Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14621
• Subject: XM_011246099.2
• Aligned Length: 2286
• Identities: 2016
• Gaps: 125

Alignment

Query    1  ATGCATACAGGAGGAGAGACTTCAGCATGCAAACCTTCATCTGTTCGGCTTGCACCGTCATTTTCATTCCATGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGCTGGCCTTCAGATGGCTGGACAGATGCCCCATTCACATCAGTACAGTGACCGTCGCCAGCCAAACATAAGTG  148
                         |||||||.||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|.||||||||
Sbjct    1  -------------ATGGCTGCACAGATGCCCCACTCACACCAGTACAGTGACCGTCGCCAGCCGAGCATAAGTG  61

Query  149  ACCAACAGGTTTCTGCCTTATCATATTCTGACCAGATTCAGCAACCTCTAACTAACCAGAGGCGGATGCCCCAA  222
            ||||.|||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   62  ACCAGCAGGTGTCTGCCTTACCATATTCTGACCAGATTCAGCAACCTCTAACTAACCAGAGGCGGATGCCCCAA  135

Query  223  ACCTTCCGTGACCCAGCAACTGCTCCCCTGAGAAAACTTTCTGTTGACTTGATCAAAACATACAAGCATATTAA  296
            |||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  136  ACCTTCCGTGATCCAGCAACTGCTCCTCTGAGAAAACTCTCTGTGGACTTGATCAAAACATACAAGCATATTAA  209

Query  297  TGAGGTTTACTATGCAAAAAAGAAGCGAAGACACCAACAGGGCCAGGGAGACGATTCTAGTCATAAGAAGGAAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  210  TGAGGTTTACTATGCAAAAAAGAAGCGAAGACACCAACAGGGCCAGGGGGACGATTCCAGTCATAAGAAGGAGC  283

Query  371  GGAAGGTTTACAATGATGGTTATGATGATGATAACTATGATTATATTGTAAAAAACGGAGAAAAGTGGATGGAT  444
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  284  GGAAGGTTTACAATGATGGTTACGATGATGATAACTATGATTATATTGTAAAAAACGGGGAAAAGTGGATGGAT  357

Query  445  CGTTACGAAATTGACTCCTTGATAGGCAAAGGTTCCTTTGGACAGGTTGTAAAGGCATATGATCGTGTGGAGCA  518
            ||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||..|.||||||||
Sbjct  358  CGGTATGAAATCGACTCCTTAATAGGCAAAGGTTCATTTGGACAGGTTGTGAAAGCTTATGACAGAGTGGAGCA  431

Query  519  AGAATGGGTTGCCATTAAAATAATAAAGAACAAGAAAGCTTTTCTGAATCAAGCACAGATAGAAGTGCGACTTC  592
            |||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|
Sbjct  432  AGAATGGGTCGCCATTAAAATCATCAAGAACAAGAAAGCGTTTCTGAATCAAGCCCAGATAGAAGTGCGGCTGC  505

Query  593  TTGAGCTCATGAACAAACATGACACTGAAATGAAATACTACATAGTGCATTTGAAACGCCACTTTATGTTTCGA  666
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  506  TTGAGCTCATGAACAAACACGACACTGAAATGAAGTACTACATAGTGCATTTGAAACGCCACTTTATGTTTCGA  579

Query  667  AACCATCTCTGTTTAGTTTTTGAAATGCTGTCCTACAACCTCTATGACTTGCTGAGAAAACACCAATTTCCGAG  740
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||.|||| |||||||||.|||||||
Sbjct  580  AACCATCTCTGTTTAGTGTTTGAAATGCTGTCCTATAATCTCTATGATTTGTTGAG-AAACACCAACTTCCGAG  652

Query  741  GGGTCTCTTTGAACCTAACACGAAAGTTTGCGCAACAGATGTGCACTGCACTGCTTTTCCTTGCGACTCCAGAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.|||||||||||||||
Sbjct  653  GGGTCTCTTTGAACCTAACACGAAAGTTTGCGCAACAGATGTGCACAGCATTGCTTTTTCTTGCGACTCCAGAA  726

Query  815  CTTAGTATCATTCACTGTGATCTAAAACCTGAAAATATCCTTCTTTGTAACCCCAAACGCAGTGCAATCAAGAT  888
            ||||||||||||||||||||..||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  727  CTTAGTATCATTCACTGTGACTTAAAGCCTGAGAACATCCTTCTGTGTAACCCCAAACGGAGTGCAATCAAGAT  800

Query  889  AGTTGACTTTGGCAGTTCTTGTCAGTTGGGGCAGAGGATATACCAGTATATTCAGAGTCGCTTTTATCGGTCTC  962
            .|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  801  TGTTGATTTTGGCAGCTCTTGTCAGTTGGGGCAGAGGATATACCAGTATATTCAGAGTCGCTTTTATCGGTCTC  874

Query  963  CAGAGGTGCTACTGGGAATGCCTTATGACCTTGCCATTGATATGTGGTCCCTCGGGTGTATTTTGGTTGAAATG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct  875  CAGAGGTGCTACTGGGAATGCCTTATGACCTTGCTATCGACATGTGGTCCCTTGGATGTATCTTGGTTGAAATG  948

Query 1037  CACACTGGAGAACCTCTGTTCAGTGGTGCCAATGAGGTAGATCAGATGAATAAAATAGTGGAAGTTCTGGGTAT  1110
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||..||||.||
Sbjct  949  CACACTGGAGAGCCTCTGTTCAGTGGTGCCAATGAGGTCGATCAGATGAATAAAATAGTGGAAGTCTTGGGCAT  1022

Query 1111  TCCACCTGCTCATATTCTTGACCAAGCACCAAAAGCAAGAAAGTTCTTTGAGAAGTTGCCAGATGGCACTTGGA  1184
            .|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1023  CCCACCTGCTCATATTCTTGACCAAGCACCGAAAGCAAGAAAGTTCTTTGAGAAGTTGCCCGATGGCACTTGGA  1096

Query 1185  ACTTAAAGAAGACCAAAGATGGAAAACGGGAGTACAAACCACCAGGAACCCGTAAACTTCATAACATTCTTGGA  1258
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1097  GCTTAAAGAAGACCAAAGATGGAAAACGGGAGTACAAACCACCAGGAACCCGTAAACTTCATAATATTCTTGGA  1170

Query 1259  GTGGAAACAGGAGGACCTGGTGGGCGACGTGCTGGGGAGTCAGGTCATACGGTCGCTGACTACTTGAAGTTCAA  1332
            ||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1171  GTAGAAACAGGAGGACCTGGCGGGCGGCGTGCTGGGGAATCGGGTCATACTGTAGCTGACTACTTGAAGTTCAA  1244

Query 1333  AGACCTCATTTTAAGGATGCTTGATTATGACCCCAAAACTCGAATTCAACCTTATTATGCTCTGCAGCACAGTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1245  AGACCTCATTTTAAGGATGCTTGATTATGACCCCAAAACTCGGATTCAACCTTATTATGCCCTGCAGCACAGTT  1318

Query 1407  TCTTCAAGAAAACAGCTGATGAAGGTACAAATACAAGTAATAGTGTATCTACAAGCCCCGCCATGGAGCAGTCT  1480
            |.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 1319  TTTTCAAGAAAACAGCTGATGAAGGTACCAACACAAGTAACAGTGTGTCTACCAGCCCTGCGATGGAGCAGTCT  1392

Query 1481  CAGTCTTCGGGCACCACCTCCAGTACATCGTCAAGCTTCATGATCACTCATCAGGTG-----TCAAGA-----C  1544
            ||||||||.||||||||||||||.||.||.||.|||              |||||||     ||..||     .
Sbjct 1393  CAGTCTTCAGGCACCACCTCCAGCACCTCCTCCAGC--------------TCAGGTGGATCCTCGGGAACGAGT  1452

Query 1545  ATCAGTTGGAGGAGCACGGTCGGATCAGGACGCACCAGCATCGGCACATTGGCGGGCATTATCTTCAACTGCTG  1618
            |.||||.||| ||||..||||||||| .|||||||||||||||.||||..||.||.||    |||| .||||||
Sbjct 1453  AACAGTGGGA-GAGCCAGGTCGGATC-CGACGCACCAGCATCGACACAGCGGTGGACA----CTTC-GCTGCTG  1519

Query 1619  -TGT-CATGTCATGGACTGCGAGACACACAGTCCGGCAGGTGCGTCAGCAATTTCCTGCTCGTCTTGG-TGGAT  1689
             ||| ||.|.|||||||||.|||||||||||||| .||||||||.|||||.|||||.||||.|||.|| ||| |
Sbjct 1520  CTGTCCAGGCCATGGACTGTGAGACACACAGTCC-CCAGGTGCGCCAGCAGTTTCCGGCTCCTCTGGGATGG-T  1591

Query 1690  CAGGCACTGAAGCTCCTACACAGGTCAGTGATGAAACTCATCCT-CTCAAGAAACAACCATTCATGTAGCCCCT  1762
            ||||||||||||||||||||||.||||.||.||||||||||||| .||||||.||||||.|||||||||||||.
Sbjct 1592  CAGGCACTGAAGCTCCTACACAAGTCACTGTTGAAACTCATCCTGTTCAAGAGACAACCTTTCATGTAGCCCCC  1665

Query 1763  CAACAGAATGCATCAAATCATCACCATGGTAACAGTTCCCATCACCATCACCACCACCACCACCATCACCACCA  1836
            ||.|||||.||||...|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1666  CAGCAGAACGCATTGCATCATCACCATGGAAACAGTTCCCATCACCACCACCACCACCATCACCACCACCACCA  1739

Query 1837  CCATGGACAACAAGCCTTGGGTAACCGGACCAGGCCAAGGGTCTACAATTCTCCAACGAATAGCTCCTCTACCC  1910
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1740  CCATGGACAGCAAGCCTTGGGTAACCGGACCAGGCCAAGGGTCTACAATTCTCCAACAAATAGCTCCTCTACCC  1813

Query 1911  AAGATTCTATGGAGGTTGGCCACAGTCACCACTCCATGACATCCCTGTCTTCCTCAACGACTTCTTCCTCGACA  1984
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1814  AGGATTCTATGGAGGTTGGCCACAGTCACCACTCCATGACATCCCTGTCTTCCTCAACAACTTCTTCCTCGACA  1887

Query 1985  TCTTCCTCCTCTACTGGTAACCAAGGCAATCAGGCCTACCAGAATCGCCCAGTGGCTGCTAATACCTTGGACTT  2058
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1888  TCTTCCTCCTCTACTGGTAATCAAGGCAATCAGGCCTATCAGAACCGCCCAGTGGCTGCTAACACCTTGGACTT  1961

Query 2059  TGGACAGAATGGAGCTATGGACGTTAATTTGACCGTCTACTCCAATCCCCGCCAAGAGACTGGCATAGCTGGAC  2132
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1962  TGGACAGAATGGAGCTATGGACGTTAATTTGACCGTCTACTCCAATCCCCGCCAAGAGACTGGCATAGCTGGAC  2035

Query 2133  ATCCAACATACCAATTTTCTGCTAATACAGGTCCTGCACATTACATGACTGAAGGACATCTGACAATGAGGCAA  2206
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||
Sbjct 2036  ATCCAACATACCAATTTTCTGCTAATACAGGTCCTGCACATTACATGACTGAAGGACATCTGGCGATGAGACAA  2109

Query 2207  GGGGCTGATAGAGAAGAGTCCCCCATGACAGGAGTTTGTGTGCAACAGAGTCCTGTAGCTAGCTCG  2272
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2110  GGGGCTGATAGAGAAGAGTCTCCCATGACAGGAGTTTGTGTGCAACAGAGTCCTGTAGCTAGCTCG  2175