Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14621
• Subject: XM_006723976.3
• Aligned Length: 2302
• Identities: 2232
• Gaps: 43

Alignment

Query    1  ATGCATACAGGAGGAGAGACTTCAGCATGCAAACCTTCATCTGTTCGGCTTGCACCGTCATTTTCATTCCATGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCATACAGGAGGAGAGACTTCAGCATGCAAACCTTCATCTGTTCGGCTTGCACCGTCATTTTCATTCCATGC  74

Query   75  TGCTGGCCTTCAGATGGCTGGACAGATGCCCCATTCACATCAGTACAGTGACCGTCGCCAGCCAAACATAAGTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGCTGGCCTTCAGATGGCTGGACAGATGCCCCATTCACATCAGTACAGTGACCGTCGCCAGCCAAACATAAGTG  148

Query  149  ACCAACAGGTTTCTGCCTTATCATATTCTGACCAGATTCAGCAACCTCTAACTAAC------------------  204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
Sbjct  149  ACCAACAGGTTTCTGCCTTATCATATTCTGACCAGATTCAGCAACCTCTAACTAACCAGGTGATGCCTGATATT  222

Query  205  ---------CAGAGGCGGATGCCCCAAACCTTCCGTGACCCAGCAACTGCTCCCCTGAGAAAACTTTCTGTTGA  269
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCATGTTACAGAGGCGGATGCCCCAAACCTTCCGTGACCCAGCAACTGCTCCCCTGAGAAAACTTTCTGTTGA  296

Query  270  CTTGATCAAAACATACAAGCATATTAATGAGGTTTACTATGCAAAAAAGAAGCGAAGACACCAACAGGGCCAGG  343
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTGATCAAAACATACAAGCATATTAATGAGGTTTACTATGCAAAAAAGAAGCGAAGACACCAACAGGGCCAGG  370

Query  344  GAGACGATTCTAGTCATAAGAAGGAACGGAAGGTTTACAATGATGGTTATGATGATGATAACTATGATTATATT  417
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAGACGATTCTAGTCATAAGAAGGAACGGAAGGTTTACAATGATGGTTATGATGATGATAACTATGATTATATT  444

Query  418  GTAAAAAACGGAGAAAAGTGGATGGATCGTTACGAAATTGACTCCTTGATAGGCAAAGGTTCCTTTGGACAGGT  491
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTAAAAAACGGAGAAAAGTGGATGGATCGTTACGAAATTGACTCCTTGATAGGCAAAGGTTCCTTTGGACAGGT  518

Query  492  TGTAAAGGCATATGATCGTGTGGAGCAAGAATGGGTTGCCATTAAAATAATAAAGAACAAGAAAGCTTTTCTGA  565
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  519  TGTAAAGGCATATGATCGTGTGGAGCAAGAATGGGTTGCCATTAAAATAATAAAGAACAAGAAGGCTTTTCTGA  592

Query  566  ATCAAGCACAGATAGAAGTGCGACTTCTTGAGCTCATGAACAAACATGACACTGAAATGAAATACTACATAGTG  639
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATCAAGCACAGATAGAAGTGCGACTTCTTGAGCTCATGAACAAACATGACACTGAAATGAAATACTACATAGTG  666

Query  640  CATTTGAAACGCCACTTTATGTTTCGAAACCATCTCTGTTTAGTTTTTGAAATGCTGTCCTACAACCTCTATGA  713
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CATTTGAAACGCCACTTTATGTTTCGAAACCATCTCTGTTTAGTTTTTGAAATGCTGTCCTACAACCTCTATGA  740

Query  714  CTTGCTGAGAAAACACCAATTTCCGAGGGGTCTCTTTGAACCTAACACGAAAGTTTGCGCAACAGATGTGCACT  787
            ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTTGCTGAG-AAACACCAATTTCCGAGGGGTCTCTTTGAACCTAACACGAAAGTTTGCGCAACAGATGTGCACT  813

Query  788  GCACTGCTTTTCCTTGCGACTCCAGAACTTAGTATCATTCACTGTGATCTAAAACCTGAAAATATCCTTCTTTG  861
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  GCACTGCTTTTCCTTGCGACTCCAGAACTTAGTATCATTCACTGTGATCTAAAACCTGAAAATATCCTTCTTTG  887

Query  862  TAACCCCAAACGCAGTGCAATCAAGATAGTTGACTTTGGCAGTTCTTGTCAGTTGGGGCAGAGGATATACCAGT  935
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  TAACCCCAAACGCAGTGCAATCAAGATAGTTGACTTTGGCAGTTCTTGTCAGTTGGGGCAGAGGATATACCAGT  961

Query  936  ATATTCAGAGTCGCTTTTATCGGTCTCCAGAGGTGCTACTGGGAATGCCTTATGACCTTGCCATTGATATGTGG  1009
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  ATATTCAGAGTCGCTTTTATCGGTCTCCAGAGGTGCTACTGGGAATGCCTTATGACCTTGCCATTGATATGTGG  1035

Query 1010  TCCCTCGGGTGTATTTTGGTTGAAATGCACACTGGAGAACCTCTGTTCAGTGGTGCCAATGAGGTAGATCAGAT  1083
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  TCCCTCGGGTGTATTTTGGTTGAAATGCACACTGGAGAACCTCTGTTCAGTGGTGCCAATGAGGTAGATCAGAT  1109

Query 1084  GAATAAAATAGTGGAAGTTCTGGGTATTCCACCTGCTCATATTCTTGACCAAGCACCAAAAGCAAGAAAGTTCT  1157
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  GAATAAAATAGTGGAAGTTCTGGGTATTCCACCTGCTCATATTCTTGACCAAGCACCAAAAGCAAGAAAGTTCT  1183

Query 1158  TTGAGAAGTTGCCAGATGGCACTTGGAACTTAAAGAAGACCAAAGATGGAAAACGGGAGTACAAACCACCAGGA  1231
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  TTGAGAAGTTGCCAGATGGCACTTGGAACTTAAAGAAGACCAAAGATGGAAAACGGGAGTACAAACCACCAGGA  1257

Query 1232  ACCCGTAAACTTCATAACATTCTTGGAGTGGAAACAGGAGGACCTGGTGGGCGACGTGCTGGGGAGTCAGGTCA  1305
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258  ACCCGTAAACTTCATAACATTCTTGGAGTGGAAACAGGAGGACCTGGTGGGCGACGTGCTGGGGAGTCAGGTCA  1331

Query 1306  TACGGTCGCTGACTACTTGAAGTTCAAAGACCTCATTTTAAGGATGCTTGATTATGACCCCAAAACTCGAATTC  1379
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332  TACGGTCGCTGACTACTTGAAGTTCAAAGACCTCATTTTAAGGATGCTTGATTATGACCCCAAAACTCGAATTC  1405

Query 1380  AACCTTATTATGCTCTGCAGCACAGTTTCTTCAAGAAAACAGCTGATGAAGGTACAAATACAAGTAATAGTGTA  1453
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406  AACCTTATTATGCTCTGCAGCACAGTTTCTTCAAGAAAACAGCTGATGAAGGTACAAATACAAGTAATAGTGTA  1479

Query 1454  TCTACAAGCCCCGCCATGGAGCAGTCTCAGTCTTCGGGCACCACCTCCAGTACATCGTCAAGCTTCATGATCAC  1527
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |.|..|
Sbjct 1480  TCTACAAGCCCCGCCATGGAGCAGTCTCAGTCTTCGGGCACCACCTCCAGTACATCGTCAAGC-TCA-GGTGGC  1551

Query 1528  TCATCAGGTGTCAAGACATCAGTTGGAGGAGCACGGTCGGATCAGGACGCACCAGCATCGGCACATTGGCGGGC  1601
            ||||| ||.|.|||| ||.||||.||| ||||.|||||||||| .||||||||||||||||||||.|||.||||
Sbjct 1552  TCATC-GGGGACAAG-CAACAGTGGGA-GAGCCCGGTCGGATC-CGACGCACCAGCATCGGCACAGTGGTGGGC  1621

Query 1602  ATTATCTT--CAACTGCTGTGTCATGTCATGGACTGCGAGACACACAGTCCGGCAGGTGCGTCAGCAATTTCCT  1673
            |    |||  ||.||||.||| ||.|.|||||||||||||||||||||||| .|||||||||||||||||||||
Sbjct 1622  A----CTTCACAGCTGCCGTG-CAGGCCATGGACTGCGAGACACACAGTCC-CCAGGTGCGTCAGCAATTTCCT  1689

Query 1674  GCTCGTCTTGGTGGATCAGGCACTGAAGCTCCTACACAGGTCAGTGATGAAACTCATCCT-CTCAAGAAACAAC  1746
            ||||.|||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||| .||||||||||||
Sbjct 1690  GCTCCTCTTGGTTGGTCAGGCACTGAAGCTCCTACACAGGTCACTGTTGAAACTCATCCTGTTCAAGAAACAAC  1763

Query 1747  CATTCATGTAGCCCCTCAACAGAATGCATCAAATCATCACCATGGTAACAGTTCCCATCACCATCACCACCACC  1820
            |.|||||||||||||||||||||||||||...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1764  CTTTCATGTAGCCCCTCAACAGAATGCATTGCATCATCACCATGGTAACAGTTCCCATCACCATCACCACCACC  1837

Query 1821  ACCACCATCACCACCACCATGGACAACAAGCCTTGGGTAACCGGACCAGGCCAAGGGTCTACAATTCTCCAACG  1894
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1838  ACCACCATCACCACCACCATGGACAACAAGCCTTGGGTAACCGGACCAGGCCAAGGGTCTACAATTCTCCAACG  1911

Query 1895  AATAGCTCCTCTACCCAAGATTCTATGGAGGTTGGCCACAGTCACCACTCCATGACATCCCTGTCTTCCTCAAC  1968
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1912  AATAGCTCCTCTACCCAAGATTCTATGGAGGTTGGCCACAGTCACCACTCCATGACATCCCTGTCTTCCTCAAC  1985

Query 1969  GACTTCTTCCTCGACATCTTCCTCCTCTACTGGTAACCAAGGCAATCAGGCCTACCAGAATCGCCCAGTGGCTG  2042
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1986  GACTTCTTCCTCGACATCTTCCTCCTCTACTGGTAACCAAGGCAATCAGGCCTACCAGAATCGCCCAGTGGCTG  2059

Query 2043  CTAATACCTTGGACTTTGGACAGAATGGAGCTATGGACGTTAATTTGACCGTCTACTCCAATCCCCGCCAAGAG  2116
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2060  CTAATACCTTGGACTTTGGACAGAATGGAGCTATGGACGTTAATTTGACCGTCTACTCCAATCCCCGCCAAGAG  2133

Query 2117  ACTGGCATAGCTGGACATCCAACATACCAATTTTCTGCTAATACAGGTCCTGCACATTACATGACTGAAGGACA  2190
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2134  ACTGGCATAGCTGGACATCCAACATACCAATTTTCTGCTAATACAGGTCCTGCACATTACATGACTGAAGGACA  2207

Query 2191  TCTGACAATGAGGCAAGGGGCTGATAGAGAAGAGTCCCCCATGACAGGAGTTTGTGTGCAACAGAGTCCTGTAG  2264
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2208  TCTGACAATGAGGCAAGGGGCTGATAGAGAAGAGTCCCCCATGACAGGAGTTTGTGTGCAACAGAGTCCTGTAG  2281

Query 2265  CTAGCTCG  2272
            ||||||||
Sbjct 2282  CTAGCTCG  2289