Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14615
• Subject: XM_006521769.2
• Aligned Length: 2785
• Identities: 2176
• Gaps: 321

Alignment

Query    1  ATG-----CCGGTCCGGAAGCAAGA--------TACCCAGAGAGCATTGCACC--TTTTGGAGGAATATCGTTC  59
            |||     |...|.|||||.|||.|        |||.|        |.||.||  |...|||||         |
Sbjct    1  ATGAATTACATTTTCGGAAACAACACACTTCTGTACTC--------TCGCGCCAGTCGAGGAGG---------C  57

Query   60  AAAACTA-----AGCCAAACTGAAGACAGACAGCTCAGAAGTTCCATAGAACGGGTTATTAACATATTTCAGAG  128
            ||..|||     |||||   ||          ||||||.||..||..||                    |||| 
Sbjct   58  AATGCTAGCTCTAGCCA---TG----------GCTCAGTAGGCCCTAAG--------------------CAGA-  97

Query  129  CAACCTCTTTCAGGCTTTAATAGATATTCAAGAATTTTATGAAGTGACCTTACTGGATAATCCAAAATGTATAG  202
             |||                                               |||||..||   ||||.|    |
Sbjct   98  -AAC-----------------------------------------------ACTGGGCAA---AAAAGG----G  116

Query  203  ATCGTTCAAAGCCGTCTGAACCAATTCAA-CCTGTGAATACTTGGGAGATTTCC--AGCCTTCCAAGCTCTACT  273
            .||| |||.|      |||||   |.||| ||             |||    ||  ||||||||        |.
Sbjct  117  CTCG-TCAGA------TGAAC---TGCAAGCC-------------GAG----CCAGAGCCTTCC--------CG  155

Query  274  GTGACTTCAGAGA-----------CACTGCCAAG---CAGCCTTAGCCCTAGTGTAGAGAAATACA----GGTA  329
            .||.|..||||.|           |||| |.|||   ||||.|||    |.|        |.|.||    ||||
Sbjct  156  CTGGCAGCAGATAGTTGCATTCTTCACT-CGAAGACACAGCTTTA----TTG--------ACTGCATCTCGGTA  216

Query  330  TCAGGATGAAGATACACCTCCTCAAGAGCATATTTCCCCACAAATCACAAATGAAG-TGATAGGTCCAGAATTG  402
            .|            ||||        |||     |||.|.||...||||   |||| ||.|....||       
Sbjct  217  GC------------CACC--------AGC-----TCCACCCAGCCCACA---GAAGCTGTTCCTCCC-------  255

Query  403  GTTCATGTCTCAGAGAAGAACTTATCAGAGATTGA----------GAATGTCCATG----GATTTGTTTC-TCA  461
              ||.|.||.||         ||.||...|  |||          |...||||.||    ||.|..|.|| ||.
Sbjct  256  --TCCTCTCCCA---------TTGTCCCTG--TGACCCCTGCCCTGCCAGTCCCTGCTGAGAGTACTGTCGTCC  316

Query  462  TTCTCATATTTCACCAATAAAGGCAAATCCTCCCCCAGTACTGGTCAACACAGATAGCTTGAAAACACCAACTT  535
            |.|.|     ||..||..|.|||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||..|.||||||||||
Sbjct  317  TGCCC-----TCCGCACCACAGGCAAATCCTCCTCCAGTGCTGGTCAACACAGACAGCTTAGAGACACCAACTT  385

Query  536  ACGTTAATGGCACAGATGCAGATTATGAATATGAAGAAATCACACTTGAAAGGGGAAATTCAGGGCTTGGTTTC  609
            |.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  386  ATGTTAATGGCACTGATGCAGATTATGAATATGAGGAAATCACACTTGAAAGGGGAAATTCGGGTCTTGGTTTC  459

Query  610  AGCATTGCAG--AGTACGGACAACCCACACATTGGAGATGACTCAAGTATTTTCATTACCAAAATTATCACAGG  681
            ||||||||||  .||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  460  AGCATTGCAGGAGGTACAGACAACCCACACATTGGAGATGACTCAAGTATTTTCATCACCAAAATTATCACAGG  533

Query  682  -GGAGCAGCCGCCCAAGATGGGAAGATTGCGGGTCAATGACTGTATATTACAAGTAAATGAAGTAGATGTTCGT  754
             |||||.||.|||||.||| ||||||||||||||.||||||||||||.|...|||||||||||.|||.||||||
Sbjct  534  CGGAGCGGCTGCCCAGGAT-GGAAGATTGCGGGTAAATGACTGTATACTGAGAGTAAATGAAGCAGACGTTCGT  606

Query  755  GATGTAACACATAGCAAAGCAGTTGAAGCGTTGAAAGAAGCAGGGTCTATTGTACGCTTGTATGTAAAAAGAAG  828
            ||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||.||||||||.||.||||||||.|||||..|
Sbjct  607  GATGTAACCCACAGCAAAGCAGTGGAGGCATTAAAAGAAGCTGGATCTATTGTGCGATTGTATGTGAAAAGGCG  680

Query  829  GAAACCAGTGTCAGAAAAAATAATGGAAATAAAGCTCATTAAAGGTCCTAAAGGTCTTGGGTTTAGCATTGCTG  902
            |||.||||..|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  681  GAAGCCAGCATCAGAAAAAATCATGGAAATAAAGCTCATTAAAGGTCCTAAAGGTCTTGGGTTCAGCATTGCTG  754

Query  903  GAGGTGTTGGAAATCAGCATATTCCTGGGGATAATAGCATCTATGTAACCAAAATAATTGAAGGAGGTGCAGCA  976
            |||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  755  GAGGTGTTGGAAATCAGCACATTCCTGGTGATAACAGCATCTATGTAACCAAAATAATTGAAGGAGGTGCAGCA  828

Query  977  CATAAGGATGGCAAACTTCAGATTGGAGATAAACTTTTAGCAGTGAATAACGTATGTTTAGAAGAAGTTACTCA  1050
            ||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||.|..||.||||||||||||||||||||
Sbjct  829  CACAAGGATGGCAAGCTTCAGATTGGAGATAAGCTTCTAGCAGTGAACAGTGTGTGTTTAGAAGAAGTTACTCA  902

Query 1051  TGAAGAAGCAGTAACTGCCTTAAAGAACACATCTGATTTTGTTTATTTGAAAGTGGCAAAACCCACAAGTATGT  1124
            ||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  903  TGAAGAAGCAGTGACTGCCTTAAAGAATACATCTGATTTTGTTTATTTGAAAGTGGCAAAACCAACAAGTATGT  976

Query 1125  ATATGAATGATGGCTATGCACCACCTGATATCACCAACTCTTCTTCTCAGCCTGTTGATAACCATGTTAGCCCA  1198
            ||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||..|||||||.||||||||.|||||.
Sbjct  977  ATATAAATGATGGCTATGCACCACCTGACATCACTAATTCTTCTTCTCAATCTGTTGACAACCATGTCAGCCCG  1050

Query 1199  TCTTCCTTCTTGGGCCAGACACCAGCATCTCCAGCCAGATACTC-CCCAGTTTCTAAAGCAGTACTTGGAGATG  1271
            ||.||||.||||||||||||.|||.|.||.||||||||.||||| |||| ||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 1051  TCCTCCTGCTTGGGCCAGACGCCAACGTCACCAGCCAGGTACTCACCCA-TTTCTAAAGCTGTGCTCGGAGATG  1123

Query 1272  ATGAAATTACAAGGGAACCTAGAAAAGTTGTTCTTCATCGTGGCTCAACGGGCCTTGGTTTCAACATTGTAGGA  1345
            |.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1124  ACGAGATCACTAGGGAACCTAGAAAAGTTGTTCTTCATCGTGGCTCAACAGGACTTGGTTTTAACATTGTGGGA  1197

Query 1346  GGAGAAGATGGAGAAGGAATATTTATTTCCTTTATCTTAGCCGGAGGACCTGCTGATCTAAGTGGAGAGCTCAG  1419
            ||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||.|.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1198  GGTGAAGATGGAGAAGGGATTTTTATCTCCTTCATCCTTGCTGGCGGACCTGCTGATCTAAGTGGAGAGCTCAG  1271

Query 1420  AAAAGGAGATCGTATTATATCGGTAAACAGTGTTGACCTCAGAGCTGCTAGTCATGAGCAGGCAGCAGCTGCAT  1493
            ||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||.
Sbjct 1272  AAAAGGAGATCGCATCATATCGGTGAACAGTGTTGACCTCAGAGCTGCAAGTCACGAACAAGCAGCAGCTGCAC  1345

Query 1494  TGAAAAATGCTGGCCAGGCTGTCACAATTGTTGCACAATATCGACCTGAAGAATACAGTCGTTTTGAAGCTAAA  1567
            |.||.||.||.|||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1346  TAAAGAACGCAGGCCAAGCCGTCACCATCGTTGCGCAATATCGACCCGAAGAGTACAGTCGTTTTGAAGCTAAA  1419

Query 1568  ATACATGATTTACGGGAGCAGATGATGAATAGTAGTATTAGTTCAGGGTCAGGTTCTCTTCGAACTAGCCAGAA  1641
            ||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1420  ATCCATGACTTACGGGAGCAGATGATGAATAGCAGTGTCAGTTCAGGGTCAGGGTCTCTTCGAACCAGCCAGAA  1493

Query 1642  GCGATCCCTCTATGTCAGAGCCCTTTTTGATTATGACAAGACTAAAGACAGTGGGCTTCCCAGTCAGGGACTGA  1715
            |||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1494  GCGCTCCCTCTATGTCAGAGCCCTCTTTGATTATGACAAGACTAAGGACAGCGGGCTTCCCAGTCAAGGACTGA  1567

Query 1716  ACTTCAAATTTGGAGATATCCTCCATGTTATTAATGCTTCTGATGATGAATGGTGGCAAGCCAGGCAGGTTACA  1789
            |||||...||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1568  ACTTCCGCTTTGGAGACATCCTCCATGTCATCAATGCTTCTGACGACGAGTGGTGGCAAGCCAGGCAGGTCACC  1641

Query 1790  CCAGATGGTGAGAGCGATGAGGTCGGAGTGATTCCCAGTAAACGCAGAGTTGAGAAGAAAGAACGAGCCCGATT  1863
            |||||.||.|||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1642  CCAGACGGGGAGAGTGACGAAGTCGGAGTGATTCCTAGTAAACGAAGAGTTGAGAAGAAGGAACGAGCCCGATT  1715

Query 1864  AAAAACAGTGAAATTCAATTCTAAAACGA---GAGATAAAGGGCAGTCATTCAATGACAAGCGTAAAAAGAACC  1934
            ||||||.||.|||||||||||||||||.|   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1716  AAAAACGGTCAAATTCAATTCTAAAACAAGAGGAGATAAAGGGCAGTCATTCAATGACAAGCGTAAAAAGAACC  1789

Query 1935  TCTTTTCCCGAAAATTCCCCTTCTACAAGAACAAGGACCAGAGTGAGCAGGAAACAAGTGATGCTCACAAGTAT  2008
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.||.||.|.
Sbjct 1790  TCTTTTCCCGAAAATTTCCCTTCTACAAGAACAAGGACCAGAGTGAACAGGAAACGAGTGATGCTGACCAGCAC  1863

Query 2009  GTA-----TA-------------TGAA----------------TGATGGCTATGCACCACCTG-ATAT-----C  2042
            |||     ||             ||||                ||||   ||     ||..|| ||||     |
Sbjct 1864  GTAACTTCTAATGCCAGCGATAGTGAAAGTAGTTACCTAATCTTGAT---TA-----CAGATGAATATGGCTGC  1929

Query 2043  ACCAACTGTGGTCAAGAAGAATACGTCTTATCTTATGAACCAGTGAATCAACAAGAAGTTAATTATACTCGACC  2116
            .|.||..||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1930  TCAAAAGGTGGTCAAGAAGAATATGTTTTATCTTATGAGCCAGTGAATCAACAAGAAGTTAATTATACCCGACC  2003

Query 2117  AGTGATCATATTGGGACCTATGAAAGACAGGATAAATGATGACTTGATCTCAGAATTTCCTGACAAATTTGGAT  2190
            |||.||||||||.|||||||||||||||||..|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2004  AGTCATCATATTAGGACCTATGAAAGACAGAGTAAATGATGACTTAATCTCAGAATTTCCTGACAAATTTGGAT  2077

Query 2191  CCTGTGTTCCTCATACAACTAGACCAAAACGAGATTATGAGGTAGATGGAAGAGATTATCATTTTGTGACTTCA  2264
            |||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2078  CCTGTGTCCCTCATACAACTAGACCGAAGCGTGACTATGAGGTGGATGGACGAGATTATCATTTTGTGACTTCA  2151

Query 2265  AGAGAGCAGATGGAAAAAGATATCCAGGAACATAAATTCATTGAAGCTGGCCAGTATAACAATCATCTATATGG  2338
            ||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 2152  AGGGAACAGATGGAAAAGGATATTCAGGAGCATAAGTTCATTGAAGCCGGCCAGTATAACAACCATCTGTATGG  2225

Query 2339  AACAAGTGTTCAGTCTGTACGAGAAGTAGCAGAAAAGGGCAAACACTGTATCCTTGATGTGTCTGGAAATGCCA  2412
            .||.||.||.|||||.||.||||.|||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2226  GACGAGCGTGCAGTCCGTGCGAGCAGTGGCAGAGAAGGGCAAACATTGTATCCTTGATGTGTCTGGAAATGCCA  2299

Query 2413  TAAAGAGATTACAGATTGCACAGCTTTACCCTATCTCCATTTTTATTAAACCCAAATCCATGGAAAATATCATG  2486
            |||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2300  TAAAGAGGTTGCAGATTGCACAGCTTTATCCAATATCTATTTTTATTAAACCCAAATCCATGGAAAATATCATG  2373

Query 2487  GAAATGAATAAGCGTCTAACAGAAGAACAAGCCAGAAAAACATTTGAGAGAGCCATGAAACTGGAACAGGAGTT  2560
            ||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 2374  GAAATGAACAAGCGCCTAACAGAAGAGCAGGCCAGAAAAACATTTGAGAGAGCCATGAAGCTGGAGCAGGAGTT  2447

Query 2561  TACTGAACATTTCACAGCTATTGTACAGGGGGATACGCTGGAAGACATTTACAACCAAGTGAAACAGATCATAG  2634
            .|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2448  CACTGAGCATTTCACAGCTATTGTCCAGGGAGACACGCTGGAGGACATTTACAACCAAGTGAAACAGATCATCG  2521

Query 2635  AAGAACAATCTGGTTCTTACATCTGGGTTCCGGCAAAAGAAAAGCTA  2681
            |||||||.|||||..|||||||||||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 2522  AAGAACAGTCTGGGCCTTACATCTGGGTCCCAGCGAAAGAAAAGCTA  2568