Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14621
- Subject:
- XM_005260933.5
- Aligned Length:
- 2275
- Identities:
- 1576
- Gaps:
- 673
Alignment
Query 1 ATGCATACAGGAGGAGAGACTTCAGCATGCAAACCTTCATCTGTTCGGCTTGCACCGTCATTTTCATTCCATGC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TGCTGGCCTTCAGATGGCTGGACAGATGCCCCATTCACATCAGTACAGTGACCGTCGCCAGCCAAACATAAGTG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ACCAACAGGTTTCTGCCTTATCATATTCTGACCAGATTCAGCAACCTCTAACTAACCAGAGGCGGATGCCCCAA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 ACCTTCCGTGACCCAGCAACTGCTCCCCTGAGAAAACTTTCTGTTGACTTGATCAAAACATACAAGCATATTAA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TGAGGTTTACTATGCAAAAAAGAAGCGAAGACACCAACAGGGCCAGGGAGACGATTCTAGTCATAAGAAGGAAC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 GGAAGGTTTACAATGATGGTTATGATGATGATAACTATGATTATATTGTAAAAAACGGAGAAAAGTGGATGGAT 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 CGTTACGAAATTGACTCCTTGATAGGCAAAGGTTCCTTTGGACAGGTTGTAAAGGCATATGATCGTGTGGAGCA 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 AGAATGGGTTGCCATTAAAATAATAAAGAACAAGAAAGCTTTTCTGAATCAAGCACAGATAGAAGTGCGACTTC 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 TTGAGCTCATGAACAAACATGACACTGAAATGAAATACTACATAGTGCATTTGAAACGCCACTTTATGTTTCGA 666
|||||||||
Sbjct 1 -----------------------------------------------------------------ATGTTTCGA 9
Query 667 AACCATCTCTGTTTAGTTTTTGAAATGCTGTCCTACAACCTCTATGACTTGCTGAGAAAACACCAATTTCCGAG 740
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 10 AACCATCTCTGTTTAGTTTTTGAAATGCTGTCCTACAACCTCTATGACTTGCTGAG-AAACACCAATTTCCGAG 82
Query 741 GGGTCTCTTTGAACCTAACACGAAAGTTTGCGCAACAGATGTGCACTGCACTGCTTTTCCTTGCGACTCCAGAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 83 GGGTCTCTTTGAACCTAACACGAAAGTTTGCGCAACAGATGTGCACTGCACTGCTTTTCCTTGCGACTCCAGAA 156
Query 815 CTTAGTATCATTCACTGTGATCTAAAACCTGAAAATATCCTTCTTTGTAACCCCAAACGCAGTGCAATCAAGAT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 157 CTTAGTATCATTCACTGTGATCTAAAACCTGAAAATATCCTTCTTTGTAACCCCAAACGCAGTGCAATCAAGAT 230
Query 889 AGTTGACTTTGGCAGTTCTTGTCAGTTGGGGCAGAGGATATACCAGTATATTCAGAGTCGCTTTTATCGGTCTC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 231 AGTTGACTTTGGCAGTTCTTGTCAGTTGGGGCAGAGGATATACCAGTATATTCAGAGTCGCTTTTATCGGTCTC 304
Query 963 CAGAGGTGCTACTGGGAATGCCTTATGACCTTGCCATTGATATGTGGTCCCTCGGGTGTATTTTGGTTGAAATG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 305 CAGAGGTGCTACTGGGAATGCCTTATGACCTTGCCATTGATATGTGGTCCCTCGGGTGTATTTTGGTTGAAATG 378
Query 1037 CACACTGGAGAACCTCTGTTCAGTGGTGCCAATGAGGTAGATCAGATGAATAAAATAGTGGAAGTTCTGGGTAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 379 CACACTGGAGAACCTCTGTTCAGTGGTGCCAATGAGGTAGATCAGATGAATAAAATAGTGGAAGTTCTGGGTAT 452
Query 1111 TCCACCTGCTCATATTCTTGACCAAGCACCAAAAGCAAGAAAGTTCTTTGAGAAGTTGCCAGATGGCACTTGGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 453 TCCACCTGCTCATATTCTTGACCAAGCACCAAAAGCAAGAAAGTTCTTTGAGAAGTTGCCAGATGGCACTTGGA 526
Query 1185 ACTTAAAGAAGACCAAAGATGGAAAACGGGAGTACAAACCACCAGGAACCCGTAAACTTCATAACATTCTTGGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 527 ACTTAAAGAAGACCAAAGATGGAAAACGGGAGTACAAACCACCAGGAACCCGTAAACTTCATAACATTCTTGGA 600
Query 1259 GTGGAAACAGGAGGACCTGGTGGGCGACGTGCTGGGGAGTCAGGTCATACGGTCGCTGACTACTTGAAGTTCAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GTGGAAACAGGAGGACCTGGTGGGCGACGTGCTGGGGAGTCAGGTCATACGGTCGCTGACTACTTGAAGTTCAA 674
Query 1333 AGACCTCATTTTAAGGATGCTTGATTATGACCCCAAAACTCGAATTCAACCTTATTATGCTCTGCAGCACAGTT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 675 AGACCTCATTTTAAGGATGCTTGATTATGACCCCAAAACTCGAATTCAACCTTATTATGCTCTGCAGCACAGTT 748
Query 1407 TCTTCAAGAAAACAGCTGATGAAGGTACAAATACAAGTAATAGTGTATCTACAAGCCCCGCCATGGAGCAGTCT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 749 TCTTCAAGAAAACAGCTGATGAAGGTACAAATACAAGTAATAGTGTATCTACAAGCCCCGCCATGGAGCAGTCT 822
Query 1481 CAGTCTTCGGGCACCACCTCCAGTACATCGTCAAGCTTCATGATCACTCATCAGGTGTCAAGACATCAGTTGGA 1554
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |.|..|||||| ||.|.|||| ||.||||.|||
Sbjct 823 CAGTCTTCGGGCACCACCTCCAGTACATCGTCAAGC-TCA-GGTGGCTCATC-GGGGACAAG-CAACAGTGGGA 892
Query 1555 GGAGCACGGTCGGATCAGGACGCACCAGCATCGGCACATTGGCGGGCATTATCTT--CAACTGCTGTGTCATGT 1626
||||.|||||||||| .||||||||||||||||||||.|||.||||| ||| ||.||||.||| ||.|.
Sbjct 893 -GAGCCCGGTCGGATC-CGACGCACCAGCATCGGCACAGTGGTGGGCA----CTTCACAGCTGCCGTG-CAGGC 959
Query 1627 CATGGACTGCGAGACACACAGTCCGGCAGGTGCGTCAGCAATTTCCTGCTCGTCTTGGTGGATCAGGCACTGAA 1700
|||||||||||||||||||||||| .|||||||||||||||||||||||||.|||||||.|.||||||||||||
Sbjct 960 CATGGACTGCGAGACACACAGTCC-CCAGGTGCGTCAGCAATTTCCTGCTCCTCTTGGTTGGTCAGGCACTGAA 1032
Query 1701 GCTCCTACACAGGTCAGTGATGAAACTCATCCT-CTCAAGAAACAACCATTCATGTAGCCCCTCAACAGAATGC 1773
||||||||||||||||.||.||||||||||||| .|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033 GCTCCTACACAGGTCACTGTTGAAACTCATCCTGTTCAAGAAACAACCTTTCATGTAGCCCCTCAACAGAATGC 1106
Query 1774 ATCAAATCATCACCATGGTAACAGTTCCCATCACCATCACCACCACCACCACCATCACCACCACCATGGACAAC 1847
||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1107 ATTGCATCATCACCATGGTAACAGTTCCCATCACCATCACCACCACCACCACCATCACCACCACCATGGACAAC 1180
Query 1848 AAGCCTTGGGTAACCGGACCAGGCCAAGGGTCTACAATTCTCCAACGAATAGCTCCTCTACCCAAGATTCTATG 1921
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181 AAGCCTTGGGTAACCGGACCAGGCCAAGGGTCTACAATTCTCCAACGAATAGCTCCTCTACCCAAGATTCTATG 1254
Query 1922 GAGGTTGGCCACAGTCACCACTCCATGACATCCCTGTCTTCCTCAACGACTTCTTCCTCGACATCTTCCTCCTC 1995
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255 GAGGTTGGCCACAGTCACCACTCCATGACATCCCTGTCTTCCTCAACGACTTCTTCCTCGACATCTTCCTCCTC 1328
Query 1996 TACTGGTAACCAAGGCAATCAGGCCTACCAGAATCGCCCAGTGGCTGCTAATACCTTGGACTTTGGACAGAATG 2069
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329 TACTGGTAACCAAGGCAATCAGGCCTACCAGAATCGCCCAGTGGCTGCTAATACCTTGGACTTTGGACAGAATG 1402
Query 2070 GAGCTATGGACGTTAATTTGACCGTCTACTCCAATCCCCGCCAAGAGACTGGCATAGCTGGACATCCAACATAC 2143
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1403 GAGCTATGGACGTTAATTTGACCGTCTACTCCAATCCCCGCCAAGAGACTGGCATAGCTGGACATCCAACATAC 1476
Query 2144 CAATTTTCTGCTAATACAGGTCCTGCACATTACATGACTGAAGGACATCTGACAATGAGGCAAGGGGCTGATAG 2217
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477 CAATTTTCTGCTAATACAGGTCCTGCACATTACATGACTGAAGGACATCTGACAATGAGGCAAGGGGCTGATAG 1550
Query 2218 AGAAGAGTCCCCCATGACAGGAGTTTGTGTGCAACAGAGTCCTGTAGCTAGCTCG 2272
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551 AGAAGAGTCCCCCATGACAGGAGTTTGTGTGCAACAGAGTCCTGTAGCTAGCTCG 1605
