGATGGAACCGTG 1469
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1403 CAATGCCAGGGTTAAACTTTTTCCGTGATGTTCCTGACTTCAGAGTGTTAGCCTGTGGTGGAGATGGAACCGTG 1476
Query 1470 GGCTGGGTTTTGGATTGCATAGAAAAGGCCAATGTAGGCAAGCATCCTCCAGTTGCGATTCTGCCTCTTGGGAC 1543
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477 GGCTGGGTTTTGGATTGCATAGAAAAGGCCAATGTAGGCAAGCATCCTCCAGTTGCGATTCTGCCTCTTGGGAC 1550
Query 1544 TGGCAATGATCTAGCAAGATGCCTGCGATGGGGAGGAGGTTACGAAGGTGAGGATCTGATGAAAATTTTAAAAG 1617
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1551 TGGCAATGATCTAGCAAGATGCCTGCGATGGGGAGGAGGTTACGAAGGTGAGAATCTGATGAAAATTCTAAAAG 1624
Query 1618 ACATTGNAAACAGCACAGAAATCATG-TGGACAGGTGGAAGTTTGAAAGTCATACNTAATGACAAGNATGAGAA 1690
||||||.||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||.|||||||||..|||||||
Sbjct 1625 ACATTGAAAACAGCACAGAAATCATGTTGGACAGGTGGAAGTTTG-AAGTCATACCTAATGACAAAGATGAGAA 1697
Query 1691 AGGAGACCCAGTGCCTANCAGTATCATCAATAATTACTTTTCCATTGGCGTGGATGCCTCCATGNCACACAGAT 1764
||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||
Sbjct 1698 AGGAGACCCAGTGCCTTACAGTATCATCAATAATTACTTTTCCATTGGCGTGGATGCCTCCATTGCACACAGAT 1771
Query 1765 TCCACATCATGAGAGAAAAACACCCNAGAGAAATTCAACAGTAGAATGAAGAACAAATTTTGGTATTTTGAGTT 1838
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1772 TCCACATCATGAGAGAAAAACACCC-AGAGAAATTCAACAGTAGAATGAAGAACAAATTTTGGTATTTTGAGTT 1844
Query 1839 TGGCACATCTGAAACTTTCTCAGCCACCTGCAAGAAGCTACATGAATCTGTAGAAATAGAATGTGATGGAGTAC 1912
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1845 TGGCACATCTGAAACTTTCTCAGCCACCTGCAAGAAGCTACATGAATCTGTAGAAATAGAATGTGATGGAGTAC 1918
Query 1913 AGATAGATTTAATAAACATCTCTCTGGAAGGAATTGCTATTTTGAATATACCAAGCATGCATGGAGGATCCAAT 1986
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1919 AGATAGATTTAATAAACATCTCTCTGGAAGGAATTGCTATTTTGAATATACCAAGCATGCATGGAGGATCCAAT 1992
Query 1987 CTTTGGGGAGAGTCTAAGAAAAGACGAAGCCATCGACGAATAGAGAAAAAAGGGTCTGACAAAAGGACCACCGT 2060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1993 CTTTGGGGAGAGTCTAAGAAAAGACGAAGCCATCGACGAATAGAGAAAAAAGGGTCTGACAAAAGGACCACCGT 2066
Query 2061 CACAGATGCCAAAGAGTTGAAGTTTGCAAGTCAAGATCTCAGTGACCAGCTGCTGGAGGTGGTCGGCTTGGAAG 2134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2067 CACAGATGCCAAAGAGTTGAAGTTTGCAAGTCAAGATCTCAGTGACCAGCTGCTGGAGGTGGTCGGCTTGGAAG 2140
Query 2135 GAGCCATGGAGATGGGGCAAATATACACAGGCCTGAAAAGTGCTGGCCGGCGGCTGGCTCAGTGCTCCTGCGTG 2208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2141 GAGCCATGGAGATGGGGCAAATATACACAGGCCTGAAAAGTGCTGGCCGGCGGCTGGCTCAGTGCTCCTGCGTG 2214
Query 2209 GTCATCAGGACGAGCAAGTCTCTGCCAATGCAAATTGATGGGGAGCCATGGATGCAGACCCCATGCACAATAAA 2282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2215 GTCATCAGGACGAGCAAGTCTCTGCCAATGCAAATTGATGGGGAGCCATGGATGCAGACCCCATGCACAATAAA 2288
Query 2283 AATTACACACAAGAACCAAGCCCCAATGCTGATGGGCCCGCCTCCAAAAACCGGTTTATTCTGCTCCCTCGTCA 2356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2289 AATTACACACAAGAACCAAGCCCCAATGCTGATGGGCCCGCCTCCAAAAACCGGTTTATTCTGCTCCCTCGTCA 2362
Query 2357 AAAGGACAAGAAACCGAAGCAAGGAA 2382
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2363 AAAGGACAAGAAACCGAAGCAAGGAA 2388