Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14615
- Subject:
- XM_017316865.1
- Aligned Length:
- 2800
- Identities:
- 2400
- Gaps:
- 141
Alignment
Query 1 ATGCCGGTCCGGAAGCAAGATACCCAGAGAGCATTGCACCTTTTGGAGGAATATCGTTCAAAACTAAGCCAAAC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCGGTCCGGAAGCAAGATACCCAGAGAGCATTGCATCTGTTGGAAGAATATCGATCGAAACTAAGCCAAAC 74
Query 75 TGAAGACAGACAGCTCAGAAGTTCCATAGAACGGGTTATTAACATATTTCAGAGCAACCTCTTTCAGGCTTTAA 148
||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGAAGACAGACAACTCAGAAGTTCCATAGAGCGGGTTATTAACATATTTCAGAGCAACCTCTTTCAGGCTTTAA 148
Query 149 TAGATATTCAAGAATTTTATGAAGTGACCTTACTGGATAATCCAAAATGTATAGATCGTTCAAAGCCGTCTGAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||.||||||||.||.||||
Sbjct 149 TAGATATTCAAGAATTTTATGAAGTGACCTTACTTGATAATCCAAAATGTGTGGATCATTCAAAGCAGTGTGAA 222
Query 223 CCAATTCAACCTGTGAATACTTGGGAGATTTCCAGCCTTCCAAGCTCTACTGTGACTTCAGAGACACTGCCAAG 296
|||.||||.|||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.||.|.|||||.|||||.||.|||||..|
Sbjct 223 CCAGTTCAGCCTGTGACTACTTGGGAGATTGCCAGCCTTCCAAGCACTGCCGTGACGTCAGAAACCCTGCCCGG 296
Query 297 CAGCCTTAGCCCTAGTGTAGAGAAATACAGGTATCAGGATGAAGATACACCTCCTCAAGAGCATATTTCCCCAC 370
|||||||||||||...||||||||||||.||||||||||||||||...||.|||||..|||||||||||.||||
Sbjct 297 CAGCCTTAGCCCTCCAGTAGAGAAATACCGGTATCAGGATGAAGAGGTACTTCCTCCTGAGCATATTTCTCCAC 370
Query 371 AAATCACAAATGAAGTGATAGGTCCAGAATTGGTTCATGTCTCAGAGAAGAACTTATCAGAGATTGAGAATGTC 444
||.||||||||||.|||.|||||||||||.||||.||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAGTCACAAATGAGGTGCTAGGTCCAGAACTGGTCCATGTCTCAGAGAAGAACCTGTCAGAGATTGAGAATGTC 444
Query 445 CATGGATTTGTTTCTCATTCTCATATTTCACCAATAA------------------------------------- 481
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 445 CATGGATTTGTTTCTCATTCTCATATCTCACCAATAAAGCCCACAGAAGCTGTTCCTCCCTCCTCTCCCATTGT 518
Query 482 --------------------------------------------------------------AGGCAAATCCTC 493
||||||||||||
Sbjct 519 CCCTGTGACCCCTGCCCTGCCAGTCCCTGCTGAGAGTACTGTCGTCCTGCCCTCCGCACCACAGGCAAATCCTC 592
Query 494 CCCCAGTACTGGTCAACACAGATAGCTTGAAAACACCAACTTACGTTAATGGCACAGATGCAGATTATGAATAT 567
|.|||||.||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTCCAGTGCTGGTCAACACAGACAGCTTAGAGACACCAACTTATGTTAATGGCACTGATGCAGATTATGAATAT 666
Query 568 GAAGAAATCACACTTGAAAGGGGAAATTCAGGGCTTGGTTTCAGCATTGCAG--AGTACGGACAACCCACACAT 639
||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||| .||||.||||||||||||||
Sbjct 667 GAGGAAATCACACTTGAAAGGGGAAATTCGGGTCTTGGTTTCAGCATTGCAGGAGGTACAGACAACCCACACAT 740
Query 640 TGGAGATGACTCAAGTATTTTCATTACCAAAATTATCACAGG-GGAGCAGCCGCCCAAGATGGGAAGATTGCGG 712
||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||| |||||.||.|||||.||| ||||||||||||
Sbjct 741 TGGAGATGACTCAAGTATTTTCATCACCAAAATTATCACAGGCGGAGCGGCTGCCCAGGAT-GGAAGATTGCGG 813
Query 713 GTCAATGACTGTATATTACAAGTAAATGAAGTAGATGTTCGTGATGTAACACATAGCAAAGCAGTTGAAGCGTT 786
||.||||||||||||.|...|||||||||||.|||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct 814 GTAAATGACTGTATACTGAGAGTAAATGAAGCAGACGTTCGTGATGTAACCCACAGCAAAGCAGTGGAGGCATT 887
Query 787 GAAAGAAGCAGGGTCTATTGTACGCTTGTATGTAAAAAGAAGGAAACCAGTGTCAGAAAAAATAATGGAAATAA 860
.||||||||.||.||||||||.||.||||||||.|||||..||||.||||..|||||||||||.||||||||||
Sbjct 888 AAAAGAAGCTGGATCTATTGTGCGATTGTATGTGAAAAGGCGGAAGCCAGCATCAGAAAAAATCATGGAAATAA 961
Query 861 AGCTCATTAAAGGTCCTAAAGGTCTTGGGTTTAGCATTGCTGGAGGTGTTGGAAATCAGCATATTCCTGGGGAT 934
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 962 AGCTCATTAAAGGTCCTAAAGGTCTTGGGTTCAGCATTGCTGGAGGTGTTGGAAATCAGCACATTCCTGGTGAT 1035
Query 935 AATAGCATCTATGTAACCAAAATAATTGAAGGAGGTGCAGCACATAAGGATGGCAAACTTCAGATTGGAGATAA 1008
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1036 AACAGCATCTATGTAACCAAAATAATTGAAGGAGGTGCAGCACACAAGGATGGCAAGCTTCAGATTGGAGATAA 1109
Query 1009 ACTTTTAGCAGTGAATAACGTATGTTTAGAAGAAGTTACTCATGAAGAAGCAGTAACTGCCTTAAAGAACACAT 1082
.|||.||||||||||.|..||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1110 GCTTCTAGCAGTGAACAGTGTGTGTTTAGAAGAAGTTACTCATGAAGAAGCAGTGACTGCCTTAAAGAATACAT 1183
Query 1083 CTGATTTTGTTTATTTGAAAGTGGCAAAACCCACAAGTATGTATATGAATGATGGCTATGCACCACCTGATATC 1156
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1184 CTGATTTTGTTTATTTGAAAGTGGCAAAACCAACAAGTATGTATATAAATGATGGCTATGCACCACCTGACATC 1257
Query 1157 ACCAACTCTTCTTCTCAGCCTGTTGATAACCATGTTAGCCCATCTTCCTTCTTGGGCCAGACACCAGCATCTCC 1230
||.||.|||||||||||..|||||||.||||||||.|||||.||.||||.||||||||||||.|||.|.||.||
Sbjct 1258 ACTAATTCTTCTTCTCAATCTGTTGACAACCATGTCAGCCCGTCCTCCTGCTTGGGCCAGACGCCAACGTCACC 1331
Query 1231 AGCCAGATACTC-CCCAGTTTCTAAAGCAGTACTTGGAGATGATGAAATTACAAGGGAACCTAGAAAAGTTGTT 1303
||||||.||||| |||| ||||||||||.||.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1332 AGCCAGGTACTCACCCA-TTTCTAAAGCTGTGCTCGGAGATGACGAGATCACTAGGGAACCTAGAAAAGTTGTT 1404
Query 1304 CTTCATCGTGGCTCAACGGGCCTTGGTTTCAACATTGTAGGAGGAGAAGATGGAGAAGGAATATTTATTTCCTT 1377
|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 1405 CTTCATCGTGGCTCAACAGGACTTGGTTTTAACATTGTGGGAGGTGAAGATGGAGAAGGGATTTTTATCTCCTT 1478
Query 1378 TATCTTAGCCGGAGGACCTGCTGATCTAAGTGGAGAGCTCAGAAAAGGAGATCGTATTATATCGGTAAACAGTG 1451
.|||.|.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 1479 CATCCTTGCTGGCGGACCTGCTGATCTAAGTGGAGAGCTCAGAAAAGGAGATCGCATCATATCGGTGAACAGTG 1552
Query 1452 TTGACCTCAGAGCTGCTAGTCATGAGCAGGCAGCAGCTGCATTGAAAAATGCTGGCCAGGCTGTCACAATTGTT 1525
||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||.|.||.||.||.|||||.||.|||||.||.|||
Sbjct 1553 TTGACCTCAGAGCTGCAAGTCACGAACAAGCAGCAGCTGCACTAAAGAACGCAGGCCAAGCCGTCACCATCGTT 1626
Query 1526 GCACAATATCGACCTGAAGAATACAGTCGTTTTGAAGCTAAAATACATGATTTACGGGAGCAGATGATGAATAG 1599
||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1627 GCGCAATATCGACCCGAAGAGTACAGTCGTTTTGAAGCTAAAATCCATGACTTACGGGAGCAGATGATGAATAG 1700
Query 1600 TAGTATTAGTTCAGGGTCAGGTTCTCTTCGAACTAGCCAGAAGCGATCCCTCTATGTCAGAGCCCTTTTTGATT 1673
.|||.|.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1701 CAGTGTCAGTTCAGGGTCAGGGTCTCTTCGAACCAGCCAGAAGCGCTCCCTCTATGTCAGAGCCCTCTTTGATT 1774
Query 1674 ATGACAAGACTAAAGACAGTGGGCTTCCCAGTCAGGGACTGAACTTCAAATTTGGAGATATCCTCCATGTTATT 1747
|||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||...||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 1775 ATGACAAGACTAAGGACAGCGGGCTTCCCAGTCAAGGACTGAACTTCCGCTTTGGAGACATCCTCCATGTCATC 1848
Query 1748 AATGCTTCTGATGATGAATGGTGGCAAGCCAGGCAGGTTACACCAGATGGTGAGAGCGATGAGGTCGGAGTGAT 1821
|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 1849 AATGCTTCTGACGACGAGTGGTGGCAAGCCAGGCAGGTCACCCCAGACGGGGAGAGTGACGAAGTCGGAGTGAT 1922
Query 1822 TCCCAGTAAACGCAGAGTTGAGAAGAAAGAACGAGCCCGATTAAAAACAGTGAAATTCAATTCTAAAACGA--- 1892
|||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1923 TCCTAGTAAACGAAGAGTTGAGAAGAAGGAACGAGCCCGATTAAAAACGGTCAAATTCAATTCTAAAACAAGAG 1996
Query 1893 GAGATAAAGGGCAGTCATTCAATGACAAGCGTAAAAAGAACCTCTTTTCCCGAAAATTCCCCTTCTACAAGAAC 1966
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1997 GAGATAAAGG---GTCATTCAATGACAAGCGTAAAAAGAACCTCTTTTCCCGAAAATTTCCCTTCTACAAGAAC 2067
Query 1967 AAGGACCAGAGTGAGCAGGAAACAAGTGATGCTCACAAGTATGTA---TATGAATGATGGCTATGCACCACCTG 2037
||||||||||||||.||||||||.|||||||||.||.||.|.||| |.| |||| |||.| |
Sbjct 2068 AAGGACCAGAGTGAACAGGAAACGAGTGATGCTGACCAGCACGTAACTTCT-AATG-----------CCAGC-G 2128
Query 2038 ATA----------TCACCAACTGTGGTCAAGAAGAATACGTCTTATCTTATGAACCAGTGAATCAACAAGAAGT 2101
||| |.||| ||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2129 ATAGTGAAAGTAGTTACC----GTGGTCAAGAAGAATATGTTTTATCTTATGAGCCAGTGAATCAACAAGAAGT 2198
Query 2102 TAATTATACTCGACCAGTGATCATATTGGGACCTATGAAAGACAGGATAAATGATGACTTGATCTCAGAATTTC 2175
|||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||..|||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2199 TAATTATACCCGACCAGTCATCATATTAGGACCTATGAAAGACAGAGTAAATGATGACTTAATCTCAGAATTTC 2272
Query 2176 CTGACAAATTTGGATCCTGTGTTCCTCATACAACTAGACCAAAACGAGATTATGAGGTAGATGGAAGAGATTAT 2249
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||.||||||||
Sbjct 2273 CTGACAAATTTGGATCCTGTGTCCCTCATACAACTAGACCGAAGCGTGACTATGAGGTGGATGGACGAGATTAT 2346
Query 2250 CATTTTGTGACTTCAAGAGAGCAGATGGAAAAAGATATCCAGGAACATAAATTCATTGAAGCTGGCCAGTATAA 2323
|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2347 CATTTTGTGACTTCAAGGGAACAGATGGAAAAGGATATTCAGGAGCATAAGTTCATTGAAGCCGGCCAGTATAA 2420
Query 2324 CAATCATCTATATGGAACAAGTGTTCAGTCTGTACGAGAAGTAGCAGAAAAGGGCAAACACTGTATCCTTGATG 2397
|||.|||||.|||||.||.||.||.|||||.||.||||.|||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2421 CAACCATCTGTATGGGACGAGCGTGCAGTCCGTGCGAGCAGTGGCAGAGAAGGGCAAACATTGTATCCTTGATG 2494
Query 2398 TGTCTGGAAATGCCATAAAGAGATTACAGATTGCACAGCTTTACCCTATCTCCATTTTTATTAAACCCAAATCC 2471
||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2495 TGTCTGGAAATGCCATAAAGAGGTTGCAGATTGCACAGCTTTATCCAATATCTATTTTTATTAAACCCAAATCC 2568
Query 2472 ATGGAAAATATCATGGAAATGAATAAGCGTCTAACAGAAGAACAAGCCAGAAAAACATTTGAGAGAGCCATGAA 2545
|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2569 ATGGAAAATATCATGGAAATGAACAAGCGCCTAACAGAAGAGCAGGCCAGAAAAACATTTGAGAGAGCCATGAA 2642
Query 2546 ACTGGAACAGGAGTTTACTGAACATTTCACAGCTATTGTACAGGGGGATACGCTGGAAGACATTTACAACCAAG 2619
.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2643 GCTGGAGCAGGAGTTCACTGAGCATTTCACAGCTATTGTCCAGGGAGACACGCTGGAGGACATTTACAACCAAG 2716
Query 2620 TGAAACAGATCATAGAAGAACAATCTGGTTCTTACATCTGGGTTCCGGCAAAAGAAAAGCTA 2681
|||||||||||||.||||||||.|||||..|||||||||||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 2717 TGAAACAGATCATCGAAGAACAGTCTGGGCCTTACATCTGGGTCCCAGCGAAAGAAAAGCTA 2778