Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14621
• Subject: NM_001347722.2
• Aligned Length: 2275
• Identities: 2232
• Gaps: 16

Alignment

Query    1  ATGCATACAGGAGGAGAGACTTCAGCATGCAAACCTTCATCTGTTCGGCTTGCACCGTCATTTTCATTCCATGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCATACAGGAGGAGAGACTTCAGCATGCAAACCTTCATCTGTTCGGCTTGCACCGTCATTTTCATTCCATGC  74

Query   75  TGCTGGCCTTCAGATGGCTGGACAGATGCCCCATTCACATCAGTACAGTGACCGTCGCCAGCCAAACATAAGTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGCTGGCCTTCAGATGGCTGGACAGATGCCCCATTCACATCAGTACAGTGACCGTCGCCAGCCAAACATAAGTG  148

Query  149  ACCAACAGGTTTCTGCCTTATCATATTCTGACCAGATTCAGCAACCTCTAACTAACCAGAGGCGGATGCCCCAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACCAACAGGTTTCTGCCTTATCATATTCTGACCAGATTCAGCAACCTCTAACTAACCAGAGGCGGATGCCCCAA  222

Query  223  ACCTTCCGTGACCCAGCAACTGCTCCCCTGAGAAAACTTTCTGTTGACTTGATCAAAACATACAAGCATATTAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACCTTCCGTGACCCAGCAACTGCTCCCCTGAGAAAACTTTCTGTTGACTTGATCAAAACATACAAGCATATTAA  296

Query  297  TGAGGTTTACTATGCAAAAAAGAAGCGAAGACACCAACAGGGCCAGGGAGACGATTCTAGTCATAAGAAGGAAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAGGTTTACTATGCAAAAAAGAAGCGAAGACACCAACAGGGCCAGGGAGACGATTCTAGTCATAAGAAGGAAC  370

Query  371  GGAAGGTTTACAATGATGGTTATGATGATGATAACTATGATTATATTGTAAAAAACGGAGAAAAGTGGATGGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGAAGGTTTACAATGATGGTTATGATGATGATAACTATGATTATATTGTAAAAAACGGAGAAAAGTGGATGGAT  444

Query  445  CGTTACGAAATTGACTCCTTGATAGGCAAAGGTTCCTTTGGACAGGTTGTAAAGGCATATGATCGTGTGGAGCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGTTACGAAATTGACTCCTTGATAGGCAAAGGTTCCTTTGGACAGGTTGTAAAGGCATATGATCGTGTGGAGCA  518

Query  519  AGAATGGGTTGCCATTAAAATAATAAAGAACAAGAAAGCTTTTCTGAATCAAGCACAGATAGAAGTGCGACTTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGAATGGGTTGCCATTAAAATAATAAAGAACAAGAAGGCTTTTCTGAATCAAGCACAGATAGAAGTGCGACTTC  592

Query  593  TTGAGCTCATGAACAAACATGACACTGAAATGAAATACTACATAGTGCATTTGAAACGCCACTTTATGTTTCGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTGAGCTCATGAACAAACATGACACTGAAATGAAATACTACATAGTGCATTTGAAACGCCACTTTATGTTTCGA  666

Query  667  AACCATCTCTGTTTAGTTTTTGAAATGCTGTCCTACAACCTCTATGACTTGCTGAGAAAACACCAATTTCCGAG  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  667  AACCATCTCTGTTTAGTTTTTGAAATGCTGTCCTACAACCTCTATGACTTGCTGAG-AAACACCAATTTCCGAG  739

Query  741  GGGTCTCTTTGAACCTAACACGAAAGTTTGCGCAACAGATGTGCACTGCACTGCTTTTCCTTGCGACTCCAGAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  GGGTCTCTTTGAACCTAACACGAAAGTTTGCGCAACAGATGTGCACTGCACTGCTTTTCCTTGCGACTCCAGAA  813

Query  815  CTTAGTATCATTCACTGTGATCTAAAACCTGAAAATATCCTTCTTTGTAACCCCAAACGCAGTGCAATCAAGAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  CTTAGTATCATTCACTGTGATCTAAAACCTGAAAATATCCTTCTTTGTAACCCCAAACGCAGTGCAATCAAGAT  887

Query  889  AGTTGACTTTGGCAGTTCTTGTCAGTTGGGGCAGAGGATATACCAGTATATTCAGAGTCGCTTTTATCGGTCTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  AGTTGACTTTGGCAGTTCTTGTCAGTTGGGGCAGAGGATATACCAGTATATTCAGAGTCGCTTTTATCGGTCTC  961

Query  963  CAGAGGTGCTACTGGGAATGCCTTATGACCTTGCCATTGATATGTGGTCCCTCGGGTGTATTTTGGTTGAAATG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  CAGAGGTGCTACTGGGAATGCCTTATGACCTTGCCATTGATATGTGGTCCCTCGGGTGTATTTTGGTTGAAATG  1035

Query 1037  CACACTGGAGAACCTCTGTTCAGTGGTGCCAATGAGGTAGATCAGATGAATAAAATAGTGGAAGTTCTGGGTAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  CACACTGGAGAACCTCTGTTCAGTGGTGCCAATGAGGTAGATCAGATGAATAAAATAGTGGAAGTTCTGGGTAT  1109

Query 1111  TCCACCTGCTCATATTCTTGACCAAGCACCAAAAGCAAGAAAGTTCTTTGAGAAGTTGCCAGATGGCACTTGGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  TCCACCTGCTCATATTCTTGACCAAGCACCAAAAGCAAGAAAGTTCTTTGAGAAGTTGCCAGATGGCACTTGGA  1183

Query 1185  ACTTAAAGAAGACCAAAGATGGAAAACGGGAGTACAAACCACCAGGAACCCGTAAACTTCATAACATTCTTGGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  ACTTAAAGAAGACCAAAGATGGAAAACGGGAGTACAAACCACCAGGAACCCGTAAACTTCATAACATTCTTGGA  1257

Query 1259  GTGGAAACAGGAGGACCTGGTGGGCGACGTGCTGGGGAGTCAGGTCATACGGTCGCTGACTACTTGAAGTTCAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258  GTGGAAACAGGAGGACCTGGTGGGCGACGTGCTGGGGAGTCAGGTCATACGGTCGCTGACTACTTGAAGTTCAA  1331

Query 1333  AGACCTCATTTTAAGGATGCTTGATTATGACCCCAAAACTCGAATTCAACCTTATTATGCTCTGCAGCACAGTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332  AGACCTCATTTTAAGGATGCTTGATTATGACCCCAAAACTCGAATTCAACCTTATTATGCTCTGCAGCACAGTT  1405

Query 1407  TCTTCAAGAAAACAGCTGATGAAGGTACAAATACAAGTAATAGTGTATCTACAAGCCCCGCCATGGAGCAGTCT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406  TCTTCAAGAAAACAGCTGATGAAGGTACAAATACAAGTAATAGTGTATCTACAAGCCCCGCCATGGAGCAGTCT  1479

Query 1481  CAGTCTTCGGGCACCACCTCCAGTACATCGTCAAGCTTCATGATCACTCATCAGGTGTCAAGACATCAGTTGGA  1554
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |.|..|||||| ||.|.|||| ||.||||.|||
Sbjct 1480  CAGTCTTCGGGCACCACCTCCAGTACATCGTCAAGC-TCA-GGTGGCTCATC-GGGGACAAG-CAACAGTGGGA  1549

Query 1555  GGAGCACGGTCGGATCAGGACGCACCAGCATCGGCACATTGGCGGGCATTATCTT--CAACTGCTGTGTCATGT  1626
             ||||.|||||||||| .||||||||||||||||||||.|||.|||||    |||  ||.||||.||| ||.|.
Sbjct 1550  -GAGCCCGGTCGGATC-CGACGCACCAGCATCGGCACAGTGGTGGGCA----CTTCACAGCTGCCGTG-CAGGC  1616

Query 1627  CATGGACTGCGAGACACACAGTCCGGCAGGTGCGTCAGCAATTTCCTGCTCGTCTTGGTGGATCAGGCACTGAA  1700
            |||||||||||||||||||||||| .|||||||||||||||||||||||||.|||||||.|.||||||||||||
Sbjct 1617  CATGGACTGCGAGACACACAGTCC-CCAGGTGCGTCAGCAATTTCCTGCTCCTCTTGGTTGGTCAGGCACTGAA  1689

Query 1701  GCTCCTACACAGGTCAGTGATGAAACTCATCCT-CTCAAGAAACAACCATTCATGTAGCCCCTCAACAGAATGC  1773
            ||||||||||||||||.||.||||||||||||| .|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1690  GCTCCTACACAGGTCACTGTTGAAACTCATCCTGTTCAAGAAACAACCTTTCATGTAGCCCCTCAACAGAATGC  1763

Query 1774  ATCAAATCATCACCATGGTAACAGTTCCCATCACCATCACCACCACCACCACCATCACCACCACCATGGACAAC  1847
            ||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1764  ATTGCATCATCACCATGGTAACAGTTCCCATCACCATCACCACCACCACCACCATCACCACCACCATGGACAAC  1837

Query 1848  AAGCCTTGGGTAACCGGACCAGGCCAAGGGTCTACAATTCTCCAACGAATAGCTCCTCTACCCAAGATTCTATG  1921
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1838  AAGCCTTGGGTAACCGGACCAGGCCAAGGGTCTACAATTCTCCAACGAATAGCTCCTCTACCCAAGATTCTATG  1911

Query 1922  GAGGTTGGCCACAGTCACCACTCCATGACATCCCTGTCTTCCTCAACGACTTCTTCCTCGACATCTTCCTCCTC  1995
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1912  GAGGTTGGCCACAGTCACCACTCCATGACATCCCTGTCTTCCTCAACGACTTCTTCCTCGACATCTTCCTCCTC  1985

Query 1996  TACTGGTAACCAAGGCAATCAGGCCTACCAGAATCGCCCAGTGGCTGCTAATACCTTGGACTTTGGACAGAATG  2069
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1986  TACTGGTAACCAAGGCAATCAGGCCTACCAGAATCGCCCAGTGGCTGCTAATACCTTGGACTTTGGACAGAATG  2059

Query 2070  GAGCTATGGACGTTAATTTGACCGTCTACTCCAATCCCCGCCAAGAGACTGGCATAGCTGGACATCCAACATAC  2143
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2060  GAGCTATGGACGTTAATTTGACCGTCTACTCCAATCCCCGCCAAGAGACTGGCATAGCTGGACATCCAACATAC  2133

Query 2144  CAATTTTCTGCTAATACAGGTCCTGCACATTACATGACTGAAGGACATCTGACAATGAGGCAAGGGGCTGATAG  2217
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2134  CAATTTTCTGCTAATACAGGTCCTGCACATTACATGACTGAAGGACATCTGACAATGAGGCAAGGGGCTGATAG  2207

Query 2218  AGAAGAGTCCCCCATGACAGGAGTTTGTGTGCAACAGAGTCCTGTAGCTAGCTCG  2272
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2208  AGAAGAGTCCCCCATGACAGGAGTTTGTGTGCAACAGAGTCCTGTAGCTAGCTCG  2262