Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14615
• Subject: XM_017316872.1
• Aligned Length: 2728
• Identities: 2368
• Gaps: 102

Alignment

Query    1  ATGCCGGTCCGGAAGCAAGATACCCAGAGAGCATTGCACCTTTTGGAGGAATATCGTTCAAAACTAAGCCAAAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCGGTCCGGAAGCAAGATACCCAGAGAGCATTGCATCTGTTGGAAGAATATCGATCGAAACTAAGCCAAAC  74

Query   75  TGAAGACAGACAGCTCAGAAGTTCCATAGAACGGGTTATTAACATATTTCAGAGCAACCTCTTTCAGGCTTTAA  148
            ||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGAAGACAGACAACTCAGAAGTTCCATAGAGCGGGTTATTAACATATTTCAGAGCAACCTCTTTCAGGCTTTAA  148

Query  149  TAGATATTCAAGAATTTTATGAAGTGACCTTACTGGATAATCCAAAATGTATAGATCGTTCAAAGCCGTCTGAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||.||||||||.||.||||
Sbjct  149  TAGATATTCAAGAATTTTATGAAGTGACCTTACTTGATAATCCAAAATGTGTGGATCATTCAAAGCAGTGTGAA  222

Query  223  CCAATTCAACCTGTGAATACTTGGGAGATTTCCAGCCTTCCAAGCTCTACTGTGACTTCAGAGACACTGCCAAG  296
            |||.||||.|||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.||.|.|||||.|||||.||.|||||..|
Sbjct  223  CCAGTTCAGCCTGTGACTACTTGGGAGATTGCCAGCCTTCCAAGCACTGCCGTGACGTCAGAAACCCTGCCCGG  296

Query  297  CAGCCTTAGCCCTAGTGTAGAGAAATACAGGTATCAGGATGAAGATACACCTCCTCAAGAGCATATTTCCCCAC  370
            |||||||||||||...||||||||||||.||||||||||||||||...||.|||||..|||||||||||.||||
Sbjct  297  CAGCCTTAGCCCTCCAGTAGAGAAATACCGGTATCAGGATGAAGAGGTACTTCCTCCTGAGCATATTTCTCCAC  370

Query  371  AAATCACAAATGAAGTGATAGGTCCAGAATTGGTTCATGTCTCAGAGAAGAACTTATCAGAGATTGAGAATGTC  444
            ||.||||||||||.|||.|||||||||||.||||.||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGTCACAAATGAGGTGCTAGGTCCAGAACTGGTCCATGTCTCAGAGAAGAACCTGTCAGAGATTGAGAATGTC  444

Query  445  CATGGATTTGTTTCTCATTCTCATATTTCACCAATAAAGGCAAATCCTCCCCCAGTACTGGTCAACACAGATAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct  445  CATGGATTTGTTTCTCATTCTCATATCTCACCAATAAAGGCAAATCCTCCTCCAGTGCTGGTCAACACAGACAG  518

Query  519  CTTGAAAACACCAACTTACGTTAATGGCACAGATGCAGATTATGAATATGAAGAAATCACACTTGAAAGGGGAA  592
            |||..|.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTAGAGACACCAACTTATGTTAATGGCACTGATGCAGATTATGAATATGAGGAAATCACACTTGAAAGGGGAA  592

Query  593  ATTCAGGGCTTGGTTTCAGCATTGCAG--AGTACGGACAACCCACACATTGGAGATGACTCAAGTATTTTCATT  664
            ||||.||.|||||||||||||||||||  .||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  593  ATTCGGGTCTTGGTTTCAGCATTGCAGGAGGTACAGACAACCCACACATTGGAGATGACTCAAGTATTTTCATC  666

Query  665  ACCAAAATTATCACAGG-GGAGCAGCCGCCCAAGATGGGAAGATTGCGGGTCAATGACTGTATATTACAAGTAA  737
            ||||||||||||||||| |||||.||.|||||.||| ||||||||||||||.||||||||||||.|...|||||
Sbjct  667  ACCAAAATTATCACAGGCGGAGCGGCTGCCCAGGAT-GGAAGATTGCGGGTAAATGACTGTATACTGAGAGTAA  739

Query  738  ATGAAGTAGATGTTCGTGATGTAACACATAGCAAAGCAGTTGAAGCGTTGAAAGAAGCAGGGTCTATTGTACGC  811
            ||||||.|||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||.||||||||.||.
Sbjct  740  ATGAAGCAGACGTTCGTGATGTAACCCACAGCAAAGCAGTGGAGGCATTAAAAGAAGCTGGATCTATTGTGCGA  813

Query  812  TTGTATGTAAAAAGAAGGAAACCAGTGTCAGAAAAAATAATGGAAATAAAGCTCATTAAAGGTCCTAAAGGTCT  885
            ||||||||.|||||..||||.||||..|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  TTGTATGTGAAAAGGCGGAAGCCAGCATCAGAAAAAATCATGGAAATAAAGCTCATTAAAGGTCCTAAAGGTCT  887

Query  886  TGGGTTTAGCATTGCTGGAGGTGTTGGAAATCAGCATATTCCTGGGGATAATAGCATCTATGTAACCAAAATAA  959
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  TGGGTTCAGCATTGCTGGAGGTGTTGGAAATCAGCACATTCCTGGTGATAACAGCATCTATGTAACCAAAATAA  961

Query  960  TTGAAGGAGGTGCAGCACATAAGGATGGCAAACTTCAGATTGGAGATAAACTTTTAGCAGTGAATAACGTATGT  1033
            |||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||.|..||.|||
Sbjct  962  TTGAAGGAGGTGCAGCACACAAGGATGGCAAGCTTCAGATTGGAGATAAGCTTCTAGCAGTGAACAGTGTGTGT  1035

Query 1034  TTAGAAGAAGTTACTCATGAAGAAGCAGTAACTGCCTTAAAGAACACATCTGATTTTGTTTATTTGAAAGTGGC  1107
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  TTAGAAGAAGTTACTCATGAAGAAGCAGTGACTGCCTTAAAGAATACATCTGATTTTGTTTATTTGAAAGTGGC  1109

Query 1108  AAAACCCACAAGTATGTATATGAATGATGGCTATGCACCACCTGATATCACCAACTCTTCTTCTCAGCCTGTTG  1181
            ||||||.||||                                             ||||||||||..||||||
Sbjct 1110  AAAACCAACAA---------------------------------------------CTTCTTCTCAATCTGTTG  1138

Query 1182  ATAACCATGTTAGCCCATCTTCCTTCTTGGGCCAGACACCAGCATCTCCAGCCAGATACTC-CCCAGTTTCTAA  1254
            |.||||||||.|||||.||.||||.||||||||||||.|||.|.||.||||||||.||||| |||| |||||||
Sbjct 1139  ACAACCATGTCAGCCCGTCCTCCTGCTTGGGCCAGACGCCAACGTCACCAGCCAGGTACTCACCCA-TTTCTAA  1211

Query 1255  AGCAGTACTTGGAGATGATGAAATTACAAGGGAACCTAGAAAAGTTGTTCTTCATCGTGGCTCAACGGGCCTTG  1328
            |||.||.||.||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1212  AGCTGTGCTCGGAGATGACGAGATCACTAGGGAACCTAGAAAAGTTGTTCTTCATCGTGGCTCAACAGGACTTG  1285

Query 1329  GTTTCAACATTGTAGGAGGAGAAGATGGAGAAGGAATATTTATTTCCTTTATCTTAGCCGGAGGACCTGCTGAT  1402
            ||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||.|.||.||.||||||||||||
Sbjct 1286  GTTTTAACATTGTGGGAGGTGAAGATGGAGAAGGGATTTTTATCTCCTTCATCCTTGCTGGCGGACCTGCTGAT  1359

Query 1403  CTAAGTGGAGAGCTCAGAAAAGGAGATCGTATTATATCGGTAAACAGTGTTGACCTCAGAGCTGCTAGTCATGA  1476
            |||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1360  CTAAGTGGAGAGCTCAGAAAAGGAGATCGCATCATATCGGTGAACAGTGTTGACCTCAGAGCTGCAAGTCACGA  1433

Query 1477  GCAGGCAGCAGCTGCATTGAAAAATGCTGGCCAGGCTGTCACAATTGTTGCACAATATCGACCTGAAGAATACA  1550
            .||.||||||||||||.|.||.||.||.|||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1434  ACAAGCAGCAGCTGCACTAAAGAACGCAGGCCAAGCCGTCACCATCGTTGCGCAATATCGACCCGAAGAGTACA  1507

Query 1551  GTCGTTTTGAAGCTAAAATACATGATTTACGGGAGCAGATGATGAATAGTAGTATTAGTTCAGGGTCAGGTTCT  1624
            |||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||.|||
Sbjct 1508  GTCGTTTTGAAGCTAAAATCCATGACTTACGGGAGCAGATGATGAATAGCAGTGTCAGTTCAGGGTCAGGGTCT  1581

Query 1625  CTTCGAACTAGCCAGAAGCGATCCCTCTATGTCAGAGCCCTTTTTGATTATGACAAGACTAAAGACAGTGGGCT  1698
            ||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1582  CTTCGAACCAGCCAGAAGCGCTCCCTCTATGTCAGAGCCCTCTTTGATTATGACAAGACTAAGGACAGCGGGCT  1655

Query 1699  TCCCAGTCAGGGACTGAACTTCAAATTTGGAGATATCCTCCATGTTATTAATGCTTCTGATGATGAATGGTGGC  1772
            |||||||||.||||||||||||...||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 1656  TCCCAGTCAAGGACTGAACTTCCGCTTTGGAGACATCCTCCATGTCATCAATGCTTCTGACGACGAGTGGTGGC  1729

Query 1773  AAGCCAGGCAGGTTACACCAGATGGTGAGAGCGATGAGGTCGGAGTGATTCCCAGTAAACGCAGAGTTGAGAAG  1846
            |||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1730  AAGCCAGGCAGGTCACCCCAGACGGGGAGAGTGACGAAGTCGGAGTGATTCCTAGTAAACGAAGAGTTGAGAAG  1803

Query 1847  AAAGAACGAGCCCGATTAAAAACAGTGAAATTCAATTCTAAAACGA---GAGATAAAGGGCAGTCATTCAATGA  1917
            ||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|   |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1804  AAGGAACGAGCCCGATTAAAAACGGTCAAATTCAATTCTAAAACAAGAGGAGATAAAGGGCAGTCATTCAATGA  1877

Query 1918  CAAGCGTAAAAAGAACCTCTTTTCCCGAAAATTCCCCTTCTACAAGAACAAGGACCAGAGTGAGCAGGAAACAA  1991
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1878  CAAGCGTAAAAAGAACCTCTTTTCCCGAAAATTTCCCTTCTACAAGAACAAGGACCAGAGTGAACAGGAAACGA  1951

Query 1992  GTGATGCTCACAAGTATGTA-----TA-------------TGAA----------------TGATGGCTATGCAC  2031
            ||||||||.||.||.|.|||     ||             ||||                ||||   ||     
Sbjct 1952  GTGATGCTGACCAGCACGTAACTTCTAATGCCAGCGATAGTGAAAGTAGTTACCTAATCTTGAT---TA-----  2017

Query 2032  CACCTG-ATAT-----CACCAACTGTGGTCAAGAAGAATACGTCTTATCTTATGAACCAGTGAATCAACAAGAA  2099
            ||..|| ||||     |.|.||..||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 2018  CAGATGAATATGGCTGCTCAAAAGGTGGTCAAGAAGAATATGTTTTATCTTATGAGCCAGTGAATCAACAAGAA  2091

Query 2100  GTTAATTATACTCGACCAGTGATCATATTGGGACCTATGAAAGACAGGATAAATGATGACTTGATCTCAGAATT  2173
            |||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||..|||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2092  GTTAATTATACCCGACCAGTCATCATATTAGGACCTATGAAAGACAGAGTAAATGATGACTTAATCTCAGAATT  2165

Query 2174  TCCTGACAAATTTGGATCCTGTGTTCCTCATACAACTAGACCAAAACGAGATTATGAGGTAGATGGAAGAGATT  2247
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||.||||||
Sbjct 2166  TCCTGACAAATTTGGATCCTGTGTCCCTCATACAACTAGACCGAAGCGTGACTATGAGGTGGATGGACGAGATT  2239

Query 2248  ATCATTTTGTGACTTCAAGAGAGCAGATGGAAAAAGATATCCAGGAACATAAATTCATTGAAGCTGGCCAGTAT  2321
            |||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 2240  ATCATTTTGTGACTTCAAGGGAACAGATGGAAAAGGATATTCAGGAGCATAAGTTCATTGAAGCCGGCCAGTAT  2313

Query 2322  AACAATCATCTATATGGAACAAGTGTTCAGTCTGTACGAGAAGTAGCAGAAAAGGGCAAACACTGTATCCTTGA  2395
            |||||.|||||.|||||.||.||.||.|||||.||.||||.|||.|||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2314  AACAACCATCTGTATGGGACGAGCGTGCAGTCCGTGCGAGCAGTGGCAGAGAAGGGCAAACATTGTATCCTTGA  2387

Query 2396  TGTGTCTGGAAATGCCATAAAGAGATTACAGATTGCACAGCTTTACCCTATCTCCATTTTTATTAAACCCAAAT  2469
            ||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2388  TGTGTCTGGAAATGCCATAAAGAGGTTGCAGATTGCACAGCTTTATCCAATATCTATTTTTATTAAACCCAAAT  2461

Query 2470  CCATGGAAAATATCATGGAAATGAATAAGCGTCTAACAGAAGAACAAGCCAGAAAAACATTTGAGAGAGCCATG  2543
            |||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2462  CCATGGAAAATATCATGGAAATGAACAAGCGCCTAACAGAAGAGCAGGCCAGAAAAACATTTGAGAGAGCCATG  2535

Query 2544  AAACTGGAACAGGAGTTTACTGAACATTTCACAGCTATTGTACAGGGGGATACGCTGGAAGACATTTACAACCA  2617
            ||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2536  AAGCTGGAGCAGGAGTTCACTGAGCATTTCACAGCTATTGTCCAGGGAGACACGCTGGAGGACATTTACAACCA  2609

Query 2618  AGTGAAACAGATCATAGAAGAACAATCTGGTTCTTACATCTGGGTTCCGGCAAAAGAAAAGCTA  2681
            |||||||||||||||.||||||||.|||||..|||||||||||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 2610  AGTGAAACAGATCATCGAAGAACAGTCTGGGCCTTACATCTGGGTCCCAGCGAAAGAAAAGCTA  2673