Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14615
• Subject: XM_017005823.2
• Aligned Length: 2738
• Identities: 2323
• Gaps: 365

Alignment

Query    1  ATGCCGGTCCGGAAGCAAGATACCCAGAGAGCATTGCACCTTTTGGAGGAATATCGTTCAAAACTAAGCCAAAC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGAAGACAGACAGCTCAGAAGTTCCATAGAACGGGTTATTAACATATTTCAGAGCAACCTCTTTCAGGCTTTAA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TAGATATTCAAGAATTTTATGAAGTGACCTTACTGGATAATCCAAAATGTATAGATCGTTCAAAGCCGTCTGAA  222
                              |||||      ||||             ||.|                  ||.|||
Sbjct    1  ------------------ATGAA------TTAC-------------ATTT------------------TCGGAA  19

Query  223  CCAATTCA-ACCTGTGAATACT----TGGGAGATTTCCA----GCCTTCCAAGCTCTACTGTGACTTCAGAGAC  287
            .|||  || ||.|.|  |||||    .||.||   ||.|    ||..|.|.||||||             ||.|
Sbjct   20  ACAA--CACACTTCT--ATACTCTCGCGGCAG---TCGAGGAGGCAATACTAGCTCT-------------AGCC  73

Query  288  ACTGCCAAGCAGCCTTAGCCCTAGTGTAG-AGAAATACAGG-------------TATCAGGATGAAGATACACC  347
            |..||..|||||     ||||.|    || |||||.||.||             ..||| ||||||        
Sbjct   74  ATGGCTCAGCAG-----GCCCAA----AGCAGAAACACTGGGCAAAAAAGGGCTCGTCA-GATGAA--------  129

Query  348  TCCT-CAA---GAGCATATTTCCCCACAA--ATCACAAATGAAG-TGATAGGTCCAGAATTGGTTCATGTCTCA  414
              || |||   |||         |||.||  .||||....|.|| .|||||.|.||    |..||||   ||| 
Sbjct  130  --CTGCAAGCTGAG---------CCAGAACCTTCACGCTGGCAGCAGATAGTTGCA----TTTTTCA---CTC-  184

Query  415  GAGAAGAACTTATCAGAGATTGA--GAATGTCCATGGATTTGTTTCTCATT---------CTCATATTTCACCA  477
              |||||      ||.||.||.|  ||.||  ||          ||||..|         |||      |||| 
Sbjct  185  --GAAGA------CACAGCTTTATTGACTG--CA----------TCTCGGTAGCCACCAGCTC------CACC-  231

Query  478  ATAAAGGCAAATCCTCCCCCAGTACTGGTCAACACAGATAGCTTGAAAACACCAACTTACGTTAATGGCACAGA  551
               .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  232  ---CAGGCAAATCCTCCCCCAGTACTGGTCAACACAGATAGCTTGGAAACACCAACTTACGTTAATGGCACAGA  302

Query  552  TGCAGATTATGAATATGAAGAAATCACACTTGAAAGGGGAAATTCAGGGCTTGGTTTCAGCATTGCAG--AGTA  623
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  .|||
Sbjct  303  TGCAGATTATGAATATGAAGAAATCACACTTGAAAGGGGAAATTCAGGGCTTGGTTTCAGCATTGCAGGAGGTA  376

Query  624  CGGACAACCCACACATTGGAGATGACTCAAGTATTTTCATTACCAAAATTATCACA-GGGGAGCAGCCGCCCAA  696
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  377  CGGACAACCCACACATTGGAGATGACTCAAGTATTTTCATTACCAAAATTATCACAGGGGGAGCAGCCGCCCAA  450

Query  697  GATGGGAAGATTGCGGGTCAATGACTGTATATTACAAGTAAATGAAGTAGATGTTCGTGATGTAACACATAGCA  770
            ||| |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  451  GAT-GGAAGATTGCGGGTCAATGACTGTATATTACGAGTAAATGAAGTAGATGTTCGTGATGTAACACATAGCA  523

Query  771  AAGCAGTTGAAGCGTTGAAAGAAGCAGGGTCTATTGTACGCTTGTATGTAAAAAGAAGGAAACCAGTGTCAGAA  844
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  524  AAGCAGTTGAAGCGTTGAAAGAAGCAGGGTCTATTGTACGCTTGTATGTAAAAAGAAGGAAACCAGTGTCAGAA  597

Query  845  AAAATAATGGAAATAAAGCTCATTAAAGGTCCTAAAGGTCTTGGGTTTAGCATTGCTGGAGGTGTTGGAAATCA  918
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  598  AAAATAATGGAAATAAAGCTCATTAAAGGTCCTAAAGGTCTTGGGTTTAGCATTGCTGGAGGTGTTGGAAATCA  671

Query  919  GCATATTCCTGGGGATAATAGCATCTATGTAACCAAAATAATTGAAGGAGGTGCAGCACATAAGGATGGCAAAC  992
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  672  GCATATTCCTGGGGATAATAGCATCTATGTAACCAAAATAATTGAAGGAGGTGCAGCACATAAGGATGGCAAAC  745

Query  993  TTCAGATTGGAGATAAACTTTTAGCAGTGAATAACGTATGTTTAGAAGAAGTTACTCATGAAGAAGCAGTAACT  1066
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  746  TTCAGATTGGAGATAAACTTTTAGCAGTGAATAACGTATGTTTAGAAGAAGTTACTCATGAAGAAGCAGTAACT  819

Query 1067  GCCTTAAAGAACACATCTGATTTTGTTTATTTGAAAGTGGCAAAACCCACAAGTATGTATATGAATGATGGCTA  1140
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  820  GCCTTAAAGAACACATCTGATTTTGTTTATTTGAAAGTGGCAAAACCCACAAGTATGTATATGAATGATGGCTA  893

Query 1141  TGCACCACCTGATATCACCAACTCTTCTTCTCAGCCTGTTGATAACCATGTTAGCCCATCTTCCTTCTTGGGCC  1214
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  894  TGCACCACCTGATATCACCAACTCTTCTTCTCAGCCTGTTGATAACCATGTTAGCCCATCTTCCTTCTTGGGCC  967

Query 1215  AGACACCAGCATCTCCAGCCAGATACTCCCCAGTTTCTAAAGCAGTACTTGGAGATGATGAAATTACAAGGGAA  1288
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  968  AGACACCAGCATCTCCAGCCAGATACTCCCCAGTTTCTAAAGCAGTACTTGGAGATGATGAAATTACAAGGGAA  1041

Query 1289  CCTAGAAAAGTTGTTCTTCATCGTGGCTCAACGGGCCTTGGTTTCAACATTGTAGGAGGAGAAGATGGAGAAGG  1362
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1042  CCTAGAAAAGTTGTTCTTCATCGTGGCTCAACGGGCCTTGGTTTCAACATTGTAGGAGGAGAAGATGGAGAAGG  1115

Query 1363  AATATTTATTTCCTTTATCTTAGCCGGAGGACCTGCTGATCTAAGTGGAGAGCTCAGAAAAGGAGATCGTATTA  1436
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1116  AATATTTATTTCCTTTATCTTAGCCGGAGGACCTGCTGATCTAAGTGGAGAGCTCAGAAAAGGAGATCGTATTA  1189

Query 1437  TATCGGTAAACAGTGTTGACCTCAGAGCTGCTAGTCATGAGCAGGCAGCAGCTGCATTGAAAAATGCTGGCCAG  1510
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1190  TATCGGTAAACAGTGTTGACCTCAGAGCTGCTAGTCATGAGCAGGCAGCAGCTGCATTGAAAAATGCTGGCCAG  1263

Query 1511  GCTGTCACAATTGTTGCACAATATCGACCTGAAGAATACAGTCGTTTTGAAGCTAAAATACATGATTTACGGGA  1584
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1264  GCTGTCACAATTGTTGCACAATATCGACCTGAAGAATACAGTCGTTTTGAAGCTAAAATACATGATTTACGGGA  1337

Query 1585  GCAGATGATGAATAGTAGTATTAGTTCAGGGTCAGGTTCTCTTCGAACTAGCCAGAAGCGATCCCTCTATGTCA  1658
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1338  GCAGATGATGAATAGTAGTATTAGTTCAGGGTCAGGTTCTCTTCGAACTAGCCAGAAGCGATCCCTCTATGTCA  1411

Query 1659  GAGCCCTTTTTGATTATGACAAGACTAAAGACAGTGGGCTTCCCAGTCAGGGACTGAACTTCAAATTTGGAGAT  1732
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1412  GAGCCCTTTTTGATTATGACAAGACTAAAGACAGTGGGCTTCCCAGTCAGGGACTGAACTTCAAATTTGGAGAT  1485

Query 1733  ATCCTCCATGTTATTAATGCTTCTGATGATGAATGGTGGCAAGCCAGGCAGGTTACACCAGATGGTGAGAGCGA  1806
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1486  ATCCTCCATGTTATTAATGCTTCTGATGATGAATGGTGGCAAGCCAGGCAGGTTACACCAGATGGTGAGAGCGA  1559

Query 1807  TGAGGTCGGAGTGATTCCCAGTAAACGCAGAGTTGAGAAGAAAGAACGAGCCCGATTAAAAACAGTGAAATTCA  1880
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1560  TGAGGTCGGAGTGATTCCCAGTAAACGCAGAGTTGAGAAGAAAGAACGAGCCCGATTAAAAACAGTGAAATTCA  1633

Query 1881  ATTCTAAAACGAGAGATAAAGGGCAGTCATTCAATGACAAGCGTAAAAAGAACCTCTTTTCCCGAAAATTCCCC  1954
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1634  ATTCTAAAACGAGAGATAAAGGGCAGTCATTCAATGACAAGCGTAAAAAGAACCTCTTTTCCCGAAAATTCCCC  1707

Query 1955  TTCTACAAGAACAAGGACCAGAGTGAGCAGGAAACAAGTGATGCTCACAAGTATGTA---TATGAATGATGGCT  2025
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||   |.| ||||      
Sbjct 1708  TTCTACAAGAACAAGGACCAGAGTGAGCAGGAAACAAGTGATGCTGACCAGCATGTAACTTCT-AATG------  1774

Query 2026  ATGCACCACCTGATA----------TCACCAACTGTGGTCAAGAAGAATACGTCTTATCTTATGAACCAGTGAA  2089
                 |||.| ||||          |.|||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1775  -----CCAGC-GATAGTGAAAGTAGTTACC----GTGGTCAAGAAGAATACGTCTTATCTTATGAACCAGTGAA  1838

Query 2090  TCAACAAGAAGTTAATTATACTCGACCAGTGATCATATTGGGACCTATGAAAGACAGGATAAATGATGACTTGA  2163
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1839  TCAACAAGAAGTTAATTATACTCGACCAGTGATCATATTGGGACCTATGAAAGACAGGATAAATGATGACTTGA  1912

Query 2164  TCTCAGAATTTCCTGACAAATTTGGATCCTGTGTTCCTCATACAACTAGACCAAAACGAGATTATGAGGTAGAT  2237
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1913  TCTCAGAATTTCCTGACAAATTTGGATCCTGTGTTCCTCATACAACTAGACCAAAACGAGATTATGAGGTAGAT  1986

Query 2238  GGAAGAGATTATCATTTTGTGACTTCAAGAGAGCAGATGGAAAAAGATATCCAGGAACATAAATTCATTGAAGC  2311
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1987  GGAAGAGATTATCATTTTGTGACTTCAAGAGAGCAGATGGAAAAAGATATCCAGGAACATAAATTCATTGAAGC  2060

Query 2312  TGGCCAGTATAACAATCATCTATATGGAACAAGTGTTCAGTCTGTACGAGAAGTAGCAGAAAAGGGCAAACACT  2385
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2061  TGGCCAGTATAACAATCATCTATATGGAACAAGTGTTCAGTCTGTACGAGAAGTAGCAGAAAAGGGCAAACACT  2134

Query 2386  GTATCCTTGATGTGTCTGGAAATGCCATAAAGAGATTACAGATTGCACAGCTTTACCCTATCTCCATTTTTATT  2459
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2135  GTATCCTTGATGTGTCTGGAAATGCCATAAAGAGATTACAGATTGCACAGCTTTACCCTATCTCCATTTTTATT  2208

Query 2460  AAACCCAAATCCATGGAAAATATCATGGAAATGAATAAGCGTCTAACAGAAGAACAAGCCAGAAAAACATTTGA  2533
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2209  AAACCCAAATCCATGGAAAATATCATGGAAATGAATAAGCGTCTAACAGAAGAACAAGCCAGAAAAACATTTGA  2282

Query 2534  GAGAGCCATGAAACTGGAACAGGAGTTTACTGAACATTTCACAGCTATTGTACAGGGGGATACGCTGGAAGACA  2607
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2283  GAGAGCCATGAAACTGGAACAGGAGTTTACTGAACATTTCACAGCTATTGTACAGGGGGATACGCTGGAAGACA  2356

Query 2608  TTTACAACCAAGTGAAACAGATCATAGAAGAACAATCTGGTTCTTACATCTGGGTTCCGGCAAAAGAAAAGCTA  2681
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2357  TTTACAACCAAGTGAAACAGATCATAGAAGAACAATCTGGTTCTTACATCTGGGTTCCGGCAAAAGAAAAGCTA  2430