Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14615
• Subject: XM_006521765.3
• Aligned Length: 2802
• Identities: 2358
• Gaps: 172

Alignment

Query    1  ATGCCGGTCCGGAAGCAAGATACCCAGAGAGCATTGCACCTTTTGGAGGAATATCGTTCAAAACTAAGCCAAAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCGGTCCGGAAGCAAGATACCCAGAGAGCATTGCATCTGTTGGAAGAATATCGATCGAAACTAAGCCAAAC  74

Query   75  TGAAGACAGACAGCTCAGAAGTTCCATAGAACGGGTTATTAACATATTTCAGAGCAACCTCTTTCAGGCTTTAA  148
            ||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGAAGACAGACAACTCAGAAGTTCCATAGAGCGGGTTATTAACATATTTCAGAGCAACCTCTTTCAGGCTTTAA  148

Query  149  TAGATATTCAAGAATTTTATGAAGTGACCTTACTGGATAATCCAAAATGTATAGATCGTTCAAAGCCGTCTGAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||.||||||||.||.||||
Sbjct  149  TAGATATTCAAGAATTTTATGAAGTGACCTTACTTGATAATCCAAAATGTGTGGATCATTCAAAGCAGTGTGAA  222

Query  223  CCAATTCAACCTGTGAATACTTGGGAGATTTCCAGCCTTCCAAGCTCTACTGTGACTTCAGAGACACTGCCAAG  296
            |||.||||.|||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.||.|.|||||.|||||.||.|||||..|
Sbjct  223  CCAGTTCAGCCTGTGACTACTTGGGAGATTGCCAGCCTTCCAAGCACTGCCGTGACGTCAGAAACCCTGCCCGG  296

Query  297  CAGCCTTAGCCCTAGTGTAGAGAAATACAGGTATCAGGATGAAGATACACCTCCTCAAGAGCATATTTCCCCAC  370
            |||||||||||||...||||||||||||.||||||||||||||||...||.|||||..|||||||||||.||||
Sbjct  297  CAGCCTTAGCCCTCCAGTAGAGAAATACCGGTATCAGGATGAAGAGGTACTTCCTCCTGAGCATATTTCTCCAC  370

Query  371  AAATCACAAATGAAGTGATAGGTCCAGAATTGGTTCATGTCTCAGAGAAGAACTTATCAGAGATTGAGAATGTC  444
            ||.||||||||||.|||.|||||||||||.||||.||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGTCACAAATGAGGTGCTAGGTCCAGAACTGGTCCATGTCTCAGAGAAGAACCTGTCAGAGATTGAGAATGTC  444

Query  445  CATGGATTTGTTTCTCATTCTCATATTTCACCAATAA-------------------------------------  481
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||                                     
Sbjct  445  CATGGATTTGTTTCTCATTCTCATATCTCACCAATAAAGCCCACAGAAGCTGTTCCTCCCTCCTCTCCCATTGT  518

Query  482  --------------------------------------------------------------AGGCAAATCCTC  493
                                                                          ||||||||||||
Sbjct  519  CCCTGTGACCCCTGCCCTGCCAGTCCCTGCTGAGAGTACTGTCGTCCTGCCCTCCGCACCACAGGCAAATCCTC  592

Query  494  CCCCAGTACTGGTCAACACAGATAGCTTGAAAACACCAACTTACGTTAATGGCACAGATGCAGATTATGAATAT  567
            |.|||||.||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTCCAGTGCTGGTCAACACAGACAGCTTAGAGACACCAACTTATGTTAATGGCACTGATGCAGATTATGAATAT  666

Query  568  GAAGAAATCACACTTGAAAGGGGAAATTCAGGGCTTGGTTTCAGCATTGCAG--AGTACGGACAACCCACACAT  639
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||  .||||.||||||||||||||
Sbjct  667  GAGGAAATCACACTTGAAAGGGGAAATTCGGGTCTTGGTTTCAGCATTGCAGGAGGTACAGACAACCCACACAT  740

Query  640  TGGAGATGACTCAAGTATTTTCATTACCAAAATTATCACAGG-GGAGCAGCCGCCCAAGATGGGAAGATTGCGG  712
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||| |||||.||.|||||.||| ||||||||||||
Sbjct  741  TGGAGATGACTCAAGTATTTTCATCACCAAAATTATCACAGGCGGAGCGGCTGCCCAGGAT-GGAAGATTGCGG  813

Query  713  GTCAATGACTGTATATTACAAGTAAATGAAGTAGATGTTCGTGATGTAACACATAGCAAAGCAGTTGAAGCGTT  786
            ||.||||||||||||.|...|||||||||||.|||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct  814  GTAAATGACTGTATACTGAGAGTAAATGAAGCAGACGTTCGTGATGTAACCCACAGCAAAGCAGTGGAGGCATT  887

Query  787  GAAAGAAGCAGGGTCTATTGTACGCTTGTATGTAAAAAGAAGGAAACCAGTGTCAGAAAAAATAATGGAAATAA  860
            .||||||||.||.||||||||.||.||||||||.|||||..||||.||||..|||||||||||.||||||||||
Sbjct  888  AAAAGAAGCTGGATCTATTGTGCGATTGTATGTGAAAAGGCGGAAGCCAGCATCAGAAAAAATCATGGAAATAA  961

Query  861  AGCTCATTAAAGGTCCTAAAGGTCTTGGGTTTAGCATTGCTGGAGGTGTTGGAAATCAGCATATTCCTGGGGAT  934
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  962  AGCTCATTAAAGGTCCTAAAGGTCTTGGGTTCAGCATTGCTGGAGGTGTTGGAAATCAGCACATTCCTGGTGAT  1035

Query  935  AATAGCATCTATGTAACCAAAATAATTGAAGGAGGTGCAGCACATAAGGATGGCAAACTTCAGATTGGAGATAA  1008
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1036  AACAGCATCTATGTAACCAAAATAATTGAAGGAGGTGCAGCACACAAGGATGGCAAGCTTCAGATTGGAGATAA  1109

Query 1009  ACTTTTAGCAGTGAATAACGTATGTTTAGAAGAAGTTACTCATGAAGAAGCAGTAACTGCCTTAAAGAACACAT  1082
            .|||.||||||||||.|..||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1110  GCTTCTAGCAGTGAACAGTGTGTGTTTAGAAGAAGTTACTCATGAAGAAGCAGTGACTGCCTTAAAGAATACAT  1183

Query 1083  CTGATTTTGTTTATTTGAAAGTGGCAAAACCCACAAGTATGTATATGAATGATGGCTATGCACCACCTGATATC  1156
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1184  CTGATTTTGTTTATTTGAAAGTGGCAAAACCAACAAGTATGTATATAAATGATGGCTATGCACCACCTGACATC  1257

Query 1157  ACCAACTCTTCTTCTCAGCCTGTTGATAACCATGTTAGCCCATCTTCCTTCTTGGGCCAGACACCAGCATCTCC  1230
            ||.||.|||||||||||..|||||||.||||||||.|||||.||.||||.||||||||||||.|||.|.||.||
Sbjct 1258  ACTAATTCTTCTTCTCAATCTGTTGACAACCATGTCAGCCCGTCCTCCTGCTTGGGCCAGACGCCAACGTCACC  1331

Query 1231  AGCCAGATACTC-CCCAGTTTCTAAAGCAGTACTTGGAGATGATGAAATTACAAGGGAACCTAGAAAAGTTGTT  1303
            ||||||.||||| |||| ||||||||||.||.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1332  AGCCAGGTACTCACCCA-TTTCTAAAGCTGTGCTCGGAGATGACGAGATCACTAGGGAACCTAGAAAAGTTGTT  1404

Query 1304  CTTCATCGTGGCTCAACGGGCCTTGGTTTCAACATTGTAGGAGGAGAAGATGGAGAAGGAATATTTATTTCCTT  1377
            |||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 1405  CTTCATCGTGGCTCAACAGGACTTGGTTTTAACATTGTGGGAGGTGAAGATGGAGAAGGGATTTTTATCTCCTT  1478

Query 1378  TATCTTAGCCGGAGGACCTGCTGATCTAAGTGGAGAGCTCAGAAAAGGAGATCGTATTATATCGGTAAACAGTG  1451
            .|||.|.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 1479  CATCCTTGCTGGCGGACCTGCTGATCTAAGTGGAGAGCTCAGAAAAGGAGATCGCATCATATCGGTGAACAGTG  1552

Query 1452  TTGACCTCAGAGCTGCTAGTCATGAGCAGGCAGCAGCTGCATTGAAAAATGCTGGCCAGGCTGTCACAATTGTT  1525
            ||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||.|.||.||.||.|||||.||.|||||.||.|||
Sbjct 1553  TTGACCTCAGAGCTGCAAGTCACGAACAAGCAGCAGCTGCACTAAAGAACGCAGGCCAAGCCGTCACCATCGTT  1626

Query 1526  GCACAATATCGACCTGAAGAATACAGTCGTTTTGAAGCTAAAATACATGATTTACGGGAGCAGATGATGAATAG  1599
            ||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1627  GCGCAATATCGACCCGAAGAGTACAGTCGTTTTGAAGCTAAAATCCATGACTTACGGGAGCAGATGATGAATAG  1700

Query 1600  TAGTATTAGTTCAGGGTCAGGTTCTCTTCGAACTAGCCAGAAGCGATCCCTCTATGTCAGAGCCCTTTTTGATT  1673
            .|||.|.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1701  CAGTGTCAGTTCAGGGTCAGGGTCTCTTCGAACCAGCCAGAAGCGCTCCCTCTATGTCAGAGCCCTCTTTGATT  1774

Query 1674  ATGACAAGACTAAAGACAGTGGGCTTCCCAGTCAGGGACTGAACTTCAAATTTGGAGATATCCTCCATGTTATT  1747
            |||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||...||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 1775  ATGACAAGACTAAGGACAGCGGGCTTCCCAGTCAAGGACTGAACTTCCGCTTTGGAGACATCCTCCATGTCATC  1848

Query 1748  AATGCTTCTGATGATGAATGGTGGCAAGCCAGGCAGGTTACACCAGATGGTGAGAGCGATGAGGTCGGAGTGAT  1821
            |||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 1849  AATGCTTCTGACGACGAGTGGTGGCAAGCCAGGCAGGTCACCCCAGACGGGGAGAGTGACGAAGTCGGAGTGAT  1922

Query 1822  TCCCAGTAAACGCAGAGTTGAGAAGAAAGAACGAGCCCGATTAAAAACAGTGAAATTCAATTCTAAAACGA---  1892
            |||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|   
Sbjct 1923  TCCTAGTAAACGAAGAGTTGAGAAGAAGGAACGAGCCCGATTAAAAACGGTCAAATTCAATTCTAAAACAAGAG  1996

Query 1893  GAGATAAAGGGCAGTCATTC--AATGACAAGCG-TAAAAAGAACCTCTTTTCCCGAA------AATTCCCCTTC  1957
            |||||||||||.||  ||.|  .|.||||.|.| |.|||||         .||.|||      ||     ||||
Sbjct 1997  GAGATAAAGGGGAG--ATCCCTGACGACATGGGATCAAAAG---------GCCTGAAGCACGTAA-----CTTC  2054

Query 1958  TACAAGAACAAGGACCAG----AGTG--AGCAGGAAACAAGTGATGCTCACAAGTATGTATATGAATGATGGCT  2025
            || |.|        ||||    ||||  ||.||..|.|.|.|..||.|.||        |.|||||| ||||| 
Sbjct 2055  TA-ATG--------CCAGCGATAGTGAAAGTAGTTACCTAATCTTGATTAC--------AGATGAAT-ATGGC-  2109

Query 2026  ATGCACCACCTGATATCACCAACTGTGGTCAAGAAGAATACGTCTTATCTTATGAACCAGTGAATCAACAAGAA  2099
             |||           |||  ||..||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 2110  -TGC-----------TCA--AAAGGTGGTCAAGAAGAATATGTTTTATCTTATGAGCCAGTGAATCAACAAGAA  2169

Query 2100  GTTAATTATACTCGACCAGTGATCATATTGGGACCTATGAAAGACAGGATAAATGATGACTTGATCTCAGAATT  2173
            |||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||..|||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2170  GTTAATTATACCCGACCAGTCATCATATTAGGACCTATGAAAGACAGAGTAAATGATGACTTAATCTCAGAATT  2243

Query 2174  TCCTGACAAATTTGGATCCTGTGTTCCTCATACAACTAGACCAAAACGAGATTATGAGGTAGATGGAAGAGATT  2247
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||.||||||
Sbjct 2244  TCCTGACAAATTTGGATCCTGTGTCCCTCATACAACTAGACCGAAGCGTGACTATGAGGTGGATGGACGAGATT  2317

Query 2248  ATCATTTTGTGACTTCAAGAGAGCAGATGGAAAAAGATATCCAGGAACATAAATTCATTGAAGCTGGCCAGTAT  2321
            |||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 2318  ATCATTTTGTGACTTCAAGGGAACAGATGGAAAAGGATATTCAGGAGCATAAGTTCATTGAAGCCGGCCAGTAT  2391

Query 2322  AACAATCATCTATATGGAACAAGTGTTCAGTCTGTACGAGAAGTAGCAGAAAAGGGCAAACACTGTATCCTTGA  2395
            |||||.|||||.|||||.||.||.||.|||||.||.||||.|||.|||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2392  AACAACCATCTGTATGGGACGAGCGTGCAGTCCGTGCGAGCAGTGGCAGAGAAGGGCAAACATTGTATCCTTGA  2465

Query 2396  TGTGTCTGGAAATGCCATAAAGAGATTACAGATTGCACAGCTTTACCCTATCTCCATTTTTATTAAACCCAAAT  2469
            ||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2466  TGTGTCTGGAAATGCCATAAAGAGGTTGCAGATTGCACAGCTTTATCCAATATCTATTTTTATTAAACCCAAAT  2539

Query 2470  CCATGGAAAATATCATGGAAATGAATAAGCGTCTAACAGAAGAACAAGCCAGAAAAACATTTGAGAGAGCCATG  2543
            |||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2540  CCATGGAAAATATCATGGAAATGAACAAGCGCCTAACAGAAGAGCAGGCCAGAAAAACATTTGAGAGAGCCATG  2613

Query 2544  AAACTGGAACAGGAGTTTACTGAACATTTCACAGCTATTGTACAGGGGGATACGCTGGAAGACATTTACAACCA  2617
            ||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2614  AAGCTGGAGCAGGAGTTCACTGAGCATTTCACAGCTATTGTCCAGGGAGACACGCTGGAGGACATTTACAACCA  2687

Query 2618  AGTGAAACAGATCATAGAAGAACAATCTGGTTCTTACATCTGGGTTCCGGCAAAAGAAAAGCTA  2681
            |||||||||||||||.||||||||.|||||..|||||||||||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 2688  AGTGAAACAGATCATCGAAGAACAGTCTGGGCCTTACATCTGGGTCCCAGCGAAAGAAAAGCTA  2751