Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14621
- Subject:
- NM_130436.2
- Aligned Length:
- 2275
- Identities:
- 2232
- Gaps:
- 16
Alignment
Query 1 ATGCATACAGGAGGAGAGACTTCAGCATGCAAACCTTCATCTGTTCGGCTTGCACCGTCATTTTCATTCCATGC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCATACAGGAGGAGAGACTTCAGCATGCAAACCTTCATCTGTTCGGCTTGCACCGTCATTTTCATTCCATGC 74
Query 75 TGCTGGCCTTCAGATGGCTGGACAGATGCCCCATTCACATCAGTACAGTGACCGTCGCCAGCCAAACATAAGTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGCTGGCCTTCAGATGGCTGGACAGATGCCCCATTCACATCAGTACAGTGACCGTCGCCAGCCAAACATAAGTG 148
Query 149 ACCAACAGGTTTCTGCCTTATCATATTCTGACCAGATTCAGCAACCTCTAACTAACCAGAGGCGGATGCCCCAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACCAACAGGTTTCTGCCTTATCATATTCTGACCAGATTCAGCAACCTCTAACTAACCAGAGGCGGATGCCCCAA 222
Query 223 ACCTTCCGTGACCCAGCAACTGCTCCCCTGAGAAAACTTTCTGTTGACTTGATCAAAACATACAAGCATATTAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ACCTTCCGTGACCCAGCAACTGCTCCCCTGAGAAAACTTTCTGTTGACTTGATCAAAACATACAAGCATATTAA 296
Query 297 TGAGGTTTACTATGCAAAAAAGAAGCGAAGACACCAACAGGGCCAGGGAGACGATTCTAGTCATAAGAAGGAAC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGAGGTTTACTATGCAAAAAAGAAGCGAAGACACCAACAGGGCCAGGGAGACGATTCTAGTCATAAGAAGGAAC 370
Query 371 GGAAGGTTTACAATGATGGTTATGATGATGATAACTATGATTATATTGTAAAAAACGGAGAAAAGTGGATGGAT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGAAGGTTTACAATGATGGTTATGATGATGATAACTATGATTATATTGTAAAAAACGGAGAAAAGTGGATGGAT 444
Query 445 CGTTACGAAATTGACTCCTTGATAGGCAAAGGTTCCTTTGGACAGGTTGTAAAGGCATATGATCGTGTGGAGCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CGTTACGAAATTGACTCCTTGATAGGCAAAGGTTCCTTTGGACAGGTTGTAAAGGCATATGATCGTGTGGAGCA 518
Query 519 AGAATGGGTTGCCATTAAAATAATAAAGAACAAGAAAGCTTTTCTGAATCAAGCACAGATAGAAGTGCGACTTC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGAATGGGTTGCCATTAAAATAATAAAGAACAAGAAGGCTTTTCTGAATCAAGCACAGATAGAAGTGCGACTTC 592
Query 593 TTGAGCTCATGAACAAACATGACACTGAAATGAAATACTACATAGTGCATTTGAAACGCCACTTTATGTTTCGA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTGAGCTCATGAACAAACATGACACTGAAATGAAATACTACATAGTGCATTTGAAACGCCACTTTATGTTTCGA 666
Query 667 AACCATCTCTGTTTAGTTTTTGAAATGCTGTCCTACAACCTCTATGACTTGCTGAGAAAACACCAATTTCCGAG 740
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 667 AACCATCTCTGTTTAGTTTTTGAAATGCTGTCCTACAACCTCTATGACTTGCTGAG-AAACACCAATTTCCGAG 739
Query 741 GGGTCTCTTTGAACCTAACACGAAAGTTTGCGCAACAGATGTGCACTGCACTGCTTTTCCTTGCGACTCCAGAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740 GGGTCTCTTTGAACCTAACACGAAAGTTTGCGCAACAGATGTGCACTGCACTGCTTTTCCTTGCGACTCCAGAA 813
Query 815 CTTAGTATCATTCACTGTGATCTAAAACCTGAAAATATCCTTCTTTGTAACCCCAAACGCAGTGCAATCAAGAT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 CTTAGTATCATTCACTGTGATCTAAAACCTGAAAATATCCTTCTTTGTAACCCCAAACGCAGTGCAATCAAGAT 887
Query 889 AGTTGACTTTGGCAGTTCTTGTCAGTTGGGGCAGAGGATATACCAGTATATTCAGAGTCGCTTTTATCGGTCTC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 AGTTGACTTTGGCAGTTCTTGTCAGTTGGGGCAGAGGATATACCAGTATATTCAGAGTCGCTTTTATCGGTCTC 961
Query 963 CAGAGGTGCTACTGGGAATGCCTTATGACCTTGCCATTGATATGTGGTCCCTCGGGTGTATTTTGGTTGAAATG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 CAGAGGTGCTACTGGGAATGCCTTATGACCTTGCCATTGATATGTGGTCCCTCGGGTGTATTTTGGTTGAAATG 1035
Query 1037 CACACTGGAGAACCTCTGTTCAGTGGTGCCAATGAGGTAGATCAGATGAATAAAATAGTGGAAGTTCTGGGTAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 CACACTGGAGAACCTCTGTTCAGTGGTGCCAATGAGGTAGATCAGATGAATAAAATAGTGGAAGTTCTGGGTAT 1109
Query 1111 TCCACCTGCTCATATTCTTGACCAAGCACCAAAAGCAAGAAAGTTCTTTGAGAAGTTGCCAGATGGCACTTGGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 TCCACCTGCTCATATTCTTGACCAAGCACCAAAAGCAAGAAAGTTCTTTGAGAAGTTGCCAGATGGCACTTGGA 1183
Query 1185 ACTTAAAGAAGACCAAAGATGGAAAACGGGAGTACAAACCACCAGGAACCCGTAAACTTCATAACATTCTTGGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 ACTTAAAGAAGACCAAAGATGGAAAACGGGAGTACAAACCACCAGGAACCCGTAAACTTCATAACATTCTTGGA 1257
Query 1259 GTGGAAACAGGAGGACCTGGTGGGCGACGTGCTGGGGAGTCAGGTCATACGGTCGCTGACTACTTGAAGTTCAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 GTGGAAACAGGAGGACCTGGTGGGCGACGTGCTGGGGAGTCAGGTCATACGGTCGCTGACTACTTGAAGTTCAA 1331
Query 1333 AGACCTCATTTTAAGGATGCTTGATTATGACCCCAAAACTCGAATTCAACCTTATTATGCTCTGCAGCACAGTT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332 AGACCTCATTTTAAGGATGCTTGATTATGACCCCAAAACTCGAATTCAACCTTATTATGCTCTGCAGCACAGTT 1405
Query 1407 TCTTCAAGAAAACAGCTGATGAAGGTACAAATACAAGTAATAGTGTATCTACAAGCCCCGCCATGGAGCAGTCT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 TCTTCAAGAAAACAGCTGATGAAGGTACAAATACAAGTAATAGTGTATCTACAAGCCCCGCCATGGAGCAGTCT 1479
Query 1481 CAGTCTTCGGGCACCACCTCCAGTACATCGTCAAGCTTCATGATCACTCATCAGGTGTCAAGACATCAGTTGGA 1554
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |.|..|||||| ||.|.|||| ||.||||.|||
Sbjct 1480 CAGTCTTCGGGCACCACCTCCAGTACATCGTCAAGC-TCA-GGTGGCTCATC-GGGGACAAG-CAACAGTGGGA 1549
Query 1555 GGAGCACGGTCGGATCAGGACGCACCAGCATCGGCACATTGGCGGGCATTATCTT--CAACTGCTGTGTCATGT 1626
||||.|||||||||| .||||||||||||||||||||.|||.||||| ||| ||.||||.||| ||.|.
Sbjct 1550 -GAGCCCGGTCGGATC-CGACGCACCAGCATCGGCACAGTGGTGGGCA----CTTCACAGCTGCCGTG-CAGGC 1616
Query 1627 CATGGACTGCGAGACACACAGTCCGGCAGGTGCGTCAGCAATTTCCTGCTCGTCTTGGTGGATCAGGCACTGAA 1700
|||||||||||||||||||||||| .|||||||||||||||||||||||||.|||||||.|.||||||||||||
Sbjct 1617 CATGGACTGCGAGACACACAGTCC-CCAGGTGCGTCAGCAATTTCCTGCTCCTCTTGGTTGGTCAGGCACTGAA 1689
Query 1701 GCTCCTACACAGGTCAGTGATGAAACTCATCCT-CTCAAGAAACAACCATTCATGTAGCCCCTCAACAGAATGC 1773
||||||||||||||||.||.||||||||||||| .|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1690 GCTCCTACACAGGTCACTGTTGAAACTCATCCTGTTCAAGAAACAACCTTTCATGTAGCCCCTCAACAGAATGC 1763
Query 1774 ATCAAATCATCACCATGGTAACAGTTCCCATCACCATCACCACCACCACCACCATCACCACCACCATGGACAAC 1847
||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1764 ATTGCATCATCACCATGGTAACAGTTCCCATCACCATCACCACCACCACCACCATCACCACCACCATGGACAAC 1837
Query 1848 AAGCCTTGGGTAACCGGACCAGGCCAAGGGTCTACAATTCTCCAACGAATAGCTCCTCTACCCAAGATTCTATG 1921
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1838 AAGCCTTGGGTAACCGGACCAGGCCAAGGGTCTACAATTCTCCAACGAATAGCTCCTCTACCCAAGATTCTATG 1911
Query 1922 GAGGTTGGCCACAGTCACCACTCCATGACATCCCTGTCTTCCTCAACGACTTCTTCCTCGACATCTTCCTCCTC 1995
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1912 GAGGTTGGCCACAGTCACCACTCCATGACATCCCTGTCTTCCTCAACGACTTCTTCCTCGACATCTTCCTCCTC 1985
Query 1996 TACTGGTAACCAAGGCAATCAGGCCTACCAGAATCGCCCAGTGGCTGCTAATACCTTGGACTTTGGACAGAATG 2069
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1986 TACTGGTAACCAAGGCAATCAGGCCTACCAGAATCGCCCAGTGGCTGCTAATACCTTGGACTTTGGACAGAATG 2059
Query 2070 GAGCTATGGACGTTAATTTGACCGTCTACTCCAATCCCCGCCAAGAGACTGGCATAGCTGGACATCCAACATAC 2143
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2060 GAGCTATGGACGTTAATTTGACCGTCTACTCCAATCCCCGCCAAGAGACTGGCATAGCTGGACATCCAACATAC 2133
Query 2144 CAATTTTCTGCTAATACAGGTCCTGCACATTACATGACTGAAGGACATCTGACAATGAGGCAAGGGGCTGATAG 2217
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2134 CAATTTTCTGCTAATACAGGTCCTGCACATTACATGACTGAAGGACATCTGACAATGAGGCAAGGGGCTGATAG 2207
Query 2218 AGAAGAGTCCCCCATGACAGGAGTTTGTGTGCAACAGAGTCCTGTAGCTAGCTCG 2272
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2208 AGAAGAGTCCCCCATGACAGGAGTTTGTGTGCAACAGAGTCCTGTAGCTAGCTCG 2262