Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14633
- Subject:
- NM_001042599.1
- Aligned Length:
- 3924
- Identities:
- 3876
- Gaps:
- 48
Alignment
Query 1 ATGAAGCCGGCGACAGGACTTTGGGTCTGGGTGAGCCTTCTCGTGGCGGCGGGGACCGTCCAGCCCAGCGATTC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAGCCGGCGACAGGACTTTGGGTCTGGGTGAGCCTTCTCGTGGCGGCGGGGACCGTCCAGCCCAGCGATTC 74
Query 75 TCAGTCAGTGTGTGCAGGAACGGAGAATAAACTGAGCTCTCTCTCTGACCTGGAACAGCAGTACCGAGCCTTGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCAGTCAGTGTGTGCAGGAACGGAGAATAAACTGAGCTCTCTCTCTGACCTGGAACAGCAGTACCGAGCCTTGC 148
Query 149 GCAAGTACTATGAAAACTGTGAGGTTGTCATGGGCAACCTGGAGATAACCAGCATTGAGCACAACCGGGACCTC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCAAGTACTATGAAAACTGTGAGGTTGTCATGGGCAACCTGGAGATAACCAGCATTGAGCACAACCGGGACCTC 222
Query 223 TCCTTCCTGCGGTCTGTTCGAGAAGTCACAGGCTACGTGTTAGTGGCTCTTAATCAGTTTCGTTACCTGCCTCT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCCTTCCTGCGGTCTGTTCGAGAAGTCACAGGCTACGTGTTAGTGGCTCTTAATCAGTTTCGTTACCTGCCTCT 296
Query 297 GGAGAATTTACGCATTATTCGTGGGACAAAACTTTATGAGGATCGATATGCCTTGGCAATATTTTTAAACTACA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGAGAATTTACGCATTATTCGTGGGACAAAACTTTATGAGGATCGATATGCCTTGGCAATATTTTTAAACTACA 370
Query 371 GAAAAGATGGAAACTTTGGACTTCAAGAACTTGGATTAAAGAACTTGACAGAAATCCTAAATGGTGGAGTCTAT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GAAAAGATGGAAACTTTGGACTTCAAGAACTTGGATTAAAGAACTTGACAGAAATCCTAAATGGTGGAGTCTAT 444
Query 445 GTAGACCAGAACAAATTCCTTTGTTATGCAGACACCATTCATTGGCAAGATATTGTTCGGAACCCATGGCCTTC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTAGACCAGAACAAATTCCTTTGTTATGCAGACACCATTCATTGGCAAGATATTGTTCGGAACCCATGGCCTTC 518
Query 519 CAACTTGACTCTTGTGTCAACAAATGGTAGTTCAGGATGTGGACGTTGCCATAAGTCCTGTACTGGCCGTTGCT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAACTTGACTCTTGTGTCAACAAATGGTAGTTCAGGATGTGGACGTTGCCATAAGTCCTGTACTGGCCGTTGCT 592
Query 593 GGGGACCCACAGAAAATCATTGCCAGACTTTGACAAGGACGGTGTGTGCAGAACAATGTGACGGCAGATGCTAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GGGGACCCACAGAAAATCATTGCCAGACTTTGACAAGGACGGTGTGTGCAGAACAATGTGACGGCAGATGCTAC 666
Query 667 GGACCTTACGTCAGTGACTGCTGCCATCGAGAATGTGCTGGAGGCTGCTCAGGACCTAAGGACACAGACTGCTT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGACCTTACGTCAGTGACTGCTGCCATCGAGAATGTGCTGGAGGCTGCTCAGGACCTAAGGACACAGACTGCTT 740
Query 741 TGCCTGCATGAATTTCAATGACAGTGGAGCATGTGTTACTCAGTGTCCCCAAACCTTTGTCTACAATCCAACCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGCCTGCATGAATTTCAATGACAGTGGAGCATGTGTTACTCAGTGTCCCCAAACCTTTGTCTACAATCCAACCA 814
Query 815 CCTTTCAACTGGAGCACAATTTCAATGCAAAGTACACATATGGAGCATTCTGTGTCAAGAAATGTCCACATAAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCTTTCAACTGGAGCACAATTTCAATGCAAAGTACACATATGGAGCATTCTGTGTCAAGAAATGTCCACATAAC 888
Query 889 TTTGTGGTAGATTCCAGTTCTTGTGTGCGTGCCTGCCCTAGTTCCAAGATGGAAGTAGAAGAAAATGGGATTAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTTGTGGTAGATTCCAGTTCTTGTGTGCGTGCCTGCCCTAGTTCCAAGATGGAAGTAGAAGAAAATGGGATTAA 962
Query 963 AATGTGTAAACCTTGCACTGACATTTGCCCAAAAGCTTGTGATGGCATTGGCACAGGATCATTGATGTCAGCTC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AATGTGTAAACCTTGCACTGACATTTGCCCAAAAGCTTGTGATGGCATTGGCACAGGATCATTGATGTCAGCTC 1036
Query 1037 AGACTGTGGATTCCAGTAACATTGACAAATTCATAAACTGTACCAAGATCAATGGGAATTTGATCTTTCTAGTC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGACTGTGGATTCCAGTAACATTGACAAATTCATAAACTGTACCAAGATCAATGGGAATTTGATCTTTCTAGTC 1110
Query 1111 ACTGGTATTCATGGGGACCCTTACAATGCAATTGAAGCCATAGACCCAGAGAAACTGAACGTCTTTCGGACAGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACTGGTATTCATGGGGACCCTTACAATGCAATTGAAGCCATAGACCCAGAGAAACTGAACGTCTTTCGGACAGT 1184
Query 1185 CAGAGAGATAACAGGTTTCCTGAACATACAGTCATGGCCACCAAACATGACTGACTTCAGTGTTTTTTCTAACC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CAGAGAGATAACAGGTTTCCTGAACATACAGTCATGGCCACCAAACATGACTGACTTCAGTGTTTTTTCTAACC 1258
Query 1259 TGGTGACCATTGGTGGAAGAGTACTCTATAGTGGCCTGTCCTTGCTTATCCTCAAGCAACAGGGCATCACCTCT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGGTGACCATTGGTGGAAGAGTACTCTATAGTGGCCTGTCCTTGCTTATCCTCAAGCAACAGGGCATCACCTCT 1332
Query 1333 CTACAGTTCCAGTCCCTGAAGGAAATCAGCGCAGGAAACATCTATATTACTGACAACAGCAACCTGTGTTATTA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CTACAGTTCCAGTCCCTGAAGGAAATCAGCGCAGGAAACATCTATATTACTGACAACAGCAACCTGTGTTATTA 1406
Query 1407 TCATACCATTAACTGGACAACACTCTTCAGCACAATCAACCAGAGAATAGTAATCCGGGACAACAGAAAAGCTG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TCATACCATTAACTGGACAACACTCTTCAGCACAATCAACCAGAGAATAGTAATCCGGGACAACAGAAAAGCTG 1480
Query 1481 AAAATTGTACTGCTGAAGGAATGGTGTGCAACCATCTGTGTTCCAGTGATGGCTGTTGGGGACCTGGGCCAGAC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AAAATTGTACTGCTGAAGGAATGGTGTGCAACCATCTGTGTTCCAGTGATGGCTGTTGGGGACCTGGGCCAGAC 1554
Query 1555 CAATGTCTGTCGTGTCGCCGCTTCAGTAGAGGAAGGATCTGCATAGAGTCTTGTAACCTCTATGATGGTGAATT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CAATGTCTGTCGTGTCGCCGCTTCAGTAGAGGAAGGATCTGCATAGAGTCTTGTAACCTCTATGATGGTGAATT 1628
Query 1629 TCGGGAGTTTGAGAATGGCTCCATCTGTGTGGAGTGTGACCCCCAGTGTGAGAAGATGGAAGATGGCCTCCTCA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TCGGGAGTTTGAGAATGGCTCCATCTGTGTGGAGTGTGACCCCCAGTGTGAGAAGATGGAAGATGGCCTCCTCA 1702
Query 1703 CATGCCATGGACCGGGTCCTGACAACTGTACAAAGTGCTCTCATTTTAAAGATGGCCCAAACTGTGTGGAAAAA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CATGCCATGGACCGGGTCCTGACAACTGTACAAAGTGCTCTCATTTTAAAGATGGCCCAAACTGTGTGGAAAAA 1776
Query 1777 TGTCCAGATGGCTTACAGGGGGCAAACAGTTTCATTTTCAAGTATGCTGATCCAGATCGGGAGTGCCACCCATG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TGTCCAGATGGCTTACAGGGGGCAAACAGTTTCATTTTCAAGTATGCTGATCCAGATCGGGAGTGCCACCCATG 1850
Query 1851 CCATCCAAACTGCACCCAAGGGTGTAACGGTCCCACTAGTCATGACTGCATTTACTACCCATGGACGGGCCATT 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CCATCCAAACTGCACCCAAGGGTGTAACGGTCCCACTAGTCATGACTGCATTTACTACCCATGGACGGGCCATT 1924
Query 1925 CCACTTTACCACAACATGCTAGAACTCCCCTGATTGCAGCTGGAGTAATTGGTGGGCTCTTCATTCTGGTCATT 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CCACTTTACCACAACATGCTAGAACTCCCCTGATTGCAGCTGGAGTAATTGGTGGGCTCTTCATTCTGGTCATT 1998
Query 1999 GTGGGTCTGACATTTGCTGTTTATGTTAGAAGGAAGAGCATCAAAAAGAAAAGAGCCTTGAGAAGATTCTTGGA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GTGGGTCTGACATTTGCTGTTTATGTTAGAAGGAAGAGCATCAAAAAGAAAAGAGCCTTGAGAAGATTCTTGGA 2072
Query 2073 AACAGAGTTGGTGGAACCATTAACTCCCAGTGGCACAGCACCCAATCAAGCTCAACTTCGTATTTTGAAAGAAA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AACAGAGTTGGTGGAACCATTAACTCCCAGTGGCACAGCACCCAATCAAGCTCAACTTCGTATTTTGAAAGAAA 2146
Query 2147 CTGAGCTGAAGAGGGTAAAAGTCCTTGGCTCAGGTGCTTTTGGAACGGTTTATAAAGGTATTTGGGTACCTGAA 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CTGAGCTGAAGAGGGTAAAAGTCCTTGGCTCAGGTGCTTTTGGAACGGTTTATAAAGGTATTTGGGTACCTGAA 2220
Query 2221 GGAGAAACTGTGAAGATTCCTGTGGCTATTAAGATTCTTAATGAGACAACTGGTCCCAAGGCAAATGTGGAGTT 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GGAGAAACTGTGAAGATTCCTGTGGCTATTAAGATTCTTAATGAGACAACTGGTCCCAAGGCAAATGTGGAGTT 2294
Query 2295 CATGGATGAAGCTCTGATCATGGCAAGTATGGATCATCCACACCTAGTCCGGTTGCTGGGTGTGTGTCTGAGCC 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CATGGATGAAGCTCTGATCATGGCAAGTATGGATCATCCACACCTAGTCCGGTTGCTGGGTGTGTGTCTGAGCC 2368
Query 2369 CAACCATCCAGCTGGTTACTCAACTTATGCCCCATGGCTGCCTGTTGGAGTATGTCCACGAGCACAAGGATAAC 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 CAACCATCCAGCTGGTTACTCAACTTATGCCCCATGGCTGCCTGTTGGAGTATGTCCACGAGCACAAGGATAAC 2442
Query 2443 ATTGGATCACAACTGCTGCTTAACTGGTGTGTCCAGATAGCTAAGGGAATGATGTACCTGGAAGAAAGACGACT 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 ATTGGATCACAACTGCTGCTTAACTGGTGTGTCCAGATAGCTAAGGGAATGATGTACCTGGAAGAAAGACGACT 2516
Query 2517 CGTTCATCGGGATTTGGCAGCCCGTAATGTCTTAGTGAAATCTCCAAACCATGTGAAAATCACAGATTTTGGGC 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 CGTTCATCGGGATTTGGCAGCCCGTAATGTCTTAGTGAAATCTCCAAACCATGTGAAAATCACAGATTTTGGGC 2590
Query 2591 TAGCCAGACTCTTGGAAGGAGATGAAAAAGAGTACAATGCTGATGGAGGAAAGATGCCAATTAAATGGATGGCT 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 TAGCCAGACTCTTGGAAGGAGATGAAAAAGAGTACAATGCTGATGGAGGAAAGATGCCAATTAAATGGATGGCT 2664
Query 2665 CTGGAGTGTATACATTACAGGAAATTCACCCATCAGAGTGACGTTTGGAGCTATGGAGTTACTATATGGGAACT 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 CTGGAGTGTATACATTACAGGAAATTCACCCATCAGAGTGACGTTTGGAGCTATGGAGTTACTATATGGGAACT 2738
Query 2739 GATGACCTTTGGAGGAAAACCCTATGATGGAATTCCAACGCGAGAAATCCCTGATTTATTAGAGAAAGGAGAAC 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 GATGACCTTTGGAGGAAAACCCTATGATGGAATTCCAACGCGAGAAATCCCTGATTTATTAGAGAAAGGAGAAC 2812
Query 2813 GTTTGCCTCAGCCTCCCATCTGCACTATTGACGTTTACATGGTCATGGTCAAATGTTGGATGATTGATGCTGAC 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 GTTTGCCTCAGCCTCCCATCTGCACTATTGACGTTTACATGGTCATGGTCAAATGTTGGATGATTGATGCTGAC 2886
Query 2887 AGTAGACCTAAATTTAAGGAACTGGCTGCTGAGTTTTCAAGGATGGCTCGAGACCCTCAAAGATACCTAGTTAT 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 AGTAGACCTAAATTTAAGGAACTGGCTGCTGAGTTTTCAAGGATGGCTCGAGACCCTCAAAGATACCTAGTTAT 2960
Query 2961 TCAGGGTGATGATCGTATGAAGCTTCCCAGTCCAAATGACAGCAAGTTCTTTCAGAATCTCTTGGATGAAGAGG 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 TCAGGGTGATGATCGTATGAAGCTTCCCAGTCCAAATGACAGCAAGTTCTTTCAGAATCTCTTGGATGAAGAGG 3034
Query 3035 ATTTGGAAGATATGATGGATGCTGAGGAGTACTTGGTCCCTCAGGCTTTCAACATCCCACCTCCCATCTATACT 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 ATTTGGAAGATATGATGGATGCTGAGGAGTACTTGGTCCCTCAGGCTTTCAACATCCCACCTCCCATCTATACT 3108
Query 3109 TCCAGAGCAAGAATTGACTCGAATAGGAGTGAAATTGGACACAGCCCTCCTCCTGCCTACACCCCCATGTCAGG 3182
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 TCCAGAGCAAGAATTGACTCGAATAGG----------------------------------------------- 3135
Query 3183 AAACCAGTTTGTATACCGAGATGGAGGTTTTGCTGCTGAACAAGGAGTGTCTGTGCCCTACAGAGCCCCAACTA 3256
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3136 -AACCAGTTTGTATACCGAGATGGAGGTTTTGCTGCTGAACAAGGAGTGTCTGTGCCCTACAGAGCCCCAACTA 3208
Query 3257 GCACAATTCCAGAAGCTCCTGTGGCACAGGGTGCTACTGCTGAGATTTTTGATGACTCCTGCTGTAATGGCACC 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3209 GCACAATTCCAGAAGCTCCTGTGGCACAGGGTGCTACTGCTGAGATTTTTGATGACTCCTGCTGTAATGGCACC 3282
Query 3331 CTACGCAAGCCAGTGGCACCCCATGTCCAAGAGGACAGTAGCACCCAGAGGTACAGTGCTGACCCCACCGTGTT 3404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3283 CTACGCAAGCCAGTGGCACCCCATGTCCAAGAGGACAGTAGCACCCAGAGGTACAGTGCTGACCCCACCGTGTT 3356
Query 3405 TGCCCCAGAACGGAGCCCACGAGGAGAGCTGGATGAGGAAGGTTACATGACTCCTATGCGAGACAAACCCAAAC 3478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3357 TGCCCCAGAACGGAGCCCACGAGGAGAGCTGGATGAGGAAGGTTACATGACTCCTATGCGAGACAAACCCAAAC 3430
Query 3479 AAGAATACCTGAATCCAGTGGAGGAGAACCCTTTTGTTTCTCGGAGAAAAAATGGAGACCTTCAAGCATTGGAT 3552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3431 AAGAATACCTGAATCCAGTGGAGGAGAACCCTTTTGTTTCTCGGAGAAAAAATGGAGACCTTCAAGCATTGGAT 3504
Query 3553 AATCCCGAATATCACAATGCATCCAATGGTCCACCCAAGGCCGAGGATGAGTATGTGAATGAGCCACTGTACCT 3626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3505 AATCCCGAATATCACAATGCATCCAATGGTCCACCCAAGGCCGAGGATGAGTATGTGAATGAGCCACTGTACCT 3578
Query 3627 CAACACCTTTGCCAACACCTTGGGAAAAGCTGAGTACCTGAAGAACAACATACTGTCAATGCCAGAGAAGGCCA 3700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3579 CAACACCTTTGCCAACACCTTGGGAAAAGCTGAGTACCTGAAGAACAACATACTGTCAATGCCAGAGAAGGCCA 3652
Query 3701 AGAAAGCGTTTGACAACCCTGACTACTGGAACCACAGCCTGCCACCTCGGAGCACCCTTCAGCACCCAGACTAC 3774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3653 AGAAAGCGTTTGACAACCCTGACTACTGGAACCACAGCCTGCCACCTCGGAGCACCCTTCAGCACCCAGACTAC 3726
Query 3775 CTGCAGGAGTACAGCACAAAATATTTTTATAAACAGAATGGGCGGATCCGGCCTATTGTGGCAGAGAATCCTGA 3848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3727 CTGCAGGAGTACAGCACAAAATATTTTTATAAACAGAATGGGCGGATCCGGCCTATTGTGGCAGAGAATCCTGA 3800
Query 3849 ATACCTCTCTGAGTTCTCCCTGAAGCCAGGCACTGTGCTGCCGCCTCCACCTTACAGACACCGGAATACTGTGG 3922
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3801 ATACCTCTCTGAGTTCTCCCTGAAGCCAGGCACTGTGCTGCCGCCTCCACCTTACAGACACCGGAATACTGTGG 3874
Query 3923 TG 3924
||
Sbjct 3875 TG 3876