Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14621
- Subject:
- NM_007890.2
- Aligned Length:
- 2313
- Identities:
- 2100
- Gaps:
- 65
Alignment
Query 1 ATGCATACAGGAGGAGAGACTTCAGCATGCAAACCTTCATCTGTTCGGCTTGCACCGTCATTTTCATTCCATGC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1 ATGCATACAGGAGGAGAGACTTCAGCATGCAAACCTTCATCTGTCCGGCTTGCACCGTCGTTCTCATTCCATGC 74
Query 75 TGCTGGCCTTCAGATGGCTGGACAGATGCCCCATTCACATCAGTACAGTGACCGTCGCCAGCCAAACATAAGTG 148
||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|.||||||||
Sbjct 75 TGCTGGCCTTCAGATGGCTGCACAGATGCCCCACTCACACCAGTACAGTGACCGTCGCCAGCCGAGCATAAGTG 148
Query 149 ACCAACAGGTTTCTGCCTTATCATATTCTGACCAGATTCAGCAACCTCTAACTAAC------------------ 204
||||.|||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACCAGCAGGTGTCTGCCTTACCATATTCTGACCAGATTCAGCAACCTCTAACTAACCAGGTGATGCCTGACATT 222
Query 205 ---------CAGAGGCGGATGCCCCAAACCTTCCGTGACCCAGCAACTGCTCCCCTGAGAAAACTTTCTGTTGA 269
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 223 GTCATGTTACAGAGGCGGATGCCCCAAACCTTCCGTGATCCAGCAACTGCTCCTCTGAGAAAACTCTCTGTGGA 296
Query 270 CTTGATCAAAACATACAAGCATATTAATGAGGTTTACTATGCAAAAAAGAAGCGAAGACACCAACAGGGCCAGG 343
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTTGATCAAAACATACAAGCATATTAATGAGGTTTACTATGCAAAAAAGAAGCGAAGACACCAACAGGGCCAGG 370
Query 344 GAGACGATTCTAGTCATAAGAAGGAACGGAAGGTTTACAATGATGGTTATGATGATGATAACTATGATTATATT 417
|.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGGACGATTCCAGTCATAAGAAGGAGCGGAAGGTTTACAATGATGGTTACGATGATGATAACTATGATTATATT 444
Query 418 GTAAAAAACGGAGAAAAGTGGATGGATCGTTACGAAATTGACTCCTTGATAGGCAAAGGTTCCTTTGGACAGGT 491
|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 445 GTAAAAAACGGGGAAAAGTGGATGGATCGGTATGAAATCGACTCCTTAATAGGCAAAGGTTCATTTGGACAGGT 518
Query 492 TGTAAAGGCATATGATCGTGTGGAGCAAGAATGGGTTGCCATTAAAATAATAAAGAACAAGAAAGCTTTTCTGA 565
|||.||.||.|||||..|.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 519 TGTGAAAGCTTATGACAGAGTGGAGCAAGAATGGGTCGCCATTAAAATCATCAAGAACAAGAAAGCGTTTCTGA 592
Query 566 ATCAAGCACAGATAGAAGTGCGACTTCTTGAGCTCATGAACAAACATGACACTGAAATGAAATACTACATAGTG 639
|||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 593 ATCAAGCCCAGATAGAAGTGCGGCTGCTTGAGCTCATGAACAAACACGACACTGAAATGAAGTACTACATAGTG 666
Query 640 CATTTGAAACGCCACTTTATGTTTCGAAACCATCTCTGTTTAGTTTTTGAAATGCTGTCCTACAACCTCTATGA 713
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 667 CATTTGAAACGCCACTTTATGTTTCGAAACCATCTCTGTTTAGTGTTTGAAATGCTGTCCTATAATCTCTATGA 740
Query 714 CTTGCTGAGAAAACACCAATTTCCGAGGGGTCTCTTTGAACCTAACACGAAAGTTTGCGCAACAGATGTGCACT 787
.|||.|||| |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 741 TTTGTTGAG-AAACACCAACTTCCGAGGGGTCTCTTTGAACCTAACACGAAAGTTTGCGCAACAGATGTGCACA 813
Query 788 GCACTGCTTTTCCTTGCGACTCCAGAACTTAGTATCATTCACTGTGATCTAAAACCTGAAAATATCCTTCTTTG 861
|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.|||||.||.||||||||.||
Sbjct 814 GCATTGCTTTTTCTTGCGACTCCAGAACTTAGTATCATTCACTGTGACTTAAAGCCTGAGAACATCCTTCTGTG 887
Query 862 TAACCCCAAACGCAGTGCAATCAAGATAGTTGACTTTGGCAGTTCTTGTCAGTTGGGGCAGAGGATATACCAGT 935
||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 TAACCCCAAACGGAGTGCAATCAAGATTGTTGATTTTGGCAGCTCTTGTCAGTTGGGGCAGAGGATATACCAGT 961
Query 936 ATATTCAGAGTCGCTTTTATCGGTCTCCAGAGGTGCTACTGGGAATGCCTTATGACCTTGCCATTGATATGTGG 1009
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 962 ATATTCAGAGTCGCTTTTATCGGTCTCCAGAGGTGCTACTGGGAATGCCTTATGACCTTGCTATCGACATGTGG 1035
Query 1010 TCCCTCGGGTGTATTTTGGTTGAAATGCACACTGGAGAACCTCTGTTCAGTGGTGCCAATGAGGTAGATCAGAT 1083
|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1036 TCCCTTGGATGTATCTTGGTTGAAATGCACACTGGAGAGCCTCTGTTCAGTGGTGCCAATGAGGTCGATCAGAT 1109
Query 1084 GAATAAAATAGTGGAAGTTCTGGGTATTCCACCTGCTCATATTCTTGACCAAGCACCAAAAGCAAGAAAGTTCT 1157
||||||||||||||||||..||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1110 GAATAAAATAGTGGAAGTCTTGGGCATCCCACCTGCTCATATTCTTGACCAAGCACCGAAAGCAAGAAAGTTCT 1183
Query 1158 TTGAGAAGTTGCCAGATGGCACTTGGAACTTAAAGAAGACCAAAGATGGAAAACGGGAGTACAAACCACCAGGA 1231
|||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 TTGAGAAGTTGCCCGATGGCACTTGGAGCTTAAAGAAGACCAAAGATGGAAAACGGGAGTACAAACCACCAGGA 1257
Query 1232 ACCCGTAAACTTCATAACATTCTTGGAGTGGAAACAGGAGGACCTGGTGGGCGACGTGCTGGGGAGTCAGGTCA 1305
|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 1258 ACCCGTAAACTTCATAATATTCTTGGAGTAGAAACAGGAGGACCTGGCGGGCGGCGTGCTGGGGAATCGGGTCA 1331
Query 1306 TACGGTCGCTGACTACTTGAAGTTCAAAGACCTCATTTTAAGGATGCTTGATTATGACCCCAAAACTCGAATTC 1379
|||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1332 TACTGTAGCTGACTACTTGAAGTTCAAAGACCTCATTTTAAGGATGCTTGATTATGACCCCAAAACTCGGATTC 1405
Query 1380 AACCTTATTATGCTCTGCAGCACAGTTTCTTCAAGAAAACAGCTGATGAAGGTACAAATACAAGTAATAGTGTA 1453
|||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.
Sbjct 1406 AACCTTATTATGCCCTGCAGCACAGTTTTTTCAAGAAAACAGCTGATGAAGGTACCAACACAAGTAACAGTGTG 1479
Query 1454 TCTACAAGCCCCGCCATGGAGCAGTCTCAGTCTTCGGGCACCACCTCCAGTACATCGTCAAGCTTCATGATCAC 1527
|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.|||
Sbjct 1480 TCTACCAGCCCTGCGATGGAGCAGTCTCAGTCTTCAGGCACCACCTCCAGCACCTCCTCCAGC----------- 1542
Query 1528 TCATCAGGTG-----TCAAGA-----CATCAGTTGGAGGAGCACGGTCGGATCAGGACGCACCAGCATCGGCAC 1591
||||||| ||..|| .|.||||.||| ||||..||||||||| .|||||||||||||||.|||
Sbjct 1543 ---TCAGGTGGATCCTCGGGAACGAGTAACAGTGGGA-GAGCCAGGTCGGATC-CGACGCACCAGCATCGACAC 1611
Query 1592 ATTGGCGGGCATTATCTTCAACTGCTG-TGT-CATGTCATGGACTGCGAGACACACAGTCCGGCAGGTGCGTCA 1663
|..||.||.|| |||| .|||||| ||| ||.|.|||||||||.|||||||||||||| .||||||||.||
Sbjct 1612 AGCGGTGGACA----CTTC-GCTGCTGCTGTCCAGGCCATGGACTGTGAGACACACAGTCC-CCAGGTGCGCCA 1679
Query 1664 GCAATTTCCTGCTCGTCTTGG-TGGATCAGGCACTGAAGCTCCTACACAGGTCAGTGATGAAACTCATCCT-CT 1735
|||.|||||.||||.|||.|| ||| |||||||||||||||||||||||.||||.||.||||||||||||| .|
Sbjct 1680 GCAGTTTCCGGCTCCTCTGGGATGG-TCAGGCACTGAAGCTCCTACACAAGTCACTGTTGAAACTCATCCTGTT 1752
Query 1736 CAAGAAACAACCATTCATGTAGCCCCTCAACAGAATGCATCAAATCATCACCATGGTAACAGTTCCCATCACCA 1809
|||||.||||||.|||||||||||||.||.|||||.||||...|||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1753 CAAGAGACAACCTTTCATGTAGCCCCCCAGCAGAACGCATTGCATCATCACCATGGAAACAGTTCCCATCACCA 1826
Query 1810 TCACCACCACCACCACCATCACCACCACCATGGACAACAAGCCTTGGGTAACCGGACCAGGCCAAGGGTCTACA 1883
.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1827 CCACCACCACCATCACCACCACCACCACCATGGACAGCAAGCCTTGGGTAACCGGACCAGGCCAAGGGTCTACA 1900
Query 1884 ATTCTCCAACGAATAGCTCCTCTACCCAAGATTCTATGGAGGTTGGCCACAGTCACCACTCCATGACATCCCTG 1957
||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1901 ATTCTCCAACAAATAGCTCCTCTACCCAGGATTCTATGGAGGTTGGCCACAGTCACCACTCCATGACATCCCTG 1974
Query 1958 TCTTCCTCAACGACTTCTTCCTCGACATCTTCCTCCTCTACTGGTAACCAAGGCAATCAGGCCTACCAGAATCG 2031
|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1975 TCTTCCTCAACAACTTCTTCCTCGACATCTTCCTCCTCTACTGGTAATCAAGGCAATCAGGCCTATCAGAACCG 2048
Query 2032 CCCAGTGGCTGCTAATACCTTGGACTTTGGACAGAATGGAGCTATGGACGTTAATTTGACCGTCTACTCCAATC 2105
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2049 CCCAGTGGCTGCTAACACCTTGGACTTTGGACAGAATGGAGCTATGGACGTTAATTTGACCGTCTACTCCAATC 2122
Query 2106 CCCGCCAAGAGACTGGCATAGCTGGACATCCAACATACCAATTTTCTGCTAATACAGGTCCTGCACATTACATG 2179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2123 CCCGCCAAGAGACTGGCATAGCTGGACATCCAACATACCAATTTTCTGCTAATACAGGTCCTGCACATTACATG 2196
Query 2180 ACTGAAGGACATCTGACAATGAGGCAAGGGGCTGATAGAGAAGAGTCCCCCATGACAGGAGTTTGTGTGCAACA 2253
|||||||||||||||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2197 ACTGAAGGACATCTGGCGATGAGACAAGGGGCTGATAGAGAAGAGTCTCCCATGACAGGAGTTTGTGTGCAACA 2270
Query 2254 GAGTCCTGTAGCTAGCTCG 2272
|||||||||||||||||||
Sbjct 2271 GAGTCCTGTAGCTAGCTCG 2289