Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14607
- Subject:
- NM_001350724.2
- Aligned Length:
- 2394
- Identities:
- 2239
- Gaps:
- 144
Alignment
Query 1 ATGACAAACCAGGAAAAATGGGCCCACCTCAGCCCTTCGGAATTTTCCCAACTTCAGAAATATGCTGAGTATTC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TACAAAGAAATTAAAGGATGTTCTTGAAGAATTCCATGGTAATGGTGTGCTTGCAAAGTATAATCCTGAAGGGA 148
|||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1 -----------------ATGTTCTTGAAGAATTCCAT-----------------------------------GA 22
Query 149 CAATAGATTTTGAAGGTTTCAAACTATTCATGAAGACATTCCTGGAAGCCGAGCTTCCTGATGATTTCACTGCA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 23 CAATAGATTTTGAAGGTTTCAAACTATTCATGAAGACATTCCTGGAAGCCGAGCTTCCTGATGATTTCACTGCA 96
Query 223 CACCTTTTCATGTCATTTAGCAACAAGTTTCCTCATTCTAGTCCAATGGTAAAAAGTAAGCCTGCTCTCCTATC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 97 CACCTTTTCATGTCATTTAGCAACAAGTTTCCTCATTCTAGTCCAATGGTAAAAAGTAAGCCTGCTCTCCTATC 170
Query 297 AGGCGGTCTGAGAATGAATAAAGGTGCCATCACCCCTCCCCGAACTACTTCTCCTGCAAATACGTGTTCCCCAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 171 AGGCGGTCTGAGAATGAATAAAGGTGCCATCACCCCTCCCCGGACTACTTCTCCTGCAAATACGTGTTCCCCAG 244
Query 371 AAGTAATCCATCTGAAGGACATTGTCTGTTACCTGTCTCTGCTTGAAAGAGGAAGACCTGAGGATAAGCTTGAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 245 AAGTAATCCATCTGAAGGACATTGTCTGTTACCTGTCTCTGCTTGAAAGAGGAAGACCTGAGGATAAGCTTGAG 318
Query 445 TTTATGTTTCGCCTTTATGACACGGATGGGAATGGCTTCCTGGACAGCTCGGAGCTAGAAAATATCATCAGTCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 319 TTTATGTTTCGCCTTTATGACACGGATGGGAATGGCTTCCTGGACAGCTCGGAGCTAGAAAATATCATCAGTCA 392
Query 519 GATGATGCATGTTGCAGAATACCTTGAGTGGGATGTCACTGAACTTAATCCAATCCTCCATGAAATGATGGAAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 393 GATGATGCATGTTGCAGAATACCTTGAGTGGGATGTCACTGAACTTAATCCAATCCTCCATGAAATGATGGAAG 466
Query 593 AAATTGACTATGATCATGATGGAACCGTGTCTCTGGAGGAATGGATTCAAGGAGGAATGACAACGATTCCACTT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 467 AAATTGACTATGATCATGATGGAACCGTGTCTCTGGAGGAATGGATTCAAGGAGGAATGACAACGATTCCACTT 540
Query 667 CTTGTGCTCCTGGGCTTAGAAAATAACGTGAAAGGATGATGGACAGCACGTGTGGCGACTG-AGCACTTTAACA 739
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 541 CTTGTGCTCCTGGGCTTAGAAAATAACGTG-AAGGATGATGGACAGCACGTGTGGCGACTGAAGCACTTTAACA 613
Query 740 AACCTG-CTA-TGCA--CTTTG-CTG-ACATGCTGATT-GCGTGGGGAAGCAGG--CTCTGCTGTTCCTTCTGC 804
|||||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 614 AACCTGCCTATTGCAACCTTTGCCTGAACATGCTGATTGGCGTGGGGAAGCAGGGCCTCTGCTGTTCCTTCTGC 687
Query 805 -AGTACACAGTCCATGAGCGCTGTGTGGCTCGAGCACCTCCCTCTTGCATCAAGACCTATGTGAAGTCCAAAAG 877
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 688 AAGTACACAGTCCATGAGCGCTGTGTGGCTCGAGCACCTCCCTCTTGCATCAAGACCTATGTGAAGTCCAAAAG 761
Query 878 GAACACTGATGTCATGCACCATTACTGGGTTGAAGGTAACTGCCCAACCAAGTGTGATAAGTGCCACAAAACTG 951
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 762 GAACACTGATGTCATGCACCATTACTGGGTTGAAGGTAACTGCCCAACCAAGTGTGATAAGTGCCACAAAACTG 835
Query 952 TTAAATGTTACCAGGGCCTGACAGGACTGCATTGTGTTTGGTGTCAGATCACACTGCATAATAAATGTGCTTCT 1025
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 836 TTAAATGTTACCAGGGCCTGACAGGACTGCATTGTGTTTGGTGTCAGATCACACTGCATAATAAATGTGCTTCT 909
Query 1026 CATCTAAAACCTGAATGTGACTGTGGACCTTTGAAGGACCATATTTTACCACCCACAACAATCTGTCCAGTGGT 1099
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 910 CATCTAAAACCTGAATGTGACTGTGGACCTTTGAAGGACCATATTTTACCACCCACAACAATCTGTCCAGTGGT 983
Query 1100 ACTGCAGACTCTGCCCACTTCAGGAGTTTCAGTTCCTGAGGAAAGACAATCAACAGTGAAAAAGGAAAAGAGTG 1173
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 984 ACT---GACTCTGCCCACTTCAGGAGTTTCAGTTCCTGAGGAAAGACAATCAACAGTGAAAAAGGAAAAGAGTG 1054
Query 1174 GTTCCCAGCAGCCAAACAAAGTGATTGACAAGAATAAAATGCAAAGAGCCAACTCTGTTACTGTAGATGGACAA 1247
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1055 GTTCCCAGCAGCCAAACAAAGTGATTGACAAGAATAAAATGCAAAGAGCCAACTCTGTTACTGTAGATGGACAA 1128
Query 1248 GGCCTGCAGGTCACTCCTGTGCCTGGTACTCACCCACTTTTAGTTTTTGTGAACCCCAAAAGTGGTGGAAAACA 1321
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1129 GGCCTGCAGGTCACTCCTGTGCCTGGTACTCACCCACTTTTAGTTTTTGTGAACCCCAAAAGTGGTGGAAAACA 1202
Query 1322 AGGAGAACGAATTTACAGAAAATTCCAGTATCTATTAAATCCTCGTCAGGTTTACAGTCTTTCTGGAAATGGAC 1395
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1203 AGGAGAACGAATTTACAGAAAATTCCAGTATCTATTAAATCCTCGTCAGGTTTACAGTCTTTCTGGAAATGGAC 1276
Query 1396 CAATGCCAGGGTTAAACTTTTTCCGTGATGTTCCTGACTTCAGAGTGTTAGCCTGTGGTGGAGATGGAACCGTG 1469
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1277 CAATGCCAGGGTTAAACTTTTTCCGTGATGTTCCTGACTTCAGAGTGTTAGCCTGTGGTGGAGATGGAACCGTG 1350
Query 1470 GGCTGGGTTTTGGATTGCATAGAAAAGGCCAATGTAGGCAAGCATCCTCCAGTTGCGATTCTGCCTCTTGGGAC 1543
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1351 GGCTGGGTTTTGGATTGCATAGAAAAGGCCAATGTAGGCAAGCATCCTCCAGTTGCGATTCTGCCTCTTGGGAC 1424
Query 1544 TGGCAATGATCTAGCAAGATGCCTGCGATGGGGAGGAGGTTACGAAGGTGAGGATCTGATGAAAATTTTAAAAG 1617
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1425 TGGCAATGATCTAGCAAGATGCCTGCGATGGGGAGGAGGTTACGAAGGTGAGAATCTGATGAAAATTCTAAAAG 1498
Query 1618 ACATTGNAAACAGCACAGAAATCATG-TGGACAGGTGGAAGTTTGAAAGTCATACNTAATGACAAGNATGAGAA 1690
||||||.||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||.|||||||||..|||||||
Sbjct 1499 ACATTGAAAACAGCACAGAAATCATGTTGGACAGGTGGAAGTTTG-AAGTCATACCTAATGACAAAGATGAGAA 1571
Query 1691 AGGAGACCCAGTGCCTANCAGTATCATCAATAATTACTTTTCCATTGGCGTGGATGCCTCCATGNCACACAGAT 1764
||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||
Sbjct 1572 AGGAGACCCAGTGCCTTACAGTATCATCAATAATTACTTTTCCATTGGCGTGGATGCCTCCATTGCACACAGAT 1645
Query 1765 TCCACATCATGAGAGAAAAACACCCNAGAGAAATTCAACAGTAGAATGAAGAACAAATTTTGGTATTTTGAGTT 1838
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1646 TCCACATCATGAGAGAAAAACACCC-AGAGAAATTCAACAGTAGAATGAAGAACAAATTTTGGTATTTTGAGTT 1718
Query 1839 TGGCACATCTGAAACTTTCTCAGCCACCTGCAAGAAGCTACATGAATCTGTAGAAATAGAATGTGATGGAGTAC 1912
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1719 TGGCACATCTGAAACTTTCTCAGCCACCTGCAAGAAGCTACATGAATCTGTAGAAATAGAATGTGATGGAGTAC 1792
Query 1913 AGATAGATTTAATAAACATCTCTCTGGAAGGAATTGCTATTTTGAATATACCAAGCATGCATGGAGGATCCAAT 1986
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1793 AGATAGATTTAATAAACATCTCTCTGGAAGGAATTGCTATTTTGAATATACCAAGCATGCATGGAGGATCCAAT 1866
Query 1987 CTTTGGGGAGAGTCTAAGAAAAGACGAAGCCATCGACGAATAGAGAAAAAAGGGTCTGACAAAAGGACCACCGT 2060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1867 CTTTGGGGAGAGTCTAAGAAAAGACGAAGCCATCGACGAATAGAGAAAAAAGGGTCTGACAAAAGGACCACCGT 1940
Query 2061 CACAGATGCCAAAGAGTTGAAGTTTGCAAGTCAAGATCTCAGTGACCAGCTGCTGGAGGTGGTCGGCTTGGAAG 2134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1941 CACAGATGCCAAAGAGTTGAAGTTTGCAAGTCAAGATCTCAGTGACCAGCTGCTGGAGGTGGTCGGCTTGGAAG 2014
Query 2135 GAGCCATGGAGATGGGGCAAATATACACAGGCCTGAAAAGTGCTGGCCGGCGGCTGGCTCAGTGCTCCTGCGTG 2208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2015 GAGCCATGGAGATGGGGCAAATATACACAGGCCTGAAAAGTGCTGGCCGGCGGCTGGCTCAGTGCTCCTGCGTG 2088
Query 2209 GTCATCAGGACGAGCAAGTCTCTGCCAATGCAAATTGATGGGGAGCCATGGATGCAGACCCCATGCACAATAAA 2282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2089 GTCATCAGGACGAGCAAGTCTCTGCCAATGCAAATTGATGGGGAGCCATGGATGCAGACCCCATGCACAATAAA 2162
Query 2283 AATTACACACAAGAACCAAGCCCCAATGCTGATGGGCCCGCCTCCAAAAACCGGTTTATTCTGCTCCCTCGTCA 2356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2163 AATTACACACAAGAACCAAGCCCCAATGCTGATGGGCCCGCCTCCAAAAACCGGTTTATTCTGCTCCCTCGTCA 2236
Query 2357 AAAGGACAAGAAACCGAAGCAAGGAA 2382
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2237 AAAGGACAAGAAACCGAAGCAAGGAA 2262