Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14621
• Subject: XM_024452057.1
• Aligned Length: 2275
• Identities: 2145
• Gaps: 103

Alignment

Query    1  ATGCATACAGGAGGAGAGACTTCAGCATGCAAACCTTCATCTGTTCGGCTTGCACCGTCATTTTCATTCCATGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGCTGGCCTTCAGATGGCTGGACAGATGCCCCATTCACATCAGTACAGTGACCGTCGCCAGCCAAACATAAGTG  148
                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------ATGGCTGGACAGATGCCCCATTCACATCAGTACAGTGACCGTCGCCAGCCAAACATAAGTG  61

Query  149  ACCAACAGGTTTCTGCCTTATCATATTCTGACCAGATTCAGCAACCTCTAACTAACCAGAGGCGGATGCCCCAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   62  ACCAACAGGTTTCTGCCTTATCATATTCTGACCAGATTCAGCAACCTCTAACTAACCAGAGGCGGATGCCCCAA  135

Query  223  ACCTTCCGTGACCCAGCAACTGCTCCCCTGAGAAAACTTTCTGTTGACTTGATCAAAACATACAAGCATATTAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  136  ACCTTCCGTGACCCAGCAACTGCTCCCCTGAGAAAACTTTCTGTTGACTTGATCAAAACATACAAGCATATTAA  209

Query  297  TGAGGTTTACTATGCAAAAAAGAAGCGAAGACACCAACAGGGCCAGGGAGACGATTCTAGTCATAAGAAGGAAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  210  TGAGGTTTACTATGCAAAAAAGAAGCGAAGACACCAACAGGGCCAGGGAGACGATTCTAGTCATAAGAAGGAAC  283

Query  371  GGAAGGTTTACAATGATGGTTATGATGATGATAACTATGATTATATTGTAAAAAACGGAGAAAAGTGGATGGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  284  GGAAGGTTTACAATGATGGTTATGATGATGATAACTATGATTATATTGTAAAAAACGGAGAAAAGTGGATGGAT  357

Query  445  CGTTACGAAATTGACTCCTTGATAGGCAAAGGTTCCTTTGGACAGGTTGTAAAGGCATATGATCGTGTGGAGCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  358  CGTTACGAAATTGACTCCTTGATAGGCAAAGGTTCCTTTGGACAGGTTGTAAAGGCATATGATCGTGTGGAGCA  431

Query  519  AGAATGGGTTGCCATTAAAATAATAAAGAACAAGAAAGCTTTTCTGAATCAAGCACAGATAGAAGTGCGACTTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  432  AGAATGGGTTGCCATTAAAATAATAAAGAACAAGAAGGCTTTTCTGAATCAAGCACAGATAGAAGTGCGACTTC  505

Query  593  TTGAGCTCATGAACAAACATGACACTGAAATGAAATACTACATAGTGCATTTGAAACGCCACTTTATGTTTCGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  506  TTGAGCTCATGAACAAACATGACACTGAAATGAAATACTACATAGTGCATTTGAAACGCCACTTTATGTTTCGA  579

Query  667  AACCATCTCTGTTTAGTTTTTGAAATGCTGTCCTACAACCTCTATGACTTGCTGAGAAAACACCAATTTCCGAG  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  580  AACCATCTCTGTTTAGTTTTTGAAATGCTGTCCTACAACCTCTATGACTTGCTGAG-AAACACCAATTTCCGAG  652

Query  741  GGGTCTCTTTGAACCTAACACGAAAGTTTGCGCAACAGATGTGCACTGCACTGCTTTTCCTTGCGACTCCAGAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  653  GGGTCTCTTTGAACCTAACACGAAAGTTTGCGCAACAGATGTGCACTGCACTGCTTTTCCTTGCGACTCCAGAA  726

Query  815  CTTAGTATCATTCACTGTGATCTAAAACCTGAAAATATCCTTCTTTGTAACCCCAAACGCAGTGCAATCAAGAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  727  CTTAGTATCATTCACTGTGATCTAAAACCTGAAAATATCCTTCTTTGTAACCCCAAACGCAGTGCAATCAAGAT  800

Query  889  AGTTGACTTTGGCAGTTCTTGTCAGTTGGGGCAGAGGATATACCAGTATATTCAGAGTCGCTTTTATCGGTCTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  801  AGTTGACTTTGGCAGTTCTTGTCAGTTGGGGCAGAGGATATACCAGTATATTCAGAGTCGCTTTTATCGGTCTC  874

Query  963  CAGAGGTGCTACTGGGAATGCCTTATGACCTTGCCATTGATATGTGGTCCCTCGGGTGTATTTTGGTTGAAATG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  875  CAGAGGTGCTACTGGGAATGCCTTATGACCTTGCCATTGATATGTGGTCCCTCGGGTGTATTTTGGTTGAAATG  948

Query 1037  CACACTGGAGAACCTCTGTTCAGTGGTGCCAATGAGGTAGATCAGATGAATAAAATAGTGGAAGTTCTGGGTAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  949  CACACTGGAGAACCTCTGTTCAGTGGTGCCAATGAGGTAGATCAGATGAATAAAATAGTGGAAGTTCTGGGTAT  1022

Query 1111  TCCACCTGCTCATATTCTTGACCAAGCACCAAAAGCAAGAAAGTTCTTTGAGAAGTTGCCAGATGGCACTTGGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1023  TCCACCTGCTCATATTCTTGACCAAGCACCAAAAGCAAGAAAGTTCTTTGAGAAGTTGCCAGATGGCACTTGGA  1096

Query 1185  ACTTAAAGAAGACCAAAGATGGAAAACGGGAGTACAAACCACCAGGAACCCGTAAACTTCATAACATTCTTGGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1097  ACTTAAAGAAGACCAAAGATGGAAAACGGGAGTACAAACCACCAGGAACCCGTAAACTTCATAACATTCTTGGA  1170

Query 1259  GTGGAAACAGGAGGACCTGGTGGGCGACGTGCTGGGGAGTCAGGTCATACGGTCGCTGACTACTTGAAGTTCAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1171  GTGGAAACAGGAGGACCTGGTGGGCGACGTGCTGGGGAGTCAGGTCATACGGTCGCTGACTACTTGAAGTTCAA  1244

Query 1333  AGACCTCATTTTAAGGATGCTTGATTATGACCCCAAAACTCGAATTCAACCTTATTATGCTCTGCAGCACAGTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1245  AGACCTCATTTTAAGGATGCTTGATTATGACCCCAAAACTCGAATTCAACCTTATTATGCTCTGCAGCACAGTT  1318

Query 1407  TCTTCAAGAAAACAGCTGATGAAGGTACAAATACAAGTAATAGTGTATCTACAAGCCCCGCCATGGAGCAGTCT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1319  TCTTCAAGAAAACAGCTGATGAAGGTACAAATACAAGTAATAGTGTATCTACAAGCCCCGCCATGGAGCAGTCT  1392

Query 1481  CAGTCTTCGGGCACCACCTCCAGTACATCGTCAAGCTTCATGATCACTCATCAGGTGTCAAGACATCAGTTGGA  1554
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |.|..|||||| ||.|.|||| ||.||||.|||
Sbjct 1393  CAGTCTTCGGGCACCACCTCCAGTACATCGTCAAGC-TCA-GGTGGCTCATC-GGGGACAAG-CAACAGTGGGA  1462

Query 1555  GGAGCACGGTCGGATCAGGACGCACCAGCATCGGCACATTGGCGGGCATTATCTT--CAACTGCTGTGTCATGT  1626
             ||||.|||||||||| .||||||||||||||||||||.|||.|||||    |||  ||.||||.||| ||.|.
Sbjct 1463  -GAGCCCGGTCGGATC-CGACGCACCAGCATCGGCACAGTGGTGGGCA----CTTCACAGCTGCCGTG-CAGGC  1529

Query 1627  CATGGACTGCGAGACACACAGTCCGGCAGGTGCGTCAGCAATTTCCTGCTCGTCTTGGTGGATCAGGCACTGAA  1700
            |||||||||||||||||||||||| .|||||||||||||||||||||||||.|||||||.|.||||||||||||
Sbjct 1530  CATGGACTGCGAGACACACAGTCC-CCAGGTGCGTCAGCAATTTCCTGCTCCTCTTGGTTGGTCAGGCACTGAA  1602

Query 1701  GCTCCTACACAGGTCAGTGATGAAACTCATCCT-CTCAAGAAACAACCATTCATGTAGCCCCTCAACAGAATGC  1773
            ||||||||||||||||.||.||||||||||||| .|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1603  GCTCCTACACAGGTCACTGTTGAAACTCATCCTGTTCAAGAAACAACCTTTCATGTAGCCCCTCAACAGAATGC  1676

Query 1774  ATCAAATCATCACCATGGTAACAGTTCCCATCACCATCACCACCACCACCACCATCACCACCACCATGGACAAC  1847
            ||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1677  ATTGCATCATCACCATGGTAACAGTTCCCATCACCATCACCACCACCACCACCATCACCACCACCATGGACAAC  1750

Query 1848  AAGCCTTGGGTAACCGGACCAGGCCAAGGGTCTACAATTCTCCAACGAATAGCTCCTCTACCCAAGATTCTATG  1921
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1751  AAGCCTTGGGTAACCGGACCAGGCCAAGGGTCTACAATTCTCCAACGAATAGCTCCTCTACCCAAGATTCTATG  1824

Query 1922  GAGGTTGGCCACAGTCACCACTCCATGACATCCCTGTCTTCCTCAACGACTTCTTCCTCGACATCTTCCTCCTC  1995
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1825  GAGGTTGGCCACAGTCACCACTCCATGACATCCCTGTCTTCCTCAACGACTTCTTCCTCGACATCTTCCTCCTC  1898

Query 1996  TACTGGTAACCAAGGCAATCAGGCCTACCAGAATCGCCCAGTGGCTGCTAATACCTTGGACTTTGGACAGAATG  2069
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1899  TACTGGTAACCAAGGCAATCAGGCCTACCAGAATCGCCCAGTGGCTGCTAATACCTTGGACTTTGGACAGAATG  1972

Query 2070  GAGCTATGGACGTTAATTTGACCGTCTACTCCAATCCCCGCCAAGAGACTGGCATAGCTGGACATCCAACATAC  2143
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1973  GAGCTATGGACGTTAATTTGACCGTCTACTCCAATCCCCGCCAAGAGACTGGCATAGCTGGACATCCAACATAC  2046

Query 2144  CAATTTTCTGCTAATACAGGTCCTGCACATTACATGACTGAAGGACATCTGACAATGAGGCAAGGGGCTGATAG  2217
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2047  CAATTTTCTGCTAATACAGGTCCTGCACATTACATGACTGAAGGACATCTGACAATGAGGCAAGGGGCTGATAG  2120

Query 2218  AGAAGAGTCCCCCATGACAGGAGTTTGTGTGCAACAGAGTCCTGTAGCTAGCTCG  2272
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2121  AGAAGAGTCCCCCATGACAGGAGTTTGTGTGCAACAGAGTCCTGTAGCTAGCTCG  2175