Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14621
• Subject: NM_130438.2
• Aligned Length: 2299
• Identities: 1556
• Gaps: 739

Alignment

Query    1  ATGCATACAGGAGGAGAGACTTCAGCATGCAAACCTTCATCTGTTCGGCTTGCACCGTCATTTTCATTCCATGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCATACAGGAGGAGAGACTTCAGCATGCAAACCTTCATCTGTTCGGCTTGCACCGTCATTTTCATTCCATGC  74

Query   75  TGCTGGCCTTCAGATGGCTGGACAGATGCCCCATTCACATCAGTACAGTGACCGTCGCCAGCCAAACATAAGTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGCTGGCCTTCAGATGGCTGGACAGATGCCCCATTCACATCAGTACAGTGACCGTCGCCAGCCAAACATAAGTG  148

Query  149  ACCAACAGGTTTCTGCCTTATCATATTCTGACCAGATTCAGCAACCTCTAACTAAC------------------  204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
Sbjct  149  ACCAACAGGTTTCTGCCTTATCATATTCTGACCAGATTCAGCAACCTCTAACTAACCAGGTGATGCCTGATATT  222

Query  205  ---------CAGAGGCGGATGCCCCAAACCTTCCGTGACCCAGCAACTGCTCCCCTGAGAAAACTTTCTGTTGA  269
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCATGTTACAGAGGCGGATGCCCCAAACCTTCCGTGACCCAGCAACTGCTCCCCTGAGAAAACTTTCTGTTGA  296

Query  270  CTTGATCAAAACATACAAGCATATTAATGAGGTTTACTATGCAAAAAAGAAGCGAAGACACCAACAGGGCCAGG  343
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTGATCAAAACATACAAGCATATTAATGAGGTTTACTATGCAAAAAAGAAGCGAAGACACCAACAGGGCCAGG  370

Query  344  GAGACGATTCTAGTCATAAGAAGGAACGGAAGGTTTACAATGATGGTTATGATGATGATAACTATGATTATATT  417
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAGACGATTCTAGTCATAAGAAGGAACGGAAGGTTTACAATGATGGTTATGATGATGATAACTATGATTATATT  444

Query  418  GTAAAAAACGGAGAAAAGTGGATGGATCGTTACGAAATTGACTCCTTGATAGGCAAAGGTTCCTTTGGACAGGT  491
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTAAAAAACGGAGAAAAGTGGATGGATCGTTACGAAATTGACTCCTTGATAGGCAAAGGTTCCTTTGGACAGGT  518

Query  492  TGTAAAGGCATATGATCGTGTGGAGCAAGAATGGGTTGCCATTAAAATAATAAAGAACAAGAAAGCTTTTCTGA  565
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  519  TGTAAAGGCATATGATCGTGTGGAGCAAGAATGGGTTGCCATTAAAATAATAAAGAACAAGAAGGCTTTTCTGA  592

Query  566  ATCAAGCACAGATAGAAGTGCGACTTCTTGAGCTCATGAACAAACATGACACTGAAATGAAATACTACATAGTG  639
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATCAAGCACAGATAGAAGTGCGACTTCTTGAGCTCATGAACAAACATGACACTGAAATGAAATACTACATAGTG  666

Query  640  CATTTGAAACGCCACTTTATGTTTCGAAACCATCTCTGTTTAGTTTTTGAAATGCTGTCCTACAACCTCTATGA  713
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CATTTGAAACGCCACTTTATGTTTCGAAACCATCTCTGTTTAGTTTTTGAAATGCTGTCCTACAACCTCTATGA  740

Query  714  CTTGCTGAGAAAACACCAATTTCCGAGGGGTCTCTTTGAACCTAACACGAAAGTTTGCGCAACAGATGTGCACT  787
            ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTTGCTGAG-AAACACCAATTTCCGAGGGGTCTCTTTGAACCTAACACGAAAGTTTGCGCAACAGATGTGCACT  813

Query  788  GCACTGCTTTTCCTTGCGACTCCAGAACTTAGTATCATTCACTGTGATCTAAAACCTGAAAATATCCTTCTTTG  861
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  GCACTGCTTTTCCTTGCGACTCCAGAACTTAGTATCATTCACTGTGATCTAAAACCTGAAAATATCCTTCTTTG  887

Query  862  TAACCCCAAACGCAGTGCAATCAAGATAGTTGACTTTGGCAGTTCTTGTCAGTTGGGGCAGAGGATATACCAGT  935
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  TAACCCCAAACGCAGTGCAATCAAGATAGTTGACTTTGGCAGTTCTTGTCAGTTGGGGCAGAGGATATACCAGT  961

Query  936  ATATTCAGAGTCGCTTTTATCGGTCTCCAGAGGTGCTACTGGGAATGCCTTATGACCTTGCCATTGATATGTGG  1009
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  ATATTCAGAGTCGCTTTTATCGGTCTCCAGAGGTGCTACTGGGAATGCCTTATGACCTTGCCATTGATATGTGG  1035

Query 1010  TCCCTCGGGTGTATTTTGGTTGAAATGCACACTGGAGAACCTCTGTTCAGTGGTGCCAATGAGGTAGATCAGAT  1083
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  TCCCTCGGGTGTATTTTGGTTGAAATGCACACTGGAGAACCTCTGTTCAGTGGTGCCAATGAGGTAGATCAGAT  1109

Query 1084  GAATAAAATAGTGGAAGTTCTGGGTATTCCACCTGCTCATATTCTTGACCAAGCACCAAAAGCAAGAAAGTTCT  1157
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  GAATAAAATAGTGGAAGTTCTGGGTATTCCACCTGCTCATATTCTTGACCAAGCACCAAAAGCAAGAAAGTTCT  1183

Query 1158  TTGAGAAGTTGCCAGATGGCACTTGGAACTTAAAGAAGACCAAAGATGGAAAACGGGAGTACAAACCACCAGGA  1231
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  TTGAGAAGTTGCCAGATGGCACTTGGAACTTAAAGAAGACCAAAGATGGAAAACGGGAGTACAAACCACCAGGA  1257

Query 1232  ACCCGTAAACTTCATAACATTCTTGGAGTGGAAACAGGAGGACCTGGTGGGCGACGTGCTGGGGAGTCAGGTCA  1305
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258  ACCCGTAAACTTCATAACATTCTTGGAGTGGAAACAGGAGGACCTGGTGGGCGACGTGCTGGGGAGTCAGGTCA  1331

Query 1306  TACGGTCGCTGACTACTTGAAGTTCAAAGACCTCATTTTAAGGATGCTTGATTATGACCCCAAAACTCGAATTC  1379
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332  TACGGTCGCTGACTACTTGAAGTTCAAAGACCTCATTTTAAGGATGCTTGATTATGACCCCAAAACTCGAATTC  1405

Query 1380  AACCTTATTATGCTCTGCAGCACAGTTTCTTCAAGAAAACAGCTGATGAAGGTACAAATACAAGTAATAGTGTA  1453
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406  AACCTTATTATGCTCTGCAGCACAGTTTCTTCAAGAAAACAGCTGATGAAGGTACAAATACAAGTAATAGTGTA  1479

Query 1454  TCTACAAGCCCCGCCATGGAGCAGTCTCAGTCTTCGGGCACCACCTCCAGTACATCGTCAAGCTTCATGATCAC  1527
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
Sbjct 1480  TCTACAAGCCCCGCCATGGAGCAGTCTCAGTCTTCGGGCACCACCTCCAGTACATCGTCAAGCT----------  1543

Query 1528  TCATCAGGTGTCAAGACATCAGTTGGAGGAGCACGGTCGGATCAGGACGCACCAGCATCGGCACATTGGCGGGC  1601
                                                                                      
Sbjct 1544  --------------------------------------------------------------------------  1543

Query 1602  ATTATCTTCAACTGCTGTGTCATGTCATGGACTGCGAGACACACAGTCCGGCAGGTGCGTCAGCAATTTCCTGC  1675
                                                               |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1544  ---------------------------------------------------CAGGTGCGTCAGCAATTTCCTGC  1566

Query 1676  TCGTCTTGGTGGATCAGGCACTGAAGCTCCTACACAGGTCAGTGATGAAACTCATCCTCTCAAGAAACAACCAT  1749
            ||.|||||||.|.||||||||                                                     
Sbjct 1567  TCCTCTTGGTTGGTCAGGCAC-----------------------------------------------------  1587

Query 1750  TCATGTAGCCCCTCAACAGAATGCATCAAATCATCACCATGGTAACAGTTCCCATCACCATCACCACCACCACC  1823
                                                                                      
Sbjct 1588  --------------------------------------------------------------------------  1587

Query 1824  ACCATCACCACCACCATGGACAACAAGCCTTGGGTAACCGGACCAGGCCAAGGGTCTACAATTCTCCAACGAAT  1897
                                                                                      
Sbjct 1588  --------------------------------------------------------------------------  1587

Query 1898  AGCTCCTCTACCCAAGATTCTATGGAGGTTGGCCACAGTCACCACTCCATGACATCCCTGTCTTCCTCAACGAC  1971
                                                                                      
Sbjct 1588  --------------------------------------------------------------------------  1587

Query 1972  TTCTTCCTCGACATCTTCCTCCTCTACTGGTAACCAAGGCAATCAGGCCTACCAGAATCGCCCAGTGGCTGCTA  2045
                                                                                      
Sbjct 1588  --------------------------------------------------------------------------  1587

Query 2046  ATACCTTGGACTTTGGACAGAATGGAGCTATGGACGTTAATTTGACCGTCTACTCCAATCCCCGCCAAGAGACT  2119
                                                                                      
Sbjct 1588  --------------------------------------------------------------------------  1587

Query 2120  GGCATAGCTGGACATCCAACATACCAATTTTCTGCTAATACAGGTCCTGCACATTACATGACTGAAGGACATCT  2193
                                                                                      
Sbjct 1588  --------------------------------------------------------------------------  1587

Query 2194  GACAATGAGGCAAGGGGCTGATAGAGAAGAGTCCCCCATGACAGGAGTTTGTGTGCAACAGAGTCCTGTAGCTA  2267
                                                                                      
Sbjct 1588  --------------------------------------------------------------------------  1587

Query 2268  GCTCG  2272
                 
Sbjct 1588  -----  1587